MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1802

Total Repeats: 3714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017590	C	6	6	58887	58892	0 %	0 %	0 %	100 %	386361791
1502	NC_017590	CCCG	2	8	58896	58903	0 %	0 %	25 %	75 %	386361791
1503	NC_017590	TCC	2	6	58914	58919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361791
1504	NC_017590	CG	3	6	58924	58929	0 %	0 %	50 %	50 %	386361791
1505	NC_017590	AAG	2	6	58948	58953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361791
1506	NC_017590	CCT	2	6	58964	58969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361792
1507	NC_017590	C	6	6	58987	58992	0 %	0 %	0 %	100 %	386361792
1508	NC_017590	GCC	2	6	58993	58998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361792
1509	NC_017590	CCT	2	6	59036	59041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361792
1510	NC_017590	GAG	2	6	59055	59060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361792
1511	NC_017590	CTT	2	6	59100	59105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361792
1512	NC_017590	G	7	7	59109	59115	0 %	0 %	100 %	0 %	386361792
1513	NC_017590	ACC	2	6	59143	59148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361792
1514	NC_017590	AGA	2	6	59188	59193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361793
1515	NC_017590	AGG	2	6	59236	59241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361793
1516	NC_017590	GCC	2	6	59266	59271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361793
1517	NC_017590	CCA	2	6	59282	59287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361793
1518	NC_017590	GGGCCA	2	12	59321	59332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386361793
1519	NC_017590	CTC	2	6	59354	59359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361793
1520	NC_017590	CAAGC	2	10	59369	59378	40 %	0 %	20 %	40 %	386361793
1521	NC_017590	GAA	2	6	59445	59450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361793
1522	NC_017590	AGGA	2	8	59461	59468	50 %	0 %	50 %	0 %	386361793
1523	NC_017590	GAA	2	6	59537	59542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361793
1524	NC_017590	C	6	6	59582	59587	0 %	0 %	0 %	100 %	386361794
1525	NC_017590	CCA	2	6	59605	59610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361794
1526	NC_017590	CCG	2	6	59620	59625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361794
1527	NC_017590	TCC	3	9	59631	59639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361794
1528	NC_017590	CCG	2	6	59716	59721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361794
1529	NC_017590	TGG	2	6	59724	59729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361794
1530	NC_017590	GCAAA	2	10	59758	59767	60 %	0 %	20 %	20 %	386361794
1531	NC_017590	CAC	2	6	59843	59848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361794
1532	NC_017590	TTC	2	6	59877	59882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361794
1533	NC_017590	CCA	2	6	59884	59889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361794
1534	NC_017590	C	6	6	59939	59944	0 %	0 %	0 %	100 %	386361794
1535	NC_017590	TGG	2	6	59964	59969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361794
1536	NC_017590	CAC	2	6	59981	59986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361794
1537	NC_017590	CCT	2	6	59992	59997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361794
1538	NC_017590	GCCTC	2	10	60019	60028	0 %	20 %	20 %	60 %	386361794
1539	NC_017590	CCA	2	6	60052	60057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361794
1540	NC_017590	GCC	3	9	60078	60086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361794
1541	NC_017590	GCC	2	6	60108	60113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361794
1542	NC_017590	GCC	2	6	60121	60126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361794
1543	NC_017590	CCG	2	6	60127	60132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361794
1544	NC_017590	TCC	2	6	60144	60149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361794
1545	NC_017590	C	7	7	60197	60203	0 %	0 %	0 %	100 %	386361794
1546	NC_017590	GGC	2	6	60245	60250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361794
1547	NC_017590	GTC	2	6	60251	60256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361794
1548	NC_017590	TGA	2	6	60268	60273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361794
1549	NC_017590	CGC	2	6	60287	60292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361794
1550	NC_017590	CCA	2	6	60307	60312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361794
1551	NC_017590	CCT	2	6	60328	60333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361794
1552	NC_017590	CCAGG	2	10	60347	60356	20 %	0 %	40 %	40 %	386361794
1553	NC_017590	CTTC	2	8	60466	60473	0 %	50 %	0 %	50 %	386361795
1554	NC_017590	TCC	2	6	60507	60512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361795
1555	NC_017590	GGC	3	9	60529	60537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361795
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1557	NC_017590	TTCC	2	8	60575	60582	0 %	50 %	0 %	50 %	386361795
1558	NC_017590	GGA	3	9	60598	60606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361795
1559	NC_017590	GGA	2	6	60670	60675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361795
1560	NC_017590	CGG	2	6	60694	60699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361795
1561	NC_017590	CGG	2	6	60754	60759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361795
1562	NC_017590	CCCCGC	2	12	60782	60793	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	386361795
1563	NC_017590	GCC	2	6	60843	60848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361795
1564	NC_017590	GTT	2	6	60875	60880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361795
