MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017587	CTT	2	6	530446	530451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360045
14002	NC_017587	CCT	2	6	530473	530478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360046
14003	NC_017587	AAG	2	6	530490	530495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360046
14004	NC_017587	GAG	2	6	530559	530564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360046
14005	NC_017587	TGCGG	2	10	530586	530595	0 %	20 %	60 %	20 %	386360046
14006	NC_017587	GGC	2	6	530660	530665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360046
14007	NC_017587	C	6	6	530680	530685	0 %	0 %	0 %	100 %	386360046
14008	NC_017587	AGG	2	6	530704	530709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360046
14009	NC_017587	GAG	2	6	530733	530738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360046
14010	NC_017587	GAG	2	6	530748	530753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360046
14011	NC_017587	G	6	6	530756	530761	0 %	0 %	100 %	0 %	386360046
14012	NC_017587	CCA	2	6	530789	530794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360046
14013	NC_017587	GGC	2	6	530871	530876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360046
14014	NC_017587	AGG	2	6	530905	530910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360046
14015	NC_017587	CGC	3	9	530943	530951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360046
14016	NC_017587	GAC	2	6	530976	530981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360046
14017	NC_017587	G	6	6	530992	530997	0 %	0 %	100 %	0 %	386360046
14018	NC_017587	CCA	2	6	531002	531007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360046
14019	NC_017587	GAG	2	6	531015	531020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360046
14020	NC_017587	G	6	6	531035	531040	0 %	0 %	100 %	0 %	386360046
14021	NC_017587	GAG	2	6	531045	531050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360046
14022	NC_017587	G	6	6	531065	531070	0 %	0 %	100 %	0 %	386360046
14023	NC_017587	GCG	2	6	531111	531116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360046
14024	NC_017587	CTC	2	6	531120	531125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360046
14025	NC_017587	CCA	2	6	531128	531133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360046
14026	NC_017587	CCGCCA	2	12	531191	531202	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386360046
14027	NC_017587	GGA	2	6	531206	531211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360046
14028	NC_017587	CCT	2	6	531248	531253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360046
14029	NC_017587	GGGC	2	8	531262	531269	0 %	0 %	75 %	25 %	386360046
14030	NC_017587	CAC	2	6	531279	531284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360046
14031	NC_017587	GGC	2	6	531290	531295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360046
14032	NC_017587	CCT	2	6	531302	531307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360046
14033	NC_017587	TCG	2	6	531346	531351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360046
14034	NC_017587	GCCC	2	8	531357	531364	0 %	0 %	25 %	75 %	386360046
14035	NC_017587	CGA	2	6	531407	531412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360046
14036	NC_017587	GGC	2	6	531557	531562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_017587	TGGA	2	8	531671	531678	25 %	25 %	50 %	0 %	386360047
14038	NC_017587	CAC	2	6	531691	531696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360047
14039	NC_017587	GTGGC	2	10	531701	531710	0 %	20 %	60 %	20 %	386360047
14040	NC_017587	GCCCC	2	10	531734	531743	0 %	0 %	20 %	80 %	386360047
14041	NC_017587	GAA	2	6	531745	531750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360047
14042	NC_017587	GGC	2	6	531790	531795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360047
14043	NC_017587	TCC	2	6	531881	531886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360047
14044	NC_017587	GGC	4	12	531937	531948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360047
14045	NC_017587	CCG	2	6	531968	531973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360047
14046	NC_017587	GGC	3	9	532009	532017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360047
14047	NC_017587	GCG	2	6	532022	532027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360047
14048	NC_017587	ACC	4	12	532115	532126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360047
14049	NC_017587	TCC	2	6	532130	532135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360047
14050	NC_017587	GAGGGC	2	12	532147	532158	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386360047
14051	NC_017587	CGG	3	9	532206	532214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360047
14052	NC_017587	G	6	6	532217	532222	0 %	0 %	100 %	0 %	386360047
14053	NC_017587	GCCC	2	8	532263	532270	0 %	0 %	25 %	75 %	386360047
14054	NC_017587	TCACGG	2	12	532287	532298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386360047
14055	NC_017587	GGC	2	6	532315	532320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360047
14056	NC_017587	GGT	3	9	532321	532329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360047
14057	NC_017587	GTTC	2	8	532455	532462	0 %	50 %	25 %	25 %	386360047
14058	NC_017587	CCT	2	6	532503	532508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360047
14059	NC_017587	GCC	2	6	532544	532549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360047
14060	NC_017587	GAC	2	6	532564	532569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360047
14061	NC_017587	CAT	2	6	532606	532611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360047
14062	NC_017587	GAG	3	9	532688	532696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360048
14063	NC_017587	AGG	2	6	532704	532709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360048
14064	NC_017587	CCG	2	6	532711	532716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360048
14065	NC_017587	CTC	2	6	532730	532735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360048
14066	NC_017587	GGC	2	6	532751	532756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360048
14067	NC_017587	TCC	2	6	532776	532781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360048
14068	NC_017587	TCT	2	6	532786	532791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360048
14069	NC_017587	TGG	2	6	532870	532875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360048
