MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_018015	CT	3	6	317888	317893	0 %	50 %	0 %	50 %	390960525
6502	NC_018015	CGA	2	6	317935	317940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960525
6503	NC_018015	CTCG	2	8	317987	317994	0 %	25 %	25 %	50 %	390960525
6504	NC_018015	CTT	2	6	318053	318058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960525
6505	NC_018015	CTC	2	6	318107	318112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960525
6506	NC_018015	TC	3	6	318118	318123	0 %	50 %	0 %	50 %	390960525
6507	NC_018015	TCG	2	6	318178	318183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960525
6508	NC_018015	CTT	2	6	318212	318217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960525
6509	NC_018015	GCTC	2	8	318220	318227	0 %	25 %	25 %	50 %	390960525
6510	NC_018015	CTC	2	6	318239	318244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960525
6511	NC_018015	GCC	2	6	318354	318359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960525
6512	NC_018015	TC	3	6	318509	318514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_018015	GAAG	2	8	318527	318534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_018015	TCG	2	6	318592	318597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960526
6515	NC_018015	GAA	2	6	318617	318622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960526
6516	NC_018015	CTCC	2	8	318686	318693	0 %	25 %	0 %	75 %	390960526
6517	NC_018015	CCG	2	6	318696	318701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960526
6518	NC_018015	TCC	2	6	318753	318758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960526
6519	NC_018015	ACG	2	6	318939	318944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960526
6520	NC_018015	CGA	2	6	318949	318954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960526
6521	NC_018015	CTC	2	6	318974	318979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960526
6522	NC_018015	TGAA	2	8	319026	319033	50 %	25 %	25 %	0 %	390960526
6523	NC_018015	CGGGAG	2	12	319046	319057	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	390960526
6524	NC_018015	GA	3	6	319059	319064	50 %	0 %	50 %	0 %	390960526
6525	NC_018015	T	7	7	319087	319093	0 %	100 %	0 %	0 %	390960526
6526	NC_018015	CTC	2	6	319139	319144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960526
6527	NC_018015	TCG	2	6	319191	319196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960526
6528	NC_018015	CGC	2	6	319235	319240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960526
6529	NC_018015	GGA	3	9	319258	319266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960526
6530	NC_018015	GGT	2	6	319279	319284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960526
6531	NC_018015	CAC	2	6	319286	319291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960526
6532	NC_018015	TC	4	8	319295	319302	0 %	50 %	0 %	50 %	390960526
6533	NC_018015	AGT	2	6	319321	319326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960526
6534	NC_018015	C	6	6	319335	319340	0 %	0 %	0 %	100 %	390960526
6535	NC_018015	TGA	2	6	319444	319449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960526
6536	NC_018015	CTT	2	6	319649	319654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960526
6537	NC_018015	GAG	2	6	319655	319660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960526
6538	NC_018015	CCGC	2	8	319742	319749	0 %	0 %	25 %	75 %	390960526
6539	NC_018015	GAA	2	6	319787	319792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960526
6540	NC_018015	TC	3	6	319807	319812	0 %	50 %	0 %	50 %	390960526
6541	NC_018015	CAG	2	6	319844	319849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960527
6542	NC_018015	TCC	2	6	319851	319856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960527
6543	NC_018015	GGACCG	2	12	319857	319868	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	390960527
6544	NC_018015	CGG	2	6	319892	319897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960527
6545	NC_018015	CTC	2	6	319976	319981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960527
6546	NC_018015	CAC	2	6	319997	320002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960527
6547	NC_018015	CTT	2	6	320006	320011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960527
6548	NC_018015	TTC	2	6	320265	320270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960528
6549	NC_018015	CTT	2	6	320277	320282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960528
6550	NC_018015	TCC	2	6	320289	320294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960528
6551	NC_018015	CTT	2	6	320307	320312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960528
6552	NC_018015	TCC	2	6	320367	320372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960528
6553	NC_018015	CAG	2	6	320388	320393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960528
6554	NC_018015	CTCTT	2	10	320425	320434	0 %	60 %	0 %	40 %	390960528
6555	NC_018015	GTA	2	6	320445	320450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960528
6556	NC_018015	CCT	3	9	320558	320566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960528
6557	NC_018015	CGG	2	6	320577	320582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960528
6558	NC_018015	CCG	2	6	320629	320634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960528
