MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1802

Total Repeats: 3714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017590	GAC	2	6	98647	98652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361824
2502	NC_017590	CCGC	2	8	98670	98677	0 %	0 %	25 %	75 %	386361824
2503	NC_017590	CCT	3	9	98694	98702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361824
2504	NC_017590	GCG	2	6	98707	98712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361824
2505	NC_017590	GAG	2	6	98716	98721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361824
2506	NC_017590	CCT	2	6	98751	98756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361824
2507	NC_017590	CGG	2	6	98757	98762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361824
2508	NC_017590	ATC	2	6	98765	98770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361824
2509	NC_017590	AGG	2	6	98774	98779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361824
2510	NC_017590	TGG	2	6	98831	98836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361824
2511	NC_017590	GAG	2	6	98938	98943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361824
2512	NC_017590	AGG	2	6	99071	99076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361824
2513	NC_017590	GGCGT	2	10	99315	99324	0 %	20 %	60 %	20 %	386361825
2514	NC_017590	CTC	2	6	99365	99370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361825
2515	NC_017590	CGG	2	6	99400	99405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361825
2516	NC_017590	C	6	6	99411	99416	0 %	0 %	0 %	100 %	386361825
2517	NC_017590	CTCGG	2	10	99420	99429	0 %	20 %	40 %	40 %	386361825
2518	NC_017590	GAG	2	6	99602	99607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361825
2519	NC_017590	TCCC	2	8	99683	99690	0 %	25 %	0 %	75 %	386361825
2520	NC_017590	GGC	2	6	99734	99739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361826
2521	NC_017590	AAG	2	6	99742	99747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361826
2522	NC_017590	AGG	2	6	99751	99756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361826
2523	NC_017590	CCA	2	6	99817	99822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361826
2524	NC_017590	CCG	2	6	99832	99837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361826
2525	NC_017590	C	6	6	99862	99867	0 %	0 %	0 %	100 %	386361826
2526	NC_017590	TCG	2	6	99870	99875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361826
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2533	NC_017590	CGA	3	9	100261	100269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361827
2534	NC_017590	GCC	2	6	100285	100290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361827
2535	NC_017590	AGT	2	6	100291	100296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361827
2536	NC_017590	CTC	2	6	100391	100396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361827
2537	NC_017590	GAG	2	6	100406	100411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361827
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2539	NC_017590	GAA	2	6	100460	100465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361827
2540	NC_017590	TAG	2	6	100541	100546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_017590	CCG	2	6	100619	100624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361828
2542	NC_017590	CCAG	2	8	100680	100687	25 %	0 %	25 %	50 %	386361828
2543	NC_017590	CCT	2	6	100690	100695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361828
2544	NC_017590	CCT	2	6	100752	100757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361828
2545	NC_017590	CCA	2	6	100768	100773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361828
2546	NC_017590	GTA	2	6	100799	100804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361828
2547	NC_017590	TCC	2	6	100828	100833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2548	NC_017590	CCT	2	6	100889	100894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361829
2549	NC_017590	GCC	2	6	100915	100920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361829
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2551	NC_017590	GGGCCC	2	12	101021	101032	0 %	0 %	50 %	50 %	386361829
2552	NC_017590	TGG	2	6	101042	101047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361829
2553	NC_017590	G	6	6	101046	101051	0 %	0 %	100 %	0 %	386361829
2554	NC_017590	GAG	2	6	101061	101066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361829
2555	NC_017590	CCCCT	2	10	101079	101088	0 %	20 %	0 %	80 %	386361829
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2558	NC_017590	GGC	2	6	101118	101123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361829
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2560	NC_017590	TCC	2	6	101164	101169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361829
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2562	NC_017590	GAG	2	6	101214	101219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361829
2563	NC_017590	CCTC	2	8	101224	101231	0 %	25 %	0 %	75 %	386361829
2564	NC_017590	CTTGGC	2	12	101256	101267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361829
2565	NC_017590	GCCGTA	2	12	101298	101309	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386361829
2566	NC_017590	CCAGG	2	10	101319	101328	20 %	0 %	40 %	40 %	386361829
2567	NC_017590	TGA	2	6	101393	101398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361829
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2572	NC_017590	GGA	2	6	101634	101639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361829
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2578	NC_017590	GCT	2	6	101807	101812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361829
2579	NC_017590	GTA	2	6	101820	101825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361829
