MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_018015	CGT	2	6	440262	440267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960645
9002	NC_018015	ATCA	2	8	440278	440285	50 %	25 %	0 %	25 %	390960645
9003	NC_018015	CCA	2	6	440327	440332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960645
9004	NC_018015	T	7	7	440362	440368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_018015	TGG	2	6	440378	440383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_018015	CTC	2	6	440484	440489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960646
9007	NC_018015	TTC	2	6	440532	440537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960646
9008	NC_018015	CTG	2	6	440541	440546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960646
9009	NC_018015	CAC	2	6	440601	440606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960646
9010	NC_018015	TC	3	6	440654	440659	0 %	50 %	0 %	50 %	390960646
9011	NC_018015	CCT	2	6	440669	440674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960646
9012	NC_018015	ACC	2	6	440688	440693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960646
9013	NC_018015	CTGG	2	8	440708	440715	0 %	25 %	50 %	25 %	390960646
9014	NC_018015	GCG	2	6	440716	440721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960646
9015	NC_018015	TCT	2	6	440734	440739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960646
9016	NC_018015	TTC	2	6	440763	440768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960646
9017	NC_018015	CGCC	2	8	440800	440807	0 %	0 %	25 %	75 %	390960646
9018	NC_018015	CCG	2	6	440817	440822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960646
9019	NC_018015	GCG	2	6	440848	440853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960646
9020	NC_018015	TGA	2	6	440860	440865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960646
9021	NC_018015	GCT	2	6	440880	440885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960646
9022	NC_018015	TCA	2	6	440902	440907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960646
9023	NC_018015	CTT	2	6	440909	440914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960646
9024	NC_018015	CTT	2	6	440930	440935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960646
9025	NC_018015	TGG	2	6	441144	441149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960646
9026	NC_018015	TGG	2	6	441216	441221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960646
9027	NC_018015	GAC	2	6	441272	441277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960646
9028	NC_018015	CTC	2	6	441324	441329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960646
9029	NC_018015	GAA	2	6	441365	441370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960646
9030	NC_018015	TCC	2	6	441373	441378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960646
9031	NC_018015	GAG	2	6	441397	441402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960646
9032	NC_018015	AGCC	2	8	441491	441498	25 %	0 %	25 %	50 %	390960647
9033	NC_018015	AGA	2	6	441525	441530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960647
9034	NC_018015	GAG	2	6	441584	441589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960647
9035	NC_018015	CGT	2	6	441607	441612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960647
9036	NC_018015	TTC	2	6	441623	441628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960647
9037	NC_018015	GAG	2	6	441640	441645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960647
9038	NC_018015	ATT	2	6	441662	441667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960647
9039	NC_018015	CCACCG	2	12	441668	441679	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	390960647
9040	NC_018015	GAG	2	6	441685	441690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960647
9041	NC_018015	TCC	2	6	441712	441717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960647
9042	NC_018015	GA	3	6	441721	441726	50 %	0 %	50 %	0 %	390960647
9043	NC_018015	CAT	2	6	441778	441783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960647
9044	NC_018015	AGG	2	6	441797	441802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960647
9045	NC_018015	G	6	6	441864	441869	0 %	0 %	100 %	0 %	390960647
9046	NC_018015	CGA	2	6	441882	441887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960647
9047	NC_018015	GGT	2	6	441909	441914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960647
9048	NC_018015	CAGC	2	8	442012	442019	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9049	NC_018015	CTATCG	2	12	442032	442043	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_018015	GAT	2	6	442069	442074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_018015	GATG	2	8	442168	442175	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_018015	TTC	2	6	442248	442253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960648
9053	NC_018015	TAC	2	6	442329	442334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960648
9054	NC_018015	AG	3	6	442356	442361	50 %	0 %	50 %	0 %	390960648
9055	NC_018015	GGAA	2	8	442377	442384	50 %	0 %	50 %	0 %	390960648
9056	NC_018015	CTC	2	6	442401	442406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960648
9057	NC_018015	GGA	2	6	442427	442432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960648
9058	NC_018015	TGA	2	6	442555	442560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960648
9059	NC_018015	GAG	2	6	442628	442633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960648
9060	NC_018015	GGT	2	6	442673	442678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960648
9061	NC_018015	TTC	2	6	442680	442685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960648
9062	NC_018015	CTG	2	6	442752	442757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960648
9063	NC_018015	GAG	2	6	442766	442771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960648
9064	NC_018015	GAG	2	6	442775	442780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960648
9065	NC_018015	CTC	2	6	442880	442885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960648
9066	NC_018015	GCC	2	6	442889	442894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960648
9067	NC_018015	TGG	2	6	442921	442926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960648
9068	NC_018015	CGCCCT	2	12	442976	442987	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	390960648
9069	NC_018015	GAA	2	6	443099	443104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960648
9070	NC_018015	GGT	2	6	443274	443279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960649
9071	NC_018015	TAG	2	6	443312	443317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960649
9072	NC_018015	GGA	3	9	443379	443387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960649
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9077	NC_018015	G	6	6	443555	443560	0 %	0 %	100 %	0 %	390960649
9078	NC_018015	AGG	2	6	443588	443593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960649
