MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_018015	TGA	2	6	414421	414426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_018015	AAG	2	6	414438	414443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960614
8503	NC_018015	AGCTCA	2	12	414472	414483	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390960614
8504	NC_018015	GAA	2	6	414488	414493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960614
8505	NC_018015	AGC	2	6	414616	414621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960614
8506	NC_018015	TCA	2	6	414658	414663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960614
8507	NC_018015	GTC	2	6	414675	414680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960614
8508	NC_018015	CGA	2	6	414719	414724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960614
8509	NC_018015	ACG	2	6	414727	414732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960614
8510	NC_018015	TCA	2	6	414736	414741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960614
8511	NC_018015	CGG	2	6	414752	414757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960614
8512	NC_018015	GTC	2	6	414804	414809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960614
8513	NC_018015	GAAG	2	8	414847	414854	50 %	0 %	50 %	0 %	390960614
8514	NC_018015	GAG	2	6	414863	414868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960614
8515	NC_018015	TCC	2	6	415005	415010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960615
8516	NC_018015	AAG	2	6	415034	415039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960615
8517	NC_018015	TCG	2	6	415065	415070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960615
8518	NC_018015	TCA	2	6	415077	415082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960615
8519	NC_018015	CGG	2	6	415120	415125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960615
8520	NC_018015	GAG	2	6	415135	415140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960615
8521	NC_018015	AG	3	6	415139	415144	50 %	0 %	50 %	0 %	390960615
8522	NC_018015	AAG	2	6	415163	415168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960615
8523	NC_018015	AGG	2	6	415191	415196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960615
8524	NC_018015	ATC	2	6	415205	415210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960615
8525	NC_018015	GAG	2	6	415213	415218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960615
8526	NC_018015	GAGG	2	8	415273	415280	25 %	0 %	75 %	0 %	390960615
8527	NC_018015	ACC	2	6	415286	415291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960615
8528	NC_018015	AGG	2	6	415343	415348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960615
8529	NC_018015	AAG	2	6	415484	415489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960615
8530	NC_018015	TTC	2	6	415548	415553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_018015	T	6	6	415583	415588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_018015	TGA	2	6	415682	415687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_018015	TCT	2	6	415706	415711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_018015	GA	3	6	415744	415749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_018015	AG	3	6	415760	415765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_018015	GAA	2	6	415773	415778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_018015	CCG	2	6	415787	415792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8538	NC_018015	TAT	2	6	415818	415823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_018015	GAG	2	6	415833	415838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_018015	TAA	2	6	415940	415945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_018015	ATT	2	6	415953	415958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_018015	A	6	6	415992	415997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_018015	AAG	2	6	416003	416008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_018015	AC	3	6	416042	416047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8545	NC_018015	TAA	2	6	416051	416056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_018015	TCATT	2	10	416096	416105	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8547	NC_018015	ATT	2	6	416293	416298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_018015	AAG	2	6	416318	416323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_018015	AAT	2	6	416324	416329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_018015	CTC	2	6	416350	416355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960616
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8552	NC_018015	CGC	2	6	416594	416599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960616
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8554	NC_018015	GAA	2	6	416634	416639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960616
8555	NC_018015	CCT	2	6	416681	416686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960616
8556	NC_018015	CCT	3	9	416798	416806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960616
8557	NC_018015	CTCA	2	8	416907	416914	25 %	25 %	0 %	50 %	390960616
8558	NC_018015	GAG	2	6	416961	416966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960616
8559	NC_018015	CTC	2	6	416982	416987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960616
8560	NC_018015	TCCT	2	8	417022	417029	0 %	50 %	0 %	50 %	390960616
8561	NC_018015	TCGC	2	8	417061	417068	0 %	25 %	25 %	50 %	390960616
8562	NC_018015	GAA	2	6	417069	417074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960616
8563	NC_018015	GGAGC	2	10	417153	417162	20 %	0 %	60 %	20 %	390960616
8564	NC_018015	ACG	2	6	417169	417174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960616
8565	NC_018015	TCGTAG	2	12	417214	417225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390960616
8566	NC_018015	GTA	2	6	417255	417260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960616
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8570	NC_018015	TCA	2	6	417516	417521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_018015	TTCC	2	8	417554	417561	0 %	50 %	0 %	50 %	390960617
8572	NC_018015	T	6	6	417579	417584	0 %	100 %	0 %	0 %	390960617
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8576	NC_018015	GCCT	2	8	417794	417801	0 %	25 %	25 %	50 %	390960617
8577	NC_018015	CCT	3	9	417799	417807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960617
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8579	NC_018015	CTCC	2	8	417874	417881	0 %	25 %	0 %	75 %	390960617
8580	NC_018015	CGC	2	6	418070	418075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960617
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8582	NC_018015	GAG	2	6	418162	418167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960617
8583	NC_018015	ATG	2	6	418172	418177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960617
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8585	NC_018015	ACG	2	6	418244	418249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960617
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8587	NC_018015	GTG	2	6	418323	418328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960617
8588	NC_018015	CTCG	2	8	418333	418340	0 %	25 %	25 %	50 %	390960617
8589	NC_018015	TCC	2	6	418431	418436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960617
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8592	NC_018015	TCC	2	6	418520	418525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960617
8593	NC_018015	CGA	2	6	418614	418619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960617
8594	NC_018015	CGG	2	6	418627	418632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960617
8595	NC_018015	GGA	2	6	418633	418638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960617
8596	NC_018015	A	6	6	418825	418830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_018015	TAGCC	2	10	418880	418889	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8598	NC_018015	AGGCG	2	10	418995	419004	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8599	NC_018015	TCCCGG	2	12	419038	419049	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8600	NC_018015	TTGC	2	8	419260	419267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8601	NC_018015	AGCT	2	8	419272	419279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8602	NC_018015	GTG	2	6	419290	419295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_018015	GGT	2	6	419395	419400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_018015	GAT	2	6	419404	419409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960618
8605	NC_018015	AAGGGT	2	12	419410	419421	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	390960618
8606	NC_018015	AG	3	6	419437	419442	50 %	0 %	50 %	0 %	390960618
8607	NC_018015	GGA	2	6	419545	419550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960618
8608	NC_018015	CCT	2	6	419609	419614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8609	NC_018015	ACGT	2	8	419849	419856	25 %	25 %	25 %	25 %	390960619
8610	NC_018015	GAA	3	9	419866	419874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960619
8611	NC_018015	CCT	2	6	420032	420037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960620
8612	NC_018015	CTC	2	6	420180	420185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960620
8613	NC_018015	TCG	2	6	420221	420226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960620
8614	NC_018015	CTC	2	6	420271	420276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960620
8615	NC_018015	CCT	2	6	420404	420409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960620
8616	NC_018015	GTA	2	6	420432	420437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960620
8617	NC_018015	TCG	2	6	420568	420573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960620
8618	NC_018015	TGA	2	6	420575	420580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960620
8619	NC_018015	TCT	3	9	420626	420634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960620
8620	NC_018015	AG	3	6	420638	420643	50 %	0 %	50 %	0 %	390960620
8621	NC_018015	GGTTG	2	10	420648	420657	0 %	40 %	60 %	0 %	390960620
8622	NC_018015	TCT	2	6	420698	420703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960620
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8624	NC_018015	TCC	2	6	420768	420773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960620
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8993	NC_018015	CCT	2	6	439849	439854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8994	NC_018015	CCT	2	6	439870	439875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8995	NC_018015	GA	3	6	439999	440004	50 %	0 %	50 %	0 %	390960645
8996	NC_018015	GTC	2	6	440095	440100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960645
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