MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017587	CTC	2	6	153339	153344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359627
4002	NC_017587	CTT	2	6	153372	153377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359627
4003	NC_017587	CAC	2	6	153387	153392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359627
4004	NC_017587	AGGT	2	8	153412	153419	25 %	25 %	50 %	0 %	386359627
4005	NC_017587	GCG	2	6	153555	153560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359627
4006	NC_017587	CTC	2	6	153582	153587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359627
4007	NC_017587	GGGCG	2	10	153606	153615	0 %	0 %	80 %	20 %	386359627
4008	NC_017587	GGAA	2	8	153639	153646	50 %	0 %	50 %	0 %	386359627
4009	NC_017587	CCT	2	6	153659	153664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359627
4010	NC_017587	TCC	2	6	153686	153691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359627
4011	NC_017587	TCC	2	6	153712	153717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359627
4012	NC_017587	ACCCGG	2	12	153718	153729	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386359627
4013	NC_017587	CCT	2	6	153752	153757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359627
4014	NC_017587	GCG	2	6	153793	153798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359627
4015	NC_017587	TCCT	2	8	153831	153838	0 %	50 %	0 %	50 %	386359627
4016	NC_017587	TCC	2	6	153910	153915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359627
4017	NC_017587	TCC	2	6	153919	153924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359627
4018	NC_017587	CTC	2	6	153957	153962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359627
4019	NC_017587	G	7	7	153976	153982	0 %	0 %	100 %	0 %	386359627
4020	NC_017587	CCT	2	6	153983	153988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359627
4021	NC_017587	ACC	2	6	154048	154053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359627
4022	NC_017587	CCT	2	6	154058	154063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359627
4023	NC_017587	CTT	2	6	154071	154076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359627
4024	NC_017587	CTT	2	6	154152	154157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359627
4025	NC_017587	TCC	2	6	154171	154176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359627
4026	NC_017587	CCA	2	6	154202	154207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359627
4027	NC_017587	TCC	2	6	154250	154255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_017587	GTT	2	6	154272	154277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386359628
4029	NC_017587	TCC	2	6	154472	154477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359628
4030	NC_017587	CCT	2	6	154514	154519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359629
4031	NC_017587	GCACC	2	10	154569	154578	20 %	0 %	20 %	60 %	386359629
4032	NC_017587	CTC	2	6	154602	154607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359629
4033	NC_017587	C	7	7	154659	154665	0 %	0 %	0 %	100 %	386359629
4034	NC_017587	CCA	2	6	154679	154684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359629
4035	NC_017587	AGA	2	6	154685	154690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359629
4036	NC_017587	AGT	2	6	154708	154713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359630
4037	NC_017587	GGC	2	6	154727	154732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359630
4038	NC_017587	GTAGGG	2	12	154778	154789	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386359630
4039	NC_017587	GGGCG	2	10	154814	154823	0 %	0 %	80 %	20 %	386359630
4040	NC_017587	AGG	2	6	154836	154841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359630
4041	NC_017587	TGG	2	6	154852	154857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359630
4042	NC_017587	ACC	2	6	154908	154913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359630
4043	NC_017587	TCA	2	6	154936	154941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359630
4044	NC_017587	CGG	2	6	154987	154992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359630
4045	NC_017587	CCG	2	6	155017	155022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359630
4046	NC_017587	GCA	2	6	155026	155031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359630
4047	NC_017587	GGC	2	6	155090	155095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359630
4048	NC_017587	TCC	2	6	155118	155123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359630
4049	NC_017587	CCT	3	9	155131	155139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359630
4050	NC_017587	TCG	2	6	155187	155192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359630
4051	NC_017587	GGC	2	6	155198	155203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359630
4052	NC_017587	GAG	2	6	155207	155212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359630
4053	NC_017587	CGT	2	6	155221	155226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359630
4054	NC_017587	CCA	2	6	155242	155247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359630
4055	NC_017587	CGG	2	6	155257	155262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359630
4056	NC_017587	GTG	3	9	155294	155302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359630
4057	NC_017587	CAC	2	6	155336	155341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359630
4058	NC_017587	C	6	6	155361	155366	0 %	0 %	0 %	100 %	386359630
4059	NC_017587	GGC	2	6	155465	155470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359630
4060	NC_017587	GCC	2	6	155496	155501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359630
4061	NC_017587	G	6	6	155509	155514	0 %	0 %	100 %	0 %	386359630
4062	NC_017587	TCC	2	6	155592	155597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359630
4063	NC_017587	ACC	3	9	155604	155612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359630
4064	NC_017587	ACCC	2	8	155681	155688	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4065	NC_017587	CTC	2	6	155696	155701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359631
4066	NC_017587	GAG	2	6	155705	155710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359631
4067	NC_017587	CCT	2	6	155713	155718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359631
4068	NC_017587	G	6	6	155771	155776	0 %	0 %	100 %	0 %	386359631
4069	NC_017587	CTT	2	6	155788	155793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359631
4070	NC_017587	CCT	2	6	155797	155802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359631
4071	NC_017587	TCC	2	6	155832	155837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359631
4072	NC_017587	TCC	3	9	155844	155852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359631
4073	NC_017587	CTC	2	6	155855	155860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359631
4074	NC_017587	CTT	2	6	155912	155917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359631
4075	NC_017587	CCT	3	9	155932	155940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359631
4076	NC_017587	GTC	3	9	155957	155965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359631
4077	NC_017587	GGA	2	6	155969	155974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359631
4078	NC_017587	C	6	6	156022	156027	0 %	0 %	0 %	100 %	386359631
