MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 chromosome

Total Repeats: 63525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017992	T	92	92	1	92	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017992	TTA	2	6	98	103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017992	ATT	2	6	115	120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933133
4	NC_017992	TATAA	2	10	137	146	60 %	40 %	0 %	0 %	390933133
5	NC_017992	A	6	6	159	164	100 %	0 %	0 %	0 %	390933133
6	NC_017992	GAA	2	6	191	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933133
7	NC_017992	ATG	2	6	296	301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933133
8	NC_017992	A	6	6	318	323	100 %	0 %	0 %	0 %	390933133
9	NC_017992	AT	3	6	329	334	50 %	50 %	0 %	0 %	390933133
10	NC_017992	TGC	2	6	345	350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933133
11	NC_017992	TGA	2	6	366	371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933133
12	NC_017992	ATC	2	6	507	512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933133
13	NC_017992	AG	3	6	665	670	50 %	0 %	50 %	0 %	390933133
14	NC_017992	AAAC	2	8	723	730	75 %	0 %	0 %	25 %	390933133
15	NC_017992	ATTTA	2	10	773	782	40 %	60 %	0 %	0 %	390933133
16	NC_017992	TAA	2	6	788	793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017992	TATAAA	2	12	831	842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017992	GGA	2	6	862	867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017992	ATT	2	6	884	889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933134
20	NC_017992	T	6	6	906	911	0 %	100 %	0 %	0 %	390933134
21	NC_017992	TC	3	6	933	938	0 %	50 %	0 %	50 %	390933134
22	NC_017992	TGC	2	6	978	983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933134
23	NC_017992	CTT	2	6	1003	1008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933134
24	NC_017992	AGC	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933134
25	NC_017992	T	6	6	1053	1058	0 %	100 %	0 %	0 %	390933134
26	NC_017992	TTC	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933134
27	NC_017992	CAG	2	6	1181	1186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933134
28	NC_017992	GCA	2	6	1222	1227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933134
29	NC_017992	CCG	2	6	1270	1275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933134
30	NC_017992	CCA	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933134
31	NC_017992	CTA	2	6	1301	1306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933134
32	NC_017992	TCTT	2	8	1310	1317	0 %	75 %	0 %	25 %	390933134
33	NC_017992	AT	3	6	1377	1382	50 %	50 %	0 %	0 %	390933134
34	NC_017992	TCA	3	9	1390	1398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933134
35	NC_017992	TGG	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390933134
36	NC_017992	TTA	2	6	1424	1429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933134
37	NC_017992	CT	3	6	1508	1513	0 %	50 %	0 %	50 %	390933134
38	NC_017992	TG	3	6	1619	1624	0 %	50 %	50 %	0 %	390933134
39	NC_017992	CAT	2	6	1680	1685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933134
40	NC_017992	TTC	2	6	1707	1712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933134
41	NC_017992	T	7	7	1734	1740	0 %	100 %	0 %	0 %	390933134
42	NC_017992	ATACC	2	10	1925	1934	40 %	20 %	0 %	40 %	390933134
43	NC_017992	TGT	2	6	1935	1940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933134
44	NC_017992	T	6	6	1978	1983	0 %	100 %	0 %	0 %	390933134
45	NC_017992	TCC	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017992	T	6	6	2087	2092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017992	AGA	2	6	2135	2140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017992	CT	3	6	2238	2243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017992	ATA	2	6	2275	2280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017992	TAA	2	6	2293	2298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017992	A	6	6	2313	2318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017992	AT	3	6	2351	2356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017992	ACA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933135
54	NC_017992	CAC	2	6	2410	2415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933135
55	NC_017992	GCA	2	6	2511	2516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933135
56	NC_017992	TTC	2	6	2594	2599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933135
57	NC_017992	TCT	2	6	2637	2642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933135
58	NC_017992	CCT	2	6	2785	2790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933135
59	NC_017992	T	6	6	2862	2867	0 %	100 %	0 %	0 %	390933135
60	NC_017992	GTC	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933135
61	NC_017992	TC	3	6	2877	2882	0 %	50 %	0 %	50 %	390933135
62	NC_017992	TCC	2	6	2894	2899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017992	T	6	6	2900	2905	0 %	100 %	0 %	0 %	390933136
64	NC_017992	CCAA	2	8	2931	2938	50 %	0 %	0 %	50 %	390933136
65	NC_017992	CAA	2	6	3032	3037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933136
66	NC_017992	TTG	2	6	3121	3126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933136
67	NC_017992	CCA	2	6	3154	3159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933136
68	NC_017992	CTAT	2	8	3163	3170	25 %	50 %	0 %	25 %	390933136
69	NC_017992	TGA	2	6	3282	3287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933136
70	NC_017992	AAAAG	2	10	3302	3311	80 %	0 %	20 %	0 %	390933136
