MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiocystis violascens DSM 198 chromosome

Total Repeats: 111817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_018012	AGT	2	6	514910	514915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948927
11502	NC_018012	ATCC	2	8	514942	514949	25 %	25 %	0 %	50 %	390948927
11503	NC_018012	GTG	2	6	514972	514977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390948927
11504	NC_018012	ACG	2	6	514992	514997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948927
11505	NC_018012	GC	3	6	515008	515013	0 %	0 %	50 %	50 %	390948927
11506	NC_018012	CAG	2	6	515014	515019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948927
11507	NC_018012	CGG	2	6	515373	515378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948927
11508	NC_018012	GGA	2	6	515541	515546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_018012	CAGT	2	8	515567	515574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11510	NC_018012	CGC	2	6	515581	515586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11511	NC_018012	TCA	2	6	515670	515675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_018012	AACA	2	8	515699	515706	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11513	NC_018012	TGT	2	6	515764	515769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_018012	GCA	2	6	515802	515807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948928
11515	NC_018012	ATG	2	6	515904	515909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948928
11516	NC_018012	GGC	2	6	515911	515916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948928
11517	NC_018012	CCG	2	6	515931	515936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948928
11518	NC_018012	GGC	2	6	516037	516042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948928
11519	NC_018012	CGA	2	6	516115	516120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948928
11520	NC_018012	GGAAT	2	10	516325	516334	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_018012	CGC	2	6	516524	516529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948929
11522	NC_018012	AAG	2	6	516655	516660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390948929
11523	NC_018012	CTCGCT	2	12	516756	516767	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11524	NC_018012	AAACA	2	10	516788	516797	80 %	0 %	0 %	20 %	390948930
11525	NC_018012	CGG	2	6	516856	516861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948930
11526	NC_018012	GCT	2	6	516937	516942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948930
11527	NC_018012	GCC	2	6	516992	516997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948930
11528	NC_018012	CGGG	2	8	517027	517034	0 %	0 %	75 %	25 %	390948930
11529	NC_018012	CAT	2	6	517087	517092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948930
11530	NC_018012	CAG	2	6	517097	517102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948930
11531	NC_018012	CGC	2	6	517113	517118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948930
11532	NC_018012	CG	3	6	517170	517175	0 %	0 %	50 %	50 %	390948930
11533	NC_018012	ACC	2	6	517190	517195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948930
11534	NC_018012	CCG	2	6	517242	517247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948930
11535	NC_018012	GAC	2	6	517299	517304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948931
11536	NC_018012	CCG	2	6	517367	517372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948931
11537	NC_018012	ATC	2	6	517421	517426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948931
11538	NC_018012	TGC	2	6	517427	517432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948931
11539	NC_018012	TCGC	2	8	517469	517476	0 %	25 %	25 %	50 %	390948931
11540	NC_018012	GGC	2	6	517482	517487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948931
11541	NC_018012	GCTG	2	8	517488	517495	0 %	25 %	50 %	25 %	390948931
11542	NC_018012	CCAG	2	8	517550	517557	25 %	0 %	25 %	50 %	390948931
11543	NC_018012	CG	3	6	517577	517582	0 %	0 %	50 %	50 %	390948931
11544	NC_018012	CCG	2	6	517588	517593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948931
11545	NC_018012	CGGCG	2	10	517660	517669	0 %	0 %	60 %	40 %	390948931
11546	NC_018012	GC	3	6	517756	517761	0 %	0 %	50 %	50 %	390948931
11547	NC_018012	AAC	2	6	517784	517789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390948931
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11549	NC_018012	CCG	2	6	517886	517891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948931
11550	NC_018012	CG	3	6	517890	517895	0 %	0 %	50 %	50 %	390948931
11551	NC_018012	CGA	2	6	518016	518021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948931
11552	NC_018012	GGAT	2	8	518045	518052	25 %	25 %	50 %	0 %	390948931
11553	NC_018012	GC	3	6	518084	518089	0 %	0 %	50 %	50 %	390948931
11554	NC_018012	CG	4	8	518096	518103	0 %	0 %	50 %	50 %	390948931