1565	NC_017590	CCT	2	6	60916	60921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361795
1566	NC_017590	CCG	2	6	60967	60972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361795
1567	NC_017590	TCA	2	6	61057	61062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361795
1568	NC_017590	TGC	2	6	61110	61115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361795
1569	NC_017590	CCT	2	6	61180	61185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361795
1570	NC_017590	AGG	3	9	61215	61223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361795
1571	NC_017590	GCC	2	6	61224	61229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361795
1572	NC_017590	CGC	2	6	61239	61244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361795
1573	NC_017590	GGAG	2	8	61303	61310	25 %	0 %	75 %	0 %	386361795
1574	NC_017590	C	6	6	61313	61318	0 %	0 %	0 %	100 %	386361795
1575	NC_017590	CCT	2	6	61390	61395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361795
1576	NC_017590	CCGGTG	2	12	61406	61417	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386361795
1577	NC_017590	GTG	2	6	61440	61445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361795
1578	NC_017590	CCA	2	6	61447	61452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361795
1579	NC_017590	GCC	2	6	61467	61472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361795
1580	NC_017590	CGC	2	6	61489	61494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361795
1581	NC_017590	AAG	2	6	61507	61512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361796
1582	NC_017590	CCG	2	6	61537	61542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361796
1583	NC_017590	ATG	2	6	61556	61561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361796
1584	NC_017590	CCTCCA	2	12	61602	61613	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386361796
1585	NC_017590	C	6	6	61638	61643	0 %	0 %	0 %	100 %	386361796
1586	NC_017590	CT	3	6	61733	61738	0 %	50 %	0 %	50 %	386361796
1587	NC_017590	ACC	2	6	61739	61744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361796
1588	NC_017590	TCC	4	12	61760	61771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361796
1589	NC_017590	CCG	2	6	61812	61817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361796
1590	NC_017590	GAT	3	9	61825	61833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361796
1591	NC_017590	CCTTCC	2	12	61836	61847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361796
1592	NC_017590	C	7	7	61851	61857	0 %	0 %	0 %	100 %	386361796
1593	NC_017590	GGT	2	6	61879	61884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361796
1594	NC_017590	TCG	2	6	61895	61900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361796
1595	NC_017590	TGG	2	6	62004	62009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361796
1596	NC_017590	C	6	6	62014	62019	0 %	0 %	0 %	100 %	386361796
1597	NC_017590	TGA	2	6	62025	62030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361796
1598	NC_017590	TCC	2	6	62045	62050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361796
1599	NC_017590	CAC	2	6	62077	62082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361796
1600	NC_017590	TGGCG	2	10	62145	62154	0 %	20 %	60 %	20 %	386361796
1601	NC_017590	GGCCCG	2	12	62251	62262	0 %	0 %	50 %	50 %	386361796
1602	NC_017590	CAC	2	6	62293	62298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361796
1603	NC_017590	CCA	2	6	62301	62306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361796
1604	NC_017590	GAG	2	6	62329	62334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361796
1605	NC_017590	TCC	2	6	62401	62406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361797
1606	NC_017590	CTC	2	6	62463	62468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361797
1607	NC_017590	CTG	2	6	62475	62480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361797
1608	NC_017590	GGC	2	6	62547	62552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361797
1609	NC_017590	GCA	2	6	62556	62561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361797
1610	NC_017590	CCT	2	6	62576	62581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361797
1611	NC_017590	AGG	2	6	62642	62647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361797
1612	NC_017590	TCC	2	6	62704	62709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361797
1613	NC_017590	AGG	2	6	62725	62730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361797
1614	NC_017590	GGT	2	6	62778	62783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361797
1615	NC_017590	CCCG	2	8	62831	62838	0 %	0 %	25 %	75 %	386361797
1616	NC_017590	CCA	2	6	62879	62884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361797
1617	NC_017590	TCC	2	6	62887	62892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361797
1618	NC_017590	CCT	2	6	62906	62911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361797
1619	NC_017590	GA	3	6	62929	62934	50 %	0 %	50 %	0 %	386361797
1620	NC_017590	GAG	2	6	62997	63002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361797
1621	NC_017590	AGG	2	6	63025	63030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361797
1622	NC_017590	C	6	6	63080	63085	0 %	0 %	0 %	100 %	386361797
1623	NC_017590	CCT	2	6	63158	63163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_017590	TCGT	2	8	63220	63227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_017590	GGA	2	6	63306	63311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361798
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1627	NC_017590	GAG	3	9	63343	63351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361798
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