MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1801

Total Repeats: 6822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017588	TGG	2	6	197975	197980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017588	AAG	2	6	198008	198013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017588	GAA	2	6	198088	198093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017588	GCC	2	6	198104	198109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_017588	G	6	6	198112	198117	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017588	AGG	2	6	198157	198162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361634
5007	NC_017588	CCT	3	9	198185	198193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361634
5008	NC_017588	CCA	2	6	198242	198247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361634
5009	NC_017588	C	6	6	198252	198257	0 %	0 %	0 %	100 %	386361634
5010	NC_017588	CTC	2	6	198309	198314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361634
5011	NC_017588	ACC	2	6	198331	198336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361634
5012	NC_017588	ATC	2	6	198352	198357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361634
5013	NC_017588	CTT	2	6	198374	198379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_017588	CCT	2	6	198425	198430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361635
5015	NC_017588	CCT	2	6	198491	198496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361635
5016	NC_017588	AAG	2	6	198546	198551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361635
5017	NC_017588	GAAA	2	8	198586	198593	75 %	0 %	25 %	0 %	386361635
5018	NC_017588	TCC	2	6	198599	198604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361635
5019	NC_017588	GGA	2	6	198629	198634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361635
5020	NC_017588	CCA	2	6	198662	198667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361635
5021	NC_017588	GAAGG	2	10	198777	198786	40 %	0 %	60 %	0 %	386361635
5022	NC_017588	G	6	6	198785	198790	0 %	0 %	100 %	0 %	386361635
5023	NC_017588	GAA	2	6	198819	198824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361635
5024	NC_017588	GGT	2	6	198917	198922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361635
5025	NC_017588	GGA	2	6	198965	198970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361635
5026	NC_017588	GGC	2	6	198971	198976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361635
5027	NC_017588	GGA	2	6	199001	199006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361635
5028	NC_017588	GAT	2	6	199059	199064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361635
5029	NC_017588	GGC	2	6	199080	199085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361635
5030	NC_017588	CCA	2	6	199130	199135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361635
5031	NC_017588	G	6	6	199181	199186	0 %	0 %	100 %	0 %	386361635
5032	NC_017588	AGG	2	6	199204	199209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361635
5033	NC_017588	CAC	2	6	199212	199217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361635
5034	NC_017588	CCG	2	6	199240	199245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361635
5035	NC_017588	ACG	2	6	199246	199251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361635
5036	NC_017588	GCC	2	6	199267	199272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361636
5037	NC_017588	GGC	2	6	199302	199307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361636
5038	NC_017588	AGG	2	6	199315	199320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361636
5039	NC_017588	CGG	2	6	199327	199332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361636
5040	NC_017588	CGG	2	6	199357	199362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361636
5041	NC_017588	CCTG	2	8	199448	199455	0 %	25 %	25 %	50 %	386361636
5042	NC_017588	AGG	2	6	199489	199494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361636
5043	NC_017588	CTG	2	6	199563	199568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361636
5044	NC_017588	ACC	2	6	199633	199638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361636
5045	NC_017588	CGG	2	6	199655	199660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361636
5046	NC_017588	CCT	2	6	199688	199693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361636
5047	NC_017588	AGT	2	6	199700	199705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361636
5048	NC_017588	GAA	2	6	199712	199717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361636
5049	NC_017588	TGA	2	6	199730	199735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361636
5050	NC_017588	GGC	2	6	199736	199741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361636
5051	NC_017588	GAG	2	6	199749	199754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361636
5052	NC_017588	CCA	2	6	199757	199762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361636
5053	NC_017588	CTC	2	6	199776	199781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361636
5054	NC_017588	CCT	2	6	199802	199807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361636
5055	NC_017588	CTTC	2	8	199826	199833	0 %	50 %	0 %	50 %	386361636
