MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 chromosome

Total Repeats: 63525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017992	TCA	2	6	239560	239565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933361
5502	NC_017992	T	6	6	239591	239596	0 %	100 %	0 %	0 %	390933361
5503	NC_017992	ACT	2	6	239620	239625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933362
5504	NC_017992	GAA	2	6	239659	239664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933362
5505	NC_017992	T	6	6	239687	239692	0 %	100 %	0 %	0 %	390933362
5506	NC_017992	TCA	2	6	239700	239705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933362
5507	NC_017992	GAC	2	6	239769	239774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933362
5508	NC_017992	TA	3	6	239781	239786	50 %	50 %	0 %	0 %	390933362
5509	NC_017992	TG	3	6	239824	239829	0 %	50 %	50 %	0 %	390933362
5510	NC_017992	TTC	2	6	239843	239848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933362
5511	NC_017992	A	6	6	239902	239907	100 %	0 %	0 %	0 %	390933362
5512	NC_017992	TC	3	6	239911	239916	0 %	50 %	0 %	50 %	390933362
5513	NC_017992	CTT	2	6	239923	239928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933362
5514	NC_017992	GCC	2	6	239954	239959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933362
5515	NC_017992	TCC	2	6	240029	240034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933362
5516	NC_017992	TAC	2	6	240137	240142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933362
5517	NC_017992	TCC	2	6	240206	240211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933362
5518	NC_017992	TTC	2	6	240212	240217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933362
5519	NC_017992	TCT	2	6	240222	240227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933362
5520	NC_017992	T	7	7	240288	240294	0 %	100 %	0 %	0 %	390933362
5521	NC_017992	TGC	2	6	240307	240312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933362
5522	NC_017992	AGC	2	6	240324	240329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933362
5523	NC_017992	TCC	2	6	240338	240343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933362
5524	NC_017992	ATG	2	6	240387	240392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933362
5525	NC_017992	ATC	2	6	240464	240469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933362
5526	NC_017992	CTT	2	6	240505	240510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933362
5527	NC_017992	CAA	2	6	240514	240519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933362
5528	NC_017992	TCT	2	6	240523	240528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933362
5529	NC_017992	TCA	2	6	240531	240536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933362
5530	NC_017992	ATC	2	6	240584	240589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933362
5531	NC_017992	TGCC	2	8	240595	240602	0 %	25 %	25 %	50 %	390933362
5532	NC_017992	TCA	2	6	240612	240617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933362
5533	NC_017992	TGATGG	2	12	240641	240652	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	390933362
5534	NC_017992	GAC	2	6	240677	240682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933362
5535	NC_017992	T	6	6	240686	240691	0 %	100 %	0 %	0 %	390933362
5536	NC_017992	CCTT	2	8	240881	240888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_017992	ATTT	2	8	240940	240947	25 %	75 %	0 %	0 %	390933363
5538	NC_017992	T	7	7	240945	240951	0 %	100 %	0 %	0 %	390933363
5539	NC_017992	GAT	2	6	240952	240957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933363
5540	NC_017992	GTC	2	6	241000	241005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933363
5541	NC_017992	TAAA	2	8	241006	241013	75 %	25 %	0 %	0 %	390933363
5542	NC_017992	CT	3	6	241056	241061	0 %	50 %	0 %	50 %	390933363
5543	NC_017992	GCCA	2	8	241113	241120	25 %	0 %	25 %	50 %	390933363
5544	NC_017992	TCT	2	6	241122	241127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933363
5545	NC_017992	T	6	6	241143	241148	0 %	100 %	0 %	0 %	390933363
5546	NC_017992	ACT	2	6	241166	241171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933363
5547	NC_017992	T	7	7	241224	241230	0 %	100 %	0 %	0 %	390933363
5548	NC_017992	ATC	2	6	241300	241305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933363
5549	NC_017992	CGA	2	6	241314	241319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933363
5550	NC_017992	CGG	2	6	241449	241454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390933363
5551	NC_017992	TA	3	6	241497	241502	50 %	50 %	0 %	0 %	390933363
5552	NC_017992	CAT	2	6	241506	241511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933363
5553	NC_017992	T	6	6	241563	241568	0 %	100 %	0 %	0 %	390933363
5554	NC_017992	TCT	2	6	241638	241643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933363
5555	NC_017992	CT	3	6	241678	241683	0 %	50 %	0 %	50 %	390933363
5556	NC_017992	TCA	2	6	241694	241699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933363
5557	NC_017992	TCT	3	9	241739	241747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933363
