MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1802

Total Repeats: 3714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017590	CGC	2	6	33	38	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017590	GGAG	2	8	133	140	25 %	0 %	75 %	0 %	386361712
3	NC_017590	CAC	2	6	177	182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361712
4	NC_017590	GGCG	2	8	185	192	0 %	0 %	75 %	25 %	386361712
5	NC_017590	GCC	2	6	202	207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361712
6	NC_017590	TCC	2	6	286	291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361712
7	NC_017590	CTC	3	9	312	320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361712
8	NC_017590	GGA	2	6	341	346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361712
9	NC_017590	GGCCC	2	10	372	381	0 %	0 %	40 %	60 %	386361712
10	NC_017590	ACC	2	6	437	442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017590	CTG	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017590	AGG	2	6	516	521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361713
13	NC_017590	AGG	2	6	531	536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361713
14	NC_017590	G	6	6	624	629	0 %	0 %	100 %	0 %	386361713
15	NC_017590	GGT	2	6	682	687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361713
16	NC_017590	CTT	2	6	708	713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017590	TTTG	2	8	748	755	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017590	CAG	2	6	797	802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361714
19	NC_017590	GAGG	2	8	808	815	25 %	0 %	75 %	0 %	386361714
20	NC_017590	GCC	2	6	825	830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361714
21	NC_017590	TCT	2	6	831	836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361714
22	NC_017590	TGG	2	6	843	848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361714
23	NC_017590	GGGA	2	8	877	884	25 %	0 %	75 %	0 %	386361714
24	NC_017590	GAG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361714
25	NC_017590	CCT	2	6	940	945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361714
26	NC_017590	CTT	2	6	961	966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361714
27	NC_017590	C	6	6	967	972	0 %	0 %	0 %	100 %	386361714
28	NC_017590	GAG	2	6	1016	1021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361714
29	NC_017590	GCC	2	6	1026	1031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361714
30	NC_017590	CGG	2	6	1063	1068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017590	GGC	2	6	1119	1124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017590	CGC	2	6	1158	1163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017590	GCTT	2	8	1181	1188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017590	CAG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361715
35	NC_017590	CGG	2	6	1308	1313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361715
36	NC_017590	ACT	2	6	1338	1343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361715
37	NC_017590	AGG	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
38	NC_017590	CCT	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361715
39	NC_017590	AGG	2	6	1413	1418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
40	NC_017590	CTCCC	2	10	1472	1481	0 %	20 %	0 %	80 %	386361715
41	NC_017590	TGG	2	6	1509	1514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361715
42	NC_017590	G	6	6	1554	1559	0 %	0 %	100 %	0 %	386361715
43	NC_017590	GGA	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
44	NC_017590	GGT	2	6	1681	1686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361715
45	NC_017590	GGA	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
46	NC_017590	GCGGAG	2	12	1706	1717	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386361715
47	NC_017590	GAC	2	6	1733	1738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361715
48	NC_017590	ACC	2	6	1739	1744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361715
49	NC_017590	GGA	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
50	NC_017590	GAG	3	9	1796	1804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
51	NC_017590	GGA	2	6	1828	1833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
52	NC_017590	CGG	2	6	1856	1861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361715
53	NC_017590	AGG	2	6	1875	1880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
54	NC_017590	GGA	2	6	1915	1920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
55	NC_017590	GAG	2	6	1931	1936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
56	NC_017590	AGG	2	6	1953	1958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
57	NC_017590	GGC	2	6	1984	1989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361715
58	NC_017590	G	6	6	2013	2018	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017590	TCT	2	6	2041	2046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017590	GGCTCA	2	12	2129	2140	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386361716
61	NC_017590	GGC	2	6	2141	2146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361716
62	NC_017590	GGA	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
63	NC_017590	CGG	2	6	2175	2180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361716
64	NC_017590	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
65	NC_017590	TGA	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361716
66	NC_017590	GGC	2	6	2222	2227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361716
67	NC_017590	AGG	2	6	2230	2235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
68	NC_017590	GCCC	2	8	2264	2271	0 %	0 %	25 %	75 %	386361716
69	NC_017590	TGGCCC	2	12	2293	2304	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386361716
70	NC_017590	AGG	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
71	NC_017590	CGGCA	2	10	2352	2361	20 %	0 %	40 %	40 %	386361716
72	NC_017590	AGG	2	6	2374	2379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
73	NC_017590	GAGG	2	8	2450	2457	25 %	0 %	75 %	0 %	386361716
74	NC_017590	GGA	2	6	2489	2494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
