MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM4

Total Repeats: 2174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017959	CCG	2	6	75348	75353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875248
2002	NC_017959	TCA	2	6	75384	75389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389875248
2003	NC_017959	GAA	2	6	75412	75417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389875248
2004	NC_017959	GGC	2	6	75437	75442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875248
2005	NC_017959	CGC	2	6	75472	75477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875248
2006	NC_017959	CGC	2	6	75506	75511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875248
2007	NC_017959	GC	3	6	75550	75555	0 %	0 %	50 %	50 %	389875248
2008	NC_017959	ATG	2	6	75557	75562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389875248
2009	NC_017959	CTGAT	2	10	75604	75613	20 %	40 %	20 %	20 %	389875248
2010	NC_017959	CCGGA	2	10	75618	75627	20 %	0 %	40 %	40 %	389875249
2011	NC_017959	GGC	2	6	75636	75641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875249
2012	NC_017959	GCC	2	6	75657	75662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875249
2013	NC_017959	GCC	2	6	75832	75837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875249
2014	NC_017959	GGC	2	6	75932	75937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875249
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2018	NC_017959	TGC	2	6	76057	76062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875249
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2020	NC_017959	TGC	2	6	76096	76101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875249
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2031	NC_017959	GCGG	2	8	76779	76786	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2032	NC_017959	GCCC	2	8	76796	76803	0 %	0 %	25 %	75 %	389875250
2033	NC_017959	CTC	2	6	76826	76831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389875250
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2040	NC_017959	TGC	2	6	77176	77181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875250
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2048	NC_017959	CATC	2	8	77418	77425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2049	NC_017959	CCCG	2	8	77437	77444	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2050	NC_017959	ACCG	2	8	77478	77485	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2051	NC_017959	TCG	2	6	77528	77533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875251
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2054	NC_017959	CGGC	2	8	77613	77620	0 %	0 %	50 %	50 %	389875251
2055	NC_017959	CCG	2	6	77633	77638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875251
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2072	NC_017959	A	6	6	78079	78084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_017959	GGA	2	6	78142	78147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2099	NC_017959	GTC	2	6	79457	79462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2101	NC_017959	GGA	2	6	79570	79575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_017959	TGGGC	2	10	79610	79619	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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2112	NC_017959	TTC	2	6	80158	80163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2113	NC_017959	CG	3	6	80282	80287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2114	NC_017959	GGC	2	6	80358	80363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2115	NC_017959	TC	3	6	80367	80372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2120	NC_017959	GGA	2	6	80575	80580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_017959	AGT	2	6	80605	80610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2123	NC_017959	CGA	2	6	80648	80653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2124	NC_017959	GGCC	2	8	80671	80678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2125	NC_017959	G	6	6	80760	80765	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_017959	ACC	2	6	80766	80771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2127	NC_017959	GAC	2	6	80793	80798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2128	NC_017959	CGA	2	6	80841	80846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2129	NC_017959	GGA	2	6	81077	81082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_017959	CAGA	2	8	81291	81298	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2131	NC_017959	ACC	2	6	81341	81346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2132	NC_017959	AGG	2	6	81405	81410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_017959	AGC	2	6	81421	81426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2134	NC_017959	AAAG	2	8	81435	81442	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_017959	GAT	2	6	81774	81779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2136	NC_017959	GTT	2	6	81820	81825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2137	NC_017959	GA	3	6	81901	81906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2138	NC_017959	G	6	6	81983	81988	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2139	NC_017959	AGG	2	6	82091	82096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2140	NC_017959	CGG	2	6	82128	82133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2141	NC_017959	TAC	2	6	82302	82307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2142	NC_017959	ACC	2	6	82399	82404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2143	NC_017959	GC	3	6	82506	82511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2144	NC_017959	TGG	2	6	82514	82519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2145	NC_017959	GGT	2	6	82622	82627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2146	NC_017959	GTT	2	6	82713	82718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2147	NC_017959	TCA	2	6	82737	82742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2148	NC_017959	CGT	2	6	82817	82822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2149	NC_017959	GGAC	2	8	82899	82906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2150	NC_017959	CCTC	2	8	82993	83000	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2151	NC_017959	ACC	2	6	83032	83037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2152	NC_017959	GT	3	6	83053	83058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2153	NC_017959	GCA	2	6	83063	83068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2154	NC_017959	GCTGA	2	10	83073	83082	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2155	NC_017959	CGC	2	6	83118	83123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2156	NC_017959	CA	4	8	83157	83164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2157	NC_017959	TCA	2	6	83165	83170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2158	NC_017959	TGG	2	6	83244	83249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2159	NC_017959	ACC	2	6	83265	83270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2160	NC_017959	ATCCC	2	10	83273	83282	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2161	NC_017959	ATGG	2	8	83368	83375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2162	NC_017959	CAC	2	6	83388	83393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2163	NC_017959	ATCTC	2	10	83405	83414	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2164	NC_017959	AGC	2	6	83455	83460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2165	NC_017959	CAC	2	6	83527	83532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2166	NC_017959	ATCTC	2	10	83544	83553	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2167	NC_017959	AGC	2	6	83594	83599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2168	NC_017959	CGC	2	6	83674	83679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2169	NC_017959	CGC	2	6	83690	83695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2170	NC_017959	GCG	2	6	83698	83703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2171	NC_017959	TGC	2	6	83705	83710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2172	NC_017959	TC	5	10	83727	83736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2173	NC_017959	CAGG	2	8	83743	83750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2174	NC_017959	CTTC	3	12	83812	83823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.