5056	NC_017588	A	6	6	199837	199842	100 %	0 %	0 %	0 %	386361636
5057	NC_017588	CCT	2	6	199855	199860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361637
5058	NC_017588	C	6	6	199868	199873	0 %	0 %	0 %	100 %	386361637
5059	NC_017588	TCC	2	6	199908	199913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361637
5060	NC_017588	CCT	2	6	199931	199936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361637
5061	NC_017588	CCT	2	6	199939	199944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361637
5062	NC_017588	GCCCC	2	10	199948	199957	0 %	0 %	20 %	80 %	386361637
5063	NC_017588	C	6	6	199961	199966	0 %	0 %	0 %	100 %	386361637
5064	NC_017588	G	6	6	199978	199983	0 %	0 %	100 %	0 %	386361637
5065	NC_017588	AGG	2	6	200031	200036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361637
5066	NC_017588	ACC	2	6	200046	200051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361637
5067	NC_017588	GCC	2	6	200065	200070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361637
5068	NC_017588	G	6	6	200095	200100	0 %	0 %	100 %	0 %	386361637
5069	NC_017588	GCG	2	6	200135	200140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361637
5070	NC_017588	GGT	2	6	200143	200148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361637
5071	NC_017588	GGC	2	6	200150	200155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361637
5072	NC_017588	GTG	2	6	200193	200198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361637
5073	NC_017588	G	6	6	200207	200212	0 %	0 %	100 %	0 %	386361637
5074	NC_017588	GGA	2	6	200217	200222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361637
5075	NC_017588	CTC	2	6	200282	200287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361637
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5077	NC_017588	GAG	3	9	200342	200350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361637
5078	NC_017588	CGG	2	6	200391	200396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361637
5079	NC_017588	C	6	6	200422	200427	0 %	0 %	0 %	100 %	386361637
5080	NC_017588	GGA	2	6	200428	200433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361637
5081	NC_017588	GAG	2	6	200441	200446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361637
5082	NC_017588	GCG	2	6	200489	200494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361637
5083	NC_017588	CTC	2	6	200519	200524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361637
5084	NC_017588	CAGC	2	8	200525	200532	25 %	0 %	25 %	50 %	386361637
5085	NC_017588	GCG	2	6	200618	200623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361637
5086	NC_017588	CGG	2	6	200644	200649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361637
5087	NC_017588	GGA	2	6	200693	200698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361637
5088	NC_017588	TAGGG	2	10	200710	200719	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017588	GCC	2	6	200787	200792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_017588	CTC	2	6	200836	200841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361638
5091	NC_017588	TCC	2	6	200846	200851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361638
5092	NC_017588	CCT	2	6	200883	200888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361638
5093	NC_017588	AGG	2	6	200897	200902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361638
5094	NC_017588	CGC	2	6	200928	200933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361638
5095	NC_017588	GCC	2	6	200936	200941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361638
5096	NC_017588	TGG	2	6	200995	201000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361638
5097	NC_017588	AGG	2	6	201155	201160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361638
5098	NC_017588	GAT	2	6	201204	201209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361638
5099	NC_017588	AGG	2	6	201233	201238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361638
5100	NC_017588	TCC	2	6	201287	201292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361638
5101	NC_017588	GGA	2	6	201303	201308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361638
5102	NC_017588	CCT	2	6	201342	201347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361638
5103	NC_017588	GTGGAG	2	12	201361	201372	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386361638
5104	NC_017588	GCGG	2	8	201378	201385	0 %	0 %	75 %	25 %	386361638
5105	NC_017588	GGAAG	2	10	201426	201435	40 %	0 %	60 %	0 %	386361638
5106	NC_017588	GGC	2	6	201492	201497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361638
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5108	NC_017588	CCGC	2	8	201629	201636	0 %	0 %	25 %	75 %	386361638
5109	NC_017588	GGA	2	6	201651	201656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361638
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5111	NC_017588	CCT	2	6	201722	201727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361639
5112	NC_017588	GGT	2	6	201749	201754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361639
5113	NC_017588	CAA	2	6	201776	201781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361639
5114	NC_017588	ACC	2	6	201789	201794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361639
