MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 plasmid pMU3262

Total Repeats: 3148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017998	AGAAA	2	10	15	24	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017998	TAA	2	6	29	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017998	AAG	2	6	47	52	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017998	ATT	2	6	63	68	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017998	AAG	2	6	74	79	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017998	TAA	2	6	83	88	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017998	TTAC	2	8	119	126	25 %	50 %	0 %	25 %	390935778
8	NC_017998	CAA	2	6	156	161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935778
9	NC_017998	CCTC	2	8	162	169	0 %	25 %	0 %	75 %	390935778
10	NC_017998	TCT	2	6	223	228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935778
11	NC_017998	T	7	7	231	237	0 %	100 %	0 %	0 %	390935778
12	NC_017998	CTTTT	2	10	242	251	0 %	80 %	0 %	20 %	390935778
13	NC_017998	TCTT	2	8	252	259	0 %	75 %	0 %	25 %	390935778
14	NC_017998	TA	4	8	266	273	50 %	50 %	0 %	0 %	390935778
15	NC_017998	TCC	2	6	284	289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017998	ATC	2	6	333	338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935779
17	NC_017998	CTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935779
18	NC_017998	ATT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935779
19	NC_017998	T	8	8	445	452	0 %	100 %	0 %	0 %	390935779
20	NC_017998	ACA	2	6	511	516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935779
21	NC_017998	ATT	2	6	598	603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935779
22	NC_017998	TGA	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935779
23	NC_017998	TCC	2	6	828	833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935779
24	NC_017998	ATT	2	6	852	857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935779
25	NC_017998	AT	4	8	900	907	50 %	50 %	0 %	0 %	390935779
26	NC_017998	AT	3	6	932	937	50 %	50 %	0 %	0 %	390935779
27	NC_017998	TTA	2	6	971	976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935779
28	NC_017998	TTA	2	6	982	987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935779
29	NC_017998	CTA	2	6	994	999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935779
30	NC_017998	TAG	2	6	1016	1021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935779
31	NC_017998	AT	3	6	1056	1061	50 %	50 %	0 %	0 %	390935779
32	NC_017998	TC	3	6	1101	1106	0 %	50 %	0 %	50 %	390935779
33	NC_017998	TA	3	6	1155	1160	50 %	50 %	0 %	0 %	390935779
34	NC_017998	ACC	2	6	1161	1166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935779
35	NC_017998	AAC	2	6	1212	1217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935779
36	NC_017998	TCT	2	6	1240	1245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935779
37	NC_017998	ATA	2	6	1342	1347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017998	ACAT	2	8	1490	1497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017998	A	6	6	1511	1516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017998	AAAT	2	8	1532	1539	75 %	25 %	0 %	0 %	390935780
41	NC_017998	CGTT	2	8	1555	1562	0 %	50 %	25 %	25 %	390935780
42	NC_017998	T	6	6	1603	1608	0 %	100 %	0 %	0 %	390935780
43	NC_017998	TTAA	2	8	1687	1694	50 %	50 %	0 %	0 %	390935780
44	NC_017998	A	6	6	1776	1781	100 %	0 %	0 %	0 %	390935780
45	NC_017998	AAG	2	6	1879	1884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935780
46	NC_017998	GCA	2	6	1906	1911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935780
47	NC_017998	CTT	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935780
48	NC_017998	AGT	2	6	1929	1934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935780
49	NC_017998	AGTA	2	8	1995	2002	50 %	25 %	25 %	0 %	390935780
50	NC_017998	AAG	2	6	2057	2062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935780
51	NC_017998	AG	3	6	2112	2117	50 %	0 %	50 %	0 %	390935780
52	NC_017998	ATTC	2	8	2126	2133	25 %	50 %	0 %	25 %	390935780
53	NC_017998	TCA	2	6	2144	2149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935780
54	NC_017998	GCA	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935780
55	NC_017998	TCT	2	6	2224	2229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935780
56	NC_017998	TTA	2	6	2252	2257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935780
57	NC_017998	TTTA	2	8	2262	2269	25 %	75 %	0 %	0 %	390935780
58	NC_017998	CAA	2	6	2294	2299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935780
59	NC_017998	T	7	7	2422	2428	0 %	100 %	0 %	0 %	390935780
60	NC_017998	ATT	2	6	2454	2459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935780
61	NC_017998	AAT	2	6	2546	2551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935780
62	NC_017998	GCC	2	6	2595	2600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935780
63	NC_017998	TA	3	6	2606	2611	50 %	50 %	0 %	0 %	390935780
64	NC_017998	ACC	2	6	2616	2621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935780
65	NC_017998	T	6	6	2633	2638	0 %	100 %	0 %	0 %	390935780
66	NC_017998	ATA	2	6	2653	2658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935780
67	NC_017998	TAAA	2	8	2669	2676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017998	CAC	2	6	2680	2685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017998	T	6	6	2711	2716	0 %	100 %	0 %	0 %	390935781
70	NC_017998	TAC	2	6	2768	2773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935781
71	NC_017998	TCC	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935781
72	NC_017998	AAGT	2	8	2868	2875	50 %	25 %	25 %	0 %	390935781
73	NC_017998	CTTA	2	8	2925	2932	25 %	50 %	0 %	25 %	390935781
74	NC_017998	TCC	2	6	3045	3050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017998	ATTT	2	8	3068	3075	25 %	75 %	0 %	0 %	390935782
76	NC_017998	ATT	2	6	3083	3088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935782
77	NC_017998	T	6	6	3122	3127	0 %	100 %	0 %	0 %	390935782
78	NC_017998	TA	3	6	3196	3201	50 %	50 %	0 %	0 %	390935782
79	NC_017998	TCT	2	6	3247	3252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935782
80	NC_017998	CAT	2	6	3279	3284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935782
81	NC_017998	TAA	2	6	3336	3341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935782
82	NC_017998	T	6	6	3348	3353	0 %	100 %	0 %	0 %	390935782
83	NC_017998	A	6	6	3374	3379	100 %	0 %	0 %	0 %	390935782
84	NC_017998	CATA	2	8	3390	3397	50 %	25 %	0 %	25 %	390935782
85	NC_017998	T	6	6	3398	3403	0 %	100 %	0 %	0 %	390935782
