MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_017587	CTC	2	6	1601500	1601505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361135
43003	NC_017587	GC	3	6	1601510	1601515	0 %	0 %	50 %	50 %	386361135
43004	NC_017587	GAG	3	9	1601521	1601529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361135
43005	NC_017587	AGG	2	6	1601537	1601542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361135
43006	NC_017587	GGAGC	2	10	1601551	1601560	20 %	0 %	60 %	20 %	386361135
43007	NC_017587	ACC	2	6	1601609	1601614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361135
43008	NC_017587	CTC	2	6	1601626	1601631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361135
43009	NC_017587	GCG	2	6	1601701	1601706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361135
43010	NC_017587	GTC	2	6	1601728	1601733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361135
43011	NC_017587	CCA	2	6	1601736	1601741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361135
43012	NC_017587	CCT	2	6	1601762	1601767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361136
43013	NC_017587	ACC	2	6	1601779	1601784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361136
43014	NC_017587	CGC	2	6	1601850	1601855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361136
43015	NC_017587	GGC	2	6	1601862	1601867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361136
43016	NC_017587	CGG	2	6	1601882	1601887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361136
43017	NC_017587	GAG	2	6	1601889	1601894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361136
43018	NC_017587	GCG	2	6	1601905	1601910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361136
43019	NC_017587	AGG	2	6	1601923	1601928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361136
43020	NC_017587	CGCTC	2	10	1601963	1601972	0 %	20 %	20 %	60 %	386361136
43021	NC_017587	GAG	2	6	1601991	1601996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361136
43022	NC_017587	GCC	2	6	1602001	1602006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361136
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43025	NC_017587	GCG	2	6	1602061	1602066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361136
43026	NC_017587	AGT	2	6	1602095	1602100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361136
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43032	NC_017587	G	6	6	1602324	1602329	0 %	0 %	100 %	0 %	386361136
43033	NC_017587	GACCTT	2	12	1602360	1602371	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386361136
43034	NC_017587	GGC	2	6	1602410	1602415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361136
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43037	NC_017587	ATG	2	6	1602579	1602584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361137
43038	NC_017587	CGT	2	6	1602619	1602624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361137
43039	NC_017587	CACCCG	2	12	1602662	1602673	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386361137
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43042	NC_017587	GAG	2	6	1602728	1602733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361137
43043	NC_017587	GCCC	2	8	1602744	1602751	0 %	0 %	25 %	75 %	386361137
43044	NC_017587	G	6	6	1602786	1602791	0 %	0 %	100 %	0 %	386361137
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43054	NC_017587	CTC	2	6	1603409	1603414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361137
43055	NC_017587	GGGC	2	8	1603429	1603436	0 %	0 %	75 %	25 %	386361137
43056	NC_017587	GAG	2	6	1603439	1603444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361137
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43060	NC_017587	CGG	2	6	1603609	1603614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361137
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43062	NC_017587	GCCC	2	8	1603812	1603819	0 %	0 %	25 %	75 %	386361138
43063	NC_017587	C	6	6	1603817	1603822	0 %	0 %	0 %	100 %	386361138
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43108	NC_017587	CCGG	2	8	1605281	1605288	0 %	0 %	50 %	50 %	386361138
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43182	NC_017587	G	7	7	1608222	1608228	0 %	0 %	100 %	0 %	386361141
43183	NC_017587	TGA	2	6	1608245	1608250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361141
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43186	NC_017587	CCT	2	6	1608314	1608319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361141
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43191	NC_017587	TCC	2	6	1608394	1608399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361141
43192	NC_017587	C	6	6	1608422	1608427	0 %	0 %	0 %	100 %	386361141
43193	NC_017587	GAC	2	6	1608453	1608458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361141
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43200	NC_017587	C	6	6	1608770	1608775	0 %	0 %	0 %	100 %	386361141
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43204	NC_017587	GAG	2	6	1608891	1608896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361141
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43206	NC_017587	AAG	2	6	1608931	1608936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361141
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43210	NC_017587	GCC	2	6	1609009	1609014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361141
43211	NC_017587	GGA	2	6	1609034	1609039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361141
43212	NC_017587	GAA	2	6	1609155	1609160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361141
43213	NC_017587	CGC	2	6	1609176	1609181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361141
43214	NC_017587	CAC	2	6	1609191	1609196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361141
43215	NC_017587	ACC	2	6	1609213	1609218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361141
43216	NC_017587	GAGGTA	2	12	1609281	1609292	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386361141
43217	NC_017587	GAG	2	6	1609305	1609310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361141
43218	NC_017587	AAGGAA	2	12	1609317	1609328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361141
43219	NC_017587	AAG	2	6	1609357	1609362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361141
43220	NC_017587	GAA	2	6	1609377	1609382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43221	NC_017587	CATAC	2	10	1609384	1609393	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43222	NC_017587	CCT	2	6	1609404	1609409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361142
43223	NC_017587	GC	3	6	1609410	1609415	0 %	0 %	50 %	50 %	386361142
43224	NC_017587	CTC	2	6	1609441	1609446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361142
43225	NC_017587	CGGG	2	8	1609466	1609473	0 %	0 %	75 %	25 %	386361142
43226	NC_017587	GTG	2	6	1609477	1609482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361142
43227	NC_017587	CTC	2	6	1609513	1609518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361142
43228	NC_017587	CCCCA	2	10	1609530	1609539	20 %	0 %	0 %	80 %	386361142
43229	NC_017587	CGC	2	6	1609566	1609571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361142
43230	NC_017587	TGG	2	6	1609580	1609585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361142
43231	NC_017587	TTCC	2	8	1609590	1609597	0 %	50 %	0 %	50 %	386361142
43232	NC_017587	CTC	2	6	1609606	1609611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361142
43233	NC_017587	CTC	2	6	1609621	1609626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361142
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43235	NC_017587	GCC	2	6	1609642	1609647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361142
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43242	NC_017587	G	6	6	1609779	1609784	0 %	0 %	100 %	0 %	386361142
43243	NC_017587	TGG	2	6	1609796	1609801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361142
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43335	NC_017587	CCTC	2	8	1613152	1613159	0 %	25 %	0 %	75 %	386361146
43336	NC_017587	TCC	2	6	1613174	1613179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361146
43337	NC_017587	GGA	2	6	1613202	1613207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361146
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43347	NC_017587	AGC	2	6	1613481	1613486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43349	NC_017587	GCCAG	2	10	1613532	1613541	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43350	NC_017587	GAG	2	6	1613542	1613547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43351	NC_017587	C	6	6	1613676	1613681	0 %	0 %	0 %	100 %	386361147
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43473	NC_017587	CTC	2	6	1618505	1618510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43475	NC_017587	CTC	2	6	1618656	1618661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361152
43476	NC_017587	CCT	2	6	1618667	1618672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361152
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