MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017587	CCTT	2	8	40392	40399	0 %	50 %	0 %	50 %	386359506
1002	NC_017587	GGC	2	6	40405	40410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359506
1003	NC_017587	GGC	2	6	40513	40518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359506
1004	NC_017587	CCAG	2	8	40521	40528	25 %	0 %	25 %	50 %	386359506
1005	NC_017587	CAGGGC	2	12	40555	40566	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386359506
1006	NC_017587	TCC	2	6	40607	40612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359506
1007	NC_017587	G	6	6	40629	40634	0 %	0 %	100 %	0 %	386359506
1008	NC_017587	GGGCCC	2	12	40689	40700	0 %	0 %	50 %	50 %	386359506
1009	NC_017587	GGC	2	6	40750	40755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359506
1010	NC_017587	CGC	2	6	40822	40827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359506
1011	NC_017587	G	6	6	40851	40856	0 %	0 %	100 %	0 %	386359506
1012	NC_017587	GGGCCA	2	12	40929	40940	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386359506
1013	NC_017587	ACC	2	6	40999	41004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_017587	GCG	2	6	41030	41035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359507
1015	NC_017587	G	7	7	41077	41083	0 %	0 %	100 %	0 %	386359507
1016	NC_017587	GGC	2	6	41130	41135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359507
1017	NC_017587	C	6	6	41168	41173	0 %	0 %	0 %	100 %	386359507
1018	NC_017587	GGCCCA	2	12	41229	41240	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386359507
1019	NC_017587	CCGGGC	2	12	41286	41297	0 %	0 %	50 %	50 %	386359507
1020	NC_017587	CCT	2	6	41298	41303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359507
1021	NC_017587	AGGGA	2	10	41345	41354	40 %	0 %	60 %	0 %	386359507
1022	NC_017587	GC	3	6	41367	41372	0 %	0 %	50 %	50 %	386359507
1023	NC_017587	GAG	2	6	41401	41406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359507
1024	NC_017587	TGGCCC	2	12	41411	41422	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386359507
1025	NC_017587	GGC	2	6	41462	41467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359507
1026	NC_017587	GGCC	2	8	41482	41489	0 %	0 %	50 %	50 %	386359507
1027	NC_017587	GGA	2	6	41523	41528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359507
1028	NC_017587	GGT	2	6	41529	41534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359507
1029	NC_017587	CTC	2	6	41548	41553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359507
1030	NC_017587	G	6	6	41560	41565	0 %	0 %	100 %	0 %	386359507
1031	NC_017587	GGC	2	6	41577	41582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359507
1032	NC_017587	CTCC	2	8	41583	41590	0 %	25 %	0 %	75 %	386359507
1033	NC_017587	GGA	2	6	41592	41597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359507
1034	NC_017587	CGC	2	6	41646	41651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359507
1035	NC_017587	GGC	2	6	41672	41677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359507
1036	NC_017587	G	7	7	41688	41694	0 %	0 %	100 %	0 %	386359507
1037	NC_017587	CTC	2	6	41767	41772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359507
1038	NC_017587	GGT	2	6	41841	41846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359507
1039	NC_017587	GGA	2	6	41847	41852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359507
1040	NC_017587	CCCGG	2	10	41860	41869	0 %	0 %	40 %	60 %	386359507
1041	NC_017587	GGC	2	6	41870	41875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359507
1042	NC_017587	G	7	7	41892	41898	0 %	0 %	100 %	0 %	386359507
1043	NC_017587	CCT	2	6	41910	41915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359507
1044	NC_017587	GGGCTT	2	12	41932	41943	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386359507
1045	NC_017587	CGCCCT	2	12	41952	41963	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386359507
1046	NC_017587	CAG	2	6	41977	41982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359507
1047	NC_017587	GGT	2	6	41985	41990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359507
1048	NC_017587	AGG	2	6	42083	42088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359507
1049	NC_017587	TGGG	2	8	42106	42113	0 %	25 %	75 %	0 %	386359507
1050	NC_017587	CCT	2	6	42189	42194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359507
1051	NC_017587	TTC	2	6	42226	42231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359507
1052	NC_017587	GCC	2	6	42289	42294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359507
1053	NC_017587	CTC	2	6	42295	42300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359507
1054	NC_017587	TGGCC	2	10	42308	42317	0 %	20 %	40 %	40 %	386359507
1055	NC_017587	GCCC	2	8	42321	42328	0 %	0 %	25 %	75 %	386359507
1056	NC_017587	TCC	3	9	42332	42340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359507
1057	NC_017587	TCC	2	6	42356	42361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359507
1058	NC_017587	G	7	7	42378	42384	0 %	0 %	100 %	0 %	386359507
1059	NC_017587	CTGGG	2	10	42400	42409	0 %	20 %	60 %	20 %	386359507
1060	NC_017587	GGT	2	6	42420	42425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359507
1061	NC_017587	GAG	2	6	42453	42458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359507
1062	NC_017587	GTG	2	6	42519	42524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359508
1063	NC_017587	GGC	2	6	42554	42559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359508
1064	NC_017587	GGCG	2	8	42601	42608	0 %	0 %	75 %	25 %	386359508
1065	NC_017587	GCCCT	2	10	42627	42636	0 %	20 %	20 %	60 %	386359508
1066	NC_017587	GGT	2	6	42653	42658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359508
