MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 chromosome

Total Repeats: 63525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017992	CTA	2	6	130337	130342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933259
3002	NC_017992	GCT	2	6	130372	130377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933259
3003	NC_017992	TGCT	2	8	130443	130450	0 %	50 %	25 %	25 %	390933259
3004	NC_017992	TGC	2	6	130473	130478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933259
3005	NC_017992	CTA	2	6	130505	130510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933259
3006	NC_017992	GCC	2	6	130543	130548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933259
3007	NC_017992	TGCT	2	8	130611	130618	0 %	50 %	25 %	25 %	390933259
3008	NC_017992	TGC	2	6	130641	130646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933259
3009	NC_017992	CTA	2	6	130673	130678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933259
3010	NC_017992	GCC	2	6	130711	130716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933259
3011	NC_017992	TGCT	2	8	130779	130786	0 %	50 %	25 %	25 %	390933259
3012	NC_017992	TGC	2	6	130809	130814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933259
3013	NC_017992	CTA	2	6	130841	130846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933259
3014	NC_017992	CTC	2	6	130869	130874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933259
3015	NC_017992	GGC	2	6	130875	130880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390933259
3016	NC_017992	ATT	2	6	130902	130907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933259
3017	NC_017992	T	6	6	130910	130915	0 %	100 %	0 %	0 %	390933259
3018	NC_017992	CAA	2	6	130925	130930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933259
3019	NC_017992	TTCT	2	8	130931	130938	0 %	75 %	0 %	25 %	390933259
3020	NC_017992	TGTAGC	2	12	131064	131075	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390933259
3021	NC_017992	CTA	2	6	131108	131113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933259
3022	NC_017992	ATC	2	6	131196	131201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933259
3023	NC_017992	TCT	2	6	131225	131230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933259
3024	NC_017992	ATT	2	6	131247	131252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933259
3025	NC_017992	AGA	2	6	131298	131303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933259
3026	NC_017992	TCT	2	6	131311	131316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933259
3027	NC_017992	GCT	2	6	131425	131430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933259
3028	NC_017992	TCT	2	6	131437	131442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933259
3029	NC_017992	GCCGAC	2	12	131443	131454	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390933259
3030	NC_017992	TCG	2	6	131591	131596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933259
3031	NC_017992	TCT	2	6	131605	131610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933259
3032	NC_017992	GCTGAC	2	12	131611	131622	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390933259
3033	NC_017992	GCT	2	6	131761	131766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933259
3034	NC_017992	TCT	2	6	131773	131778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933259
3035	NC_017992	GCCGAC	2	12	131779	131790	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390933259
3036	NC_017992	GCT	2	6	131929	131934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933259
3037	NC_017992	TCT	2	6	131941	131946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933259
3038	NC_017992	GCCGAC	2	12	131947	131958	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390933259
3039	NC_017992	ATT	2	6	132099	132104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933259
3040	NC_017992	TTC	2	6	132171	132176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933259
3041	NC_017992	TAT	2	6	132266	132271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933259
3042	NC_017992	T	7	7	132336	132342	0 %	100 %	0 %	0 %	390933259
3043	NC_017992	ATT	2	6	132364	132369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933259
3044	NC_017992	CCT	2	6	132373	132378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_017992	TTTA	2	8	132384	132391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017992	T	7	7	132420	132426	0 %	100 %	0 %	0 %	390933260
3047	NC_017992	GTT	2	6	132434	132439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933260
3048	NC_017992	TA	3	6	132523	132528	50 %	50 %	0 %	0 %	390933260
3049	NC_017992	TCA	2	6	132572	132577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933260
3050	NC_017992	AAT	2	6	132660	132665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933260
3051	NC_017992	TTCT	2	8	132690	132697	0 %	75 %	0 %	25 %	390933260
3052	NC_017992	TAA	2	6	132699	132704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933260
3053	NC_017992	T	8	8	132726	132733	0 %	100 %	0 %	0 %	390933260
3054	NC_017992	TTTC	2	8	132735	132742	0 %	75 %	0 %	25 %	390933260
3055	NC_017992	AT	3	6	132787	132792	50 %	50 %	0 %	0 %	390933260
3056	NC_017992	TAT	2	6	132850	132855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933260
3057	NC_017992	TTA	2	6	132908	132913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933260
3058	NC_017992	TTG	2	6	132917	132922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933260
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3060	NC_017992	CTT	2	6	133011	133016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933260
3061	NC_017992	TAA	2	6	133024	133029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933260
3062	NC_017992	ATT	2	6	133049	133054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933260
3063	NC_017992	T	7	7	133057	133063	0 %	100 %	0 %	0 %	390933260
3064	NC_017992	CTT	2	6	133071	133076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933260
3065	NC_017992	AATT	2	8	133089	133096	50 %	50 %	0 %	0 %	390933260
3066	NC_017992	CAT	2	6	133104	133109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933260
3067	NC_017992	TAC	2	6	133114	133119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933260
3068	NC_017992	TGA	2	6	133139	133144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933260
3069	NC_017992	TCA	2	6	133196	133201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933260
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3072	NC_017992	AAT	2	6	133370	133375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933260
3073	NC_017992	CAT	2	6	133558	133563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933260
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3075	NC_017992	AAAT	2	8	133702	133709	75 %	25 %	0 %	0 %	390933260
3076	NC_017992	TCTA	2	8	133738	133745	25 %	50 %	0 %	25 %	390933260
3077	NC_017992	TCAT	2	8	133820	133827	25 %	50 %	0 %	25 %	390933260
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3089	NC_017992	TTA	2	6	134111	134116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933260
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3092	NC_017992	GT	4	8	134295	134302	0 %	50 %	50 %	0 %	390933260
3093	NC_017992	TAAA	2	8	134310	134317	75 %	25 %	0 %	0 %	390933260
3094	NC_017992	TTA	2	6	134322	134327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933260
3095	NC_017992	TCA	2	6	134330	134335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933260
3096	NC_017992	T	7	7	134363	134369	0 %	100 %	0 %	0 %	390933260
3097	NC_017992	TCA	2	6	134387	134392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933260
3098	NC_017992	AC	3	6	134440	134445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_017992	AAT	2	6	134537	134542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933261
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3103	NC_017992	TA	3	6	134774	134779	50 %	50 %	0 %	0 %	390933261
3104	NC_017992	T	8	8	134789	134796	0 %	100 %	0 %	0 %	390933261
3105	NC_017992	ATTT	2	8	134820	134827	25 %	75 %	0 %	0 %	390933261
3106	NC_017992	CA	3	6	134846	134851	50 %	0 %	0 %	50 %	390933261
3107	NC_017992	ACA	2	6	134860	134865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933261
3108	NC_017992	ATTC	2	8	134882	134889	25 %	50 %	0 %	25 %	390933261
3109	NC_017992	A	7	7	134906	134912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017992	T	6	6	134984	134989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017992	CAC	2	6	135116	135121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_017992	A	6	6	135152	135157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017992	AAAT	2	8	135308	135315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017992	TAA	2	6	135354	135359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017992	ATA	2	6	135364	135369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017992	TTAAT	2	10	135397	135406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017992	T	6	6	135408	135413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017992	AT	3	6	135416	135421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017992	TA	3	6	135423	135428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017992	T	6	6	135443	135448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017992	ATA	2	6	135449	135454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017992	ATT	2	6	135468	135473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017992	TTGA	2	8	135482	135489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017992	TAA	2	6	135506	135511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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