MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_018015	ATT	2	6	537030	537035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960741
11002	NC_018015	GTC	2	6	537131	537136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960742
11003	NC_018015	GAC	2	6	537140	537145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960742
11004	NC_018015	TCG	2	6	537162	537167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960742
11005	NC_018015	ACG	2	6	537216	537221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960742
11006	NC_018015	TG	3	6	537247	537252	0 %	50 %	50 %	0 %	390960742
11007	NC_018015	TCC	2	6	537256	537261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960742
11008	NC_018015	TCTT	2	8	537309	537316	0 %	75 %	0 %	25 %	390960742
11009	NC_018015	CGT	2	6	537323	537328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960742
11010	NC_018015	CAC	2	6	537338	537343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11011	NC_018015	ATA	2	6	537397	537402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_018015	ATT	2	6	537551	537556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_018015	ACC	2	6	537586	537591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11014	NC_018015	TTA	2	6	537613	537618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_018015	AATC	2	8	537619	537626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11016	NC_018015	CTC	2	6	537672	537677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11017	NC_018015	TCC	2	6	537689	537694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11018	NC_018015	TCTCC	2	10	537696	537705	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11019	NC_018015	ATC	2	6	537748	537753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_018015	TC	4	8	537752	537759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11021	NC_018015	TA	4	8	537783	537790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_018015	A	6	6	537864	537869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_018015	TGAA	2	8	537893	537900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_018015	TGT	2	6	537904	537909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_018015	CT	3	6	537923	537928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11026	NC_018015	A	6	6	537943	537948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_018015	CGA	2	6	538110	538115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960743
11028	NC_018015	AGG	2	6	538119	538124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960743
11029	NC_018015	AGA	2	6	538203	538208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960743
11030	NC_018015	GAG	3	9	538217	538225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960743
11031	NC_018015	AAG	2	6	538244	538249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960743
11032	NC_018015	AGG	2	6	538299	538304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960743
11033	NC_018015	AGA	2	6	538407	538412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960743
11034	NC_018015	TAC	2	6	538463	538468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960743
11035	NC_018015	TAA	2	6	538587	538592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960743
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11037	NC_018015	GAG	2	6	538637	538642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960743
11038	NC_018015	CAG	2	6	538709	538714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960743
11039	NC_018015	AGG	2	6	538740	538745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960743
11040	NC_018015	ATA	2	6	538763	538768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960743
11041	NC_018015	CGC	2	6	538819	538824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960743
11042	NC_018015	GAC	2	6	538868	538873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960743
11043	NC_018015	GAG	2	6	538952	538957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960743
11044	NC_018015	AGC	2	6	538965	538970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960743
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11046	NC_018015	CTCC	2	8	539107	539114	0 %	25 %	0 %	75 %	390960743
11047	NC_018015	GAC	2	6	539117	539122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960743
11048	NC_018015	GAG	2	6	539138	539143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960743
11049	NC_018015	GGA	2	6	539182	539187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960743
11050	NC_018015	ACT	2	6	539214	539219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960743
11051	NC_018015	GAA	2	6	539299	539304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960743
11052	NC_018015	AAG	2	6	539348	539353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960743
11053	NC_018015	GTC	2	6	539401	539406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960744
11054	NC_018015	AAC	2	6	539446	539451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960744
11055	NC_018015	TCC	2	6	539498	539503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960744
11056	NC_018015	AGA	2	6	539523	539528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960744
11057	NC_018015	GAA	2	6	539623	539628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960745
11058	NC_018015	TGC	2	6	539717	539722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960745
11059	NC_018015	CTTCGT	2	12	539950	539961	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390960745
11060	NC_018015	AGA	2	6	539973	539978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960745
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11062	NC_018015	GCT	2	6	540229	540234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960746
11063	NC_018015	AAG	2	6	540236	540241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960746
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11065	NC_018015	GAG	2	6	540254	540259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960746
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11069	NC_018015	CGA	2	6	540409	540414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960746
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11071	NC_018015	ACA	2	6	540429	540434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960746
11072	NC_018015	TGA	2	6	540459	540464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960746
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11081	NC_018015	GCAG	2	8	540774	540781	25 %	0 %	50 %	25 %	390960746
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11086	NC_018015	GCCA	2	8	541026	541033	25 %	0 %	25 %	50 %	390960747
11087	NC_018015	GAG	2	6	541036	541041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960747
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11089	NC_018015	TCC	2	6	541214	541219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960747
11090	NC_018015	CTTC	2	8	541239	541246	0 %	50 %	0 %	50 %	390960748
11091	NC_018015	T	6	6	541275	541280	0 %	100 %	0 %	0 %	390960748
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11099	NC_018015	GGA	2	6	541623	541628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960748