11555	NC_018012	AGG	3	9	518120	518128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948931
11556	NC_018012	CGC	2	6	518130	518135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948931
11557	NC_018012	GGAT	2	8	518174	518181	25 %	25 %	50 %	0 %	390948931
11558	NC_018012	CG	3	6	518191	518196	0 %	0 %	50 %	50 %	390948931
11559	NC_018012	CGA	2	6	518235	518240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948931
11560	NC_018012	CCG	2	6	518285	518290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948931
11561	NC_018012	TCG	2	6	518366	518371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_018012	GTC	2	6	518411	518416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_018012	CTT	2	6	518450	518455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_018012	TTGAC	2	10	518460	518469	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11565	NC_018012	GCG	2	6	518471	518476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_018012	AAC	2	6	518533	518538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390948932
11567	NC_018012	TTCGC	2	10	518559	518568	0 %	40 %	20 %	40 %	390948932
11568	NC_018012	GAG	3	9	518607	518615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390948932
11569	NC_018012	ATC	2	6	518620	518625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948932
11570	NC_018012	CGAGC	2	10	518648	518657	20 %	0 %	40 %	40 %	390948932
11571	NC_018012	CGTG	2	8	518693	518700	0 %	25 %	50 %	25 %	390948932
11572	NC_018012	GCG	2	6	518701	518706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948932
11573	NC_018012	CCA	2	6	518722	518727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948932
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11576	NC_018012	GCGG	2	8	518765	518772	0 %	0 %	75 %	25 %	390948932
11577	NC_018012	CG	3	6	518827	518832	0 %	0 %	50 %	50 %	390948932
11578	NC_018012	CG	3	6	518839	518844	0 %	0 %	50 %	50 %	390948932
11579	NC_018012	CCA	2	6	518857	518862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390948932
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11582	NC_018012	CGA	2	6	518939	518944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948932
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11589	NC_018012	CG	3	6	519172	519177	0 %	0 %	50 %	50 %	390948932
11590	NC_018012	GCT	2	6	519197	519202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948932
11591	NC_018012	CTG	2	6	519243	519248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948932
11592	NC_018012	CGA	2	6	519317	519322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948932
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11595	NC_018012	GC	4	8	519531	519538	0 %	0 %	50 %	50 %	390948932
11596	NC_018012	CCG	2	6	519585	519590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948932
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11600	NC_018012	TCGA	2	8	519696	519703	25 %	25 %	25 %	25 %	390948932
11601	NC_018012	CAA	2	6	519713	519718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390948932
11602	NC_018012	CGT	2	6	519819	519824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948932
11603	NC_018012	CGG	2	6	519836	519841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948932
11604	NC_018012	CGC	2	6	519922	519927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948932
11605	NC_018012	CTGT	2	8	519929	519936	0 %	50 %	25 %	25 %	390948932
11606	NC_018012	GAAT	2	8	519966	519973	50 %	25 %	25 %	0 %	390948932
11607	NC_018012	TCT	2	6	520035	520040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390948933
11608	NC_018012	GC	3	6	520187	520192	0 %	0 %	50 %	50 %	390948933
11609	NC_018012	GC	3	6	520208	520213	0 %	0 %	50 %	50 %	390948933
11610	NC_018012	CG	3	6	520222	520227	0 %	0 %	50 %	50 %	390948933
11611	NC_018012	CGC	3	9	520354	520362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948933
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11615	NC_018012	TGA	2	6	520728	520733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948933
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11617	NC_018012	CG	4	8	520783	520790	0 %	0 %	50 %	50 %	390948933
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11621	NC_018012	GC	3	6	520883	520888	0 %	0 %	50 %	50 %	390948933
11622	NC_018012	TC	3	6	521109	521114	0 %	50 %	0 %	50 %	390948933
11623	NC_018012	CGA	2	6	521134	521139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948933
11624	NC_018012	ATC	2	6	521148	521153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390948933
11625	NC_018012	CGCGAG	2	12	521183	521194	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	390948933
11626	NC_018012	TC	3	6	521200	521205	0 %	50 %	0 %	50 %	390948933
11627	NC_018012	GC	3	6	521238	521243	0 %	0 %	50 %	50 %	390948933