71	NC_017992	T	6	6	3384	3389	0 %	100 %	0 %	0 %	390933136
72	NC_017992	TAA	2	6	3474	3479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017992	TAT	3	9	3498	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017992	CAT	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017992	T	6	6	3517	3522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017992	T	7	7	3543	3549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017992	A	8	8	3599	3606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017992	TGG	2	6	3628	3633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017992	ATT	2	6	3717	3722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017992	A	6	6	3737	3742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017992	TGG	2	6	3759	3764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017992	TAT	2	6	3968	3973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017992	T	6	6	4011	4016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017992	AAT	3	9	4074	4082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017992	TTTTTA	2	12	4088	4099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017992	TGC	2	6	4153	4158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017992	TGA	2	6	4159	4164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017992	AGG	2	6	4196	4201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017992	T	7	7	4204	4210	0 %	100 %	0 %	0 %	390933137
90	NC_017992	AAT	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
91	NC_017992	T	6	6	4255	4260	0 %	100 %	0 %	0 %	390933137
92	NC_017992	TGC	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933137
93	NC_017992	TAA	2	6	4303	4308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
94	NC_017992	A	7	7	4351	4357	100 %	0 %	0 %	0 %	390933137
95	NC_017992	TCA	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933137
96	NC_017992	AAT	2	6	4422	4427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
97	NC_017992	T	7	7	4529	4535	0 %	100 %	0 %	0 %	390933137
98	NC_017992	AAC	2	6	4638	4643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933137
99	NC_017992	AAC	2	6	4725	4730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933137
100	NC_017992	ATG	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933137
101	NC_017992	TTG	2	6	4822	4827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933137
102	NC_017992	ACA	2	6	4846	4851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933137
103	NC_017992	TCA	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933137
104	NC_017992	TCC	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933137
105	NC_017992	GGA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390933137
106	NC_017992	AAG	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933137
107	NC_017992	TAA	2	6	5134	5139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
108	NC_017992	CGG	3	9	5237	5245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390933137
109	NC_017992	GAAA	2	8	5316	5323	75 %	0 %	25 %	0 %	390933137
110	NC_017992	ATG	2	6	5446	5451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933137
111	NC_017992	ATA	2	6	5565	5570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
112	NC_017992	AGA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933137
113	NC_017992	ACA	2	6	5755	5760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933137
114	NC_017992	AGC	2	6	5792	5797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933137
115	NC_017992	ATCT	2	8	5806	5813	25 %	50 %	0 %	25 %	390933137
116	NC_017992	GCC	2	6	6039	6044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933137
117	NC_017992	TAG	2	6	6070	6075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933137
118	NC_017992	GAT	2	6	6189	6194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933137
119	NC_017992	ATC	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933137
120	NC_017992	AAG	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933137
121	NC_017992	AGA	2	6	6371	6376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933137
122	NC_017992	ATA	2	6	6396	6401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
123	NC_017992	TA	3	6	6400	6405	50 %	50 %	0 %	0 %	390933137
124	NC_017992	AC	3	6	6412	6417	50 %	0 %	0 %	50 %	390933137
125	NC_017992	ACA	2	6	6439	6444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933137
126	NC_017992	TA	3	6	6450	6455	50 %	50 %	0 %	0 %	390933137
127	NC_017992	AAT	2	6	6471	6476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
128	NC_017992	AAT	2	6	6521	6526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933137
129	NC_017992	TCA	2	6	6619	6624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933138
130	NC_017992	A	6	6	6649	6654	100 %	0 %	0 %	0 %	390933138
131	NC_017992	CAT	2	6	6693	6698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933138
132	NC_017992	CTTT	2	8	6706	6713	0 %	75 %	0 %	25 %	390933138
133	NC_017992	TCA	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933138
134	NC_017992	TTG	2	6	6800	6805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933138
135	NC_017992	TC	3	6	6815	6820	0 %	50 %	0 %	50 %	390933138
136	NC_017992	T	6	6	6836	6841	0 %	100 %	0 %	0 %	390933138
137	NC_017992	CTATT	2	10	6854	6863	20 %	60 %	0 %	20 %	390933138
138	NC_017992	GCT	2	6	6879	6884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933138
139	NC_017992	TTG	3	9	6895	6903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933138
