MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_018015	GTCCTC	2	12	512175	512186	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390960721
10502	NC_018015	TGAA	2	8	512194	512201	50 %	25 %	25 %	0 %	390960721
10503	NC_018015	GGT	2	6	512202	512207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960721
10504	NC_018015	GTG	2	6	512217	512222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960721
10505	NC_018015	CCG	2	6	512284	512289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10506	NC_018015	CG	4	8	512288	512295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10507	NC_018015	TGG	2	6	512297	512302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_018015	TAAA	2	8	512311	512318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_018015	TGG	2	6	512337	512342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_018015	GAGG	2	8	512412	512419	25 %	0 %	75 %	0 %	390960722
10511	NC_018015	GAT	2	6	512437	512442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960722
10512	NC_018015	GAT	2	6	512467	512472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960722
10513	NC_018015	GAG	2	6	512532	512537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960722
10514	NC_018015	GAAG	2	8	512547	512554	50 %	0 %	50 %	0 %	390960722
10515	NC_018015	GGGT	2	8	512568	512575	0 %	25 %	75 %	0 %	390960722
10516	NC_018015	GAA	2	6	512722	512727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960723
10517	NC_018015	GGC	2	6	512755	512760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960723
10518	NC_018015	CTA	2	6	512809	512814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960723
10519	NC_018015	GCG	2	6	512865	512870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960723
10520	NC_018015	GAA	2	6	512939	512944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960723
10521	NC_018015	CTTGCC	2	12	512960	512971	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390960724
10522	NC_018015	TTG	2	6	512973	512978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960724
10523	NC_018015	CCCTTG	2	12	513009	513020	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390960724
10524	NC_018015	TGA	2	6	513121	513126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960724
10525	NC_018015	GTG	2	6	513131	513136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960724
10526	NC_018015	CCA	2	6	513142	513147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960724
10527	NC_018015	ACC	2	6	513160	513165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960724
10528	NC_018015	GGC	2	6	513227	513232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960724
10529	NC_018015	CTT	2	6	513260	513265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960724
10530	NC_018015	CTTC	2	8	513299	513306	0 %	50 %	0 %	50 %	390960724
10531	NC_018015	CTTC	2	8	513326	513333	0 %	50 %	0 %	50 %	390960724
10532	NC_018015	ACGCGA	2	12	513345	513356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960724
10533	NC_018015	ATC	2	6	513459	513464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960724
10534	NC_018015	CTT	2	6	513494	513499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960724
10535	NC_018015	CCT	2	6	513549	513554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10536	NC_018015	GCCC	2	8	513600	513607	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10537	NC_018015	GTCG	2	8	513609	513616	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10538	NC_018015	CCTC	2	8	513689	513696	0 %	25 %	0 %	75 %	390960725
10539	NC_018015	GAA	2	6	513705	513710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960725
10540	NC_018015	GAAC	2	8	513737	513744	50 %	0 %	25 %	25 %	390960725
10541	NC_018015	CTA	2	6	513747	513752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960725
10542	NC_018015	GA	3	6	513784	513789	50 %	0 %	50 %	0 %	390960725
10543	NC_018015	TCG	2	6	513800	513805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960725
10544	NC_018015	ACC	2	6	513824	513829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960725
10545	NC_018015	CGT	2	6	513855	513860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960725
10546	NC_018015	GGAGCT	2	12	513930	513941	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390960725
10547	NC_018015	GC	3	6	513975	513980	0 %	0 %	50 %	50 %	390960725
10548	NC_018015	CAT	2	6	513996	514001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960725
10549	NC_018015	GTC	2	6	514039	514044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960725
10550	NC_018015	AAGG	2	8	514059	514066	50 %	0 %	50 %	0 %	390960725
10551	NC_018015	GAT	2	6	514083	514088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960725
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10553	NC_018015	CGA	2	6	514122	514127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960725
10554	NC_018015	GA	3	6	514241	514246	50 %	0 %	50 %	0 %	390960725
10555	NC_018015	CAC	2	6	514261	514266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960725
10556	NC_018015	GA	3	6	514276	514281	50 %	0 %	50 %	0 %	390960725
10557	NC_018015	GTC	2	6	514405	514410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960725
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10564	NC_018015	GTT	2	6	514777	514782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_018015	CCGATG	2	12	514824	514835	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_018015	G	6	6	514837	514842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_018015	TCT	2	6	514847	514852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10568	NC_018015	C	6	6	514890	514895	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10744	NC_018015	TCT	2	6	522779	522784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960730
10745	NC_018015	CGT	2	6	522851	522856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960730
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