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9088	NC_018015	GCC	2	6	443999	444004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960650
9089	NC_018015	G	6	6	444049	444054	0 %	0 %	100 %	0 %	390960650
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9092	NC_018015	GA	3	6	444126	444131	50 %	0 %	50 %	0 %	390960650
9093	NC_018015	TCG	2	6	444151	444156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960650
9094	NC_018015	GGA	2	6	444251	444256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960650
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9097	NC_018015	CTTT	2	8	444339	444346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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9103	NC_018015	AGGC	2	8	444611	444618	25 %	0 %	50 %	25 %	390960651
9104	NC_018015	GA	3	6	444622	444627	50 %	0 %	50 %	0 %	390960651
9105	NC_018015	A	6	6	444646	444651	100 %	0 %	0 %	0 %	390960651
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9111	NC_018015	AGA	2	6	444953	444958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_018015	AGG	2	6	445054	445059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_018015	CTTT	2	8	445061	445068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9114	NC_018015	CGT	2	6	445078	445083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9116	NC_018015	CAC	2	6	445128	445133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9117	NC_018015	TCC	2	6	445206	445211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960652
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9119	NC_018015	TCT	2	6	445327	445332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960652
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9121	NC_018015	GCCA	2	8	445484	445491	25 %	0 %	25 %	50 %	390960652
9122	NC_018015	ATC	2	6	445545	445550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960652
9123	NC_018015	GTT	2	6	445598	445603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960652
9124	NC_018015	ACC	2	6	445620	445625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960652
9125	NC_018015	A	6	6	445811	445816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_018015	GA	3	6	445851	445856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_018015	CCG	2	6	445905	445910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960653
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9129	NC_018015	CA	3	6	445991	445996	50 %	0 %	0 %	50 %	390960653
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9137	NC_018015	GAG	2	6	446424	446429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960654
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9140	NC_018015	CGT	2	6	446505	446510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960654
9141	NC_018015	CGG	2	6	446546	446551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960654
9142	NC_018015	CGT	2	6	446568	446573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960654
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9144	NC_018015	C	7	7	446621	446627	0 %	0 %	0 %	100 %	390960654
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9147	NC_018015	GTT	2	6	446875	446880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960654
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9150	NC_018015	AGGA	2	8	446968	446975	50 %	0 %	50 %	0 %	390960654
9151	NC_018015	GGAG	2	8	446978	446985	25 %	0 %	75 %	0 %	390960654
9152	NC_018015	TAC	2	6	447001	447006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960654
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9157	NC_018015	CTC	2	6	447215	447220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9166	NC_018015	CGA	2	6	447617	447622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960655
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9168	NC_018015	CTG	2	6	447827	447832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960655
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9194	NC_018015	CTA	2	6	448940	448945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960655
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9203	NC_018015	CGG	2	6	449558	449563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960655
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9205	NC_018015	GTG	2	6	449650	449655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9211	NC_018015	TGA	2	6	450038	450043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960657
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9228	NC_018015	AG	3	6	451256	451261	50 %	0 %	50 %	0 %	390960658
9229	NC_018015	GAA	2	6	451265	451270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960658
9230	NC_018015	CCT	2	6	451356	451361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960658
9231	NC_018015	CTG	2	6	451385	451390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960658
9232	NC_018015	GAT	2	6	451481	451486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9233	NC_018015	GAA	2	6	451607	451612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960659
9234	NC_018015	GAT	2	6	451625	451630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960659
9235	NC_018015	TCA	2	6	451633	451638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960659
9236	NC_018015	ACGAG	2	10	451654	451663	40 %	0 %	40 %	20 %	390960659
9237	NC_018015	ATA	2	6	451683	451688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960659
9238	NC_018015	AAG	2	6	451710	451715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960659
9239	NC_018015	GCTC	2	8	451724	451731	0 %	25 %	25 %	50 %	390960659
9240	NC_018015	GGT	2	6	451763	451768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960659
9241	NC_018015	GGA	2	6	451783	451788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960660
9242	NC_018015	AGGA	2	8	451793	451800	50 %	0 %	50 %	0 %	390960660
9243	NC_018015	TAC	2	6	451886	451891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960660
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9245	NC_018015	GTC	2	6	451973	451978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960660
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9489	NC_018015	GAT	2	6	466430	466435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960671
9490	NC_018015	TGG	2	6	466534	466539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960671
9491	NC_018015	CGT	2	6	466630	466635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960671
9492	NC_018015	CCG	2	6	466650	466655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960671
9493	NC_018015	GTC	2	6	466811	466816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960671
9494	NC_018015	TCCGTG	2	12	466856	466867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960671
9495	NC_018015	TGG	2	6	466927	466932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960671
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