MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018015	GTC	2	6	219494	219499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960420
4502	NC_018015	CTCA	2	8	219500	219507	25 %	25 %	0 %	50 %	390960420
4503	NC_018015	CTG	2	6	219632	219637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960420
4504	NC_018015	C	6	6	219704	219709	0 %	0 %	0 %	100 %	390960420
4505	NC_018015	CTC	2	6	219713	219718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960420
4506	NC_018015	AAG	2	6	219752	219757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960420
4507	NC_018015	CTT	2	6	219767	219772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960420
4508	NC_018015	TTG	2	6	219818	219823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_018015	GGC	2	6	219824	219829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_018015	ACG	2	6	219947	219952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960421
4511	NC_018015	ACAGGG	2	12	219983	219994	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	390960421
4512	NC_018015	AAC	2	6	220039	220044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960421
4513	NC_018015	TGG	2	6	220070	220075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960421
4514	NC_018015	GGA	2	6	220101	220106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960421
4515	NC_018015	GGA	3	9	220113	220121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960421
4516	NC_018015	CTC	2	6	220123	220128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960421
4517	NC_018015	TGA	2	6	220151	220156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960421
4518	NC_018015	AAG	2	6	220168	220173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960421
4519	NC_018015	GAC	2	6	220237	220242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960421
4520	NC_018015	GAA	2	6	220333	220338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960421
4521	NC_018015	ACG	2	6	220343	220348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960421
4522	NC_018015	GGC	2	6	220386	220391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960421
4523	NC_018015	T	6	6	220420	220425	0 %	100 %	0 %	0 %	390960422
4524	NC_018015	TCC	2	6	220509	220514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960422
4525	NC_018015	ACC	2	6	220515	220520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960422
4526	NC_018015	TCC	2	6	220535	220540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960422
4527	NC_018015	GAAG	2	8	220588	220595	50 %	0 %	50 %	0 %	390960422
4528	NC_018015	TCCC	2	8	220596	220603	0 %	25 %	0 %	75 %	390960422
4529	NC_018015	CT	3	6	220621	220626	0 %	50 %	0 %	50 %	390960422
4530	NC_018015	CAGGG	2	10	220631	220640	20 %	0 %	60 %	20 %	390960422
4531	NC_018015	GC	3	6	220711	220716	0 %	0 %	50 %	50 %	390960422
4532	NC_018015	CCAGC	2	10	220794	220803	20 %	0 %	20 %	60 %	390960422
4533	NC_018015	GC	3	6	220884	220889	0 %	0 %	50 %	50 %	390960422
4534	NC_018015	CCT	2	6	220891	220896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960422
4535	NC_018015	GAA	2	6	220994	220999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960422
4536	NC_018015	AGGG	2	8	221000	221007	25 %	0 %	75 %	0 %	390960422
4537	NC_018015	GGA	2	6	221098	221103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_018015	GGA	2	6	221109	221114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_018015	CAG	2	6	221191	221196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960423
4540	NC_018015	AGG	2	6	221199	221204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960423
4541	NC_018015	GTC	2	6	221283	221288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960423
4542	NC_018015	TCC	2	6	221302	221307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960423
4543	NC_018015	AAG	2	6	221368	221373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960423
4544	NC_018015	TCA	2	6	221501	221506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960423
4545	NC_018015	TTC	2	6	221539	221544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960423
4546	NC_018015	CGT	2	6	221576	221581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960423
4547	NC_018015	CTG	2	6	221610	221615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960423
4548	NC_018015	AC	3	6	221655	221660	50 %	0 %	0 %	50 %	390960423
4549	NC_018015	TC	3	6	221769	221774	0 %	50 %	0 %	50 %	390960423
4550	NC_018015	T	6	6	221841	221846	0 %	100 %	0 %	0 %	390960423
4551	NC_018015	GGA	2	6	221896	221901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_018015	TTA	2	6	221917	221922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_018015	CTC	2	6	222007	222012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960424
4554	NC_018015	CCG	2	6	222045	222050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960424
4555	NC_018015	CAG	2	6	222061	222066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960424
4556	NC_018015	AGA	2	6	222078	222083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960424
4557	NC_018015	CTC	3	9	222167	222175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960424
4558	NC_018015	GC	3	6	222204	222209	0 %	0 %	50 %	50 %	390960424
4559	NC_018015	GAA	2	6	222214	222219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960424
4560	NC_018015	CCA	2	6	222220	222225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960424
4561	NC_018015	GAT	2	6	222328	222333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960424
4562	NC_018015	AGT	2	6	222354	222359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960424
4563	NC_018015	CTT	2	6	222376	222381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960424
