MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017587	CAC	2	6	511403	511408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360025
13502	NC_017587	GAT	2	6	511445	511450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386360025
13503	NC_017587	GTGG	2	8	511528	511535	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_017587	GTT	2	6	511552	511557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_017587	GCCCG	2	10	511578	511587	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13506	NC_017587	AGGGG	2	10	511644	511653	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_017587	CTT	2	6	511661	511666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_017587	CCA	2	6	511745	511750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13509	NC_017587	G	6	6	511786	511791	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_017587	GGC	2	6	511799	511804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360026
13511	NC_017587	C	7	7	512033	512039	0 %	0 %	0 %	100 %	386360026
13512	NC_017587	GGA	2	6	512047	512052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360026
13513	NC_017587	CTT	2	6	512069	512074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360026
13514	NC_017587	GTG	2	6	512093	512098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360026
13515	NC_017587	GGCCCT	2	12	512118	512129	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386360026
13516	NC_017587	GC	3	6	512176	512181	0 %	0 %	50 %	50 %	386360026
13517	NC_017587	CGG	2	6	512195	512200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360026
13518	NC_017587	GCCC	2	8	512272	512279	0 %	0 %	25 %	75 %	386360026
13519	NC_017587	CTC	2	6	512288	512293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360026
13520	NC_017587	CCG	2	6	512322	512327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360026
13521	NC_017587	CCT	2	6	512335	512340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360026
13522	NC_017587	TGG	2	6	512361	512366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360026
13523	NC_017587	AGC	2	6	512409	512414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360026
13524	NC_017587	CCT	2	6	512418	512423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360026
13525	NC_017587	GAC	2	6	512450	512455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360026
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13527	NC_017587	CCT	2	6	512500	512505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360026
13528	NC_017587	C	7	7	512524	512530	0 %	0 %	0 %	100 %	386360026
13529	NC_017587	TCC	3	9	512538	512546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360026
13530	NC_017587	CCG	2	6	512560	512565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360026
13531	NC_017587	GCC	2	6	512577	512582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360026
13532	NC_017587	CAC	2	6	512720	512725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360026
13533	NC_017587	GAG	3	9	512747	512755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360026
13534	NC_017587	CCGG	2	8	512793	512800	0 %	0 %	50 %	50 %	386360026
13535	NC_017587	GGC	2	6	512898	512903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360027
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13538	NC_017587	GCCCC	2	10	512973	512982	0 %	0 %	20 %	80 %	386360027
13539	NC_017587	C	6	6	512979	512984	0 %	0 %	0 %	100 %	386360027
13540	NC_017587	GTG	2	6	513002	513007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360027
13541	NC_017587	GCCC	2	8	513022	513029	0 %	0 %	25 %	75 %	386360027
13542	NC_017587	GCGGTG	2	12	513067	513078	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386360027
13543	NC_017587	CCT	3	9	513090	513098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360027
13544	NC_017587	GGA	2	6	513114	513119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360027
13545	NC_017587	C	6	6	513166	513171	0 %	0 %	0 %	100 %	386360027
13546	NC_017587	GCT	2	6	513189	513194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360027
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13548	NC_017587	GCC	2	6	513353	513358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360027
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13554	NC_017587	CCT	2	6	513615	513620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360027
13555	NC_017587	CTC	2	6	513691	513696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360027
13556	NC_017587	TCC	2	6	513783	513788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360027
13557	NC_017587	CCT	2	6	513792	513797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360027
13558	NC_017587	CGGGC	2	10	513804	513813	0 %	0 %	60 %	40 %	386360027
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13561	NC_017587	CTC	2	6	513895	513900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360027
13562	NC_017587	TCC	2	6	513950	513955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360027
13563	NC_017587	C	6	6	514022	514027	0 %	0 %	0 %	100 %	386360027
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13572	NC_017587	CGC	2	6	514422	514427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360027
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13574	NC_017587	AGG	2	6	514581	514586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_017587	ACGT	2	8	514599	514606	25 %	25 %	25 %	25 %	386360028
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13582	NC_017587	AAG	2	6	514839	514844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360028
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13590	NC_017587	GCGGG	2	10	515212	515221	0 %	0 %	80 %	20 %	386360029
13591	NC_017587	G	6	6	515219	515224	0 %	0 %	100 %	0 %	386360029
13592	NC_017587	GTG	2	6	515339	515344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360029
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13595	NC_017587	GC	3	6	515379	515384	0 %	0 %	50 %	50 %	386360029
13596	NC_017587	CTC	2	6	515480	515485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360030
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13605	NC_017587	TGT	2	6	515752	515757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386360030
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13609	NC_017587	GAG	2	6	515840	515845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360030
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13612	NC_017587	CTTC	2	8	515955	515962	0 %	50 %	0 %	50 %	386360030
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13743	NC_017587	GGC	2	6	521013	521018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360035
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13852	NC_017587	TCA	2	6	524906	524911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360040
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13857	NC_017587	CGC	2	6	525054	525059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360040
13858	NC_017587	GAG	2	6	525217	525222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360040
13859	NC_017587	GC	3	6	525268	525273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13860	NC_017587	GCTTT	2	10	525291	525300	0 %	60 %	20 %	20 %	386360041
13861	NC_017587	GCCGGT	2	12	525310	525321	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386360041
13862	NC_017587	C	6	6	525401	525406	0 %	0 %	0 %	100 %	386360041
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13987	NC_017587	TGA	2	6	529716	529721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386360045
13988	NC_017587	ATC	2	6	529757	529762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360045
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13990	NC_017587	TCC	2	6	529884	529889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360045
13991	NC_017587	TCG	2	6	530093	530098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360045
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