MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

< Previous12...8485868788899091929394...102103Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44003	NC_017587	CCCTG	2	10	1636977	1636986	0 %	20 %	20 %	60 %	386361173
44004	NC_017587	GGC	2	6	1637068	1637073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361173
44005	NC_017587	CCT	2	6	1637127	1637132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361173
44006	NC_017587	CCT	4	12	1637163	1637174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361173
44007	NC_017587	GCCC	2	8	1637208	1637215	0 %	0 %	25 %	75 %	386361173
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44011	NC_017587	CGC	2	6	1637397	1637402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361173
44012	NC_017587	CCT	4	12	1637463	1637474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361173
44013	NC_017587	TGG	2	6	1637489	1637494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361173
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44035	NC_017587	GGAAC	2	10	1638372	1638381	40 %	0 %	40 %	20 %	386361174
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44300	NC_017587	CGAGG	2	10	1647060	1647069	20 %	0 %	60 %	20 %	386361184
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44311	NC_017587	CTG	2	6	1647351	1647356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361184
44312	NC_017587	CCA	2	6	1647362	1647367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361184
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44315	NC_017587	CCTCCC	2	12	1647497	1647508	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	386361184
44316	NC_017587	GGTCGG	2	12	1647509	1647520	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386361184
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44319	NC_017587	CAC	2	6	1647567	1647572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361184
44320	NC_017587	CTT	2	6	1647576	1647581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361184
44321	NC_017587	CTT	2	6	1647585	1647590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361184
44322	NC_017587	CCA	2	6	1647653	1647658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361184
44323	NC_017587	CCA	4	12	1647734	1647745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361184
44324	NC_017587	CG	3	6	1647771	1647776	0 %	0 %	50 %	50 %	386361184
44325	NC_017587	CCT	2	6	1647815	1647820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44326	NC_017587	GTA	2	6	1647932	1647937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44327	NC_017587	TGGA	2	8	1647944	1647951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44328	NC_017587	GGA	2	6	1647976	1647981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44329	NC_017587	CGGGGA	2	12	1648052	1648063	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386361185
44330	NC_017587	CCG	2	6	1648079	1648084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361185
44331	NC_017587	GAG	3	9	1648116	1648124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361185
44332	NC_017587	GAG	3	9	1648137	1648145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361185
44333	NC_017587	TTC	2	6	1648146	1648151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361185
44334	NC_017587	G	6	6	1648182	1648187	0 %	0 %	100 %	0 %	386361185
44335	NC_017587	GGGC	2	8	1648201	1648208	0 %	0 %	75 %	25 %	386361185
44336	NC_017587	CCT	2	6	1648223	1648228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361185
44337	NC_017587	C	7	7	1648259	1648265	0 %	0 %	0 %	100 %	386361185
44338	NC_017587	CAT	2	6	1648280	1648285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361185
44339	NC_017587	AAG	2	6	1648296	1648301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361185
44340	NC_017587	CGG	2	6	1648377	1648382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361185
44341	NC_017587	CGG	2	6	1648408	1648413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361185
44342	NC_017587	GGA	2	6	1648427	1648432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361185
44343	NC_017587	GCCC	2	8	1648453	1648460	0 %	0 %	25 %	75 %	386361185
44344	NC_017587	AGG	2	6	1648480	1648485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361185
44345	NC_017587	GGT	2	6	1648511	1648516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361185
44346	NC_017587	CGA	2	6	1648610	1648615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361185
44347	NC_017587	G	7	7	1648619	1648625	0 %	0 %	100 %	0 %	386361185
44348	NC_017587	CGC	2	6	1648634	1648639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361185
44349	NC_017587	GC	3	6	1648659	1648664	0 %	0 %	50 %	50 %	386361185
44350	NC_017587	CTC	2	6	1648695	1648700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361185
44351	NC_017587	GCG	2	6	1648729	1648734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361185
44352	NC_017587	GTGG	2	8	1648790	1648797	0 %	25 %	75 %	0 %	386361185
44353	NC_017587	G	6	6	1648801	1648806	0 %	0 %	100 %	0 %	386361185
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44355	NC_017587	CAGG	2	8	1648868	1648875	25 %	0 %	50 %	25 %	386361185
44356	NC_017587	ACCG	2	8	1648908	1648915	25 %	0 %	25 %	50 %	386361185
44357	NC_017587	TGG	2	6	1648939	1648944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361185
44358	NC_017587	CGG	2	6	1648953	1648958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361185
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44384	NC_017587	CGC	2	6	1650198	1650203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361185
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44403	NC_017587	GC	3	6	1651070	1651075	0 %	0 %	50 %	50 %	386361185
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44419	NC_017587	AGG	2	6	1651687	1651692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361185
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44428	NC_017587	GGCCTC	2	12	1652067	1652078	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386361185
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44432	NC_017587	GAG	2	6	1652172	1652177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361185
44433	NC_017587	GAG	2	6	1652232	1652237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361185
44434	NC_017587	CCGC	2	8	1652267	1652274	0 %	0 %	25 %	75 %	386361185
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44443	NC_017587	CGC	2	6	1652651	1652656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361185
44444	NC_017587	CCACG	2	10	1652690	1652699	20 %	0 %	20 %	60 %	386361185
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44450	NC_017587	CGGCC	2	10	1652898	1652907	0 %	0 %	40 %	60 %	386361185
44451	NC_017587	GGCC	2	8	1652994	1653001	0 %	0 %	50 %	50 %	386361185
44452	NC_017587	GGT	2	6	1653071	1653076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361185
44453	NC_017587	GGA	2	6	1653242	1653247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361185
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44455	NC_017587	GCG	2	6	1653274	1653279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361185
44456	NC_017587	GCC	2	6	1653297	1653302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361185
44457	NC_017587	CCT	2	6	1653310	1653315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361185
44458	NC_017587	GAG	2	6	1653339	1653344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361185
44459	NC_017587	GGCCC	2	10	1653472	1653481	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44460	NC_017587	CTC	2	6	1653538	1653543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361186
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44462	NC_017587	GCC	2	6	1653616	1653621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361186
44463	NC_017587	GTG	2	6	1653652	1653657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361186
44464	NC_017587	GCC	2	6	1653681	1653686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361186
44465	NC_017587	GAG	2	6	1653688	1653693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361186
44466	NC_017587	GGA	2	6	1653708	1653713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361186
44467	NC_017587	GGT	2	6	1653726	1653731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361186
44468	NC_017587	GAG	2	6	1653745	1653750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361186
44469	NC_017587	C	6	6	1653751	1653756	0 %	0 %	0 %	100 %	386361186
44470	NC_017587	CG	3	6	1653819	1653824	0 %	0 %	50 %	50 %	386361186
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44472	NC_017587	CTC	2	6	1653919	1653924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361186
44473	NC_017587	G	7	7	1653951	1653957	0 %	0 %	100 %	0 %	386361186
44474	NC_017587	GGA	2	6	1653975	1653980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361186
44475	NC_017587	GGA	2	6	1654026	1654031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361186
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44480	NC_017587	CTA	2	6	1654184	1654189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361187
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