MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018015	TGG	2	6	292780	292785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960497
6002	NC_018015	GAG	2	6	292827	292832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960497
6003	NC_018015	TTAT	2	8	292858	292865	25 %	75 %	0 %	0 %	390960497
6004	NC_018015	CCT	2	6	292910	292915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960497
6005	NC_018015	GAG	2	6	292977	292982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_018015	GGA	2	6	293108	293113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960498
6007	NC_018015	GCC	2	6	293178	293183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960498
6008	NC_018015	GAA	2	6	293271	293276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960498
6009	NC_018015	TTA	2	6	293331	293336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960498
6010	NC_018015	TCC	2	6	293353	293358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960498
6011	NC_018015	CGA	2	6	293360	293365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960498
6012	NC_018015	GA	3	6	293364	293369	50 %	0 %	50 %	0 %	390960498
6013	NC_018015	GC	3	6	293398	293403	0 %	0 %	50 %	50 %	390960498
6014	NC_018015	GCC	2	6	293449	293454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960499
6015	NC_018015	TCA	2	6	293648	293653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960499
6016	NC_018015	ACG	2	6	293675	293680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960499
6017	NC_018015	TAC	2	6	293698	293703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960499
6018	NC_018015	CTT	2	6	293712	293717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960499
6019	NC_018015	CTC	2	6	293725	293730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960499
6020	NC_018015	CT	3	6	293750	293755	0 %	50 %	0 %	50 %	390960499
6021	NC_018015	GAG	2	6	293800	293805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960499
6022	NC_018015	GAG	2	6	293908	293913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960499
6023	NC_018015	GGA	2	6	293975	293980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960499
6024	NC_018015	GGCT	2	8	294001	294008	0 %	25 %	50 %	25 %	390960499
6025	NC_018015	CGG	2	6	294075	294080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960499
6026	NC_018015	CTGG	2	8	294147	294154	0 %	25 %	50 %	25 %	390960499
6027	NC_018015	CGG	2	6	294194	294199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960499
6028	NC_018015	C	6	6	294233	294238	0 %	0 %	0 %	100 %	390960499
6029	NC_018015	CCT	2	6	294249	294254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960499
6030	NC_018015	TCG	2	6	294305	294310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960499
6031	NC_018015	ATA	2	6	294349	294354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960499
6032	NC_018015	CTC	2	6	294376	294381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960499
6033	NC_018015	GGA	2	6	294393	294398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960499
6034	NC_018015	GAA	2	6	294402	294407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960499
6035	NC_018015	TGA	2	6	294439	294444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960500
6036	NC_018015	GCC	2	6	294447	294452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960500
6037	NC_018015	CGT	2	6	294481	294486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960500
6038	NC_018015	TC	3	6	294551	294556	0 %	50 %	0 %	50 %	390960500
6039	NC_018015	ATGA	2	8	294588	294595	50 %	25 %	25 %	0 %	390960500
6040	NC_018015	CGG	2	6	294683	294688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960500
6041	NC_018015	GGA	2	6	294700	294705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960500
6042	NC_018015	GAG	2	6	294773	294778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960500
6043	NC_018015	CGT	2	6	294901	294906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960500
6044	NC_018015	GTG	2	6	294957	294962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960500
6045	NC_018015	CT	3	6	295018	295023	0 %	50 %	0 %	50 %	390960500
6046	NC_018015	CCT	3	9	295027	295035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960500
6047	NC_018015	TCG	2	6	295143	295148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960500
6048	NC_018015	TGA	2	6	295189	295194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960500
6049	NC_018015	ATT	2	6	295200	295205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960500
6050	NC_018015	GAG	2	6	295350	295355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960501
6051	NC_018015	TTA	2	6	295463	295468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960501
6052	NC_018015	TTG	2	6	295490	295495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960501
6053	NC_018015	CGT	2	6	295520	295525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960501
6054	NC_018015	GTG	2	6	295550	295555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_018015	GTG	2	6	295629	295634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_018015	GAG	2	6	295655	295660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960502
6057	NC_018015	GCC	2	6	295686	295691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960502
6058	NC_018015	GCG	2	6	295700	295705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960502
6059	NC_018015	ATC	2	6	295752	295757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960502
6060	NC_018015	GGAG	2	8	295784	295791	25 %	0 %	75 %	0 %	390960502
6061	NC_018015	AAC	2	6	295953	295958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960502
6062	NC_018015	CGG	2	6	296009	296014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960502
6063	NC_018015	CGG	2	6	296057	296062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960502
6064	NC_018015	TCC	2	6	296078	296083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960502
6065	NC_018015	CTG	2	6	296124	296129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960502
6066	NC_018015	ATT	2	6	296130	296135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960502
6067	NC_018015	CGA	2	6	296156	296161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960502
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6069	NC_018015	CCT	2	6	296243	296248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960502
6070	NC_018015	GGA	2	6	296354	296359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960502
