MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1802

Total Repeats: 3714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017590	GCC	2	6	18133	18138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_017590	GGA	2	6	18150	18155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017590	TGG	2	6	18185	18190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017590	CCT	2	6	18204	18209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_017590	TGG	2	6	18260	18265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017590	ATGG	2	8	18271	18278	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017590	GGC	2	6	18352	18357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361748
508	NC_017590	CCA	2	6	18402	18407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361748
509	NC_017590	CGA	2	6	18633	18638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361748
510	NC_017590	CGG	2	6	18663	18668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361748
511	NC_017590	CCT	2	6	18681	18686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361748
512	NC_017590	CTC	2	6	18694	18699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361748
513	NC_017590	ATC	2	6	18743	18748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361748
514	NC_017590	GCGGGG	2	12	18807	18818	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
515	NC_017590	CACC	2	8	18842	18849	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
516	NC_017590	ACC	2	6	18928	18933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_017590	CCCTG	2	10	18942	18951	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
518	NC_017590	CT	3	6	18987	18992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_017590	CT	3	6	19010	19015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_017590	GGA	2	6	19117	19122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017590	GGC	2	6	19123	19128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017590	GGC	2	6	19131	19136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017590	CTC	2	6	19157	19162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_017590	CCGGA	2	10	19196	19205	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
525	NC_017590	G	6	6	19213	19218	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017590	AGGGG	2	10	19221	19230	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017590	C	6	6	19294	19299	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
528	NC_017590	GCC	2	6	19323	19328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_017590	GGGC	2	8	19369	19376	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
530	NC_017590	GC	3	6	19391	19396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_017590	CGC	2	6	19412	19417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_017590	GGA	2	6	19456	19461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017590	CCA	2	6	19465	19470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361749
534	NC_017590	CCT	2	6	19547	19552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361749
535	NC_017590	CCGGG	2	10	19572	19581	0 %	0 %	60 %	40 %	386361749
536	NC_017590	GGA	2	6	19595	19600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361749
537	NC_017590	CGG	2	6	19626	19631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361749
538	NC_017590	CGCC	2	8	19640	19647	0 %	0 %	25 %	75 %	386361749
539	NC_017590	GGA	2	6	19649	19654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361749
540	NC_017590	CTT	2	6	19668	19673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361749
541	NC_017590	CTGC	2	8	19739	19746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
542	NC_017590	GGCCAC	2	12	19773	19784	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
543	NC_017590	CTC	2	6	19789	19794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_017590	CTC	2	6	19797	19802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_017590	GCC	2	6	19817	19822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_017590	CGC	2	6	19846	19851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_017590	CCT	2	6	19917	19922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_017590	CTC	2	6	19926	19931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_017590	CGC	2	6	19932	19937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_017590	ACC	2	6	19984	19989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_017590	C	6	6	19988	19993	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
552	NC_017590	CCA	2	6	20039	20044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_017590	C	7	7	20061	20067	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
554	NC_017590	CAG	2	6	20070	20075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017590	C	6	6	20095	20100	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
556	NC_017590	CTTCC	2	10	20169	20178	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
557	NC_017590	GGC	2	6	20203	20208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017590	C	7	7	20253	20259	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
559	NC_017590	CCTCTC	2	12	20288	20299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_017590	CCG	2	6	20302	20307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_017590	CCG	2	6	20369	20374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_017590	GAA	2	6	20399	20404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017590	G	6	6	20431	20436	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017590	CCT	2	6	20446	20451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_017590	G	6	6	20513	20518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017590	GTG	2	6	20580	20585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017590	GGCG	2	8	20602	20609	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
