MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_018015	GGAA	2	8	560568	560575	50 %	0 %	50 %	0 %	390960779
11502	NC_018015	TTG	2	6	560640	560645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960779
11503	NC_018015	TGCC	2	8	560674	560681	0 %	25 %	25 %	50 %	390960779
11504	NC_018015	CGT	2	6	560686	560691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960779
11505	NC_018015	CCT	2	6	560779	560784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960779
11506	NC_018015	GA	3	6	560817	560822	50 %	0 %	50 %	0 %	390960779
11507	NC_018015	CTCAC	2	10	560857	560866	20 %	20 %	0 %	60 %	390960780
11508	NC_018015	CTT	2	6	560872	560877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960780
11509	NC_018015	TC	3	6	560898	560903	0 %	50 %	0 %	50 %	390960780
11510	NC_018015	GCAC	2	8	560967	560974	25 %	0 %	25 %	50 %	390960780
11511	NC_018015	TTG	2	6	561011	561016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960780
11512	NC_018015	CTC	2	6	561062	561067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960781
11513	NC_018015	CTC	2	6	561086	561091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960781
11514	NC_018015	TCT	2	6	561118	561123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960781
11515	NC_018015	CCTCTT	2	12	561131	561142	0 %	50 %	0 %	50 %	390960781
11516	NC_018015	TCG	2	6	561270	561275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960781
11517	NC_018015	CTT	2	6	561338	561343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960781
11518	NC_018015	CGC	2	6	561376	561381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960781
11519	NC_018015	TTG	2	6	561399	561404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960781
11520	NC_018015	CGA	2	6	561439	561444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960781
11521	NC_018015	CT	3	6	561569	561574	0 %	50 %	0 %	50 %	390960781
11522	NC_018015	CATCT	2	10	561584	561593	20 %	40 %	0 %	40 %	390960781
11523	NC_018015	ACG	2	6	561632	561637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960782
11524	NC_018015	GAC	2	6	561691	561696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960782
11525	NC_018015	CGA	2	6	561729	561734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960782
11526	NC_018015	TCG	2	6	561869	561874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960782
11527	NC_018015	GGT	2	6	561885	561890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960782
11528	NC_018015	CGT	2	6	561897	561902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960782
11529	NC_018015	TTG	2	6	561941	561946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960782
11530	NC_018015	CTTC	2	8	561972	561979	0 %	50 %	0 %	50 %	390960782
11531	NC_018015	GAA	2	6	562020	562025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960782
11532	NC_018015	TCCT	2	8	562091	562098	0 %	50 %	0 %	50 %	390960782
11533	NC_018015	CGGCCT	2	12	562228	562239	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	390960782
11534	NC_018015	TA	3	6	562267	562272	50 %	50 %	0 %	0 %	390960782
11535	NC_018015	ATTA	2	8	562344	562351	50 %	50 %	0 %	0 %	390960783
11536	NC_018015	TCT	2	6	562352	562357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960783
11537	NC_018015	CTCTC	2	10	562358	562367	0 %	40 %	0 %	60 %	390960783
11538	NC_018015	TCG	2	6	562369	562374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960783
11539	NC_018015	TCCT	2	8	562503	562510	0 %	50 %	0 %	50 %	390960783
11540	NC_018015	CGC	2	6	562523	562528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960783
11541	NC_018015	CCCT	2	8	562549	562556	0 %	25 %	0 %	75 %	390960783
11542	NC_018015	TGC	2	6	562725	562730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960784
11543	NC_018015	CGG	2	6	562749	562754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960784
11544	NC_018015	TTCC	2	8	562867	562874	0 %	50 %	0 %	50 %	390960784
11545	NC_018015	GAC	2	6	562897	562902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960784
11546	NC_018015	CCTTC	2	10	562921	562930	0 %	40 %	0 %	60 %	390960784
11547	NC_018015	CGA	2	6	562941	562946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960784
11548	NC_018015	CCT	3	9	562975	562983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960784
11549	NC_018015	CGA	2	6	562998	563003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960784
11550	NC_018015	TGT	2	6	563034	563039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960784
11551	NC_018015	CTT	2	6	563119	563124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960784
11552	NC_018015	ACG	2	6	563167	563172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960785
11553	NC_018015	CTC	2	6	563272	563277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960785
11554	NC_018015	CTT	2	6	563298	563303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960785
11555	NC_018015	GGTAGT	2	12	563306	563317	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	390960785
11556	NC_018015	CGA	3	9	563327	563335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960785
11557	NC_018015	TCT	2	6	563339	563344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960785
11558	NC_018015	GAC	2	6	563358	563363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960785
11559	NC_018015	CAATC	2	10	563454	563463	40 %	20 %	0 %	40 %	390960785
11560	NC_018015	TC	4	8	563462	563469	0 %	50 %	0 %	50 %	390960785
