MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018015	GTC	2	6	267457	267462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960467
5502	NC_018015	GAG	2	6	267465	267470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960467
5503	NC_018015	GAG	2	6	267477	267482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960467
5504	NC_018015	CCT	2	6	267557	267562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960467
5505	NC_018015	CACT	2	8	267574	267581	25 %	25 %	0 %	50 %	390960467
5506	NC_018015	GAG	2	6	267585	267590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960467
5507	NC_018015	TC	3	6	267593	267598	0 %	50 %	0 %	50 %	390960467
5508	NC_018015	CCT	2	6	267720	267725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960468
5509	NC_018015	CTA	2	6	267726	267731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960468
5510	NC_018015	ATA	2	6	267778	267783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960468
5511	NC_018015	AGC	2	6	267824	267829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960468
5512	NC_018015	CAC	2	6	267886	267891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960468
5513	NC_018015	CATAG	2	10	267922	267931	40 %	20 %	20 %	20 %	390960468
5514	NC_018015	CAG	2	6	267943	267948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960468
5515	NC_018015	CGT	2	6	267993	267998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960468
5516	NC_018015	AGA	2	6	268062	268067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960468
5517	NC_018015	GAG	2	6	268084	268089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960468
5518	NC_018015	TCG	2	6	268202	268207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960468
5519	NC_018015	CCT	2	6	268308	268313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960468
5520	NC_018015	GAA	2	6	268381	268386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960468
5521	NC_018015	TCA	2	6	268388	268393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960468
5522	NC_018015	ACA	2	6	268503	268508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960469
5523	NC_018015	GTA	2	6	268598	268603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960469
5524	NC_018015	TCCT	2	8	268701	268708	0 %	50 %	0 %	50 %	390960469
5525	NC_018015	GTCT	2	8	268802	268809	0 %	50 %	25 %	25 %	390960469
5526	NC_018015	ATC	2	6	268866	268871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960469
5527	NC_018015	TCG	2	6	269020	269025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960470
5528	NC_018015	GTCGTA	2	12	269034	269045	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390960470
5529	NC_018015	CCTC	2	8	269054	269061	0 %	25 %	0 %	75 %	390960470
5530	NC_018015	CT	3	6	269113	269118	0 %	50 %	0 %	50 %	390960470
5531	NC_018015	TCG	2	6	269137	269142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960470
5532	NC_018015	CTC	2	6	269166	269171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960470
5533	NC_018015	CTC	2	6	269262	269267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960470
5534	NC_018015	GAA	2	6	269402	269407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_018015	GA	3	6	269420	269425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_018015	CTC	2	6	269462	269467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960471
5537	NC_018015	CTT	2	6	269657	269662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960471
5538	NC_018015	TCG	2	6	269670	269675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960471
5539	NC_018015	CCG	2	6	269730	269735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960471
5540	NC_018015	CGCGA	2	10	269825	269834	20 %	0 %	40 %	40 %	390960471
5541	NC_018015	CCT	3	9	269851	269859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960471
5542	NC_018015	TA	3	6	269877	269882	50 %	50 %	0 %	0 %	390960471
5543	NC_018015	GCC	2	6	269910	269915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960471
5544	NC_018015	ATC	2	6	269919	269924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960471
5545	NC_018015	GTC	2	6	269942	269947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960471
5546	NC_018015	CCT	3	9	270040	270048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960471
5547	NC_018015	T	6	6	270095	270100	0 %	100 %	0 %	0 %	390960471
5548	NC_018015	GACC	2	8	270136	270143	25 %	0 %	25 %	50 %	390960471
5549	NC_018015	GAA	2	6	270170	270175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960471
5550	NC_018015	CGC	2	6	270211	270216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960471
5551	NC_018015	GAC	2	6	270224	270229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960471
5552	NC_018015	CTT	2	6	270317	270322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960471
5553	NC_018015	GAC	2	6	270389	270394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960471
5554	NC_018015	AGC	2	6	270453	270458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960471
5555	NC_018015	CCT	2	6	270481	270486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_018015	TAA	2	6	270519	270524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_018015	CGAAA	2	10	270531	270540	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5558	NC_018015	GAC	2	6	270561	270566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5559	NC_018015	CCT	2	6	270578	270583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960472
5560	NC_018015	TCG	2	6	270647	270652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5561	NC_018015	AGT	2	6	270734	270739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960472
5562	NC_018015	TCC	2	6	270754	270759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960472
5563	NC_018015	CAG	2	6	270801	270806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5564	NC_018015	CGG	2	6	270852	270857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960472
5565	NC_018015	TGGGGT	2	12	270864	270875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960472
5566	NC_018015	GGT	2	6	270888	270893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960472
5567	NC_018015	CGG	2	6	270939	270944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960472
5568	NC_018015	GCT	2	6	270984	270989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5569	NC_018015	GCC	2	6	271039	271044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960472
5570	NC_018015	GGA	2	6	271050	271055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960472
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5572	NC_018015	CAG	2	6	271146	271151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5573	NC_018015	TCG	2	6	271285	271290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5574	NC_018015	TCG	2	6	271348	271353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5575	NC_018015	GTG	2	6	271432	271437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960472
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5577	NC_018015	TTC	2	6	271560	271565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960472
5578	NC_018015	TCC	2	6	271601	271606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960472
5579	NC_018015	TAT	2	6	271608	271613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960472
5580	NC_018015	GCG	2	6	271795	271800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960472
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5582	NC_018015	TGGAA	2	10	271951	271960	40 %	20 %	40 %	0 %	390960472