11628	NC_018012	TTG	2	6	521292	521297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11629	NC_018012	GGCA	2	8	521360	521367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11630	NC_018012	TCGC	2	8	521370	521377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11631	NC_018012	CGAA	2	8	521444	521451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11632	NC_018012	CTC	2	6	521482	521487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11633	NC_018012	ACC	2	6	521565	521570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11634	NC_018012	CGG	2	6	521579	521584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11635	NC_018012	TCCAG	2	10	521586	521595	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11636	NC_018012	GCC	3	9	521607	521615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11637	NC_018012	TGA	2	6	521648	521653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11638	NC_018012	GCG	2	6	521695	521700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11639	NC_018012	GA	3	6	521710	521715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11640	NC_018012	AGG	3	9	521726	521734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11641	NC_018012	AG	3	6	521757	521762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11642	NC_018012	ATC	2	6	521864	521869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11643	NC_018012	ATC	2	6	521955	521960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11644	NC_018012	CGC	3	9	521996	522004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11645	NC_018012	CCG	2	6	522080	522085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11646	NC_018012	CAG	2	6	522158	522163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948934
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11650	NC_018012	CTG	2	6	522435	522440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948934
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11661	NC_018012	CG	3	6	523025	523030	0 %	0 %	50 %	50 %	390948934
11662	NC_018012	CTG	2	6	523067	523072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948934
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11680	NC_018012	GCGCTG	2	12	523646	523657	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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11687	NC_018012	CGA	2	6	524184	524189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948935
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11697	NC_018012	CGG	2	6	524816	524821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948935
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11711	NC_018012	ATC	2	6	525604	525609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11713	NC_018012	GC	3	6	525732	525737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11714	NC_018012	CG	3	6	525738	525743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11715	NC_018012	CTG	2	6	525744	525749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11716	NC_018012	CGTCC	2	10	525772	525781	0 %	20 %	20 %	60 %	390948936
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11729	NC_018012	GAGT	2	8	526346	526353	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11730	NC_018012	CGGC	3	12	526373	526384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11731	NC_018012	GAT	2	6	526511	526516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948937
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11733	NC_018012	CCG	2	6	526563	526568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948937
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11736	NC_018012	CCTT	2	8	526699	526706	0 %	50 %	0 %	50 %	390948937
11737	NC_018012	TGA	2	6	526724	526729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390948937
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11988	NC_018012	TCG	2	6	538469	538474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948943
11989	NC_018012	GC	3	6	538475	538480	0 %	0 %	50 %	50 %	390948943
11990	NC_018012	CGC	2	6	538543	538548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948943
11991	NC_018012	CCCG	2	8	538552	538559	0 %	0 %	25 %	75 %	390948943
11992	NC_018012	CGG	2	6	538604	538609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948943
11993	NC_018012	AGGCC	2	10	538641	538650	20 %	0 %	40 %	40 %	390948943
11994	NC_018012	CTG	2	6	538684	538689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390948943
11995	NC_018012	GCA	3	9	538698	538706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948943
11996	NC_018012	GAC	2	6	538719	538724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390948943
11997	NC_018012	CGG	3	9	538767	538775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390948943
11998	NC_018012	CGC	2	6	538785	538790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390948943
11999	NC_018012	CTCG	2	8	538846	538853	0 %	25 %	25 %	50 %	390948943
12000	NC_018012	CG	3	6	538904	538909	0 %	0 %	50 %	50 %	390948943

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