MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiocystis violascens DSM 198 chromosome

Total Repeats: 111817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_018012	GT	3	6	609242	609247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_018012	AGC	2	6	609260	609265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_018012	ATTTC	2	10	609273	609282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13504	NC_018012	ATC	2	6	609305	609310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949006
13505	NC_018012	CTG	2	6	609407	609412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949006
13506	NC_018012	GGC	2	6	609451	609456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949006
13507	NC_018012	GGA	2	6	609478	609483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390949006
13508	NC_018012	CGA	2	6	609529	609534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949006
13509	NC_018012	TGAA	2	8	609588	609595	50 %	25 %	25 %	0 %	390949006
13510	NC_018012	TAA	2	6	609682	609687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390949006
13511	NC_018012	GA	3	6	609817	609822	50 %	0 %	50 %	0 %	390949007
13512	NC_018012	TAT	2	6	609827	609832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390949007
13513	NC_018012	ATG	2	6	609834	609839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390949007
13514	NC_018012	T	6	6	609877	609882	0 %	100 %	0 %	0 %	390949007
13515	NC_018012	GAAA	2	8	609885	609892	75 %	0 %	25 %	0 %	390949007
13516	NC_018012	ACA	2	6	610126	610131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390949007
13517	NC_018012	T	6	6	610179	610184	0 %	100 %	0 %	0 %	390949007
13518	NC_018012	TCG	2	6	610204	610209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949007
13519	NC_018012	TTGA	2	8	610278	610285	25 %	50 %	25 %	0 %	390949007
13520	NC_018012	CG	3	6	610324	610329	0 %	0 %	50 %	50 %	390949007
13521	NC_018012	AAG	2	6	610353	610358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390949007
13522	NC_018012	TCGA	2	8	610362	610369	25 %	25 %	25 %	25 %	390949007
13523	NC_018012	TTC	2	6	610477	610482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390949007
13524	NC_018012	TGG	2	6	610490	610495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390949007
13525	NC_018012	T	7	7	610584	610590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_018012	GAT	2	6	610629	610634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_018012	ATT	2	6	610696	610701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_018012	A	6	6	610780	610785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_018012	A	6	6	610803	610808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_018012	CGC	2	6	610818	610823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13531	NC_018012	ATT	2	6	610851	610856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_018012	T	6	6	610897	610902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_018012	TGA	2	6	610958	610963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_018012	A	7	7	610985	610991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_018012	T	7	7	611050	611056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_018012	A	6	6	611073	611078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_018012	GAA	2	6	611109	611114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390949008
13538	NC_018012	A	7	7	611113	611119	100 %	0 %	0 %	0 %	390949008
13539	NC_018012	TATTCA	2	12	611184	611195	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390949008
13540	NC_018012	AG	3	6	611235	611240	50 %	0 %	50 %	0 %	390949008
13541	NC_018012	TGA	2	6	611249	611254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390949008
13542	NC_018012	GAA	2	6	611334	611339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390949008
13543	NC_018012	T	7	7	611370	611376	0 %	100 %	0 %	0 %	390949008
13544	NC_018012	TGA	2	6	611398	611403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_018012	GAAA	2	8	611416	611423	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_018012	GAA	2	6	611570	611575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390949009
13547	NC_018012	CGC	2	6	611596	611601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949009
13548	NC_018012	CGA	2	6	611608	611613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949009
13549	NC_018012	TGGAA	2	10	611625	611634	40 %	20 %	40 %	0 %	390949009
13550	NC_018012	GTG	2	6	611683	611688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390949009
13551	NC_018012	GCC	2	6	611696	611701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949009
13552	NC_018012	GGC	2	6	611839	611844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949009
13553	NC_018012	GCC	2	6	611881	611886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949009
13554	NC_018012	TCA	2	6	611901	611906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949009
13555	NC_018012	GCTGCC	2	12	611917	611928	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	390949009
13556	NC_018012	CGGT	2	8	611945	611952	0 %	25 %	50 %	25 %	390949009
13557	NC_018012	CGC	3	9	611965	611973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949009
13558	NC_018012	ATC	2	6	612134	612139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949009