1067	NC_017587	GTG	2	6	42666	42671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359508
1068	NC_017587	GC	3	6	42690	42695	0 %	0 %	50 %	50 %	386359508
1069	NC_017587	GCC	2	6	42705	42710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359508
1070	NC_017587	CGG	2	6	42780	42785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359508
1071	NC_017587	TCC	2	6	42790	42795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359508
1072	NC_017587	GCC	2	6	42800	42805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359508
1073	NC_017587	GCC	2	6	42822	42827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359508
1074	NC_017587	GCC	2	6	42888	42893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359508
1075	NC_017587	C	6	6	42911	42916	0 %	0 %	0 %	100 %	386359508
1076	NC_017587	CAC	2	6	43028	43033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359508
1077	NC_017587	CCT	2	6	43034	43039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359508
1078	NC_017587	GGC	2	6	43053	43058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359508
1079	NC_017587	G	6	6	43070	43075	0 %	0 %	100 %	0 %	386359508
1080	NC_017587	TGG	2	6	43126	43131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359508
1081	NC_017587	AGG	2	6	43204	43209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359508
1082	NC_017587	CGC	2	6	43250	43255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_017587	CGGA	2	8	43324	43331	25 %	0 %	50 %	25 %	386359509
1084	NC_017587	CTC	2	6	43360	43365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359509
1085	NC_017587	TCC	2	6	43367	43372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359509
1086	NC_017587	GGC	2	6	43383	43388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359509
1087	NC_017587	CCT	2	6	43416	43421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359509
1088	NC_017587	TCC	2	6	43424	43429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359509
1089	NC_017587	C	6	6	43448	43453	0 %	0 %	0 %	100 %	386359509
1090	NC_017587	TGG	2	6	43463	43468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359509
1091	NC_017587	CCT	2	6	43479	43484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359509
1092	NC_017587	TGG	2	6	43502	43507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359509
1093	NC_017587	CCT	2	6	43568	43573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359509
1094	NC_017587	CTC	3	9	43579	43587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359509
1095	NC_017587	CGCCCT	2	12	43608	43619	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386359509
1096	NC_017587	CTC	2	6	43630	43635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359509
1097	NC_017587	GCT	2	6	43670	43675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359509
1098	NC_017587	ACCTCC	2	12	43682	43693	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386359509
1099	NC_017587	TTG	2	6	43776	43781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386359510
1100	NC_017587	GC	3	6	43797	43802	0 %	0 %	50 %	50 %	386359510
1101	NC_017587	CCT	2	6	43810	43815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359510
1102	NC_017587	TGG	2	6	43825	43830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359510
1103	NC_017587	CGC	2	6	43889	43894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359510
1104	NC_017587	G	6	6	43918	43923	0 %	0 %	100 %	0 %	386359510
1105	NC_017587	C	6	6	43927	43932	0 %	0 %	0 %	100 %	386359510
1106	NC_017587	CCA	2	6	43951	43956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359510
1107	NC_017587	CCA	2	6	43993	43998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359510
1108	NC_017587	CCA	2	6	44029	44034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359510
1109	NC_017587	CGG	2	6	44041	44046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359510
1110	NC_017587	GGCG	2	8	44059	44066	0 %	0 %	75 %	25 %	386359510
1111	NC_017587	CCT	2	6	44217	44222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359511
1112	NC_017587	GGGCG	2	10	44232	44241	0 %	0 %	80 %	20 %	386359511
1113	NC_017587	G	7	7	44424	44430	0 %	0 %	100 %	0 %	386359511
1114	NC_017587	CAC	2	6	44433	44438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359511
1115	NC_017587	TCC	2	6	44443	44448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359511
1116	NC_017587	CTC	2	6	44470	44475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359511
1117	NC_017587	CTT	2	6	44544	44549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359511
1118	NC_017587	CTC	2	6	44612	44617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359512
1119	NC_017587	TCC	2	6	44769	44774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359512
1120	NC_017587	GTG	3	9	44795	44803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359512
1121	NC_017587	GGA	2	6	44818	44823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359512
1122	NC_017587	TCC	2	6	44898	44903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359512
1123	NC_017587	AGG	2	6	45081	45086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359513
1124	NC_017587	CCT	2	6	45145	45150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359513
1125	NC_017587	GCC	2	6	45204	45209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359513
1126	NC_017587	CCT	2	6	45244	45249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359513
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1498	NC_017587	G	7	7	59008	59014	0 %	0 %	100 %	0 %	386359531
1499	NC_017587	GCC	2	6	59018	59023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359531
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