5558	NC_017992	TTC	3	9	241756	241764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933363
5559	NC_017992	TCT	2	6	241880	241885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933363
5560	NC_017992	CT	3	6	241990	241995	0 %	50 %	0 %	50 %	390933363
5561	NC_017992	TACA	2	8	242053	242060	50 %	25 %	0 %	25 %	390933363
5562	NC_017992	A	6	6	242096	242101	100 %	0 %	0 %	0 %	390933363
5563	NC_017992	T	6	6	242137	242142	0 %	100 %	0 %	0 %	390933363
5564	NC_017992	ATC	2	6	242260	242265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933363
5565	NC_017992	CTC	2	6	242308	242313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933363
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5567	NC_017992	CTGG	2	8	242377	242384	0 %	25 %	50 %	25 %	390933363
5568	NC_017992	TTC	2	6	242440	242445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933363
5569	NC_017992	TCT	2	6	242511	242516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933363
5570	NC_017992	AT	3	6	242565	242570	50 %	50 %	0 %	0 %	390933363
5571	NC_017992	TTTA	2	8	242614	242621	25 %	75 %	0 %	0 %	390933363
5572	NC_017992	T	7	7	242626	242632	0 %	100 %	0 %	0 %	390933363
5573	NC_017992	ATT	2	6	242642	242647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933363
5574	NC_017992	T	6	6	242696	242701	0 %	100 %	0 %	0 %	390933363
5575	NC_017992	TCT	2	6	242715	242720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933363
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5579	NC_017992	A	7	7	242865	242871	100 %	0 %	0 %	0 %	390933363
5580	NC_017992	A	6	6	242957	242962	100 %	0 %	0 %	0 %	390933363
5581	NC_017992	GCA	2	6	243104	243109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933363
5582	NC_017992	CGC	2	6	243207	243212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933363
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5584	NC_017992	GAC	2	6	243257	243262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933363
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5588	NC_017992	ATGA	2	8	243511	243518	50 %	25 %	25 %	0 %	390933364
5589	NC_017992	TGCTG	2	10	243557	243566	0 %	40 %	40 %	20 %	390933364
5590	NC_017992	CGTC	2	8	243617	243624	0 %	25 %	25 %	50 %	390933364
5591	NC_017992	CAT	2	6	243713	243718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933364
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5593	NC_017992	T	6	6	243781	243786	0 %	100 %	0 %	0 %	390933364
5594	NC_017992	CT	4	8	243818	243825	0 %	50 %	0 %	50 %	390933364
5595	NC_017992	ATC	2	6	243849	243854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933364
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5598	NC_017992	TCA	2	6	243997	244002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933364
5599	NC_017992	CTA	2	6	244055	244060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933364
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5601	NC_017992	TCA	2	6	244078	244083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933364
5602	NC_017992	ATA	2	6	244145	244150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_017992	A	6	6	244187	244192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_017992	TGT	2	6	244216	244221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_017992	ATT	3	9	244222	244230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_017992	AAT	2	6	244233	244238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_017992	AG	3	6	244286	244291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_017992	TGG	2	6	244299	244304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_017992	TCT	2	6	244378	244383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_017992	AAG	2	6	244393	244398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_017992	TAA	2	6	244437	244442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_017992	GGT	2	6	244444	244449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_017992	GA	3	6	244478	244483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_017992	T	8	8	244484	244491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_017992	ATA	2	6	244497	244502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_017992	TTGAT	2	10	244515	244524	20 %	60 %	20 %	0 %	390933365
5617	NC_017992	GAAA	2	8	244537	244544	75 %	0 %	25 %	0 %	390933365
5618	NC_017992	AGA	2	6	244552	244557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933365
5619	NC_017992	A	6	6	244564	244569	100 %	0 %	0 %	0 %	390933365
5620	NC_017992	TAAA	2	8	244584	244591	75 %	25 %	0 %	0 %	390933365
5621	NC_017992	GTA	2	6	244610	244615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933365
5622	NC_017992	ACG	2	6	244701	244706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933365
5623	NC_017992	CGG	2	6	244792	244797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390933365
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5625	NC_017992	GGC	2	6	244901	244906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390933365
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