MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_017587	CGCCC	2	10	661109	661118	0 %	0 %	20 %	80 %	386360186
17503	NC_017587	GTGG	2	8	661230	661237	0 %	25 %	75 %	0 %	386360186
17504	NC_017587	AGG	3	9	661274	661282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360186
17505	NC_017587	ACC	2	6	661310	661315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360186
17506	NC_017587	CCT	2	6	661389	661394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360186
17507	NC_017587	GGT	2	6	661404	661409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360186
17508	NC_017587	GGCCCC	2	12	661419	661430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360186
17509	NC_017587	TCC	2	6	661473	661478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360187
17510	NC_017587	TCC	3	9	661503	661511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360187
17511	NC_017587	TTC	2	6	661544	661549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360187
17512	NC_017587	G	6	6	661558	661563	0 %	0 %	100 %	0 %	386360187
17513	NC_017587	AGG	2	6	661599	661604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360187
17514	NC_017587	CTT	2	6	661607	661612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360187
17515	NC_017587	CCTT	2	8	661622	661629	0 %	50 %	0 %	50 %	386360187
17516	NC_017587	GGC	2	6	661630	661635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360187
17517	NC_017587	GGC	2	6	661665	661670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360187
17518	NC_017587	GAG	3	9	661715	661723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360187
17519	NC_017587	TGC	2	6	661747	661752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360187
17520	NC_017587	AGG	2	6	661770	661775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360187
17521	NC_017587	GGT	3	9	661816	661824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360188
17522	NC_017587	CCT	2	6	661861	661866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360188
17523	NC_017587	TGG	3	9	661890	661898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360188
17524	NC_017587	GCC	2	6	661920	661925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360188
17525	NC_017587	GGA	2	6	661975	661980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360188
17526	NC_017587	GGC	3	9	661996	662004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360188
17527	NC_017587	GAG	2	6	662063	662068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360188
17528	NC_017587	AGG	2	6	662121	662126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360188
17529	NC_017587	GGA	2	6	662137	662142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360188
17530	NC_017587	TTGG	2	8	662149	662156	0 %	50 %	50 %	0 %	386360188
17531	NC_017587	GC	3	6	662174	662179	0 %	0 %	50 %	50 %	386360188
17532	NC_017587	CTGG	2	8	662233	662240	0 %	25 %	50 %	25 %	386360188
17533	NC_017587	GCG	2	6	662250	662255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360188
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17535	NC_017587	G	8	8	662288	662295	0 %	0 %	100 %	0 %	386360188
17536	NC_017587	G	6	6	662298	662303	0 %	0 %	100 %	0 %	386360188
17537	NC_017587	GGC	2	6	662325	662330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360188
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17540	NC_017587	GAG	2	6	662435	662440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360188
17541	NC_017587	CGC	2	6	662454	662459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360188
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17543	NC_017587	TCC	2	6	662561	662566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360188
17544	NC_017587	G	7	7	662584	662590	0 %	0 %	100 %	0 %	386360188
17545	NC_017587	CTC	2	6	662636	662641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360188
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17547	NC_017587	GGA	2	6	662725	662730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360189
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17549	NC_017587	G	6	6	662790	662795	0 %	0 %	100 %	0 %	386360189
17550	NC_017587	GGA	2	6	662797	662802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360189
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17552	NC_017587	GGC	2	6	662935	662940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360189
17553	NC_017587	GTG	2	6	663014	663019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360189
17554	NC_017587	CTGC	2	8	663076	663083	0 %	25 %	25 %	50 %	386360189
17555	NC_017587	GTG	2	6	663131	663136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360189
17556	NC_017587	AGG	2	6	663168	663173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360189
17557	NC_017587	TGG	2	6	663174	663179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360189
17558	NC_017587	TCC	3	9	663244	663252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17559	NC_017587	TGC	2	6	663262	663267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360190
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17564	NC_017587	GGC	2	6	663473	663478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360190
17565	NC_017587	CTG	2	6	663615	663620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360190
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17574	NC_017587	CCT	2	6	663935	663940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360190
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17578	NC_017587	CGCC	2	8	664208	664215	0 %	0 %	25 %	75 %	386360190
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17588	NC_017587	GGGCG	2	10	664568	664577	0 %	0 %	80 %	20 %	386360190
17589	NC_017587	TCC	2	6	664582	664587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360190
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17592	NC_017587	GAG	2	6	664677	664682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360190
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17595	NC_017587	TCG	2	6	664788	664793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360191
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17602	NC_017587	G	7	7	665081	665087	0 %	0 %	100 %	0 %	386360191
17603	NC_017587	G	8	8	665092	665099	0 %	0 %	100 %	0 %	386360191
17604	NC_017587	GGGC	2	8	665103	665110	0 %	0 %	75 %	25 %	386360191
17605	NC_017587	GCC	2	6	665114	665119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360191
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17607	NC_017587	GCGA	2	8	665141	665148	25 %	0 %	50 %	25 %	386360191
17608	NC_017587	CTA	2	6	665182	665187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360191
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17620	NC_017587	GCCC	2	8	665533	665540	0 %	0 %	25 %	75 %	386360191
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17622	NC_017587	CCT	2	6	665626	665631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360191
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17984	NC_017587	CCT	2	6	679850	679855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360205
17985	NC_017587	GGCCCC	2	12	679862	679873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360205
17986	NC_017587	GGA	2	6	679904	679909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360205
17987	NC_017587	GTG	2	6	679935	679940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360205
17988	NC_017587	GAG	2	6	679950	679955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360205
17989	NC_017587	GAG	3	9	679959	679967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360205
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17992	NC_017587	CTC	2	6	680154	680159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360205
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