MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1801

Total Repeats: 6822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017588	AGG	2	6	88	93	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017588	CGG	2	6	185	190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017588	AGG	2	6	195	200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017588	GAA	2	6	210	215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361453
5	NC_017588	CTT	2	6	256	261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361453
6	NC_017588	GGC	2	6	316	321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361453
7	NC_017588	GGC	2	6	323	328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361453
8	NC_017588	TGG	2	6	347	352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361453
9	NC_017588	CGC	2	6	438	443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361453
10	NC_017588	GCC	2	6	456	461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361453
11	NC_017588	GGA	2	6	528	533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361453
12	NC_017588	GAC	2	6	565	570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361453
13	NC_017588	ACT	2	6	590	595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361453
14	NC_017588	GGC	2	6	604	609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361453
15	NC_017588	ACA	2	6	656	661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361453
16	NC_017588	GGCTG	2	10	678	687	0 %	20 %	60 %	20 %	386361453
17	NC_017588	AGA	2	6	737	742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361453
18	NC_017588	GGC	2	6	756	761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361453
19	NC_017588	GTGG	2	8	807	814	0 %	25 %	75 %	0 %	386361453
20	NC_017588	CAA	2	6	837	842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361453
21	NC_017588	GC	3	6	852	857	0 %	0 %	50 %	50 %	386361453
22	NC_017588	CCG	2	6	897	902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361453
23	NC_017588	TGG	2	6	913	918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361453
24	NC_017588	TAC	2	6	940	945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361453
25	NC_017588	GGA	2	6	963	968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361453
26	NC_017588	CAG	2	6	1000	1005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361453
27	NC_017588	GCC	2	6	1006	1011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361453
28	NC_017588	TCA	2	6	1016	1021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361453
29	NC_017588	CCA	2	6	1044	1049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361453
30	NC_017588	GCC	2	6	1054	1059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361453
31	NC_017588	GTG	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361453
32	NC_017588	GGC	2	6	1185	1190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361453
33	NC_017588	TCC	2	6	1199	1204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361453
34	NC_017588	GCC	2	6	1330	1335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361453
35	NC_017588	ATC	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361453
36	NC_017588	GAG	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361453
37	NC_017588	GCGG	2	8	1473	1480	0 %	0 %	75 %	25 %	386361453
38	NC_017588	GCGG	2	8	1485	1492	0 %	0 %	75 %	25 %	386361453
39	NC_017588	G	6	6	1545	1550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017588	C	6	6	1567	1572	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_017588	TGGA	2	8	1594	1601	25 %	25 %	50 %	0 %	386361454
42	NC_017588	GAC	2	6	1606	1611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361454
43	NC_017588	CTA	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361454
44	NC_017588	CGA	2	6	1694	1699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361454
45	NC_017588	TCTCC	2	10	1710	1719	0 %	40 %	0 %	60 %	386361454
46	NC_017588	CCG	2	6	1809	1814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361454
47	NC_017588	TCC	2	6	1817	1822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361454
48	NC_017588	CTC	2	6	1831	1836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361454
49	NC_017588	GTG	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361454
50	NC_017588	CTGGCC	2	12	1876	1887	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386361454
51	NC_017588	G	6	6	1910	1915	0 %	0 %	100 %	0 %	386361454
52	NC_017588	CCT	3	9	1929	1937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361454
53	NC_017588	CGG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361454
54	NC_017588	TCTTCC	2	12	1979	1990	0 %	50 %	0 %	50 %	386361454
55	NC_017588	GGCG	2	8	2004	2011	0 %	0 %	75 %	25 %	386361454
56	NC_017588	TGG	3	9	2084	2092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361454
57	NC_017588	GAA	2	6	2109	2114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361454
58	NC_017588	GTG	2	6	2128	2133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361454