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5116	NC_017588	CGGGG	2	10	201855	201864	0 %	0 %	80 %	20 %	386361639
5117	NC_017588	GGC	2	6	201908	201913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361639
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5119	NC_017588	AAG	2	6	201947	201952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361639
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5121	NC_017588	CCT	2	6	202016	202021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361639
5122	NC_017588	C	6	6	202027	202032	0 %	0 %	0 %	100 %	386361639
5123	NC_017588	CCT	2	6	202034	202039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361639
5124	NC_017588	C	7	7	202040	202046	0 %	0 %	0 %	100 %	386361639
5125	NC_017588	GCC	2	6	202084	202089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361639
5126	NC_017588	GCC	2	6	202101	202106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361639
5127	NC_017588	GGA	2	6	202145	202150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361639
5128	NC_017588	TCCCC	2	10	202181	202190	0 %	20 %	0 %	80 %	386361639
5129	NC_017588	GAG	2	6	202200	202205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361639
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5132	NC_017588	GCC	2	6	202341	202346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361639
5133	NC_017588	GGCGG	2	10	202360	202369	0 %	0 %	80 %	20 %	386361639
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5139	NC_017588	CCACG	2	10	202571	202580	20 %	0 %	20 %	60 %	386361639
5140	NC_017588	CCT	3	9	202634	202642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361639
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5145	NC_017588	GGA	2	6	202874	202879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361639
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5147	NC_017588	GGGC	2	8	202946	202953	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5148	NC_017588	CTT	2	6	203018	203023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361640
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5151	NC_017588	CTC	2	6	203061	203066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361640
5152	NC_017588	CTC	2	6	203100	203105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361640
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5154	NC_017588	GGGCC	2	10	203243	203252	0 %	0 %	60 %	40 %	386361641
5155	NC_017588	CTTC	2	8	203264	203271	0 %	50 %	0 %	50 %	386361641
5156	NC_017588	CCCTGG	2	12	203287	203298	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386361641
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5230	NC_017588	CTC	2	6	205593	205598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361643
5231	NC_017588	ACCC	2	8	205605	205612	25 %	0 %	0 %	75 %	386361643
5232	NC_017588	GGA	2	6	205664	205669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361643
5233	NC_017588	CTT	2	6	205692	205697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361643
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5235	NC_017588	TCTTCC	2	12	205728	205739	0 %	50 %	0 %	50 %	386361644
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5239	NC_017588	CCTC	2	8	205824	205831	0 %	25 %	0 %	75 %	386361644
5240	NC_017588	CTC	2	6	205883	205888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361644
5241	NC_017588	GAC	2	6	205919	205924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361644
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5243	NC_017588	CCT	2	6	205987	205992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361644
5244	NC_017588	C	6	6	206001	206006	0 %	0 %	0 %	100 %	386361644
5245	NC_017588	GAA	2	6	206026	206031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361644
5246	NC_017588	AGG	2	6	206055	206060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361644
5247	NC_017588	G	6	6	206064	206069	0 %	0 %	100 %	0 %	386361644
5248	NC_017588	GGTCTT	2	12	206071	206082	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386361644
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5369	NC_017588	TCC	3	9	210331	210339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361649
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5490	NC_017588	C	6	6	215120	215125	0 %	0 %	0 %	100 %	386361654
5491	NC_017588	CTC	2	6	215166	215171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361654
5492	NC_017588	TCC	2	6	215187	215192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361654
5493	NC_017588	GCC	2	6	215199	215204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5494	NC_017588	GGCCT	2	10	215220	215229	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5495	NC_017588	GCGCC	2	10	215328	215337	0 %	0 %	40 %	60 %	386361655
5496	NC_017588	GGC	2	6	215352	215357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361655
5497	NC_017588	C	6	6	215385	215390	0 %	0 %	0 %	100 %	386361655
5498	NC_017588	GGC	2	6	215398	215403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361655
5499	NC_017588	GCCGAG	2	12	215418	215429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386361655
5500	NC_017588	CGCCC	2	10	215462	215471	0 %	0 %	20 %	80 %	386361655

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