MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017587	C	6	6	567873	567878	0 %	0 %	0 %	100 %	386360089
15003	NC_017587	GAG	2	6	567918	567923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360089
15004	NC_017587	CCTGGC	2	12	567964	567975	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386360090
15005	NC_017587	CCT	2	6	567982	567987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360090
15006	NC_017587	GGGCCT	2	12	567988	567999	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386360090
15007	NC_017587	CTC	2	6	568004	568009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360090
15008	NC_017587	G	6	6	568041	568046	0 %	0 %	100 %	0 %	386360090
15009	NC_017587	CGC	2	6	568075	568080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360090
15010	NC_017587	CGC	2	6	568084	568089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360090
15011	NC_017587	CCA	2	6	568158	568163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360090
15012	NC_017587	GCA	2	6	568212	568217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360090
15013	NC_017587	TCC	2	6	568218	568223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360090
15014	NC_017587	CCT	2	6	568231	568236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360090
15015	NC_017587	CT	3	6	568291	568296	0 %	50 %	0 %	50 %	386360090
15016	NC_017587	TCT	3	9	568326	568334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360090
15017	NC_017587	CCA	2	6	568347	568352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360090
15018	NC_017587	CTC	2	6	568412	568417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360090
15019	NC_017587	GAT	2	6	568429	568434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386360090
15020	NC_017587	CTACGC	2	12	568486	568497	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386360090
15021	NC_017587	GGC	2	6	568501	568506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360090
15022	NC_017587	GGA	2	6	568537	568542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360090
15023	NC_017587	GGT	2	6	568548	568553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360090
15024	NC_017587	TGG	2	6	568604	568609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360090
15025	NC_017587	CTGGG	2	10	568622	568631	0 %	20 %	60 %	20 %	386360090
15026	NC_017587	CTC	2	6	568682	568687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360090
15027	NC_017587	TCC	2	6	568698	568703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360090
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15029	NC_017587	G	6	6	568728	568733	0 %	0 %	100 %	0 %	386360090
15030	NC_017587	GCC	2	6	568775	568780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360090
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15032	NC_017587	GCCT	2	8	568855	568862	0 %	25 %	25 %	50 %	386360090
15033	NC_017587	CTT	2	6	568870	568875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360090
15034	NC_017587	CCT	2	6	568876	568881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360090
15035	NC_017587	GGCCTC	2	12	568895	568906	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386360090
15036	NC_017587	CGC	2	6	568936	568941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360090
15037	NC_017587	CTT	3	9	568987	568995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360090
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15039	NC_017587	CTT	2	6	569086	569091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360090
15040	NC_017587	C	6	6	569106	569111	0 %	0 %	0 %	100 %	386360090
15041	NC_017587	TCC	3	9	569124	569132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360090
15042	NC_017587	CTC	2	6	569150	569155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360090
15043	NC_017587	CCT	2	6	569191	569196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360090
15044	NC_017587	CCTCGC	2	12	569206	569217	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386360090
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15049	NC_017587	GCGG	2	8	569341	569348	0 %	0 %	75 %	25 %	386360090
15050	NC_017587	CTT	2	6	569365	569370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360090
15051	NC_017587	G	6	6	569503	569508	0 %	0 %	100 %	0 %	386360090
15052	NC_017587	GCG	2	6	569551	569556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360090
15053	NC_017587	GACC	2	8	569581	569588	25 %	0 %	25 %	50 %	386360090
15054	NC_017587	ACT	3	9	569679	569687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360090
15055	NC_017587	TCC	2	6	569688	569693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360090
15056	NC_017587	CCT	2	6	569727	569732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360090
15057	NC_017587	TCT	2	6	569757	569762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360090
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15061	NC_017587	TGGCTC	2	12	569866	569877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360091
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15090	NC_017587	C	7	7	571030	571036	0 %	0 %	0 %	100 %	386360093
15091	NC_017587	GGT	2	6	571084	571089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360093
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15093	NC_017587	GGA	2	6	571216	571221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360093
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15101	NC_017587	GGA	2	6	571468	571473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360093
15102	NC_017587	GAGGC	2	10	571509	571518	20 %	0 %	60 %	20 %	386360093
15103	NC_017587	AGGCCC	2	12	571554	571565	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386360093
15104	NC_017587	GAG	2	6	571582	571587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360093
15105	NC_017587	GCC	2	6	571607	571612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360093
15106	NC_017587	GCG	2	6	571794	571799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360094
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15110	NC_017587	GTGGCC	2	12	571930	571941	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386360094
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15112	NC_017587	GCCC	2	8	572034	572041	0 %	0 %	25 %	75 %	386360094
15113	NC_017587	G	6	6	572044	572049	0 %	0 %	100 %	0 %	386360094
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15115	NC_017587	CACC	2	8	572094	572101	25 %	0 %	0 %	75 %	386360094
15116	NC_017587	GGC	2	6	572136	572141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360094
15117	NC_017587	CTCC	2	8	572142	572149	0 %	25 %	0 %	75 %	386360094
15118	NC_017587	T	6	6	572175	572180	0 %	100 %	0 %	0 %	386360094
15119	NC_017587	CTTG	2	8	572214	572221	0 %	50 %	25 %	25 %	386360094
15120	NC_017587	GCCC	2	8	572240	572247	0 %	0 %	25 %	75 %	386360094
15121	NC_017587	CGC	2	6	572350	572355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15245	NC_017587	GGA	2	6	577223	577228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360101
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15262	NC_017587	TCC	2	6	578072	578077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360102
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15272	NC_017587	C	6	6	578441	578446	0 %	0 %	0 %	100 %	386360102
15273	NC_017587	CTC	2	6	578494	578499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360102
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15276	NC_017587	GGT	2	6	578604	578609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360103
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15309	NC_017587	CCA	2	6	579654	579659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360103
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15320	NC_017587	GCTG	2	8	580029	580036	0 %	25 %	50 %	25 %	386360104
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15345	NC_017587	GGC	2	6	580737	580742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360105
15346	NC_017587	G	6	6	580748	580753	0 %	0 %	100 %	0 %	386360105
15347	NC_017587	TCC	2	6	580775	580780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360105
15348	NC_017587	ACC	3	9	580803	580811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360106
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15351	NC_017587	CGAAG	2	10	580894	580903	40 %	0 %	40 %	20 %	386360106
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15354	NC_017587	GGCG	2	8	580993	581000	0 %	0 %	75 %	25 %	386360106
15355	NC_017587	GGCG	2	8	581023	581030	0 %	0 %	75 %	25 %	386360106
15356	NC_017587	CCT	3	9	581044	581052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360106
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15359	NC_017587	CGA	2	6	581140	581145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360106
15360	NC_017587	TGC	2	6	581203	581208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360107
15361	NC_017587	GAG	2	6	581247	581252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360107
15362	NC_017587	C	6	6	581325	581330	0 %	0 %	0 %	100 %	386360107
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15478	NC_017587	C	6	6	585406	585411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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15487	NC_017587	GAG	2	6	585728	585733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360111
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