140	NC_017992	CT	3	6	6921	6926	0 %	50 %	0 %	50 %	390933138
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401	NC_017992	TCA	2	6	18823	18828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933152
402	NC_017992	ATA	2	6	18833	18838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933152
403	NC_017992	CAAA	2	8	18905	18912	75 %	0 %	0 %	25 %	390933152
404	NC_017992	TAAAT	2	10	18924	18933	60 %	40 %	0 %	0 %	390933152
405	NC_017992	T	6	6	18933	18938	0 %	100 %	0 %	0 %	390933152
406	NC_017992	TCA	2	6	18955	18960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933152
407	NC_017992	T	6	6	18978	18983	0 %	100 %	0 %	0 %	390933152
408	NC_017992	CAAT	2	8	19088	19095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
409	NC_017992	TAT	2	6	19104	19109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_017992	TCAA	2	8	19142	19149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
411	NC_017992	TAT	2	6	19185	19190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_017992	ATG	2	6	19216	19221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
413	NC_017992	CGGGA	2	10	19263	19272	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
414	NC_017992	T	7	7	19308	19314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_017992	GTT	2	6	19340	19345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
416	NC_017992	TCA	2	6	19454	19459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933153
417	NC_017992	GCA	2	6	19466	19471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933153
418	NC_017992	CAT	2	6	19510	19515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933153
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421	NC_017992	AC	3	6	19675	19680	50 %	0 %	0 %	50 %	390933153
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423	NC_017992	TC	3	6	19728	19733	0 %	50 %	0 %	50 %	390933153
424	NC_017992	GAT	2	6	19766	19771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933153
425	NC_017992	AATA	2	8	19789	19796	75 %	25 %	0 %	0 %	390933153
426	NC_017992	GCA	2	6	19859	19864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933153
427	NC_017992	TA	3	6	20103	20108	50 %	50 %	0 %	0 %	390933153
428	NC_017992	T	6	6	20135	20140	0 %	100 %	0 %	0 %	390933153
429	NC_017992	TGA	2	6	20152	20157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933153
430	NC_017992	A	6	6	20157	20162	100 %	0 %	0 %	0 %	390933153
431	NC_017992	GGA	2	6	20173	20178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390933153
432	NC_017992	AATG	2	8	20186	20193	50 %	25 %	25 %	0 %	390933153
433	NC_017992	A	6	6	20226	20231	100 %	0 %	0 %	0 %	390933154
434	NC_017992	CA	3	6	20391	20396	50 %	0 %	0 %	50 %	390933154
435	NC_017992	AGC	2	6	20411	20416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933154
436	NC_017992	A	6	6	20417	20422	100 %	0 %	0 %	0 %	390933154
437	NC_017992	TGT	2	6	20429	20434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933154
438	NC_017992	ACA	2	6	20458	20463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933154
439	NC_017992	AGA	2	6	20471	20476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933154
440	NC_017992	AGG	2	6	20510	20515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390933154
441	NC_017992	AGT	2	6	20591	20596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933154
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443	NC_017992	GAT	2	6	20661	20666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933154
444	NC_017992	AGC	2	6	20669	20674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933154
445	NC_017992	AGA	2	6	20705	20710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933154
446	NC_017992	ATA	2	6	20910	20915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933154
447	NC_017992	TA	3	6	20934	20939	50 %	50 %	0 %	0 %	390933154
448	NC_017992	GAA	2	6	20970	20975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933154
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451	NC_017992	CAA	2	6	21090	21095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933155
452	NC_017992	AAAG	2	8	21130	21137	75 %	0 %	25 %	0 %	390933155
453	NC_017992	ATT	2	6	21247	21252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933155
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467	NC_017992	ATTG	2	8	21787	21794	25 %	50 %	25 %	0 %	390933155
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469	NC_017992	GATT	2	8	21822	21829	25 %	50 %	25 %	0 %	390933155
470	NC_017992	TAT	2	6	21837	21842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933155
471	NC_017992	ATAA	2	8	21852	21859	75 %	25 %	0 %	0 %	390933155
472	NC_017992	ATG	2	6	21871	21876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933156
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480	NC_017992	AGT	2	6	22225	22230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
481	NC_017992	CT	3	6	22248	22253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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483	NC_017992	CTTT	2	8	22301	22308	0 %	75 %	0 %	25 %	390933157
484	NC_017992	TGA	2	6	22390	22395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933157
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491	NC_017992	TA	3	6	22783	22788	50 %	50 %	0 %	0 %	390933157
492	NC_017992	T	6	6	22822	22827	0 %	100 %	0 %	0 %	390933157
493	NC_017992	ATC	2	6	22843	22848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933157
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