13559	NC_018012	AAG	2	6	612140	612145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390949009
13560	NC_018012	GGA	2	6	612184	612189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390949009
13561	NC_018012	CGG	2	6	612193	612198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949009
13562	NC_018012	CGC	2	6	612256	612261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949009
13563	NC_018012	GC	4	8	612260	612267	0 %	0 %	50 %	50 %	390949009
13564	NC_018012	GCC	2	6	612280	612285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949009
13565	NC_018012	TGA	2	6	612294	612299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390949009
13566	NC_018012	TCG	2	6	612300	612305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949009
13567	NC_018012	CCG	2	6	612345	612350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949009
13568	NC_018012	GCT	2	6	612367	612372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949009
13569	NC_018012	TCG	2	6	612501	612506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949009
13570	NC_018012	GCG	3	9	612516	612524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949009
13571	NC_018012	GCC	2	6	612631	612636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949009
13572	NC_018012	CTG	2	6	612641	612646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949009
13573	NC_018012	CGA	2	6	612661	612666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949009
13574	NC_018012	CGAG	2	8	612687	612694	25 %	0 %	50 %	25 %	390949009
13575	NC_018012	GCAA	2	8	612735	612742	50 %	0 %	25 %	25 %	390949009
13576	NC_018012	CGG	2	6	612783	612788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949009
13577	NC_018012	GGT	2	6	612814	612819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390949009
13578	NC_018012	AAGG	2	8	612821	612828	50 %	0 %	50 %	0 %	390949009
13579	NC_018012	AC	3	6	612897	612902	50 %	0 %	0 %	50 %	390949009
13580	NC_018012	TGA	2	6	612918	612923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390949009
13581	NC_018012	AGA	2	6	612924	612929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390949009
13582	NC_018012	CGT	2	6	612978	612983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949009
13583	NC_018012	A	6	6	613009	613014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13584	NC_018012	TCC	2	6	613077	613082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390949010
13585	NC_018012	TTCT	2	8	613163	613170	0 %	75 %	0 %	25 %	390949010
13586	NC_018012	CTT	2	6	613262	613267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390949010
13587	NC_018012	CCGT	2	8	613316	613323	0 %	25 %	25 %	50 %	390949010
13588	NC_018012	CGC	2	6	613430	613435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13589	NC_018012	ACG	2	6	613436	613441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13590	NC_018012	CTG	2	6	613506	613511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13591	NC_018012	GTC	2	6	613516	613521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13592	NC_018012	CG	3	6	613523	613528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13593	NC_018012	AAG	2	6	613603	613608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_018012	AGC	2	6	613737	613742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949011
13595	NC_018012	AGG	2	6	613773	613778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390949011
13596	NC_018012	GTCG	2	8	613889	613896	0 %	25 %	50 %	25 %	390949011
13597	NC_018012	ACG	2	6	613905	613910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949011
13598	NC_018012	GAG	2	6	613937	613942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390949011
13599	NC_018012	GCG	2	6	613947	613952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949011
13600	NC_018012	GCT	2	6	613999	614004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949011
13601	NC_018012	CTG	2	6	614009	614014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949011
13602	NC_018012	GT	3	6	614103	614108	0 %	50 %	50 %	0 %	390949011
13603	NC_018012	TCG	2	6	614139	614144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949011
13604	NC_018012	ATC	2	6	614147	614152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949011
13605	NC_018012	GCC	2	6	614216	614221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949011
13606	NC_018012	TC	3	6	614329	614334	0 %	50 %	0 %	50 %	390949011
13607	NC_018012	CTA	2	6	614359	614364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949011
13608	NC_018012	ACG	2	6	614376	614381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949011
13609	NC_018012	CCG	2	6	614414	614419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949011
13610	NC_018012	AGTGG	2	10	614429	614438	20 %	20 %	60 %	0 %	390949011
13611	NC_018012	CAC	2	6	614485	614490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390949011
13612	NC_018012	CG	3	6	614549	614554	0 %	0 %	50 %	50 %	390949011
13613	NC_018012	GC	3	6	614585	614590	0 %	0 %	50 %	50 %	390949011
13614	NC_018012	TCG	2	6	614608	614613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949011
13615	NC_018012	GAC	2	6	614624	614629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949011
13616	NC_018012	CGGT	2	8	614652	614659	0 %	25 %	50 %	25 %	390949011