4079	NC_017587	CCT	2	6	156046	156051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359631
4080	NC_017587	GTA	2	6	156059	156064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359631
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4082	NC_017587	TGG	2	6	156133	156138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359631
4083	NC_017587	TGG	2	6	156150	156155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359631
4084	NC_017587	GTT	2	6	156182	156187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386359631
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4086	NC_017587	CTCG	2	8	156254	156261	0 %	25 %	25 %	50 %	386359631
4087	NC_017587	GGC	2	6	156323	156328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359631
4088	NC_017587	CGG	2	6	156334	156339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359631
4089	NC_017587	G	7	7	156338	156344	0 %	0 %	100 %	0 %	386359631
4090	NC_017587	GAA	2	6	156374	156379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359631
4091	NC_017587	GGC	2	6	156415	156420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359631
4092	NC_017587	TTG	2	6	156423	156428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386359631
4093	NC_017587	TGG	2	6	156439	156444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359631
4094	NC_017587	GTA	2	6	156509	156514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359631
4095	NC_017587	CCGG	2	8	156535	156542	0 %	0 %	50 %	50 %	386359631
4096	NC_017587	GGC	2	6	156566	156571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359631
4097	NC_017587	CGG	2	6	156583	156588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359631
4098	NC_017587	GCC	2	6	156651	156656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359631
4099	NC_017587	CCT	2	6	156674	156679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359631
4100	NC_017587	TCC	2	6	156729	156734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359631
4101	NC_017587	CTC	2	6	156752	156757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359631
4102	NC_017587	CTT	2	6	156803	156808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017587	GCCC	2	8	156829	156836	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4104	NC_017587	CCT	2	6	156854	156859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_017587	TTCCC	2	10	156886	156895	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4106	NC_017587	GTG	2	6	156936	156941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359632
4107	NC_017587	GGA	2	6	156983	156988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359632
4108	NC_017587	GCG	2	6	157004	157009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359632
4109	NC_017587	GAG	2	6	157047	157052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359632
4110	NC_017587	CTC	2	6	157053	157058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359632
4111	NC_017587	GGT	2	6	157082	157087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359632
4112	NC_017587	ACC	2	6	157113	157118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359632
4113	NC_017587	GAG	2	6	157119	157124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359632
4114	NC_017587	CTC	2	6	157137	157142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359632
4115	NC_017587	GAG	2	6	157209	157214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359632
4116	NC_017587	CCT	3	9	157220	157228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359632
4117	NC_017587	C	6	6	157237	157242	0 %	0 %	0 %	100 %	386359632
4118	NC_017587	GCA	2	6	157250	157255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359632
4119	NC_017587	CTC	2	6	157266	157271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359632
4120	NC_017587	AGC	2	6	157282	157287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359632
4121	NC_017587	ACC	2	6	157324	157329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359632
4122	NC_017587	TGG	2	6	157359	157364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359633
4123	NC_017587	GAG	2	6	157376	157381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359633
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4229	NC_017587	TCC	2	6	161087	161092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359638
4230	NC_017587	GGGC	2	8	161168	161175	0 %	0 %	75 %	25 %	386359638
4231	NC_017587	CACCTT	2	12	161197	161208	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386359638
4232	NC_017587	CCA	2	6	161286	161291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359638
4233	NC_017587	CCAG	2	8	161295	161302	25 %	0 %	25 %	50 %	386359638
4234	NC_017587	CCT	2	6	161308	161313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359638
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4239	NC_017587	GTGGG	2	10	161495	161504	0 %	20 %	80 %	0 %	386359638
4240	NC_017587	CAG	2	6	161542	161547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359638
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4242	NC_017587	GGA	2	6	161601	161606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359638
4243	NC_017587	TCC	2	6	161675	161680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359638
4244	NC_017587	GAG	2	6	161722	161727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359638
4245	NC_017587	GCG	2	6	161728	161733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359638
4246	NC_017587	CCCGG	2	10	161770	161779	0 %	0 %	40 %	60 %	386359638
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4250	NC_017587	GGA	2	6	161877	161882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359638
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4259	NC_017587	GCG	2	6	162222	162227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4291	NC_017587	G	7	7	163562	163568	0 %	0 %	100 %	0 %	386359641
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4303	NC_017587	GGTG	2	8	163843	163850	0 %	25 %	75 %	0 %	386359641
4304	NC_017587	CGT	2	6	163858	163863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359641
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4329	NC_017587	CCG	2	6	164664	164669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359642
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4360	NC_017587	TGG	2	6	166076	166081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359644
4361	NC_017587	G	6	6	166085	166090	0 %	0 %	100 %	0 %	386359644
4362	NC_017587	GGGCCG	2	12	166130	166141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359644
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4364	NC_017587	TGG	2	6	166178	166183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359644
4365	NC_017587	TGAAGG	2	12	166184	166195	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386359644
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4367	NC_017587	ACCT	2	8	166246	166253	25 %	25 %	0 %	50 %	386359644
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4492	NC_017587	CCT	2	6	171327	171332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359649
4493	NC_017587	GGT	2	6	171342	171347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359649
4494	NC_017587	CTC	2	6	171370	171375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359649
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