14070	NC_017587	CAC	2	6	532889	532894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360048
14071	NC_017587	AGG	2	6	532920	532925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360048
14072	NC_017587	GGA	2	6	532975	532980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360048
14073	NC_017587	CCA	2	6	533023	533028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360048
14074	NC_017587	CCT	2	6	533029	533034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360048
14075	NC_017587	GGC	2	6	533074	533079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360048
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14077	NC_017587	CCG	2	6	533099	533104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360048
14078	NC_017587	TCC	2	6	533118	533123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360048
14079	NC_017587	ACC	2	6	533181	533186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360048
14080	NC_017587	CGG	2	6	533218	533223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360048
14081	NC_017587	GGC	2	6	533331	533336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360049
14082	NC_017587	CGC	2	6	533387	533392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360049
14083	NC_017587	GTCCC	2	10	533461	533470	0 %	20 %	20 %	60 %	386360049
14084	NC_017587	GAG	2	6	533484	533489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360049
14085	NC_017587	C	7	7	533559	533565	0 %	0 %	0 %	100 %	386360049
14086	NC_017587	C	6	6	533588	533593	0 %	0 %	0 %	100 %	386360049
14087	NC_017587	ACC	2	6	533617	533622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360049
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14089	NC_017587	CGG	2	6	533678	533683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360049
14090	NC_017587	AGG	2	6	533713	533718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360049
14091	NC_017587	TCC	2	6	533731	533736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360049
14092	NC_017587	C	7	7	533747	533753	0 %	0 %	0 %	100 %	386360049
14093	NC_017587	CCA	2	6	533795	533800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360049
14094	NC_017587	AGG	2	6	533806	533811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360049
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14096	NC_017587	TCG	2	6	533857	533862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360049
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14099	NC_017587	CAAG	2	8	533964	533971	50 %	0 %	25 %	25 %	386360049
14100	NC_017587	G	7	7	533998	534004	0 %	0 %	100 %	0 %	386360050
14101	NC_017587	CGC	2	6	534017	534022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360050
14102	NC_017587	AGG	3	9	534030	534038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360050
14103	NC_017587	GCG	2	6	534071	534076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360050
14104	NC_017587	TCC	2	6	534087	534092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360050
14105	NC_017587	GAG	2	6	534128	534133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360050
14106	NC_017587	CG	3	6	534156	534161	0 %	0 %	50 %	50 %	386360050
14107	NC_017587	CTT	2	6	534173	534178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360050
14108	NC_017587	CCA	2	6	534214	534219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360050
14109	NC_017587	GGA	2	6	534220	534225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360050
14110	NC_017587	TCC	2	6	534231	534236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360050
14111	NC_017587	TCC	2	6	534264	534269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360050
14112	NC_017587	GAG	4	12	534278	534289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360050
14113	NC_017587	GAG	3	9	534296	534304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360050
14114	NC_017587	G	7	7	534417	534423	0 %	0 %	100 %	0 %	386360050
14115	NC_017587	CCT	2	6	534493	534498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360050
14116	NC_017587	GTG	2	6	534589	534594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360051
14117	NC_017587	GGGC	2	8	534596	534603	0 %	0 %	75 %	25 %	386360051
14118	NC_017587	GCC	2	6	534619	534624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360051
14119	NC_017587	AAG	2	6	534676	534681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360051
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14121	NC_017587	GGC	2	6	534813	534818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360051
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14232	NC_017587	GCT	2	6	539009	539014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360053
14233	NC_017587	GGA	2	6	539083	539088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360053
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14235	NC_017587	CGGT	2	8	539101	539108	0 %	25 %	50 %	25 %	386360053
14236	NC_017587	TCGC	2	8	539113	539120	0 %	25 %	25 %	50 %	386360053
14237	NC_017587	AGG	2	6	539182	539187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360053
14238	NC_017587	TCT	2	6	539249	539254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360053
14239	NC_017587	TGA	2	6	539426	539431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386360053
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14241	NC_017587	ACC	2	6	539526	539531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14242	NC_017587	CCT	2	6	539593	539598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360054
14243	NC_017587	GTG	2	6	539619	539624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360054
14244	NC_017587	CCT	2	6	539630	539635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360054
14245	NC_017587	TCC	2	6	539674	539679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360054
14246	NC_017587	CGC	2	6	539732	539737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360054
14247	NC_017587	CCT	2	6	539753	539758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360054
14248	NC_017587	CCT	2	6	539768	539773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360054
14249	NC_017587	TCC	2	6	539782	539787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360054
14250	NC_017587	CCT	3	9	539846	539854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360054
14251	NC_017587	GCG	2	6	539886	539891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360054
14252	NC_017587	G	6	6	539911	539916	0 %	0 %	100 %	0 %	386360054