11100	NC_018015	CTAG	2	8	541741	541748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11101	NC_018015	GCG	2	6	541755	541760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_018015	CCT	2	6	541762	541767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11103	NC_018015	CCG	2	6	541794	541799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11104	NC_018015	TCA	2	6	541832	541837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_018015	CCG	2	6	542049	542054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11106	NC_018015	AGA	2	6	542109	542114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_018015	ACC	2	6	542122	542127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11108	NC_018015	GAA	2	6	542217	542222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_018015	TCC	2	6	542262	542267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11110	NC_018015	AGG	3	9	542422	542430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960749
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11112	NC_018015	TAC	2	6	542448	542453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960749
11113	NC_018015	CGT	2	6	542465	542470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960749
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11116	NC_018015	GCGA	2	8	542574	542581	25 %	0 %	50 %	25 %	390960749
11117	NC_018015	AAG	2	6	542637	542642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960749
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11120	NC_018015	A	6	6	543037	543042	100 %	0 %	0 %	0 %	390960749
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11122	NC_018015	GAG	2	6	543063	543068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960749
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11231	NC_018015	GTC	2	6	548377	548382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960760
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11240	NC_018015	A	6	6	548642	548647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11241	NC_018015	CTT	2	6	548676	548681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960761
11242	NC_018015	CGT	2	6	548701	548706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960761
11243	NC_018015	GGC	2	6	548771	548776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960761
11244	NC_018015	GCTCTT	2	12	548795	548806	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390960761
11245	NC_018015	TCC	2	6	548810	548815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960761
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11254	NC_018015	CTG	2	6	549059	549064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960761
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11258	NC_018015	TCC	3	9	549167	549175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960762
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11262	NC_018015	GCT	2	6	549399	549404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960762
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11266	NC_018015	CT	3	6	549534	549539	0 %	50 %	0 %	50 %	390960762
11267	NC_018015	CTT	2	6	549586	549591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960762
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11269	NC_018015	CTT	2	6	549629	549634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960763
11270	NC_018015	CCT	2	6	549635	549640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960763
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11274	NC_018015	TCT	2	6	549889	549894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960763
11275	NC_018015	TCG	2	6	549903	549908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960763
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11278	NC_018015	CT	3	6	550232	550237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11279	NC_018015	TCAT	2	8	550254	550261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11280	NC_018015	AGG	2	6	550311	550316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11281	NC_018015	TGA	2	6	550396	550401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11282	NC_018015	TCA	2	6	550525	550530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11283	NC_018015	GCCA	2	8	550600	550607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11284	NC_018015	TCA	2	6	550608	550613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11286	NC_018015	CGCT	2	8	550675	550682	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11287	NC_018015	TGA	2	6	550684	550689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11289	NC_018015	GTCTTC	2	12	550725	550736	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11291	NC_018015	AGT	3	9	550759	550767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11294	NC_018015	CTC	2	6	550840	550845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11295	NC_018015	CTTTT	2	10	550937	550946	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11296	NC_018015	AAC	2	6	551016	551021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11297	NC_018015	A	6	6	551043	551048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11298	NC_018015	TGA	2	6	551076	551081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11322	NC_018015	ACC	2	6	551919	551924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960764
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11337	NC_018015	ACC	2	6	552878	552883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11338	NC_018015	GGC	2	6	552974	552979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960766
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11354	NC_018015	GC	3	6	553464	553469	0 %	0 %	50 %	50 %	390960767
11355	NC_018015	CTTC	2	8	553507	553514	0 %	50 %	0 %	50 %	390960767
11356	NC_018015	GGC	2	6	553531	553536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960767
11357	NC_018015	ACG	2	6	553545	553550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960767
11358	NC_018015	CTG	2	6	553622	553627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960767
11359	NC_018015	CTC	2	6	553631	553636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960767
11360	NC_018015	AG	3	6	553726	553731	50 %	0 %	50 %	0 %	390960767
11361	NC_018015	GTC	2	6	553734	553739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960767
11362	NC_018015	CCTGA	2	10	553825	553834	20 %	20 %	20 %	40 %	390960768
11363	NC_018015	CG	3	6	553935	553940	0 %	0 %	50 %	50 %	390960768
11364	NC_018015	TCC	3	9	554043	554051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960768
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11484	NC_018015	CCTC	2	8	559553	559560	0 %	25 %	0 %	75 %	390960777
11485	NC_018015	GCCT	2	8	559594	559601	0 %	25 %	25 %	50 %	390960777
11486	NC_018015	GGTCG	2	10	559602	559611	0 %	20 %	60 %	20 %	390960777
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11488	NC_018015	CCA	2	6	559803	559808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960777
11489	NC_018015	GGA	2	6	559817	559822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960777
11490	NC_018015	CTT	2	6	559830	559835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960777
11491	NC_018015	CCT	2	6	560013	560018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960778
11492	NC_018015	CCT	2	6	560040	560045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960778
11493	NC_018015	GTA	2	6	560073	560078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960778
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