59	NC_017588	GCC	2	6	2179	2184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361454
60	NC_017588	TGG	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361454
61	NC_017588	CTT	2	6	2214	2219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361454
62	NC_017588	CTT	2	6	2253	2258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361454
63	NC_017588	TGA	2	6	2267	2272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361454
64	NC_017588	CTT	2	6	2286	2291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361454
65	NC_017588	CAT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361454
66	NC_017588	GGC	2	6	2326	2331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361454
67	NC_017588	CCA	2	6	2342	2347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361454
68	NC_017588	TTC	2	6	2386	2391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361454
69	NC_017588	GTG	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361454
70	NC_017588	GCG	2	6	2475	2480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361454
71	NC_017588	G	6	6	2491	2496	0 %	0 %	100 %	0 %	386361454
72	NC_017588	CCT	3	9	2532	2540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361455
73	NC_017588	TTG	2	6	2572	2577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361455
74	NC_017588	TCT	2	6	2588	2593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361455
75	NC_017588	C	6	6	2626	2631	0 %	0 %	0 %	100 %	386361455
76	NC_017588	GAA	2	6	2706	2711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361455
77	NC_017588	GGC	2	6	2766	2771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361455
78	NC_017588	TCT	2	6	2813	2818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361455
79	NC_017588	TCC	2	6	2825	2830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361455
80	NC_017588	TGA	2	6	2837	2842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361455
81	NC_017588	CGC	2	6	2910	2915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361455
82	NC_017588	CCTCG	2	10	2931	2940	0 %	20 %	20 %	60 %	386361455
83	NC_017588	CAG	2	6	2965	2970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361455
84	NC_017588	GAG	2	6	2985	2990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361455
85	NC_017588	TGG	2	6	2993	2998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361455
86	NC_017588	TGGGG	2	10	3015	3024	0 %	20 %	80 %	0 %	386361455
87	NC_017588	CCGCT	2	10	3025	3034	0 %	20 %	20 %	60 %	386361455
88	NC_017588	GTCC	2	8	3042	3049	0 %	25 %	25 %	50 %	386361455
89	NC_017588	GGC	2	6	3075	3080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361455
90	NC_017588	TCA	2	6	3134	3139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361455
91	NC_017588	GGT	2	6	3159	3164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361455
92	NC_017588	CCA	2	6	3203	3208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361455
93	NC_017588	GTG	2	6	3235	3240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361455
94	NC_017588	GCCC	2	8	3249	3256	0 %	0 %	25 %	75 %	386361455
95	NC_017588	AGC	2	6	3281	3286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361455
96	NC_017588	GAG	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361455
97	NC_017588	GGT	2	6	3362	3367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361456
98	NC_017588	GTG	3	9	3426	3434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361456
99	NC_017588	TGG	2	6	3457	3462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361456
100	NC_017588	GGC	2	6	3516	3521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361456
101	NC_017588	TGG	2	6	3529	3534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361456
102	NC_017588	TGG	2	6	3598	3603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361456
103	NC_017588	CAC	2	6	3676	3681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361457
104	NC_017588	CAG	2	6	3682	3687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361457
105	NC_017588	GGAGG	2	10	3709	3718	20 %	0 %	80 %	0 %	386361457
106	NC_017588	GGGT	2	8	3767	3774	0 %	25 %	75 %	0 %	386361457
107	NC_017588	GCC	2	6	3815	3820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361457
108	NC_017588	AGG	2	6	3822	3827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361457
109	NC_017588	ACCA	2	8	3878	3885	50 %	0 %	0 %	50 %	386361457
110	NC_017588	ACC	2	6	3893	3898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361457
111	NC_017588	GGC	2	6	3921	3926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361457
112	NC_017588	CTC	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361457
113	NC_017588	GCGG	2	8	4099	4106	0 %	0 %	75 %	25 %	386361457
114	NC_017588	G	6	6	4162	4167	0 %	0 %	100 %	0 %	386361457
115	NC_017588	CCA	2	6	4188	4193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361457
116	NC_017588	TTC	2	6	4211	4216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361457
117	NC_017588	CTC	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361457
