MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017587	GTGG	2	8	59058	59065	0 %	25 %	75 %	0 %	386359531
1502	NC_017587	GAGG	2	8	59083	59090	25 %	0 %	75 %	0 %	386359531
1503	NC_017587	AGG	2	6	59093	59098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359531
1504	NC_017587	ATC	2	6	59099	59104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359531
1505	NC_017587	TCC	2	6	59145	59150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_017587	GGCT	2	8	59156	59163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_017587	TGA	2	6	59184	59189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359532
1508	NC_017587	CAT	2	6	59197	59202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359532
1509	NC_017587	CGC	2	6	59215	59220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359532
1510	NC_017587	G	6	6	59275	59280	0 %	0 %	100 %	0 %	386359532
1511	NC_017587	TGG	2	6	59301	59306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359532
1512	NC_017587	GGTG	2	8	59307	59314	0 %	25 %	75 %	0 %	386359532
1513	NC_017587	GC	3	6	59315	59320	0 %	0 %	50 %	50 %	386359532
1514	NC_017587	AAG	2	6	59327	59332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359532
1515	NC_017587	CTT	3	9	59375	59383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359532
1516	NC_017587	CTT	2	6	59398	59403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359532
1517	NC_017587	TTTTC	2	10	59452	59461	0 %	80 %	0 %	20 %	386359532
1518	NC_017587	CCG	2	6	59472	59477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359532
1519	NC_017587	GAG	2	6	59525	59530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359532
1520	NC_017587	CGC	2	6	59545	59550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359532
1521	NC_017587	GCG	2	6	59678	59683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359532
1522	NC_017587	CGGG	2	8	59695	59702	0 %	0 %	75 %	25 %	386359532
1523	NC_017587	GGA	2	6	59704	59709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359532
1524	NC_017587	GAG	3	9	59714	59722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359532
1525	NC_017587	TGG	2	6	59817	59822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359532
1526	NC_017587	CGC	2	6	59833	59838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359532
1527	NC_017587	AGG	2	6	59862	59867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359532
1528	NC_017587	G	6	6	59946	59951	0 %	0 %	100 %	0 %	386359532
1529	NC_017587	CTC	2	6	59999	60004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359532
1530	NC_017587	C	6	6	60017	60022	0 %	0 %	0 %	100 %	386359532
1531	NC_017587	TCT	2	6	60039	60044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359532
1532	NC_017587	GCC	2	6	60065	60070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359532
1533	NC_017587	ACCT	2	8	60089	60096	25 %	25 %	0 %	50 %	386359532
1534	NC_017587	GAG	2	6	60116	60121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359532
1535	NC_017587	TC	3	6	60171	60176	0 %	50 %	0 %	50 %	386359532
1536	NC_017587	GGGT	2	8	60188	60195	0 %	25 %	75 %	0 %	386359532
1537	NC_017587	TCC	2	6	60225	60230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359532
1538	NC_017587	CGG	2	6	60269	60274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359532
1539	NC_017587	ATCCC	2	10	60289	60298	20 %	20 %	0 %	60 %	386359532
1540	NC_017587	GAA	2	6	60358	60363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017587	CGGGG	2	10	60387	60396	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1542	NC_017587	AAAG	2	8	60397	60404	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017587	GCCC	2	8	60419	60426	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1544	NC_017587	TGG	2	6	60431	60436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017587	GCC	2	6	60501	60506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_017587	GTG	2	6	60508	60513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017587	CTTGG	2	10	60583	60592	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1548	NC_017587	CGC	2	6	60773	60778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359533
1549	NC_017587	GGGA	2	8	60805	60812	25 %	0 %	75 %	0 %	386359533
1550	NC_017587	TCC	2	6	60845	60850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359533
1551	NC_017587	GAA	2	6	60859	60864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359533
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1555	NC_017587	G	7	7	61006	61012	0 %	0 %	100 %	0 %	386359533
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1557	NC_017587	GGT	2	6	61041	61046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359533
1558	NC_017587	AGA	2	6	61047	61052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359533
1559	NC_017587	GTC	2	6	61060	61065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359533
1560	NC_017587	CTC	2	6	61075	61080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359533
1561	NC_017587	CGT	2	6	61101	61106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359533
1562	NC_017587	ACC	2	6	61124	61129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359533
1563	NC_017587	TCT	2	6	61130	61135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359533
1564	NC_017587	GTA	2	6	61183	61188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359533
1565	NC_017587	CG	3	6	61202	61207	0 %	0 %	50 %	50 %	386359533
1566	NC_017587	GGA	3	9	61266	61274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359533
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1568	NC_017587	GAG	2	6	61303	61308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359533
1569	NC_017587	GTA	2	6	61309	61314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359533
1570	NC_017587	G	6	6	61344	61349	0 %	0 %	100 %	0 %	386359533
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1574	NC_017587	G	6	6	61453	61458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017587	CTT	2	6	61468	61473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1591	NC_017587	CCATCC	2	12	61988	61999	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386359534
1592	NC_017587	GTG	2	6	62025	62030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359534
1593	NC_017587	GGT	2	6	62039	62044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359534
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1596	NC_017587	AAG	2	6	62146	62151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359534
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1598	NC_017587	CTT	2	6	62241	62246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359534
1599	NC_017587	GAGGC	2	10	62318	62327	20 %	0 %	60 %	20 %	386359534
1600	NC_017587	CGGAG	2	10	62381	62390	20 %	0 %	60 %	20 %	386359534
1601	NC_017587	GCCC	2	8	62420	62427	0 %	0 %	25 %	75 %	386359534
1602	NC_017587	TGG	2	6	62450	62455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359534
1603	NC_017587	AGG	2	6	62458	62463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359534
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1606	NC_017587	TCG	2	6	62605	62610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359534
1607	NC_017587	CCA	2	6	62634	62639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359534
1608	NC_017587	GTA	2	6	62640	62645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359534
1609	NC_017587	CCA	2	6	62702	62707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359534
1610	NC_017587	C	6	6	62769	62774	0 %	0 %	0 %	100 %	386359534
1611	NC_017587	GAG	2	6	62775	62780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359534
1612	NC_017587	G	6	6	62813	62818	0 %	0 %	100 %	0 %	386359534
1613	NC_017587	GAT	2	6	62853	62858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359534
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1617	NC_017587	GTGGG	2	10	63097	63106	0 %	20 %	80 %	0 %	386359534
1618	NC_017587	AGA	2	6	63116	63121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359534
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1623	NC_017587	TGG	2	6	63320	63325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359534
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1625	NC_017587	GCC	2	6	63376	63381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359534
1626	NC_017587	GTA	2	6	63423	63428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359534
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