MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1802

Total Repeats: 3714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017590	GCC	2	6	38808	38813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361766
1002	NC_017590	GCCC	2	8	38828	38835	0 %	0 %	25 %	75 %	386361766
1003	NC_017590	GGA	2	6	38839	38844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361766
1004	NC_017590	CCT	3	9	38854	38862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361766
1005	NC_017590	CCA	2	6	38905	38910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361766
1006	NC_017590	TTG	2	6	38940	38945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361766
1007	NC_017590	GCC	2	6	39014	39019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361766
1008	NC_017590	CGG	2	6	39027	39032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361766
1009	NC_017590	CTT	2	6	39059	39064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361766
1010	NC_017590	CTGG	2	8	39102	39109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_017590	GAA	2	6	39134	39139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017590	G	6	6	39168	39173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017590	AGG	2	6	39191	39196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017590	GAG	2	6	39208	39213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017590	GAG	2	6	39220	39225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017590	GGA	2	6	39237	39242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017590	CGG	2	6	39248	39253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017590	GTG	2	6	39263	39268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017590	ACCCG	2	10	39284	39293	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1020	NC_017590	C	6	6	39319	39324	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1021	NC_017590	CCA	2	6	39340	39345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_017590	AAG	2	6	39372	39377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017590	TCG	2	6	39400	39405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017590	CTC	2	6	39460	39465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_017590	ATC	2	6	39494	39499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017590	TG	3	6	39501	39506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017590	AGG	2	6	39510	39515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017590	CTG	2	6	39551	39556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361767
1029	NC_017590	CT	3	6	39575	39580	0 %	50 %	0 %	50 %	386361767
1030	NC_017590	GCCCC	2	10	39598	39607	0 %	0 %	20 %	80 %	386361767
1031	NC_017590	GGGAGG	2	12	39708	39719	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	386361767
1032	NC_017590	ACC	2	6	39854	39859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361767
1033	NC_017590	CGGA	2	8	39930	39937	25 %	0 %	50 %	25 %	386361767
1034	NC_017590	AGG	2	6	39939	39944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361767
1035	NC_017590	TCC	2	6	39948	39953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361767
1036	NC_017590	GAAG	2	8	40042	40049	50 %	0 %	50 %	0 %	386361767
1037	NC_017590	CGC	2	6	40261	40266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361767
1038	NC_017590	G	7	7	40400	40406	0 %	0 %	100 %	0 %	386361767
1039	NC_017590	CTC	2	6	40419	40424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361767
1040	NC_017590	ACCCCA	2	12	40482	40493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361767
1041	NC_017590	AGG	2	6	40545	40550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361767
1042	NC_017590	GTG	2	6	40577	40582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361767
1043	NC_017590	GAG	2	6	40724	40729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361767
1044	NC_017590	CCA	2	6	40795	40800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361767
1045	NC_017590	GAG	2	6	40856	40861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361767
1046	NC_017590	G	6	6	40968	40973	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017590	TCCC	2	8	40982	40989	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1048	NC_017590	C	6	6	41033	41038	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1049	NC_017590	CAG	2	6	41045	41050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017590	CAG	2	6	41069	41074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017590	GTC	2	6	41123	41128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017590	GCCA	2	8	41155	41162	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_017590	G	6	6	41200	41205	0 %	0 %	100 %	0 %	386361768
1054	NC_017590	TCT	2	6	41224	41229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361768
1055	NC_017590	CCT	2	6	41236	41241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361768
1056	NC_017590	TTCGC	2	10	41294	41303	0 %	40 %	20 %	40 %	386361768
1057	NC_017590	AGC	2	6	41306	41311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361768
1058	NC_017590	AAG	2	6	41333	41338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361768
1059	NC_017590	CGC	2	6	41391	41396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361768
1060	NC_017590	CAC	2	6	41507	41512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361768
1061	NC_017590	GGC	2	6	41534	41539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361768
1062	NC_017590	CCT	2	6	41545	41550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361768
1063	NC_017590	CTT	2	6	41566	41571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361768
1064	NC_017590	TCC	2	6	41604	41609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361768
1065	NC_017590	CAG	2	6	41612	41617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361768