13617	NC_018012	CCGATC	2	12	614901	614912	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390949011
13618	NC_018012	CGA	2	6	614977	614982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949011
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13620	NC_018012	CTT	2	6	615154	615159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390949011
13621	NC_018012	TGA	2	6	615232	615237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390949012
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13623	NC_018012	GAG	2	6	615362	615367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390949012
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13739	NC_018012	AAC	2	6	621769	621774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13746	NC_018012	GAT	2	6	622090	622095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390949016
13747	NC_018012	CAA	2	6	622222	622227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390949016
13748	NC_018012	ATC	2	6	622232	622237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390949016
13749	NC_018012	GCG	2	6	622250	622255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949016
13750	NC_018012	AACG	2	8	622283	622290	50 %	0 %	25 %	25 %	390949016
13751	NC_018012	T	6	6	622343	622348	0 %	100 %	0 %	0 %	390949016
13752	NC_018012	A	7	7	622349	622355	100 %	0 %	0 %	0 %	390949016
13753	NC_018012	TGT	2	6	622369	622374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390949016
13754	NC_018012	TGG	2	6	622502	622507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390949016
13755	NC_018012	TCGT	2	8	622589	622596	0 %	50 %	25 %	25 %	390949016
13756	NC_018012	GA	4	8	622908	622915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13757	NC_018012	TGA	2	6	622920	622925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13758	NC_018012	A	6	6	622994	622999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13759	NC_018012	AAC	2	6	623101	623106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390949017
13760	NC_018012	ACG	2	6	623162	623167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949017
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13762	NC_018012	TTTCA	2	10	623262	623271	20 %	60 %	0 %	20 %	390949017
13763	NC_018012	ACTT	2	8	623279	623286	25 %	50 %	0 %	25 %	390949017
13764	NC_018012	ACG	2	6	623303	623308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390949017
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13766	NC_018012	TGAG	2	8	623351	623358	25 %	25 %	50 %	0 %	390949017
13767	NC_018012	AT	3	6	623500	623505	50 %	50 %	0 %	0 %	390949017
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13770	NC_018012	ATT	2	6	623549	623554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390949017
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13774	NC_018012	GAAA	2	8	623844	623851	75 %	0 %	25 %	0 %	390949017
13775	NC_018012	CAA	2	6	623886	623891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390949017
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13777	NC_018012	CGAA	2	8	624140	624147	50 %	0 %	25 %	25 %	390949017
13778	NC_018012	AATA	2	8	624166	624173	75 %	25 %	0 %	0 %	390949017
13779	NC_018012	CGAT	2	8	624383	624390	25 %	25 %	25 %	25 %	390949018
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13801	NC_018012	GAGT	2	8	625634	625641	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13802	NC_018012	ATGA	2	8	625665	625672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13826	NC_018012	TG	4	8	627190	627197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13827	NC_018012	AGCA	2	8	627212	627219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13830	NC_018012	AAG	2	6	627355	627360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13861	NC_018012	TCG	2	6	628695	628700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390949020
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13986	NC_018012	GGC	2	6	633747	633752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949022
13987	NC_018012	CG	5	10	633780	633789	0 %	0 %	50 %	50 %	390949022
13988	NC_018012	CGGCG	2	10	633812	633821	0 %	0 %	60 %	40 %	390949022
13989	NC_018012	GC	3	6	633866	633871	0 %	0 %	50 %	50 %	390949022
13990	NC_018012	GC	3	6	633906	633911	0 %	0 %	50 %	50 %	390949022
13991	NC_018012	GAT	2	6	633917	633922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390949022
13992	NC_018012	CG	3	6	633975	633980	0 %	0 %	50 %	50 %	390949022
13993	NC_018012	TTG	2	6	634042	634047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390949022
13994	NC_018012	GCC	2	6	634050	634055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390949022
13995	NC_018012	CAC	2	6	634065	634070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390949022
13996	NC_018012	AAGG	2	8	634080	634087	50 %	0 %	50 %	0 %	390949022
13997	NC_018012	CCGG	2	8	634095	634102	0 %	0 %	50 %	50 %	390949022
13998	NC_018012	TGA	2	6	634169	634174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390949022
13999	NC_018012	CGG	2	6	634268	634273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390949022
14000	NC_018012	CAC	2	6	634278	634283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390949022

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