118	NC_017588	CGC	2	6	4270	4275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361457
119	NC_017588	CCT	2	6	4276	4281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361457
120	NC_017588	G	6	6	4356	4361	0 %	0 %	100 %	0 %	386361457
121	NC_017588	CAG	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361457
122	NC_017588	GGC	2	6	4396	4401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361457
123	NC_017588	AGGGG	2	10	4405	4414	20 %	0 %	80 %	0 %	386361457
124	NC_017588	TCC	3	9	4446	4454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361457
125	NC_017588	G	6	6	4520	4525	0 %	0 %	100 %	0 %	386361457
126	NC_017588	GGTGG	2	10	4573	4582	0 %	20 %	80 %	0 %	386361457
127	NC_017588	AGG	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361457
128	NC_017588	GGC	2	6	4630	4635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361457
129	NC_017588	GGA	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361457
130	NC_017588	CTC	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361457
131	NC_017588	GGC	2	6	4768	4773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361457
132	NC_017588	GGA	3	9	4819	4827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361457
133	NC_017588	CCT	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361457
134	NC_017588	GTG	3	9	4922	4930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361457
135	NC_017588	ACC	2	6	4946	4951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361457
136	NC_017588	GGC	2	6	4960	4965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361457
137	NC_017588	GGGGGC	2	12	4981	4992	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	386361457
138	NC_017588	GGA	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361457
139	NC_017588	TCC	2	6	5040	5045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361457
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159	NC_017588	G	6	6	5738	5743	0 %	0 %	100 %	0 %	386361458
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276	NC_017588	GGA	3	9	9926	9934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361460
277	NC_017588	CAGGC	2	10	9988	9997	20 %	0 %	40 %	40 %	386361460
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280	NC_017588	GCGG	2	8	10196	10203	0 %	0 %	75 %	25 %	386361460
281	NC_017588	GGC	2	6	10218	10223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361460
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378	NC_017588	GGT	2	6	13351	13356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361461
379	NC_017588	CAC	2	6	13402	13407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361461
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381	NC_017588	GGGCG	2	10	13438	13447	0 %	0 %	80 %	20 %	386361461
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383	NC_017588	CCT	3	9	13488	13496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361461
384	NC_017588	CAGG	2	8	13521	13528	25 %	0 %	50 %	25 %	386361461
385	NC_017588	G	7	7	13527	13533	0 %	0 %	100 %	0 %	386361461
386	NC_017588	CGC	2	6	13573	13578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361461
387	NC_017588	CGC	3	9	13599	13607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361461
388	NC_017588	GGC	2	6	13621	13626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361461
389	NC_017588	GC	3	6	13630	13635	0 %	0 %	50 %	50 %	386361461
390	NC_017588	GCC	2	6	13694	13699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
391	NC_017588	GAGGCG	2	12	13759	13770	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
392	NC_017588	GCACC	2	10	13776	13785	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
393	NC_017588	CTTC	2	8	14016	14023	0 %	50 %	0 %	50 %	386361462
394	NC_017588	GA	3	6	14112	14117	50 %	0 %	50 %	0 %	386361462
395	NC_017588	CTC	2	6	14120	14125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361462
396	NC_017588	GCC	2	6	14164	14169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361462
397	NC_017588	CCA	3	9	14206	14214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361462
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399	NC_017588	AGG	2	6	14286	14291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361462
400	NC_017588	CCA	2	6	14314	14319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361462
401	NC_017588	G	6	6	14343	14348	0 %	0 %	100 %	0 %	386361462
402	NC_017588	C	6	6	14392	14397	0 %	0 %	0 %	100 %	386361462
403	NC_017588	TGG	2	6	14406	14411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361462
404	NC_017588	GGA	2	6	14416	14421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361462
405	NC_017588	CAC	3	9	14444	14452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361462
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486	NC_017588	C	6	6	18148	18153	0 %	0 %	0 %	100 %	386361465
487	NC_017588	AGG	2	6	18169	18174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361465
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