11561	NC_018015	CTT	2	6	563483	563488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_018015	ATCTC	2	10	563491	563500	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11563	NC_018015	CCA	2	6	563566	563571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11564	NC_018015	CCG	2	6	563601	563606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11565	NC_018015	GCTC	2	8	563704	563711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11566	NC_018015	CTC	2	6	563749	563754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960786
11567	NC_018015	CCTTC	2	10	563818	563827	0 %	40 %	0 %	60 %	390960786
11568	NC_018015	CTT	2	6	563863	563868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960786
11569	NC_018015	CCT	2	6	563982	563987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960786
11570	NC_018015	CTT	2	6	564058	564063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960787
11571	NC_018015	GC	3	6	564076	564081	0 %	0 %	50 %	50 %	390960787
11572	NC_018015	CTT	2	6	564184	564189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960787
11573	NC_018015	TCC	2	6	564249	564254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960788
11574	NC_018015	ATG	2	6	564306	564311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960788
11575	NC_018015	GAGCTT	2	12	564335	564346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390960788
11576	NC_018015	CT	3	6	564435	564440	0 %	50 %	0 %	50 %	390960788
11577	NC_018015	ATG	2	6	564492	564497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960788
11578	NC_018015	CCT	2	6	564521	564526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960788
11579	NC_018015	CCTCAA	2	12	564604	564615	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	390960788
11580	NC_018015	GGC	2	6	564707	564712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960788
11581	NC_018015	TCT	2	6	564742	564747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960788
11582	NC_018015	GCCC	2	8	564767	564774	0 %	0 %	25 %	75 %	390960788
11583	NC_018015	TCG	2	6	564798	564803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960788
11584	NC_018015	CCTT	2	8	564822	564829	0 %	50 %	0 %	50 %	390960788
11585	NC_018015	TC	3	6	564839	564844	0 %	50 %	0 %	50 %	390960788
11586	NC_018015	CCT	2	6	564862	564867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960789
11587	NC_018015	GGT	2	6	564895	564900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960789
11588	NC_018015	TG	3	6	564966	564971	0 %	50 %	50 %	0 %	390960789
11589	NC_018015	GTT	2	6	565024	565029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960789
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11591	NC_018015	CTT	2	6	565048	565053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960789
11592	NC_018015	CGT	2	6	565167	565172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960789
11593	NC_018015	CGT	2	6	565188	565193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960789
11594	NC_018015	CAT	2	6	565198	565203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960789
11595	NC_018015	GAG	2	6	565219	565224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960789
11596	NC_018015	ACC	2	6	565334	565339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11597	NC_018015	ATC	2	6	565443	565448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960790
11598	NC_018015	TCC	2	6	565449	565454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960790
11599	NC_018015	CTG	2	6	565536	565541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960790
11600	NC_018015	CTT	2	6	565556	565561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960790
11601	NC_018015	CTT	2	6	565571	565576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960790
11602	NC_018015	CTT	2	6	565601	565606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960790
11603	NC_018015	GAG	2	6	565655	565660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960790
11604	NC_018015	TCC	2	6	565671	565676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960790
11605	NC_018015	CTT	2	6	565727	565732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960790
11606	NC_018015	TCA	2	6	565744	565749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960790
11607	NC_018015	TCC	2	6	565752	565757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960791
11608	NC_018015	TTC	2	6	565764	565769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960791
11609	NC_018015	GACC	2	8	565782	565789	25 %	0 %	25 %	50 %	390960791
11610	NC_018015	TTCC	2	8	565790	565797	0 %	50 %	0 %	50 %	390960791
11611	NC_018015	GC	3	6	565805	565810	0 %	0 %	50 %	50 %	390960791
11612	NC_018015	ACC	2	6	565849	565854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960791
11613	NC_018015	GGT	2	6	565860	565865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960791
11614	NC_018015	GTA	2	6	565927	565932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960791
11615	NC_018015	CCG	2	6	565973	565978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960791
11616	NC_018015	CGA	2	6	565980	565985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960791
11617	NC_018015	TGG	2	6	565992	565997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960791
11618	NC_018015	CTG	2	6	566066	566071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960791
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