MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017587	GAT	2	6	131669	131674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359601
3502	NC_017587	GGT	2	6	131752	131757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359601
3503	NC_017587	GGA	2	6	131758	131763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359601
3504	NC_017587	CCT	2	6	131769	131774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359601
3505	NC_017587	ACC	2	6	131799	131804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359601
3506	NC_017587	CCA	2	6	131851	131856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359601
3507	NC_017587	TTC	2	6	131883	131888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359601
3508	NC_017587	GGA	2	6	131893	131898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359601
3509	NC_017587	CCT	2	6	131911	131916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359601
3510	NC_017587	CGTG	2	8	132010	132017	0 %	25 %	50 %	25 %	386359601
3511	NC_017587	T	6	6	132094	132099	0 %	100 %	0 %	0 %	386359601
3512	NC_017587	GAG	2	6	132193	132198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359601
3513	NC_017587	GAA	2	6	132211	132216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359601
3514	NC_017587	CGC	2	6	132241	132246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359601
3515	NC_017587	TCC	2	6	132259	132264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359601
3516	NC_017587	CCT	2	6	132385	132390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359601
3517	NC_017587	TCC	2	6	132438	132443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359601
3518	NC_017587	GAG	2	6	132458	132463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359601
3519	NC_017587	GCC	2	6	132523	132528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359601
3520	NC_017587	GAG	2	6	132554	132559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359601
3521	NC_017587	CCT	2	6	132571	132576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359601
3522	NC_017587	CCT	3	9	132610	132618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359601
3523	NC_017587	GAG	3	9	132665	132673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359601
3524	NC_017587	GCC	2	6	132699	132704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359601
3525	NC_017587	CGGG	2	8	132744	132751	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_017587	G	6	6	132835	132840	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_017587	AAG	2	6	132872	132877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_017587	CAC	2	6	132964	132969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_017587	CAG	2	6	133086	133091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_017587	T	7	7	133150	133156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_017587	GGC	2	6	133178	133183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_017587	AGG	2	6	133195	133200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017587	GAC	2	6	133281	133286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359602
3534	NC_017587	CGG	2	6	133292	133297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359602
3535	NC_017587	GCG	2	6	133315	133320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359602
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3537	NC_017587	CGG	3	9	133529	133537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359602
3538	NC_017587	TGG	2	6	133628	133633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359602
3539	NC_017587	TGG	2	6	133655	133660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359602
3540	NC_017587	GC	3	6	133730	133735	0 %	0 %	50 %	50 %	386359602
3541	NC_017587	GTGG	2	8	133791	133798	0 %	25 %	75 %	0 %	386359602
3542	NC_017587	GGA	2	6	133884	133889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359602
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3545	NC_017587	GAG	2	6	134095	134100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359602
3546	NC_017587	CGC	2	6	134141	134146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359602
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3549	NC_017587	T	7	7	134209	134215	0 %	100 %	0 %	0 %	386359602
3550	NC_017587	GAC	2	6	134244	134249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359602
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3552	NC_017587	GGA	2	6	134349	134354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359602
3553	NC_017587	CGT	2	6	134403	134408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359602
3554	NC_017587	G	6	6	134435	134440	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017587	C	6	6	134451	134456	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3556	NC_017587	CTC	2	6	134496	134501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359603
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3558	NC_017587	CAA	2	6	134564	134569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386359603
3559	NC_017587	GTG	2	6	134594	134599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359603
3560	NC_017587	TCC	2	6	134736	134741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359604
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3562	NC_017587	AGG	2	6	134855	134860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359605
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3565	NC_017587	GTG	2	6	134947	134952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359605
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3571	NC_017587	GGT	2	6	135063	135068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359605
3572	NC_017587	TCG	2	6	135095	135100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359605
3573	NC_017587	CGA	2	6	135132	135137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359605
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3575	NC_017587	CAAGGT	2	12	135291	135302	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386359605
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3578	NC_017587	AGG	2	6	135402	135407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_017587	GAA	2	6	135415	135420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359606
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3582	NC_017587	CAT	2	6	135511	135516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359606
3583	NC_017587	CGGCCA	2	12	135540	135551	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386359606
3584	NC_017587	CCCG	2	8	135625	135632	0 %	0 %	25 %	75 %	386359606
3585	NC_017587	GGC	2	6	135652	135657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359606
3586	NC_017587	CCGG	2	8	135684	135691	0 %	0 %	50 %	50 %	386359606
3587	NC_017587	ACC	2	6	135761	135766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359606
3588	NC_017587	GCC	3	9	135776	135784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359606
3589	NC_017587	GAT	2	6	135787	135792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359606
3590	NC_017587	GTCGG	2	10	135794	135803	0 %	20 %	60 %	20 %	386359606
3591	NC_017587	GGT	2	6	135823	135828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359606
3592	NC_017587	CCT	2	6	135878	135883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359607
3593	NC_017587	CAA	2	6	135899	135904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386359607
3594	NC_017587	AGG	2	6	136102	136107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359607
3595	NC_017587	GAG	2	6	136110	136115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359607
3596	NC_017587	GCG	2	6	136135	136140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359607
3597	NC_017587	ATC	2	6	136146	136151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359607
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3599	NC_017587	TGGA	2	8	136170	136177	25 %	25 %	50 %	0 %	386359607
3600	NC_017587	GTG	2	6	136188	136193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359607
3601	NC_017587	CCT	2	6	136256	136261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359607
3602	NC_017587	CCCCAA	2	12	136262	136273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359607
3603	NC_017587	ATC	2	6	136305	136310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359607
3604	NC_017587	GGCGG	2	10	136322	136331	0 %	0 %	80 %	20 %	386359607
3605	NC_017587	CCG	2	6	136392	136397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359607
3606	NC_017587	ACA	2	6	136411	136416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386359607
3607	NC_017587	TCC	2	6	136474	136479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359607
3608	NC_017587	ACC	3	9	136494	136502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359607
3609	NC_017587	G	6	6	136540	136545	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_017587	GGC	2	6	136553	136558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_017587	GCC	2	6	136564	136569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_017587	G	7	7	136593	136599	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_017587	TGCGG	2	10	136616	136625	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3614	NC_017587	CAG	2	6	136638	136643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_017587	AGC	2	6	136648	136653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_017587	G	6	6	136706	136711	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017587	C	6	6	136718	136723	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3618	NC_017587	T	8	8	136730	136737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017587	ATC	2	6	136873	136878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359608
3620	NC_017587	GGA	2	6	136920	136925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359608
3621	NC_017587	CGC	2	6	136936	136941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359608
3622	NC_017587	TGG	2	6	137066	137071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359608
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3624	NC_017587	CGG	2	6	137186	137191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359609
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3995	NC_017587	TGGA	2	8	153019	153026	25 %	25 %	50 %	0 %	386359627
3996	NC_017587	GAT	2	6	153096	153101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359627
3997	NC_017587	CCT	2	6	153164	153169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359627
3998	NC_017587	GGC	2	6	153179	153184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359627
3999	NC_017587	CGA	2	6	153209	153214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359627
4000	NC_017587	GTA	2	6	153309	153314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359627

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