MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_018015	CGT	2	6	342056	342061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960549
7002	NC_018015	TCG	3	9	342070	342078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960549
7003	NC_018015	ACT	2	6	342085	342090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960549
7004	NC_018015	TCG	2	6	342127	342132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960549
7005	NC_018015	TCC	2	6	342246	342251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960550
7006	NC_018015	ACG	2	6	342279	342284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960550
7007	NC_018015	GAG	2	6	342329	342334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960550
7008	NC_018015	CG	3	6	342342	342347	0 %	0 %	50 %	50 %	390960550
7009	NC_018015	CTTT	2	8	342356	342363	0 %	75 %	0 %	25 %	390960550
7010	NC_018015	TCC	2	6	342375	342380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960550
7011	NC_018015	TC	3	6	342448	342453	0 %	50 %	0 %	50 %	390960550
7012	NC_018015	GA	3	6	342491	342496	50 %	0 %	50 %	0 %	390960550
7013	NC_018015	CACC	2	8	342520	342527	25 %	0 %	0 %	75 %	390960550
7014	NC_018015	CGA	2	6	342538	342543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960550
7015	NC_018015	GAG	2	6	342548	342553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960550
7016	NC_018015	G	6	6	342578	342583	0 %	0 %	100 %	0 %	390960550
7017	NC_018015	CGAG	2	8	342643	342650	25 %	0 %	50 %	25 %	390960550
7018	NC_018015	GAA	2	6	342678	342683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960550
7019	NC_018015	TTA	2	6	342750	342755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960550
7020	NC_018015	GA	3	6	342776	342781	50 %	0 %	50 %	0 %	390960550
7021	NC_018015	GGA	2	6	342787	342792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960550
7022	NC_018015	TCT	2	6	342811	342816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960550
7023	NC_018015	ATC	2	6	342828	342833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960550
7024	NC_018015	TCT	2	6	342862	342867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960550
7025	NC_018015	CGG	2	6	342882	342887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960550
7026	NC_018015	GGA	2	6	342904	342909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960550
7027	NC_018015	GGC	2	6	342931	342936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960550
7028	NC_018015	CCT	3	9	342955	342963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960550
7029	NC_018015	CCT	2	6	343000	343005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960550
7030	NC_018015	TCG	2	6	343134	343139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960550
7031	NC_018015	CTC	2	6	343153	343158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960550
7032	NC_018015	ACG	2	6	343241	343246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960550
7033	NC_018015	CTT	2	6	343267	343272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960550
7034	NC_018015	CTT	2	6	343282	343287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960550
7035	NC_018015	GCTC	2	8	343314	343321	0 %	25 %	25 %	50 %	390960550
7036	NC_018015	CCG	2	6	343493	343498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960550
7037	NC_018015	GAG	2	6	343499	343504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960550
7038	NC_018015	CGT	2	6	343534	343539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960550
7039	NC_018015	GGAC	2	8	343591	343598	25 %	0 %	50 %	25 %	390960550
7040	NC_018015	TGG	2	6	343605	343610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960550
7041	NC_018015	CTC	2	6	343676	343681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960550
7042	NC_018015	GAG	2	6	343709	343714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960550
7043	NC_018015	GGT	2	6	343771	343776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960550
7044	NC_018015	TCGA	2	8	343784	343791	25 %	25 %	25 %	25 %	390960550
7045	NC_018015	AGG	2	6	343865	343870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960550
7046	NC_018015	ACCC	2	8	343935	343942	25 %	0 %	0 %	75 %	390960550
7047	NC_018015	GTC	2	6	343946	343951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960550
7048	NC_018015	AGG	2	6	343952	343957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960550
7049	NC_018015	GCT	2	6	343966	343971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960550
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7051	NC_018015	GAG	2	6	344119	344124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960550
7052	NC_018015	GCT	2	6	344206	344211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960550
7053	NC_018015	GCTCA	2	10	344299	344308	20 %	20 %	20 %	40 %	390960550
7054	NC_018015	CAT	2	6	344326	344331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960550
7055	NC_018015	GA	3	6	344371	344376	50 %	0 %	50 %	0 %	390960550
7056	NC_018015	CGA	2	6	344478	344483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960551
7057	NC_018015	CTC	2	6	344485	344490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960551
7058	NC_018015	CCA	2	6	344528	344533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960551
7059	NC_018015	TCC	2	6	344600	344605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960551
7060	NC_018015	GAG	2	6	344626	344631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960551
7061	NC_018015	CTA	2	6	344748	344753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960551
7062	NC_018015	GAAG	2	8	344823	344830	50 %	0 %	50 %	0 %	390960551
7063	NC_018015	AG	3	6	344845	344850	50 %	0 %	50 %	0 %	390960551
7064	NC_018015	GCG	2	6	344863	344868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960551
7065	NC_018015	AGA	2	6	344871	344876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960551
7066	NC_018015	TCCC	2	8	344893	344900	0 %	25 %	0 %	75 %	390960551
7067	NC_018015	CCG	2	6	344905	344910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960551
7068	NC_018015	AAG	2	6	344926	344931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960551
7069	NC_018015	CTA	2	6	344946	344951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960551
7070	NC_018015	CTG	2	6	344958	344963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960551
7071	NC_018015	GGT	2	6	344971	344976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_018015	GGACG	2	10	345009	345018	20 %	0 %	60 %	20 %	390960552
7073	NC_018015	TCTACG	2	12	345098	345109	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390960552
7074	NC_018015	CACTT	2	10	345134	345143	20 %	40 %	0 %	40 %	390960552
7075	NC_018015	CTT	2	6	345171	345176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960552
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7079	NC_018015	GC	3	6	345314	345319	0 %	0 %	50 %	50 %	390960552
7080	NC_018015	GGA	2	6	345378	345383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960552
7081	NC_018015	TAC	2	6	345457	345462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960552
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7089	NC_018015	CTG	2	6	345775	345780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960552
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7093	NC_018015	TGG	2	6	345944	345949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960552
7094	NC_018015	GGA	2	6	345982	345987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960553
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7098	NC_018015	GTC	2	6	346295	346300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960553
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7101	NC_018015	GTG	2	6	346397	346402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960553
7102	NC_018015	A	7	7	346518	346524	100 %	0 %	0 %	0 %	390960553
7103	NC_018015	TGA	2	6	346537	346542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960553
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7106	NC_018015	AAG	2	6	346558	346563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960553
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7117	NC_018015	AT	3	6	347104	347109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_018015	GAG	2	6	347184	347189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_018015	CGC	2	6	347485	347490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7120	NC_018015	GTC	2	6	347498	347503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_018015	AGG	3	9	347541	347549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7123	NC_018015	AC	4	8	347608	347615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7350	NC_018015	TAT	2	6	358972	358977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7356	NC_018015	CGA	2	6	359268	359273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960564
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7371	NC_018015	TGA	2	6	359859	359864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960564
7372	NC_018015	GGC	2	6	359929	359934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960564
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7490	NC_018015	CAG	2	6	365102	365107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960568
7491	NC_018015	ATA	2	6	365108	365113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960568
7492	NC_018015	CGA	2	6	365170	365175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960568
7493	NC_018015	GAT	2	6	365188	365193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960568
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