5583	NC_018015	TTA	2	6	271961	271966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960472
5584	NC_018015	GTC	2	6	271992	271997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960472
5585	NC_018015	GCG	2	6	272003	272008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960472
5586	NC_018015	AAC	2	6	272049	272054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960472
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5588	NC_018015	ACC	2	6	272132	272137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960473
5589	NC_018015	AGA	2	6	272214	272219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960473
5590	NC_018015	GTT	2	6	272230	272235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960473
5591	NC_018015	TCC	2	6	272303	272308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960473
5592	NC_018015	TAT	2	6	272380	272385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960473
5593	NC_018015	CCG	2	6	272403	272408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960473
5594	NC_018015	TC	4	8	272453	272460	0 %	50 %	0 %	50 %	390960473
5595	NC_018015	GCTC	2	8	272464	272471	0 %	25 %	25 %	50 %	390960473
5596	NC_018015	GAG	2	6	272535	272540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_018015	TCG	2	6	272611	272616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960474
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5599	NC_018015	GAG	2	6	272652	272657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960474
5600	NC_018015	AC	3	6	272750	272755	50 %	0 %	0 %	50 %	390960474
5601	NC_018015	ATA	2	6	272775	272780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960474
5602	NC_018015	CGT	2	6	272810	272815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960474
5603	NC_018015	CCA	2	6	272824	272829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960474
5604	NC_018015	CGA	2	6	272831	272836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960474
5605	NC_018015	CAT	2	6	272843	272848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960474
5606	NC_018015	CGT	2	6	272894	272899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960474
5607	NC_018015	GGCGCC	2	12	272904	272915	0 %	0 %	50 %	50 %	390960474
5608	NC_018015	GTC	2	6	272976	272981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960474
5609	NC_018015	GAA	3	9	273014	273022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960474
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5611	NC_018015	CAT	2	6	273122	273127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960475
5612	NC_018015	CCT	2	6	273161	273166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960475
5613	NC_018015	AAT	3	9	273206	273214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960475
5614	NC_018015	C	6	6	273252	273257	0 %	0 %	0 %	100 %	390960475
5615	NC_018015	GGA	2	6	273290	273295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960475
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5617	NC_018015	GAG	2	6	273408	273413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960475
5618	NC_018015	GACG	2	8	273431	273438	25 %	0 %	50 %	25 %	390960475
5619	NC_018015	AGGA	3	12	273476	273487	50 %	0 %	50 %	0 %	390960475
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5621	NC_018015	GCC	2	6	273513	273518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960475
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5744	NC_018015	TCA	2	6	279162	279167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960482
5745	NC_018015	GGA	2	6	279205	279210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960482
5746	NC_018015	GTC	2	6	279323	279328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960482
5747	NC_018015	GAG	2	6	279362	279367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960482
5748	NC_018015	GAA	2	6	279415	279420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960482
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5750	NC_018015	TTG	2	6	279449	279454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5751	NC_018015	TTC	2	6	279462	279467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5752	NC_018015	TCC	2	6	279476	279481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5753	NC_018015	TTC	2	6	279515	279520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5754	NC_018015	CGA	2	6	279545	279550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5755	NC_018015	TCA	3	9	279593	279601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960483
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5759	NC_018015	CTG	2	6	279790	279795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960483
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5763	NC_018015	CTA	2	6	279990	279995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960483
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5787	NC_018015	CCGA	2	8	281271	281278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5788	NC_018015	TA	3	6	281343	281348	50 %	50 %	0 %	0 %	390960485
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5801	NC_018015	TAC	2	6	282083	282088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5802	NC_018015	TA	3	6	282098	282103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5803	NC_018015	AGG	2	6	282108	282113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5808	NC_018015	TTC	2	6	282268	282273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5823	NC_018015	TC	3	6	282894	282899	0 %	50 %	0 %	50 %	390960487
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5835	NC_018015	TAAC	2	8	283355	283362	50 %	25 %	0 %	25 %	390960487
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5843	NC_018015	ATGA	2	8	283704	283711	50 %	25 %	25 %	0 %	390960488
5844	NC_018015	AT	3	6	283727	283732	50 %	50 %	0 %	0 %	390960488
5845	NC_018015	AGT	2	6	283755	283760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960488
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5848	NC_018015	GTTG	2	8	283813	283820	0 %	50 %	50 %	0 %	390960488
5849	NC_018015	CTTCA	2	10	284026	284035	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5850	NC_018015	GAAC	2	8	284067	284074	50 %	0 %	25 %	25 %	390960489
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5853	NC_018015	CAAG	2	8	284216	284223	50 %	0 %	25 %	25 %	390960489
5854	NC_018015	CAA	2	6	284339	284344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960489
5855	NC_018015	GT	3	6	284460	284465	0 %	50 %	50 %	0 %	390960490
5856	NC_018015	TGA	2	6	284482	284487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960490
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5859	NC_018015	TGGTTT	2	12	284699	284710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960490
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5864	NC_018015	CGC	2	6	285007	285012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5865	NC_018015	TCC	2	6	285021	285026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5866	NC_018015	TCC	2	6	285052	285057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5868	NC_018015	ACA	2	6	285107	285112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5993	NC_018015	CGG	2	6	292424	292429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960497
5994	NC_018015	GGC	2	6	292443	292448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960497
5995	NC_018015	TAC	2	6	292449	292454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960497
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