MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 chromosome

Total Repeats: 63525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017992	GTATAT	2	12	110361	110372	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390933243
2502	NC_017992	ATA	2	6	110394	110399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933243
2503	NC_017992	ATT	2	6	110410	110415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933243
2504	NC_017992	TTA	2	6	110430	110435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933243
2505	NC_017992	TTCT	2	8	110445	110452	0 %	75 %	0 %	25 %	390933243
2506	NC_017992	GAC	2	6	110531	110536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933243
2507	NC_017992	T	6	6	110573	110578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_017992	ATT	2	6	110589	110594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_017992	ATCT	2	8	110660	110667	25 %	50 %	0 %	25 %	390933244
2510	NC_017992	TTC	2	6	110674	110679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933244
2511	NC_017992	TTTGT	2	10	110696	110705	0 %	80 %	20 %	0 %	390933244
2512	NC_017992	T	6	6	110721	110726	0 %	100 %	0 %	0 %	390933244
2513	NC_017992	GCC	2	6	110729	110734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933244
2514	NC_017992	AT	3	6	110749	110754	50 %	50 %	0 %	0 %	390933244
2515	NC_017992	ACA	2	6	110756	110761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933244
2516	NC_017992	TCC	2	6	110821	110826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933244
2517	NC_017992	TAT	2	6	110827	110832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933244
2518	NC_017992	CGG	2	6	110833	110838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390933244
2519	NC_017992	TGT	2	6	110839	110844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933244
2520	NC_017992	CAT	2	6	110851	110856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933244
2521	NC_017992	TAA	2	6	110901	110906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933244
2522	NC_017992	AAT	2	6	110914	110919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933244
2523	NC_017992	ATC	2	6	110978	110983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933244
2524	NC_017992	CTTC	2	8	111055	111062	0 %	50 %	0 %	50 %	390933244
2525	NC_017992	A	6	6	111133	111138	100 %	0 %	0 %	0 %	390933244
2526	NC_017992	AGC	2	6	111181	111186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933244
2527	NC_017992	AT	3	6	111237	111242	50 %	50 %	0 %	0 %	390933244
2528	NC_017992	GAA	2	6	111259	111264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933244
2529	NC_017992	A	6	6	111269	111274	100 %	0 %	0 %	0 %	390933244
2530	NC_017992	TGA	2	6	111359	111364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933244
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2532	NC_017992	AAT	2	6	111437	111442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933244
2533	NC_017992	GCA	2	6	111443	111448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933244
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2535	NC_017992	TAA	2	6	111489	111494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933244
2536	NC_017992	TAA	2	6	111511	111516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933244
2537	NC_017992	A	6	6	111581	111586	100 %	0 %	0 %	0 %	390933244
2538	NC_017992	ACA	2	6	111624	111629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933244
2539	NC_017992	ACA	2	6	111710	111715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933244
2540	NC_017992	CCA	2	6	111758	111763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933244
2541	NC_017992	GCA	2	6	111926	111931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933244
2542	NC_017992	A	6	6	111953	111958	100 %	0 %	0 %	0 %	390933244
2543	NC_017992	T	7	7	111966	111972	0 %	100 %	0 %	0 %	390933244
2544	NC_017992	CTC	2	6	111982	111987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_017992	T	6	6	112018	112023	0 %	100 %	0 %	0 %	390933245
2546	NC_017992	T	6	6	112130	112135	0 %	100 %	0 %	0 %	390933245
2547	NC_017992	CAAT	2	8	112160	112167	50 %	25 %	0 %	25 %	390933245
2548	NC_017992	T	6	6	112239	112244	0 %	100 %	0 %	0 %	390933245
2549	NC_017992	CTG	2	6	112247	112252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933245
2550	NC_017992	T	6	6	112264	112269	0 %	100 %	0 %	0 %	390933245
2551	NC_017992	TTG	2	6	112280	112285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933245
2552	NC_017992	CTG	2	6	112292	112297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933245
2553	NC_017992	AATTT	2	10	112339	112348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_017992	TAT	2	6	112450	112455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_017992	AC	3	6	112471	112476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2556	NC_017992	ATT	2	6	112499	112504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933246
2557	NC_017992	T	7	7	112601	112607	0 %	100 %	0 %	0 %	390933246
2558	NC_017992	TGAT	2	8	112611	112618	25 %	50 %	25 %	0 %	390933246
2559	NC_017992	CGC	2	6	112644	112649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933246
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2561	NC_017992	ATT	2	6	112697	112702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933246
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2566	NC_017992	TAC	2	6	112942	112947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933246
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2569	NC_017992	ATGC	2	8	113105	113112	25 %	25 %	25 %	25 %	390933246
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2572	NC_017992	TCCT	2	8	113169	113176	0 %	50 %	0 %	50 %	390933246
2573	NC_017992	TAA	2	6	113230	113235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933246
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2582	NC_017992	T	6	6	113644	113649	0 %	100 %	0 %	0 %	390933246
2583	NC_017992	TA	3	6	113679	113684	50 %	50 %	0 %	0 %	390933246
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2590	NC_017992	ATC	2	6	113956	113961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933246
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2592	NC_017992	TAT	2	6	114030	114035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933246
2593	NC_017992	GAT	2	6	114046	114051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933246
2594	NC_017992	ATT	2	6	114074	114079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933246
2595	NC_017992	CT	3	6	114138	114143	0 %	50 %	0 %	50 %	390933246
2596	NC_017992	TA	3	6	114145	114150	50 %	50 %	0 %	0 %	390933246
2597	NC_017992	TCT	2	6	114161	114166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933246
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2599	NC_017992	CTT	2	6	114180	114185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933246
2600	NC_017992	TCA	2	6	114195	114200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933246
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2602	NC_017992	GATA	2	8	114307	114314	50 %	25 %	25 %	0 %	390933246
2603	NC_017992	TCA	2	6	114338	114343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933246
2604	NC_017992	T	6	6	114353	114358	0 %	100 %	0 %	0 %	390933246
2605	NC_017992	ATT	2	6	114359	114364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933246
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2607	NC_017992	CTTT	2	8	114386	114393	0 %	75 %	0 %	25 %	390933246
2608	NC_017992	ATG	2	6	114396	114401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933246
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2611	NC_017992	TAT	2	6	114478	114483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933246
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2613	NC_017992	TGG	2	6	114574	114579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390933246
2614	NC_017992	TCG	2	6	114593	114598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933246
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2619	NC_017992	ATT	2	6	114920	114925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933246
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2621	NC_017992	TTTA	2	8	115039	115046	25 %	75 %	0 %	0 %	390933246
2622	NC_017992	T	6	6	115127	115132	0 %	100 %	0 %	0 %	390933246
2623	NC_017992	A	7	7	115189	115195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2625	NC_017992	TAT	2	6	115211	115216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3000	NC_017992	TGC	2	6	130305	130310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933259

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