MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_018015	TGA	2	6	490698	490703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960700
10003	NC_018015	AGT	2	6	490725	490730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960700
10004	NC_018015	CT	4	8	490762	490769	0 %	50 %	0 %	50 %	390960700
10005	NC_018015	GAC	2	6	490798	490803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960700
10006	NC_018015	AAG	2	6	490825	490830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960700
10007	NC_018015	TC	3	6	490862	490867	0 %	50 %	0 %	50 %	390960700
10008	NC_018015	CCA	2	6	490980	490985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10009	NC_018015	AAG	2	6	490995	491000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_018015	CTAT	2	8	491029	491036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10011	NC_018015	TC	3	6	491067	491072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10012	NC_018015	TTGG	2	8	491092	491099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_018015	GTTGT	2	10	491112	491121	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_018015	TCT	2	6	491122	491127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_018015	GTT	2	6	491132	491137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_018015	T	6	6	491136	491141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_018015	TCG	2	6	491149	491154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_018015	GCC	2	6	491175	491180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10019	NC_018015	ACC	2	6	491190	491195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_018015	TAG	2	6	491205	491210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_018015	TCC	2	6	491220	491225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_018015	ACC	2	6	491266	491271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10023	NC_018015	TTC	2	6	491291	491296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_018015	ATC	2	6	491297	491302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10047	NC_018015	TTC	2	6	492153	492158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_018015	GT	3	6	492236	492241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10051	NC_018015	GAG	2	6	492433	492438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10053	NC_018015	TGG	2	6	492476	492481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_018015	CCCCGC	2	12	492571	492582	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
10055	NC_018015	G	6	6	492641	492646	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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10062	NC_018015	ACC	2	6	493009	493014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10073	NC_018015	CGA	2	6	493348	493353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960703
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10088	NC_018015	G	6	6	493923	493928	0 %	0 %	100 %	0 %	390960704
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10112	NC_018015	TCGC	2	8	494689	494696	0 %	25 %	25 %	50 %	390960705
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10117	NC_018015	TTGC	2	8	495112	495119	0 %	50 %	25 %	25 %	390960705
10118	NC_018015	AGGC	2	8	495144	495151	25 %	0 %	50 %	25 %	390960705
10119	NC_018015	TCTCG	2	10	495204	495213	0 %	40 %	20 %	40 %	390960705
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10122	NC_018015	TAC	2	6	495291	495296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960705
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10124	NC_018015	AGG	2	6	495420	495425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960705
10125	NC_018015	GAGG	2	8	495429	495436	25 %	0 %	75 %	0 %	390960705
10126	NC_018015	GTT	2	6	495509	495514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960706
10127	NC_018015	GC	3	6	495519	495524	0 %	0 %	50 %	50 %	390960706
10128	NC_018015	CTT	2	6	495539	495544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960706
10129	NC_018015	GGCCTC	2	12	495609	495620	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	390960706
10130	NC_018015	CTCC	2	8	495644	495651	0 %	25 %	0 %	75 %	390960706
10131	NC_018015	CGA	2	6	495730	495735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960706
10132	NC_018015	GCT	2	6	495832	495837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960706
10133	NC_018015	CCG	2	6	495858	495863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960706
10134	NC_018015	TAT	3	9	495884	495892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960706
10135	NC_018015	ATG	2	6	495912	495917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960706
10136	NC_018015	CTG	2	6	495930	495935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960706
10137	NC_018015	CTG	2	6	496008	496013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960706
10138	NC_018015	CG	3	6	496096	496101	0 %	0 %	50 %	50 %	390960706
10139	NC_018015	TTC	2	6	496106	496111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960706
10140	NC_018015	CAT	2	6	496118	496123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960706
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10143	NC_018015	CGGC	2	8	496303	496310	0 %	0 %	50 %	50 %	390960706
10144	NC_018015	TGT	2	6	496357	496362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960706
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10153	NC_018015	TGATCC	2	12	496867	496878	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390960706
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10158	NC_018015	ATC	2	6	497175	497180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960706
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10160	NC_018015	CTT	2	6	497237	497242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960706
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10163	NC_018015	ACC	2	6	497436	497441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10164	NC_018015	GGTAAC	2	12	497496	497507	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390960707