4564	NC_018015	ATG	2	6	222419	222424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960424
4565	NC_018015	ATAG	2	8	222518	222525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_018015	GAA	2	6	222639	222644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960425
4567	NC_018015	TAT	2	6	222648	222653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960425
4568	NC_018015	CGC	2	6	222663	222668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960425
4569	NC_018015	GAG	3	9	222678	222686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960425
4570	NC_018015	CGA	2	6	222716	222721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960425
4571	NC_018015	AGC	2	6	222817	222822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960425
4572	NC_018015	GCC	2	6	222823	222828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960425
4573	NC_018015	CAT	2	6	222846	222851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960425
4574	NC_018015	GCTA	2	8	222921	222928	25 %	25 %	25 %	25 %	390960425
4575	NC_018015	TACT	2	8	222955	222962	25 %	50 %	0 %	25 %	390960425
4576	NC_018015	TCC	2	6	222970	222975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960425
4577	NC_018015	CGA	2	6	223043	223048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960425
4578	NC_018015	CCA	2	6	223069	223074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960425
4579	NC_018015	TAT	2	6	223138	223143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_018015	CAA	2	6	223164	223169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_018015	CGA	2	6	223289	223294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_018015	TTA	2	6	223300	223305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_018015	TGG	2	6	223339	223344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_018015	GAGG	2	8	223388	223395	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_018015	GAT	2	6	223424	223429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960426
4586	NC_018015	CCGC	2	8	223618	223625	0 %	0 %	25 %	75 %	390960426
4587	NC_018015	CAG	2	6	223631	223636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960426
4588	NC_018015	AAT	2	6	223649	223654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960426
4589	NC_018015	TCA	2	6	223714	223719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960426
4590	NC_018015	GAA	2	6	223781	223786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960426
4591	NC_018015	AAC	2	6	223830	223835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960426
4592	NC_018015	CGT	3	9	223880	223888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960426
4593	NC_018015	TCA	2	6	223924	223929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960426
4594	NC_018015	GCG	2	6	223957	223962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960426
4595	NC_018015	AGG	2	6	224047	224052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960426
4596	NC_018015	CCGAGG	2	12	224053	224064	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	390960426
4597	NC_018015	AGG	2	6	224067	224072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960426
4598	NC_018015	GAG	2	6	224166	224171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960426
4599	NC_018015	CGT	2	6	224183	224188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960426
4600	NC_018015	CGT	2	6	224204	224209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960426
4601	NC_018015	CGA	2	6	224213	224218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960426
4602	NC_018015	TGGG	2	8	224266	224273	0 %	25 %	75 %	0 %	390960426
4603	NC_018015	CTTT	2	8	224290	224297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4604	NC_018015	TAT	2	6	224364	224369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960427
4605	NC_018015	GAG	2	6	224463	224468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960427
4606	NC_018015	CTC	2	6	224488	224493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960427
4607	NC_018015	GTG	2	6	224662	224667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960427
4608	NC_018015	CGA	2	6	224673	224678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960427
4609	NC_018015	ATG	2	6	224794	224799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960427
4610	NC_018015	C	6	6	224825	224830	0 %	0 %	0 %	100 %	390960427
4611	NC_018015	G	6	6	224845	224850	0 %	0 %	100 %	0 %	390960427
4612	NC_018015	TGG	2	6	224885	224890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960427
4613	NC_018015	GGGA	2	8	224972	224979	25 %	0 %	75 %	0 %	390960427
4614	NC_018015	GAG	2	6	224986	224991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960427
4615	NC_018015	CTT	2	6	225003	225008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960427
4616	NC_018015	CTT	2	6	225043	225048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960427
4617	NC_018015	GGA	2	6	225054	225059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960427
4618	NC_018015	ATA	2	6	225088	225093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960427
4619	NC_018015	ATG	2	6	225145	225150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960427
4620	NC_018015	CTA	2	6	225279	225284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960427
4621	NC_018015	GAG	2	6	225307	225312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960427
4622	NC_018015	AG	3	6	225400	225405	50 %	0 %	50 %	0 %	390960427
4623	NC_018015	TGG	2	6	225463	225468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960427
4624	NC_018015	GAG	2	6	225478	225483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960427
