MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiocystis violascens DSM 198 chromosome

Total Repeats: 111817

< Previous12...3435363738394041424344...223224Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_018012	GCG	2	6	860864	860869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19002	NC_018012	TGGC	2	8	860916	860923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19003	NC_018012	TGGC	2	8	860962	860969	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19004	NC_018012	CGG	2	6	861013	861018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19005	NC_018012	ACCA	2	8	861037	861044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19006	NC_018012	GA	3	6	861080	861085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_018012	CAGC	2	8	861086	861093	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19008	NC_018012	CGG	2	6	861121	861126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19009	NC_018012	CG	3	6	861163	861168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19010	NC_018012	CGT	2	6	861207	861212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19011	NC_018012	GCG	2	6	861222	861227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19012	NC_018012	GC	4	8	861234	861241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19013	NC_018012	TGCA	2	8	861300	861307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19014	NC_018012	GCA	2	6	861314	861319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19015	NC_018012	CA	3	6	861464	861469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19016	NC_018012	T	7	7	861576	861582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_018012	CG	3	6	861618	861623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19018	NC_018012	TCC	2	6	861643	861648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19019	NC_018012	TCA	2	6	861673	861678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19020	NC_018012	GGT	2	6	861804	861809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19021	NC_018012	TCT	2	6	861827	861832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19022	NC_018012	CAT	2	6	861834	861839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19023	NC_018012	GGT	2	6	861921	861926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19024	NC_018012	CCGA	2	8	862025	862032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19025	NC_018012	GAAC	2	8	862048	862055	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19026	NC_018012	CGTCC	2	10	862081	862090	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19027	NC_018012	CAC	2	6	862107	862112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19028	NC_018012	GCC	2	6	862116	862121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19029	NC_018012	CGC	2	6	862330	862335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949206
19030	NC_018012	CG	3	6	862399	862404	0 %	0 %	50 %	50 %	390949206
19031	NC_018012	CTG	2	6	862427	862432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949206
19032	NC_018012	CAT	2	6	862456	862461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949206
19033	NC_018012	ACC	2	6	862502	862507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390949206
19034	NC_018012	CAT	2	6	862510	862515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949206
19035	NC_018012	CCT	2	6	862581	862586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390949206
19036	NC_018012	TGA	2	6	862632	862637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390949206
19037	NC_018012	GCG	2	6	862638	862643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949206
19038	NC_018012	CAT	2	6	862777	862782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949206
19039	NC_018012	TCA	2	6	862827	862832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949206
19040	NC_018012	CG	3	6	862838	862843	0 %	0 %	50 %	50 %	390949206
19041	NC_018012	AGCG	2	8	862890	862897	25 %	0 %	50 %	25 %	390949206
19042	NC_018012	CGC	2	6	862927	862932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949206
19043	NC_018012	CTTC	2	8	862950	862957	0 %	50 %	0 %	50 %	390949206
19044	NC_018012	GC	3	6	863080	863085	0 %	0 %	50 %	50 %	390949206
19045	NC_018012	GGC	2	6	863146	863151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949206
19046	NC_018012	TCG	2	6	863160	863165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949206
19047	NC_018012	ATGG	2	8	863185	863192	25 %	25 %	50 %	0 %	390949206
19048	NC_018012	GTCA	2	8	863249	863256	25 %	25 %	25 %	25 %	390949206
19049	NC_018012	CCCTT	2	10	863307	863316	0 %	40 %	0 %	60 %	390949206
19050	NC_018012	CG	3	6	863354	863359	0 %	0 %	50 %	50 %	390949206
19051	NC_018012	CAT	2	6	863395	863400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949206
19052	NC_018012	GGC	2	6	863410	863415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949206
19053	NC_018012	CGT	2	6	863434	863439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949206
19054	NC_018012	TGG	2	6	863481	863486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390949206
19055	NC_018012	GGTC	2	8	863559	863566	0 %	25 %	50 %	25 %	390949206
19056	NC_018012	CAT	2	6	863578	863583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949206
19057	NC_018012	CCG	2	6	863652	863657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949206
19058	NC_018012	ATCGGC	2	12	863867	863878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390949206
19059	NC_018012	CCT	2	6	863899	863904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390949206
19060	NC_018012	CGC	2	6	863962	863967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949206
19061	NC_018012	CCA	2	6	863968	863973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390949206
19062	NC_018012	CG	3	6	863985	863990	0 %	0 %	50 %	50 %	390949206