14253	NC_017587	GAG	2	6	539949	539954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360054
14254	NC_017587	TCC	2	6	539983	539988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360054
14255	NC_017587	GGGCG	2	10	539999	540008	0 %	0 %	80 %	20 %	386360054
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14264	NC_017587	GAG	2	6	540261	540266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360054
14265	NC_017587	CCG	2	6	540274	540279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360054
14266	NC_017587	TCCTGG	2	12	540289	540300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360054
14267	NC_017587	GGCC	2	8	540320	540327	0 %	0 %	50 %	50 %	386360054
14268	NC_017587	GGCCCT	2	12	540395	540406	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386360054
14269	NC_017587	TCC	2	6	540460	540465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360054
14270	NC_017587	CGCC	2	8	540482	540489	0 %	0 %	25 %	75 %	386360054
14271	NC_017587	CGC	2	6	540491	540496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360054
14272	NC_017587	CCA	2	6	540506	540511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14273	NC_017587	GGA	2	6	540602	540607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360055
14274	NC_017587	GAGGGC	2	12	540675	540686	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386360055
14275	NC_017587	GGC	3	9	540684	540692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360055
14276	NC_017587	TCC	2	6	540760	540765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360055
14277	NC_017587	CGG	2	6	540809	540814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360055
14278	NC_017587	GTC	2	6	540822	540827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360055
14279	NC_017587	GCCC	3	12	540831	540842	0 %	0 %	25 %	75 %	386360055
14280	NC_017587	CCT	2	6	540869	540874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360055
14281	NC_017587	GCC	2	6	540901	540906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360055
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14283	NC_017587	GCGG	2	8	540951	540958	0 %	0 %	75 %	25 %	386360055
14284	NC_017587	GCC	2	6	540967	540972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360055
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14289	NC_017587	CGTCCT	2	12	541100	541111	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386360055
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14291	NC_017587	GCC	3	9	541177	541185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360055
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14310	NC_017587	TCC	2	6	541654	541659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360056
14311	NC_017587	GGCGCT	2	12	541668	541679	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386360056
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14313	NC_017587	GGTG	2	8	541763	541770	0 %	25 %	75 %	0 %	386360056
14314	NC_017587	CCA	2	6	541796	541801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360056
14315	NC_017587	CCT	2	6	541892	541897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360056
14316	NC_017587	TCT	2	6	541960	541965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14317	NC_017587	ACC	2	6	542112	542117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360057
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14321	NC_017587	AGG	2	6	542152	542157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360057
14322	NC_017587	GGGAGG	2	12	542170	542181	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	386360057
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14324	NC_017587	GC	3	6	542202	542207	0 %	0 %	50 %	50 %	386360057
14325	NC_017587	GGC	2	6	542218	542223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360057
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14329	NC_017587	GGGC	2	8	542328	542335	0 %	0 %	75 %	25 %	386360057
14330	NC_017587	CCT	2	6	542342	542347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360057
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14332	NC_017587	G	7	7	542400	542406	0 %	0 %	100 %	0 %	386360057
14333	NC_017587	GTGGCC	2	12	542418	542429	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386360057
14334	NC_017587	CTC	3	9	542454	542462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360057
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14341	NC_017587	TGG	2	6	542581	542586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360057
14342	NC_017587	GTA	2	6	542609	542614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386360057
14343	NC_017587	GC	3	6	542642	542647	0 %	0 %	50 %	50 %	386360058
14344	NC_017587	CCGGG	2	10	542691	542700	0 %	0 %	60 %	40 %	386360058
14345	NC_017587	ACC	2	6	542749	542754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360058
14346	NC_017587	CGG	2	6	542830	542835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360058
14347	NC_017587	GTG	2	6	542841	542846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360058
14348	NC_017587	GAG	2	6	542847	542852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360058
14349	NC_017587	CGG	2	6	542893	542898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360058
14350	NC_017587	CTT	2	6	542905	542910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360058
14351	NC_017587	CAC	2	6	542966	542971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360058
14352	NC_017587	TCG	2	6	543079	543084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360058
14353	NC_017587	CCA	2	6	543106	543111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360058
14354	NC_017587	GAG	2	6	543117	543122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360058
14355	NC_017587	TCC	2	6	543181	543186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360058
14356	NC_017587	G	6	6	543199	543204	0 %	0 %	100 %	0 %	386360058
14357	NC_017587	GCTC	2	8	543254	543261	0 %	25 %	25 %	50 %	386360058
14358	NC_017587	TGG	2	6	543295	543300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360058
14359	NC_017587	GAGCAC	2	12	543339	543350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360059
14360	NC_017587	GGA	2	6	543404	543409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360059
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14362	NC_017587	GGA	2	6	543473	543478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360059
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