4625	NC_018015	TCG	2	6	225491	225496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960427
4626	NC_018015	TCG	2	6	225605	225610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960427
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4631	NC_018015	CA	3	6	225769	225774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4632	NC_018015	C	6	6	225784	225789	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4633	NC_018015	CAT	2	6	225910	225915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960428
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4650	NC_018015	CTT	2	6	226813	226818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960428
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4652	NC_018015	TTC	2	6	226910	226915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960429
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4662	NC_018015	CAT	2	6	227191	227196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960429
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4688	NC_018015	TA	4	8	228415	228422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4689	NC_018015	GTTCTC	2	12	228458	228469	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390960431
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4696	NC_018015	G	6	6	228884	228889	0 %	0 %	100 %	0 %	390960431
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4700	NC_018015	TTCGAG	2	12	229046	229057	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390960431
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4730	NC_018015	A	7	7	230453	230459	100 %	0 %	0 %	0 %	390960433
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4732	NC_018015	CTG	2	6	230522	230527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960433
4733	NC_018015	TGA	2	6	230535	230540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960433
4734	NC_018015	CTA	2	6	230560	230565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960433
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4736	NC_018015	CTG	2	6	230654	230659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960433
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4744	NC_018015	CCA	2	6	231129	231134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960433
4745	NC_018015	ACC	2	6	231215	231220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960433
4746	NC_018015	CTG	2	6	231230	231235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960433
4747	NC_018015	ACC	2	6	231263	231268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960433
4748	NC_018015	ATA	2	6	231269	231274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960433
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4758	NC_018015	TTA	2	6	231713	231718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4797	NC_018015	T	6	6	233996	234001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4845	NC_018015	GTC	2	6	236020	236025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960439
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4849	NC_018015	GA	3	6	236269	236274	50 %	0 %	50 %	0 %	390960439
4850	NC_018015	CCA	2	6	236305	236310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4851	NC_018015	AAGCTT	2	12	236336	236347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4854	NC_018015	CTC	2	6	236515	236520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960440
4855	NC_018015	GGT	2	6	236523	236528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960440
4856	NC_018015	GGCC	2	8	236541	236548	0 %	0 %	50 %	50 %	390960440
4857	NC_018015	GGC	2	6	236671	236676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960440
4858	NC_018015	CGG	2	6	236736	236741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960440
4859	NC_018015	GGGA	3	12	236749	236760	25 %	0 %	75 %	0 %	390960440
4860	NC_018015	GGT	2	6	236804	236809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960440
4861	NC_018015	CG	3	6	236819	236824	0 %	0 %	50 %	50 %	390960440
4862	NC_018015	CTC	2	6	236836	236841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960440
4863	NC_018015	CGG	2	6	236858	236863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960440
4864	NC_018015	CGC	2	6	236964	236969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960440
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4988	NC_018015	GGA	2	6	242531	242536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960445
4989	NC_018015	CTT	3	9	242588	242596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960445
4990	NC_018015	CGA	2	6	242645	242650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960445
4991	NC_018015	GA	3	6	242685	242690	50 %	0 %	50 %	0 %	390960445
4992	NC_018015	GAA	2	6	242709	242714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960445
4993	NC_018015	AG	3	6	242719	242724	50 %	0 %	50 %	0 %	390960445
4994	NC_018015	GTC	2	6	242766	242771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960445
4995	NC_018015	TAC	2	6	242808	242813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960445
4996	NC_018015	GAG	2	6	242823	242828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960445
4997	NC_018015	TCC	2	6	242847	242852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960445
4998	NC_018015	TTC	2	6	242889	242894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960445
4999	NC_018015	TCCACC	2	12	242968	242979	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	390960445
5000	NC_018015	CTC	2	6	243087	243092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960445

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