MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_018015	GCC	2	6	365448	365453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960569
7502	NC_018015	ACC	2	6	365609	365614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960570
7503	NC_018015	ACGCC	2	10	365749	365758	20 %	0 %	20 %	60 %	390960570
7504	NC_018015	GAG	2	6	365789	365794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960570
7505	NC_018015	GAG	2	6	365810	365815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960570
7506	NC_018015	GTC	2	6	365894	365899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960570
7507	NC_018015	GTC	2	6	365927	365932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960570
7508	NC_018015	TTG	2	6	366053	366058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960571
7509	NC_018015	GAGG	2	8	366070	366077	25 %	0 %	75 %	0 %	390960571
7510	NC_018015	TGA	2	6	366147	366152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960571
7511	NC_018015	ATC	2	6	366202	366207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960571
7512	NC_018015	GAA	3	9	366219	366227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960571
7513	NC_018015	CCG	2	6	366253	366258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960571
7514	NC_018015	CAGC	2	8	366261	366268	25 %	0 %	25 %	50 %	390960571
7515	NC_018015	TCA	2	6	366269	366274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960571
7516	NC_018015	TCA	2	6	366350	366355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960571
7517	NC_018015	AGG	2	6	366413	366418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960571
7518	NC_018015	ACG	2	6	366503	366508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960571
7519	NC_018015	GAG	2	6	366526	366531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960571
7520	NC_018015	AGGG	2	8	366601	366608	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_018015	AGG	2	6	366652	366657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960572
7522	NC_018015	CA	3	6	366686	366691	50 %	0 %	0 %	50 %	390960572
7523	NC_018015	TGC	2	6	366766	366771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960572
7524	NC_018015	GGC	2	6	366830	366835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960572
7525	NC_018015	AGC	2	6	366868	366873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960572
7526	NC_018015	AGGC	2	8	366897	366904	25 %	0 %	50 %	25 %	390960572
7527	NC_018015	GAA	2	6	366917	366922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960572
7528	NC_018015	GGTA	2	8	366966	366973	25 %	25 %	50 %	0 %	390960572
7529	NC_018015	GGTA	2	8	366978	366985	25 %	25 %	50 %	0 %	390960572
7530	NC_018015	CCG	2	6	367020	367025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960572
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7532	NC_018015	AAC	2	6	367089	367094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960572
7533	NC_018015	CGT	2	6	367097	367102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960572
7534	NC_018015	CAA	2	6	367181	367186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960572
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7536	NC_018015	GAA	3	9	367291	367299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960573
7537	NC_018015	ATC	2	6	367322	367327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960573
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7540	NC_018015	GCC	2	6	367466	367471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960573
7541	NC_018015	CAA	2	6	367480	367485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960573
7542	NC_018015	CTC	2	6	367571	367576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960573
7543	NC_018015	GAG	2	6	367577	367582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960573
7544	NC_018015	CCCCGG	2	12	367590	367601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960573
7545	NC_018015	GGT	2	6	367615	367620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960573
7546	NC_018015	CGT	2	6	367630	367635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960573
7547	NC_018015	TCG	2	6	367674	367679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960573
7548	NC_018015	GGTC	2	8	367825	367832	0 %	25 %	50 %	25 %	390960573
7549	NC_018015	CGA	2	6	367891	367896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960573
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7551	NC_018015	CAG	2	6	367919	367924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960573
7552	NC_018015	CCAG	2	8	367971	367978	25 %	0 %	25 %	50 %	390960573
7553	NC_018015	GAA	2	6	368017	368022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960573
7554	NC_018015	GGCT	2	8	368035	368042	0 %	25 %	50 %	25 %	390960573
7555	NC_018015	GC	3	6	368086	368091	0 %	0 %	50 %	50 %	390960573
7556	NC_018015	GAG	2	6	368120	368125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960573
7557	NC_018015	CTCAGC	2	12	368184	368195	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390960573
7558	NC_018015	GAG	2	6	368210	368215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960573
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7561	NC_018015	GAG	2	6	368249	368254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960573
7562	NC_018015	GC	3	6	368274	368279	0 %	0 %	50 %	50 %	390960573
7563	NC_018015	AAC	2	6	368316	368321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7564	NC_018015	ATGA	2	8	368331	368338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_018015	GAT	2	6	368347	368352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7570	NC_018015	CGA	2	6	368516	368521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960574
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7577	NC_018015	AAGAGG	2	12	368623	368634	50 %	0 %	50 %	0 %	390960574
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7588	NC_018015	CTA	2	6	369394	369399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7591	NC_018015	TCA	2	6	369651	369656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7594	NC_018015	CATA	2	8	369811	369818	50 %	25 %	0 %	25 %	390960576
7595	NC_018015	CGA	2	6	369914	369919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960576
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7599	NC_018015	TGGG	2	8	370308	370315	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_018015	CT	3	6	370417	370422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7601	NC_018015	TA	3	6	370457	370462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_018015	A	9	9	370474	370482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_018015	GAA	2	6	370487	370492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7608	NC_018015	GGCCC	2	10	370918	370927	0 %	0 %	40 %	60 %	390960578
7609	NC_018015	GGT	2	6	370930	370935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960578
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7988	NC_018015	CAG	2	6	388645	388650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960591
7989	NC_018015	GCC	2	6	388660	388665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960591
7990	NC_018015	GAA	2	6	388759	388764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960591
7991	NC_018015	GAT	2	6	389044	389049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960591
7992	NC_018015	GAA	2	6	389059	389064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960591
7993	NC_018015	TA	3	6	389126	389131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7994	NC_018015	AC	3	6	389271	389276	50 %	0 %	0 %	50 %	390960592
7995	NC_018015	CGGA	2	8	389307	389314	25 %	0 %	50 %	25 %	390960592
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7999	NC_018015	TCC	2	6	389588	389593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960592
8000	NC_018015	GAT	2	6	389594	389599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960592

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