6071	NC_018015	ACGGCC	2	12	296398	296409	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390960502
6072	NC_018015	TCC	2	6	296443	296448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960502
6073	NC_018015	AAC	2	6	296535	296540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960502
6074	NC_018015	GTGG	2	8	296595	296602	0 %	25 %	75 %	0 %	390960502
6075	NC_018015	TCA	2	6	296624	296629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960503
6076	NC_018015	CGA	2	6	296646	296651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960503
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6078	NC_018015	TCA	2	6	296786	296791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960503
6079	NC_018015	TGG	3	9	296848	296856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960503
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6081	NC_018015	AACC	2	8	296937	296944	50 %	0 %	0 %	50 %	390960503
6082	NC_018015	ACT	3	9	297026	297034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960503
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6086	NC_018015	GGA	2	6	297264	297269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960503
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6088	NC_018015	GGA	2	6	297369	297374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960503
6089	NC_018015	C	6	6	297404	297409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6090	NC_018015	G	6	6	297498	297503	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_018015	TGT	2	6	297544	297549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_018015	G	6	6	297562	297567	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_018015	TGA	2	6	297646	297651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960504
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6095	NC_018015	TCA	2	6	297733	297738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960504
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6101	NC_018015	CTGG	2	8	297956	297963	0 %	25 %	50 %	25 %	390960504
6102	NC_018015	C	6	6	297967	297972	0 %	0 %	0 %	100 %	390960504
6103	NC_018015	CGG	2	6	297974	297979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960504
6104	NC_018015	ACTC	2	8	297994	298001	25 %	25 %	0 %	50 %	390960504
6105	NC_018015	ATG	2	6	298029	298034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960504
6106	NC_018015	CCA	2	6	298063	298068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960504
6107	NC_018015	TCC	2	6	298077	298082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960504
6108	NC_018015	GTG	2	6	298107	298112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960504
6109	NC_018015	TCT	2	6	298120	298125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960504
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6111	NC_018015	ATA	2	6	298173	298178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960504
6112	NC_018015	ACC	2	6	298183	298188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960504
6113	NC_018015	CCA	2	6	298285	298290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960504
6114	NC_018015	TCC	2	6	298423	298428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960504
6115	NC_018015	TGAAG	2	10	298516	298525	40 %	20 %	40 %	0 %	390960505
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6118	NC_018015	GGC	2	6	298652	298657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960505
6119	NC_018015	AGA	2	6	298689	298694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960505
6120	NC_018015	CACGC	2	10	298715	298724	20 %	0 %	20 %	60 %	390960505
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6122	NC_018015	CTC	2	6	298817	298822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960505
6123	NC_018015	TTG	2	6	298827	298832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960505
6124	NC_018015	GAAG	2	8	298837	298844	50 %	0 %	50 %	0 %	390960505
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6128	NC_018015	TTC	2	6	299027	299032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960505
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6135	NC_018015	TGG	2	6	299432	299437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_018015	TGG	2	6	299476	299481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960506
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6220	NC_018015	A	7	7	303594	303600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6232	NC_018015	CAT	2	6	304514	304519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960510
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6238	NC_018015	GGT	2	6	304784	304789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960510
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6242	NC_018015	GTA	2	6	304850	304855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960510
6243	NC_018015	TGA	2	6	304867	304872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960510
6244	NC_018015	CTC	2	6	304928	304933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960510
6245	NC_018015	CGG	2	6	304969	304974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960510
6246	NC_018015	GTA	2	6	304979	304984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960510
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6251	NC_018015	CCT	2	6	305095	305100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960510
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6253	NC_018015	CGT	2	6	305335	305340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960510
6254	NC_018015	TCC	2	6	305370	305375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960510
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6359	NC_018015	CTTT	2	8	310846	310853	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6360	NC_018015	GAG	2	6	310927	310932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6361	NC_018015	GAG	2	6	310960	310965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6362	NC_018015	AGT	2	6	310991	310996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6363	NC_018015	CCT	2	6	311035	311040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6364	NC_018015	CCG	2	6	311043	311048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6365	NC_018015	TCA	2	6	311106	311111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960517
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6367	NC_018015	CTG	2	6	311336	311341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960518