19063	NC_018012	CCA	2	6	864054	864059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390949206
19064	NC_018012	ACG	2	6	864072	864077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949206
19065	NC_018012	GCG	2	6	864111	864116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949206
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19067	NC_018012	TGA	2	6	864234	864239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390949206
19068	NC_018012	GTG	2	6	864302	864307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390949206
19069	NC_018012	GC	3	6	864337	864342	0 %	0 %	50 %	50 %	390949206
19070	NC_018012	CT	3	6	864343	864348	0 %	50 %	0 %	50 %	390949206
19071	NC_018012	GGGT	2	8	864384	864391	0 %	25 %	75 %	0 %	390949206
19072	NC_018012	CAA	2	6	864430	864435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390949206
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19077	NC_018012	CTCGAT	2	12	864725	864736	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390949206
19078	NC_018012	TGC	2	6	864754	864759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949206
19079	NC_018012	GGTCC	2	10	864760	864769	0 %	20 %	40 %	40 %	390949206
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19081	NC_018012	CTG	2	6	864791	864796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949206
19082	NC_018012	CAA	2	6	864804	864809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390949206
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19088	NC_018012	CAAT	2	8	865070	865077	50 %	25 %	0 %	25 %	390949206
19089	NC_018012	TCA	2	6	865251	865256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19090	NC_018012	TGG	2	6	865274	865279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19091	NC_018012	TC	3	6	865352	865357	0 %	50 %	0 %	50 %	390949207
19092	NC_018012	GCT	2	6	865370	865375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949207
19093	NC_018012	GC	3	6	865447	865452	0 %	0 %	50 %	50 %	390949207
19094	NC_018012	CGC	2	6	865703	865708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949207
19095	NC_018012	GCT	2	6	865712	865717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949207
19096	NC_018012	GAA	2	6	865719	865724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390949207
19097	NC_018012	ACG	2	6	865897	865902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949207
19098	NC_018012	TGA	2	6	865910	865915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390949207
19099	NC_018012	GC	3	6	865934	865939	0 %	0 %	50 %	50 %	390949207
19100	NC_018012	GCG	2	6	865960	865965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949207
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19105	NC_018012	CG	3	6	866169	866174	0 %	0 %	50 %	50 %	390949207
19106	NC_018012	CCG	2	6	866228	866233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949207
19107	NC_018012	GGT	2	6	866348	866353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390949207
19108	NC_018012	GAA	2	6	866417	866422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390949207
19109	NC_018012	GCCA	2	8	866478	866485	25 %	0 %	25 %	50 %	390949207
19110	NC_018012	CAT	2	6	866597	866602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949207
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19112	NC_018012	CAT	2	6	866816	866821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949207
19113	NC_018012	GAC	2	6	866844	866849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949207
19114	NC_018012	GC	3	6	866876	866881	0 %	0 %	50 %	50 %	390949207
19115	NC_018012	AGC	2	6	866935	866940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949207
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19117	NC_018012	CGG	2	6	867029	867034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949207
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19120	NC_018012	AG	3	6	867088	867093	50 %	0 %	50 %	0 %	390949207
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19123	NC_018012	GTA	2	6	867264	867269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390949208
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19125	NC_018012	TCC	2	6	867466	867471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19127	NC_018012	CAT	2	6	867560	867565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19128	NC_018012	CGA	2	6	867718	867723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19153	NC_018012	CCG	2	6	868666	868671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19155	NC_018012	CCG	2	6	868698	868703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19237	NC_018012	GAGCC	2	10	872437	872446	20 %	0 %	40 %	40 %	390949212
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19242	NC_018012	CCG	2	6	872727	872732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949213
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19247	NC_018012	TCG	2	6	872836	872841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949213
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19493	NC_018012	GAC	2	6	883353	883358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949223
19494	NC_018012	CAC	2	6	883380	883385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390949223
19495	NC_018012	GTTC	2	8	883469	883476	0 %	50 %	25 %	25 %	390949223
19496	NC_018012	CG	3	6	883508	883513	0 %	0 %	50 %	50 %	390949223
19497	NC_018012	CCGC	2	8	883547	883554	0 %	0 %	25 %	75 %	390949223
19498	NC_018012	GA	3	6	883630	883635	50 %	0 %	50 %	0 %	390949223
19499	NC_018012	CGG	2	6	883646	883651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949223
19500	NC_018012	TGT	2	6	883763	883768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390949223

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