1066	NC_017590	CAC	2	6	41666	41671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361768
1067	NC_017590	TGA	2	6	41740	41745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361768
1068	NC_017590	CGC	2	6	41757	41762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361768
1069	NC_017590	TCCCA	2	10	41796	41805	20 %	20 %	0 %	60 %	386361768
1070	NC_017590	GCC	2	6	41991	41996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361768
1071	NC_017590	GGTC	2	8	42007	42014	0 %	25 %	50 %	25 %	386361768
1072	NC_017590	GCC	2	6	42072	42077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361768
1073	NC_017590	CTGA	2	8	42083	42090	25 %	25 %	25 %	25 %	386361768
1074	NC_017590	CGG	2	6	42094	42099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361768
1075	NC_017590	CCA	2	6	42130	42135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361768
1076	NC_017590	GGC	2	6	42136	42141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361768
1077	NC_017590	GGT	2	6	42218	42223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361768
1078	NC_017590	GTA	2	6	42239	42244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361768
1079	NC_017590	C	6	6	42257	42262	0 %	0 %	0 %	100 %	386361768
1080	NC_017590	AAG	2	6	42273	42278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361768
1081	NC_017590	CCT	2	6	42380	42385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_017590	C	6	6	42400	42405	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1083	NC_017590	C	6	6	42444	42449	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1084	NC_017590	GGC	2	6	42470	42475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_017590	GAG	2	6	42531	42536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361769
1086	NC_017590	GAG	2	6	42648	42653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361769
1087	NC_017590	TGGGTT	2	12	42696	42707	0 %	50 %	50 %	0 %	386361769
1088	NC_017590	GAG	3	9	42735	42743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361769
1089	NC_017590	ACC	2	6	42885	42890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361770
1090	NC_017590	GGT	2	6	43033	43038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361770
1091	NC_017590	TGT	2	6	43059	43064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361770
1092	NC_017590	GC	3	6	43092	43097	0 %	0 %	50 %	50 %	386361770
1093	NC_017590	CTG	2	6	43106	43111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361770
1094	NC_017590	GGA	2	6	43129	43134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361770
1095	NC_017590	GAAG	2	8	43150	43157	50 %	0 %	50 %	0 %	386361770
1096	NC_017590	ATCC	2	8	43163	43170	25 %	25 %	0 %	50 %	386361770
1097	NC_017590	C	6	6	43225	43230	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1098	NC_017590	AGG	2	6	43375	43380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361771
1099	NC_017590	GAG	2	6	43392	43397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361771
1100	NC_017590	GGA	2	6	43445	43450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361771
1101	NC_017590	GGGA	2	8	43559	43566	25 %	0 %	75 %	0 %	386361772
1102	NC_017590	GGT	2	6	43641	43646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361772
1103	NC_017590	GC	3	6	43741	43746	0 %	0 %	50 %	50 %	386361773
1104	NC_017590	TTGGC	2	10	43747	43756	0 %	40 %	40 %	20 %	386361773
1105	NC_017590	CTC	2	6	43765	43770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361773
1106	NC_017590	CTC	2	6	43774	43779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361773
1107	NC_017590	GCC	2	6	43780	43785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361773
1108	NC_017590	CGGGG	2	10	43800	43809	0 %	0 %	80 %	20 %	386361773
1109	NC_017590	GAG	2	6	43840	43845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361773
1110	NC_017590	GTG	2	6	43921	43926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361773
1111	NC_017590	CGGG	2	8	43929	43936	0 %	0 %	75 %	25 %	386361773
1112	NC_017590	TGG	2	6	44026	44031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361773
1113	NC_017590	GGC	2	6	44074	44079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361773
1114	NC_017590	CCT	2	6	44094	44099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361773
1115	NC_017590	CCCTG	2	10	44124	44133	0 %	20 %	20 %	60 %	386361773
1116	NC_017590	GTG	2	6	44167	44172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361773
1117	NC_017590	G	6	6	44194	44199	0 %	0 %	100 %	0 %	386361773
1118	NC_017590	CCAC	2	8	44257	44264	25 %	0 %	0 %	75 %	386361773
1119	NC_017590	CGC	2	6	44274	44279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361773
1120	NC_017590	GT	3	6	44388	44393	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017590	GGA	3	9	44472	44480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361774
1122	NC_017590	C	6	6	44504	44509	0 %	0 %	0 %	100 %	386361774
1123	NC_017590	GGC	2	6	44522	44527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361774
1124	NC_017590	CCCTAC	2	12	44572	44583	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386361774
1125	NC_017590	GAA	2	6	44592	44597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361774
1126	NC_017590	G	6	6	44598	44603	0 %	0 %	100 %	0 %	386361774
1127	NC_017590	CGGTGG	2	12	44605	44616	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386361774
1128	NC_017590	GGC	2	6	44708	44713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361774
1129	NC_017590	CCT	2	6	44721	44726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361774
1130	NC_017590	GGCGGA	2	12	44736	44747	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386361774
1131	NC_017590	CA	3	6	44765	44770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1384	NC_017590	TCC	2	6	54410	54415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361785
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