2580	NC_017590	CTC	2	6	101889	101894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361829
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2582	NC_017590	GGC	2	6	101907	101912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361829
2583	NC_017590	C	7	7	101919	101925	0 %	0 %	0 %	100 %	386361829
2584	NC_017590	CTC	3	9	101949	101957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361829
2585	NC_017590	GAG	2	6	101967	101972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361829
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2587	NC_017590	AGA	2	6	102026	102031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361829
2588	NC_017590	GTA	2	6	102063	102068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361829
2589	NC_017590	GGGGC	2	10	102089	102098	0 %	0 %	80 %	20 %	386361829
2590	NC_017590	CGGG	2	8	102154	102161	0 %	0 %	75 %	25 %	386361829
2591	NC_017590	CCA	2	6	102191	102196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361829
2592	NC_017590	GGCG	2	8	102269	102276	0 %	0 %	75 %	25 %	386361829
2593	NC_017590	AC	3	6	102278	102283	50 %	0 %	0 %	50 %	386361829
2594	NC_017590	GAT	2	6	102341	102346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361829
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2596	NC_017590	GCC	2	6	102402	102407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361829
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2598	NC_017590	CCA	2	6	102482	102487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361829
2599	NC_017590	G	6	6	102521	102526	0 %	0 %	100 %	0 %	386361829
2600	NC_017590	ATAG	2	8	102555	102562	50 %	25 %	25 %	0 %	386361829
2601	NC_017590	CCT	2	6	102731	102736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361829
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2603	NC_017590	CGGGG	2	10	102811	102820	0 %	0 %	80 %	20 %	386361829
2604	NC_017590	ACC	2	6	102847	102852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361829
2605	NC_017590	C	7	7	102855	102861	0 %	0 %	0 %	100 %	386361829
2606	NC_017590	CTT	2	6	102897	102902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361829
2607	NC_017590	GCACG	2	10	102957	102966	20 %	0 %	40 %	40 %	386361829
2608	NC_017590	GTA	2	6	103014	103019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361829
2609	NC_017590	GCC	2	6	103031	103036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361829
2610	NC_017590	CCT	2	6	103040	103045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361829
2611	NC_017590	G	6	6	103147	103152	0 %	0 %	100 %	0 %	386361829
2612	NC_017590	GGC	2	6	103168	103173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361829
2613	NC_017590	CCA	2	6	103178	103183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361829
2614	NC_017590	TTG	2	6	103189	103194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361829
2615	NC_017590	C	6	6	103269	103274	0 %	0 %	0 %	100 %	386361829
2616	NC_017590	CGGG	2	8	103295	103302	0 %	0 %	75 %	25 %	386361829
2617	NC_017590	CCT	2	6	103304	103309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361829
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2619	NC_017590	TCC	2	6	103336	103341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361829
2620	NC_017590	GAG	2	6	103349	103354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361829
2621	NC_017590	TC	3	6	103455	103460	0 %	50 %	0 %	50 %	386361829
2622	NC_017590	CAG	2	6	103461	103466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361829
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2624	NC_017590	TGG	2	6	103490	103495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361829
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2752	NC_017590	CCT	2	6	107908	107913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361831
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2759	NC_017590	GAGG	2	8	108166	108173	25 %	0 %	75 %	0 %	386361831
2760	NC_017590	GGA	2	6	108177	108182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361831
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2763	NC_017590	G	6	6	108354	108359	0 %	0 %	100 %	0 %	386361831
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2821	NC_017590	CCTC	2	8	110837	110844	0 %	25 %	0 %	75 %	386361833
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2852	NC_017590	CCTCC	2	10	111980	111989	0 %	20 %	0 %	80 %	386361835
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2855	NC_017590	CCGA	2	8	112067	112074	25 %	0 %	25 %	50 %	386361835
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2858	NC_017590	GAGGCG	2	12	112208	112219	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386361835
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2861	NC_017590	G	7	7	112333	112339	0 %	0 %	100 %	0 %	386361835
2862	NC_017590	AGG	2	6	112343	112348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361835
2863	NC_017590	CGT	2	6	112349	112354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361835
2864	NC_017590	GGA	2	6	112387	112392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361836
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2866	NC_017590	GCCCC	2	10	112446	112455	0 %	0 %	20 %	80 %	386361836
2867	NC_017590	GAG	4	12	112493	112504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361836
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2869	NC_017590	CGGG	2	8	112555	112562	0 %	0 %	75 %	25 %	386361836
2870	NC_017590	GGA	2	6	112573	112578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361836
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2872	NC_017590	GGA	2	6	112651	112656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361836
2873	NC_017590	TGG	2	6	112719	112724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361836
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