86	NC_017998	CTT	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935782
87	NC_017998	TCT	2	6	3419	3424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935782
88	NC_017998	GAA	2	6	3425	3430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935782
89	NC_017998	A	6	6	3470	3475	100 %	0 %	0 %	0 %	390935782
90	NC_017998	TC	3	6	3501	3506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017998	TAAT	2	8	3511	3518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017998	TAA	2	6	3523	3528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017998	AT	3	6	3575	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017998	AT	3	6	3595	3600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017998	A	6	6	3601	3606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017998	A	7	7	3608	3614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017998	AT	3	6	3655	3660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017998	TAA	2	6	3664	3669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935783
99	NC_017998	T	9	9	3699	3707	0 %	100 %	0 %	0 %	390935783
100	NC_017998	TTA	3	9	3716	3724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935783
101	NC_017998	TTA	2	6	3776	3781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935783
102	NC_017998	AT	4	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	390935783
103	NC_017998	ATC	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935783
104	NC_017998	T	8	8	3839	3846	0 %	100 %	0 %	0 %	390935783
105	NC_017998	TTC	3	9	3871	3879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935783
106	NC_017998	ATT	2	6	3883	3888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935783
107	NC_017998	T	8	8	3896	3903	0 %	100 %	0 %	0 %	390935783
108	NC_017998	TCT	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935783
109	NC_017998	CTT	2	6	3936	3941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935783
110	NC_017998	T	6	6	3958	3963	0 %	100 %	0 %	0 %	390935783
111	NC_017998	AT	3	6	3976	3981	50 %	50 %	0 %	0 %	390935783
112	NC_017998	A	6	6	4009	4014	100 %	0 %	0 %	0 %	390935783
113	NC_017998	T	7	7	4072	4078	0 %	100 %	0 %	0 %	390935783
114	NC_017998	AAT	2	6	4114	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935783
115	NC_017998	ATT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935783
116	NC_017998	TA	3	6	4134	4139	50 %	50 %	0 %	0 %	390935783
117	NC_017998	AAT	2	6	4153	4158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935783
118	NC_017998	TC	3	6	4168	4173	0 %	50 %	0 %	50 %	390935783
119	NC_017998	AGTT	2	8	4195	4202	25 %	50 %	25 %	0 %	390935783
120	NC_017998	TA	3	6	4246	4251	50 %	50 %	0 %	0 %	390935783
121	NC_017998	AATT	2	8	4303	4310	50 %	50 %	0 %	0 %	390935783
122	NC_017998	CTT	2	6	4344	4349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935783
123	NC_017998	AAAT	2	8	4354	4361	75 %	25 %	0 %	0 %	390935783
124	NC_017998	AATT	2	8	4519	4526	50 %	50 %	0 %	0 %	390935783
125	NC_017998	ATTA	2	8	4602	4609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017998	TAAT	2	8	4610	4617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017998	AAT	2	6	4623	4628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017998	TA	3	6	4642	4647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017998	AT	3	6	4668	4673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017998	AT	3	6	4675	4680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017998	AAAAC	2	10	4695	4704	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017998	A	8	8	4739	4746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017998	TA	3	6	4754	4759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017998	TTTA	2	8	4774	4781	25 %	75 %	0 %	0 %	390935784
135	NC_017998	TGA	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935784
136	NC_017998	ACT	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935784
137	NC_017998	AT	3	6	4923	4928	50 %	50 %	0 %	0 %	390935784
138	NC_017998	CAG	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935784
139	NC_017998	TGCC	2	8	5008	5015	0 %	25 %	25 %	50 %	390935784
140	NC_017998	TGA	2	6	5042	5047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935784
141	NC_017998	TA	4	8	5048	5055	50 %	50 %	0 %	0 %	390935784
142	NC_017998	TAA	2	6	5084	5089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935784
143	NC_017998	AT	3	6	5167	5172	50 %	50 %	0 %	0 %	390935784
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411	NC_017998	CTT	2	6	14754	14759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935793
412	NC_017998	TCC	2	6	14801	14806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935793
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421	NC_017998	TAAA	2	8	15045	15052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_017998	TAA	2	6	15087	15092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_017998	TTA	2	6	15134	15139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_017998	CAT	2	6	15344	15349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_017998	CAT	2	6	15366	15371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_017998	T	6	6	15388	15393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_017998	TTG	2	6	15532	15537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_017998	T	9	9	15584	15592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_017998	GAA	2	6	15640	15645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_017998	ATA	2	6	15647	15652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_017998	ATA	3	9	15675	15683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017998	TTA	2	6	15713	15718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_017998	ATT	2	6	15729	15734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935794
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451	NC_017998	AT	4	8	15899	15906	50 %	50 %	0 %	0 %	390935794
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459	NC_017998	TAT	2	6	16119	16124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935794
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461	NC_017998	CTTG	2	8	16184	16191	0 %	50 %	25 %	25 %	390935794
462	NC_017998	TAT	2	6	16285	16290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935794
463	NC_017998	CTTTA	2	10	16306	16315	20 %	60 %	0 %	20 %	390935794
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481	NC_017998	TCA	2	6	16757	16762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935794
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