75	NC_017590	CGC	2	6	2495	2500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361716
76	NC_017590	GTGG	2	8	2504	2511	0 %	25 %	75 %	0 %	386361716
77	NC_017590	GAG	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
78	NC_017590	GAG	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
79	NC_017590	CAGGCT	2	12	2630	2641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386361716
80	NC_017590	GAG	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
81	NC_017590	TGG	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361716
82	NC_017590	TGG	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361716
83	NC_017590	GGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361716
84	NC_017590	CCT	2	6	2849	2854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361716
85	NC_017590	CCT	2	6	2875	2880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361716
86	NC_017590	GCC	2	6	2899	2904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361716
87	NC_017590	CCT	2	6	2993	2998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361716
88	NC_017590	AGG	2	6	3018	3023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
89	NC_017590	CCCTTG	2	12	3091	3102	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017590	G	6	6	3102	3107	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017590	TCC	2	6	3117	3122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017590	GCAC	2	8	3276	3283	25 %	0 %	25 %	50 %	386361717
93	NC_017590	C	7	7	3322	3328	0 %	0 %	0 %	100 %	386361717
94	NC_017590	C	6	6	3357	3362	0 %	0 %	0 %	100 %	386361717
95	NC_017590	GCGT	2	8	3364	3371	0 %	25 %	50 %	25 %	386361717
96	NC_017590	CCG	2	6	3469	3474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361717
97	NC_017590	G	6	6	3555	3560	0 %	0 %	100 %	0 %	386361717
98	NC_017590	GGA	2	6	3609	3614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361717
99	NC_017590	G	7	7	3748	3754	0 %	0 %	100 %	0 %	386361717
100	NC_017590	ACCCC	3	15	3830	3844	20 %	0 %	0 %	80 %	386361717
101	NC_017590	GCC	3	9	3919	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361717
102	NC_017590	AGGGG	2	10	3966	3975	20 %	0 %	80 %	0 %	386361717
103	NC_017590	TGCCCC	2	12	3987	3998	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386361717
104	NC_017590	CCG	2	6	4050	4055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361717
105	NC_017590	GC	3	6	4129	4134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017590	AGA	2	6	4240	4245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017590	GGC	2	6	4265	4270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017590	CG	3	6	4290	4295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017590	GGA	2	6	4305	4310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017590	G	6	6	4320	4325	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017590	TGG	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361718
112	NC_017590	TGG	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361718
113	NC_017590	AGG	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361718
114	NC_017590	GGTG	2	8	4481	4488	0 %	25 %	75 %	0 %	386361718
115	NC_017590	GGA	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361718
116	NC_017590	GGT	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361718
117	NC_017590	GC	3	6	4585	4590	0 %	0 %	50 %	50 %	386361718
118	NC_017590	GGT	2	6	4596	4601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361718
119	NC_017590	G	6	6	4610	4615	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017590	TGG	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361719
121	NC_017590	CTC	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361719
122	NC_017590	CCT	2	6	4700	4705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361719
123	NC_017590	ACT	2	6	4717	4722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361719
124	NC_017590	GCGG	2	8	4769	4776	0 %	0 %	75 %	25 %	386361719
125	NC_017590	AGG	2	6	4780	4785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361719
126	NC_017590	AGG	2	6	4798	4803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361719
127	NC_017590	AGG	2	6	4807	4812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361719
128	NC_017590	GCT	2	6	4815	4820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361719
129	NC_017590	AGG	2	6	4822	4827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361719
130	NC_017590	CTT	2	6	4904	4909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361720
131	NC_017590	CCT	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361720
132	NC_017590	GCC	2	6	5001	5006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361720
133	NC_017590	GGC	2	6	5081	5086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361720
134	NC_017590	GGC	2	6	5105	5110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361720
135	NC_017590	GGC	2	6	5123	5128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361720
136	NC_017590	GAT	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361720
137	NC_017590	G	6	6	5171	5176	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017590	GCCC	2	8	5184	5191	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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273	NC_017590	CTA	2	6	9819	9824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361725
274	NC_017590	AGG	2	6	9869	9874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361725
275	NC_017590	CTC	2	6	9985	9990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361725
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394	NC_017590	AGG	2	6	14201	14206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
395	NC_017590	GGC	2	6	14231	14236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361736
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399	NC_017590	CTG	2	6	14400	14405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361737
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401	NC_017590	TCC	2	6	14437	14442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361737
402	NC_017590	TGG	2	6	14443	14448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361737
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