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10167	NC_018015	C	6	6	497581	497586	0 %	0 %	0 %	100 %	390960707
10168	NC_018015	TCC	2	6	497599	497604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960707
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10178	NC_018015	ACA	2	6	498056	498061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10179	NC_018015	CTG	2	6	498065	498070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10181	NC_018015	GAAG	2	8	498173	498180	50 %	0 %	50 %	0 %	390960708
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10200	NC_018015	GAA	2	6	498965	498970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960708
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10215	NC_018015	CAA	2	6	499679	499684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10216	NC_018015	CTT	2	6	499708	499713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960710
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10230	NC_018015	CTC	2	6	500116	500121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960710
10231	NC_018015	TGG	2	6	500133	500138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960710
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10237	NC_018015	GTA	2	6	500287	500292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960710
10238	NC_018015	CGA	2	6	500409	500414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960710
10239	NC_018015	ACC	2	6	500416	500421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960710
10240	NC_018015	GGC	2	6	500429	500434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960710
10241	NC_018015	TGA	2	6	500442	500447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960710
10242	NC_018015	TCC	2	6	500466	500471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960710
10243	NC_018015	CAT	2	6	500494	500499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960710
10244	NC_018015	TGA	2	6	500559	500564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960710
10245	NC_018015	CGT	2	6	500565	500570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960710
10246	NC_018015	GAT	2	6	500638	500643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960710
10247	NC_018015	ACC	2	6	500644	500649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960710
10248	NC_018015	CAA	2	6	500673	500678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960710
10249	NC_018015	ACC	2	6	500752	500757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960710
10250	NC_018015	CGT	2	6	500820	500825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960710
10251	NC_018015	CAA	2	6	500850	500855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960710
10252	NC_018015	CTT	2	6	500866	500871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960710
10253	NC_018015	CCT	2	6	500886	500891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960710
10254	NC_018015	GCT	2	6	500925	500930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960710
10255	NC_018015	ACC	2	6	500969	500974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10256	NC_018015	AT	3	6	501015	501020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_018015	AGG	2	6	501035	501040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_018015	CAAA	2	8	501059	501066	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10259	NC_018015	GAAAA	2	10	501091	501100	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_018015	A	6	6	501123	501128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10261	NC_018015	GAA	2	6	501159	501164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_018015	GGC	2	6	501202	501207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10263	NC_018015	TCA	2	6	501227	501232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10264	NC_018015	ATC	2	6	501257	501262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10265	NC_018015	GTC	2	6	501354	501359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10266	NC_018015	GTTAC	2	10	501377	501386	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10267	NC_018015	ACG	2	6	501404	501409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10268	NC_018015	TCG	2	6	501452	501457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10269	NC_018015	A	6	6	501458	501463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10270	NC_018015	T	6	6	501476	501481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10271	NC_018015	TGCCT	2	10	501488	501497	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10272	NC_018015	TGT	2	6	501563	501568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10273	NC_018015	CAG	2	6	501573	501578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10274	NC_018015	CTA	2	6	501592	501597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10275	NC_018015	CGG	3	9	501680	501688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960711
10276	NC_018015	CTT	2	6	501707	501712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960711
10277	NC_018015	CTG	2	6	501723	501728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960711
10278	NC_018015	ACC	2	6	501756	501761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960711
10279	NC_018015	GGC	2	6	501890	501895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960711
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10281	NC_018015	CAG	2	6	501934	501939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960711
10282	NC_018015	TAC	2	6	501948	501953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960711
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10284	NC_018015	TGC	2	6	502027	502032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960711
10285	NC_018015	TCT	2	6	502033	502038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960711
10286	NC_018015	ATG	2	6	502116	502121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960711