6368	NC_018015	GAT	2	6	311371	311376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960518
6369	NC_018015	TGA	2	6	311388	311393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960518
6370	NC_018015	TCC	2	6	311397	311402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960518
6371	NC_018015	CGA	2	6	311430	311435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960518
6372	NC_018015	CTT	2	6	311452	311457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960518
6373	NC_018015	ACC	2	6	311464	311469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960518
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6375	NC_018015	TCT	3	9	311538	311546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960518
6376	NC_018015	CTCTTC	2	12	311597	311608	0 %	50 %	0 %	50 %	390960518
6377	NC_018015	CTT	2	6	311641	311646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960518
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6379	NC_018015	A	6	6	311763	311768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6380	NC_018015	GTG	2	6	311800	311805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6381	NC_018015	TGG	2	6	311848	311853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960519
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6384	NC_018015	CTG	2	6	311919	311924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960519
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6388	NC_018015	CTC	2	6	312117	312122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960519
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6391	NC_018015	CTC	2	6	312315	312320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960519
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6395	NC_018015	TGGG	2	8	312465	312472	0 %	25 %	75 %	0 %	390960519
6396	NC_018015	CTC	2	6	312561	312566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960519
6397	NC_018015	TGA	2	6	312586	312591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960519
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6402	NC_018015	GCGGTG	2	12	312911	312922	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	390960520
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6404	NC_018015	CGA	2	6	313051	313056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960520
6405	NC_018015	GCGTA	2	10	313188	313197	20 %	20 %	40 %	20 %	390960520
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6415	NC_018015	TCG	2	6	313593	313598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960520
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6437	NC_018015	TTGA	2	8	314317	314324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6438	NC_018015	CA	3	6	314374	314379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6439	NC_018015	AAG	3	9	314517	314525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6440	NC_018015	CTC	2	6	314548	314553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960521
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6443	NC_018015	CTCG	2	8	314863	314870	0 %	25 %	25 %	50 %	390960521
6444	NC_018015	GTC	2	6	314957	314962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960522
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6452	NC_018015	TTC	2	6	315336	315341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6453	NC_018015	GAA	2	6	315488	315493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6454	NC_018015	TGA	2	6	315505	315510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6455	NC_018015	TGG	2	6	315536	315541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6456	NC_018015	GCCCA	2	10	315610	315619	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6457	NC_018015	TGG	2	6	315625	315630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6458	NC_018015	CCGG	2	8	315632	315639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6459	NC_018015	GGC	2	6	315670	315675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6460	NC_018015	G	7	7	315732	315738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6461	NC_018015	GAG	3	9	315912	315920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960523
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6467	NC_018015	ATA	2	6	316158	316163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960523
6468	NC_018015	GAG	2	6	316176	316181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960523
6469	NC_018015	CGG	2	6	316213	316218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960523
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6473	NC_018015	CGG	2	6	316516	316521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960523
6474	NC_018015	TTC	2	6	316584	316589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960523
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6483	NC_018015	GGA	2	6	317034	317039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960524
6484	NC_018015	GCCC	2	8	317072	317079	0 %	0 %	25 %	75 %	390960524
6485	NC_018015	TCC	2	6	317103	317108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960524
6486	NC_018015	CCCT	2	8	317129	317136	0 %	25 %	0 %	75 %	390960524
6487	NC_018015	GTA	2	6	317158	317163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960524
6488	NC_018015	TGT	2	6	317211	317216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960524
6489	NC_018015	GAA	2	6	317230	317235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960524
6490	NC_018015	TCCG	2	8	317312	317319	0 %	25 %	25 %	50 %	390960524
6491	NC_018015	TCG	2	6	317408	317413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960524
6492	NC_018015	CGA	2	6	317460	317465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960524
6493	NC_018015	CTC	2	6	317563	317568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960524
6494	NC_018015	GTC	2	6	317632	317637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960524
6495	NC_018015	GAG	2	6	317638	317643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960524
6496	NC_018015	GTT	2	6	317647	317652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960524
6497	NC_018015	TC	3	6	317730	317735	0 %	50 %	0 %	50 %	390960524
6498	NC_018015	CGG	2	6	317736	317741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960524
6499	NC_018015	CAA	2	6	317751	317756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960524
6500	NC_018015	CCG	2	6	317850	317855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960525

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