568	NC_017590	G	6	6	20614	20619	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017590	GGC	2	6	20633	20638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017590	CGG	3	9	20658	20666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017590	ACC	2	6	20679	20684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_017590	TCC	2	6	20715	20720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_017590	GGCA	2	8	20747	20754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_017590	TGC	2	6	20785	20790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017590	CTC	3	9	20799	20807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_017590	GCC	2	6	20810	20815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_017590	CGG	2	6	20887	20892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_017590	CCG	2	6	20979	20984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_017590	CTT	2	6	21000	21005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_017590	TGG	2	6	21011	21016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017590	CTCG	2	8	21067	21074	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
582	NC_017590	TCCC	2	8	21144	21151	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
583	NC_017590	TGCG	2	8	21261	21268	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
584	NC_017590	GAGG	2	8	21307	21314	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017590	TGC	2	6	21368	21373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361750
586	NC_017590	AGG	2	6	21631	21636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361750
587	NC_017590	GTG	3	9	21675	21683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361750
588	NC_017590	GGC	2	6	21723	21728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361750
589	NC_017590	GCC	2	6	21735	21740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361750
590	NC_017590	GGA	2	6	21781	21786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361750
591	NC_017590	TCC	3	9	21790	21798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361750
592	NC_017590	TGG	2	6	21799	21804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361750
593	NC_017590	GCC	2	6	21846	21851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361750
594	NC_017590	TGG	2	6	21943	21948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361750
595	NC_017590	GCG	2	6	22006	22011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361750
596	NC_017590	CTC	2	6	22026	22031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361750
597	NC_017590	CCG	2	6	22111	22116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361750
598	NC_017590	CAG	2	6	22148	22153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361750
599	NC_017590	GAA	2	6	22349	22354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361750
600	NC_017590	GAG	2	6	22479	22484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361750
601	NC_017590	TCCC	2	8	22542	22549	0 %	25 %	0 %	75 %	386361750
602	NC_017590	C	6	6	22556	22561	0 %	0 %	0 %	100 %	386361750
603	NC_017590	GGC	2	6	22577	22582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361750
604	NC_017590	GGT	2	6	22649	22654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361750
605	NC_017590	CAC	2	6	22718	22723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361750
606	NC_017590	CTA	2	6	22742	22747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361750
607	NC_017590	CGC	2	6	22814	22819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361750
608	NC_017590	GTG	2	6	22983	22988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361750
609	NC_017590	GAC	2	6	23133	23138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361750
610	NC_017590	TGG	2	6	23212	23217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361750
611	NC_017590	CTTC	2	8	23341	23348	0 %	50 %	0 %	50 %	386361750
612	NC_017590	CAC	2	6	23366	23371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361750
613	NC_017590	C	7	7	23389	23395	0 %	0 %	0 %	100 %	386361750
614	NC_017590	CCA	2	6	23411	23416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361750
615	NC_017590	GTG	2	6	23499	23504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361750
616	NC_017590	AGG	2	6	23512	23517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361750
617	NC_017590	AAC	2	6	23523	23528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361750
618	NC_017590	G	6	6	23612	23617	0 %	0 %	100 %	0 %	386361750
619	NC_017590	CCCG	2	8	23658	23665	0 %	0 %	25 %	75 %	386361750
620	NC_017590	CGGG	2	8	23752	23759	0 %	0 %	75 %	25 %	386361750
621	NC_017590	GCT	2	6	23833	23838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361750
622	NC_017590	AGG	2	6	23847	23852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361750
623	NC_017590	CAGGCC	2	12	23859	23870	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386361750
624	NC_017590	TCC	2	6	23965	23970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361750
625	NC_017590	CGG	2	6	23978	23983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361750
626	NC_017590	GCG	2	6	24034	24039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361750
627	NC_017590	GGC	2	6	24087	24092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361750
628	NC_017590	CGA	2	6	24155	24160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361750
629	NC_017590	CTC	2	6	24204	24209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361750
630	NC_017590	GTC	2	6	24258	24263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361750
631	NC_017590	ACG	2	6	24298	24303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361750
632	NC_017590	G	6	6	24388	24393	0 %	0 %	100 %	0 %	386361750
633	NC_017590	CCT	2	6	24440	24445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361750
634	NC_017590	GCG	2	6	24460	24465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361750
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636	NC_017590	CCT	2	6	24533	24538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361750
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