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10300	NC_018015	TAC	2	6	502977	502982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960711
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10303	NC_018015	GAG	2	6	503115	503120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960711
10304	NC_018015	TCA	2	6	503137	503142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960711
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10306	NC_018015	CTT	2	6	503278	503283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10312	NC_018015	CTT	2	6	503495	503500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960712
10313	NC_018015	AG	3	6	503506	503511	50 %	0 %	50 %	0 %	390960712
10314	NC_018015	GAA	2	6	503522	503527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960712
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10317	NC_018015	GCT	2	6	503862	503867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960712
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10327	NC_018015	TTC	2	6	504300	504305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960713
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10331	NC_018015	CTTT	2	8	504606	504613	0 %	75 %	0 %	25 %	390960714
10332	NC_018015	CCG	2	6	504638	504643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960714
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10342	NC_018015	CTG	2	6	504944	504949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960714
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10349	NC_018015	CT	3	6	505412	505417	0 %	50 %	0 %	50 %	390960714
10350	NC_018015	CTC	2	6	505444	505449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960714
10351	NC_018015	GAA	2	6	505759	505764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960714
10352	NC_018015	CTC	2	6	505780	505785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960714
10353	NC_018015	CCT	2	6	505816	505821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960714
10354	NC_018015	CCGG	3	12	505844	505855	0 %	0 %	50 %	50 %	390960714
10355	NC_018015	CCT	2	6	505888	505893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960714
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10358	NC_018015	AGT	2	6	506067	506072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960714
10359	NC_018015	TCG	2	6	506117	506122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960714
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10361	NC_018015	GAG	2	6	506167	506172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960714
10362	NC_018015	GCT	2	6	506211	506216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960714
10363	NC_018015	GGA	2	6	506263	506268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960714
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10403	NC_018015	CGT	2	6	508029	508034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960715
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10407	NC_018015	TCG	2	6	508292	508297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960715
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10470	NC_018015	GTC	2	6	510696	510701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960719
10471	NC_018015	CGG	2	6	510754	510759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960719
10472	NC_018015	TCG	2	6	510838	510843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960719
10473	NC_018015	TAA	2	6	510897	510902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10474	NC_018015	AG	3	6	510957	510962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10475	NC_018015	A	6	6	511028	511033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10476	NC_018015	GCT	2	6	511034	511039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10477	NC_018015	TGG	2	6	511104	511109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960720
10478	NC_018015	CTCGCC	2	12	511160	511171	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	390960720
10479	NC_018015	TCA	2	6	511206	511211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960720
10480	NC_018015	GCGA	2	8	511221	511228	25 %	0 %	50 %	25 %	390960720
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10482	NC_018015	CG	3	6	511342	511347	0 %	0 %	50 %	50 %	390960720
10483	NC_018015	GAGC	2	8	511356	511363	25 %	0 %	50 %	25 %	390960720
10484	NC_018015	CT	3	6	511383	511388	0 %	50 %	0 %	50 %	390960720
10485	NC_018015	TCCT	2	8	511427	511434	0 %	50 %	0 %	50 %	390960720
10486	NC_018015	CGC	2	6	511464	511469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960720
10487	NC_018015	TTC	2	6	511538	511543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960720
10488	NC_018015	CTC	2	6	511621	511626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960720
10489	NC_018015	CTC	2	6	511724	511729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960720
10490	NC_018015	CG	3	6	511752	511757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10491	NC_018015	TCC	2	6	511789	511794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960721
10492	NC_018015	CCT	2	6	511823	511828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960721
10493	NC_018015	CGC	2	6	511874	511879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960721
10494	NC_018015	TTG	2	6	511918	511923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960721
10495	NC_018015	CTC	2	6	511944	511949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960721
10496	NC_018015	GAG	2	6	511974	511979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960721
10497	NC_018015	GTC	2	6	511989	511994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960721
10498	NC_018015	CAC	2	6	512064	512069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960721
10499	NC_018015	GAA	2	6	512085	512090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960721
10500	NC_018015	TCA	2	6	512122	512127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960721

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