6559	NC_018015	TTC	2	6	320797	320802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960528
6560	NC_018015	AACTT	2	10	320845	320854	40 %	40 %	0 %	20 %	390960528
6561	NC_018015	TCA	2	6	320860	320865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960528
6562	NC_018015	TGG	2	6	320927	320932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960528
6563	NC_018015	TCT	2	6	320981	320986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960528
6564	NC_018015	GTC	2	6	321006	321011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960528
6565	NC_018015	ACG	2	6	321022	321027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960528
6566	NC_018015	TGG	2	6	321056	321061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960528
6567	NC_018015	TGA	2	6	321137	321142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960528
6568	NC_018015	CGGCG	2	10	321162	321171	0 %	0 %	60 %	40 %	390960528
6569	NC_018015	CGT	2	6	321179	321184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960528
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6571	NC_018015	GTC	2	6	321234	321239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960528
6572	NC_018015	ATCG	2	8	321264	321271	25 %	25 %	25 %	25 %	390960528
6573	NC_018015	GTA	2	6	321507	321512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960528
6574	NC_018015	GTG	2	6	321514	321519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960528
6575	NC_018015	TCC	2	6	321583	321588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960528
6576	NC_018015	GCG	2	6	321590	321595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960528
6577	NC_018015	CGG	2	6	321600	321605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960528
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6580	NC_018015	TTTATC	2	12	321853	321864	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390960528
6581	NC_018015	GGTAA	2	10	321880	321889	40 %	20 %	40 %	0 %	390960528
6582	NC_018015	GA	3	6	321919	321924	50 %	0 %	50 %	0 %	390960528
6583	NC_018015	TCT	2	6	321926	321931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960528
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6585	NC_018015	GACT	2	8	321957	321964	25 %	25 %	25 %	25 %	390960528
6586	NC_018015	GTATC	2	10	321967	321976	20 %	40 %	20 %	20 %	390960528
6587	NC_018015	AGG	2	6	322027	322032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960528
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6589	NC_018015	AGT	2	6	322307	322312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_018015	AAAAGG	2	12	322325	322336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_018015	GCG	2	6	322460	322465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960529
6592	NC_018015	CGA	2	6	322538	322543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960529
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6594	NC_018015	TA	3	6	322647	322652	50 %	50 %	0 %	0 %	390960529
6595	NC_018015	CTCG	2	8	322665	322672	0 %	25 %	25 %	50 %	390960529
6596	NC_018015	CGTTCT	2	12	322700	322711	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390960529
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6604	NC_018015	TGT	2	6	323009	323014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960529
6605	NC_018015	CTC	2	6	323016	323021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960529
6606	NC_018015	CAT	2	6	323070	323075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960529
6607	NC_018015	GAA	2	6	323214	323219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960529
6608	NC_018015	CTG	2	6	323368	323373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960529
6609	NC_018015	CTT	3	9	323505	323513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960529
6610	NC_018015	TCCCTG	2	12	323539	323550	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390960529
6611	NC_018015	CTC	2	6	323628	323633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960529
6612	NC_018015	AGT	2	6	323648	323653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960529
6613	NC_018015	ATAC	2	8	323661	323668	50 %	25 %	0 %	25 %	390960529
6614	NC_018015	GA	3	6	323697	323702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_018015	CTT	2	6	323790	323795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960530
6616	NC_018015	GTA	2	6	323823	323828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960530
6617	NC_018015	CCG	2	6	323873	323878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960530
6618	NC_018015	AGG	2	6	323884	323889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960530
6619	NC_018015	CTT	2	6	323901	323906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960530
6620	NC_018015	CAA	2	6	324029	324034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960530
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6622	NC_018015	GTC	2	6	324183	324188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960530
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6990	NC_018015	AGG	2	6	341421	341426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960548
6991	NC_018015	AAG	2	6	341520	341525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960548
6992	NC_018015	CTA	2	6	341593	341598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960548
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