MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017587	GAG	3	9	491792	491800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360004
13002	NC_017587	GTG	2	6	491813	491818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360004
13003	NC_017587	CCG	2	6	491857	491862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360004
13004	NC_017587	GGCC	2	8	491869	491876	0 %	0 %	50 %	50 %	386360004
13005	NC_017587	CTTCCT	2	12	491905	491916	0 %	50 %	0 %	50 %	386360004
13006	NC_017587	GCC	2	6	491960	491965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360004
13007	NC_017587	CCCG	2	8	492052	492059	0 %	0 %	25 %	75 %	386360004
13008	NC_017587	GAG	2	6	492074	492079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360004
13009	NC_017587	G	7	7	492079	492085	0 %	0 %	100 %	0 %	386360004
13010	NC_017587	GCG	2	6	492103	492108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360004
13011	NC_017587	TCC	3	9	492171	492179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360004
13012	NC_017587	GAC	2	6	492188	492193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360004
13013	NC_017587	GCC	2	6	492195	492200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360004
13014	NC_017587	TCA	2	6	492243	492248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360004
13015	NC_017587	GCA	3	9	492343	492351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360004
13016	NC_017587	GCC	2	6	492500	492505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360004
13017	NC_017587	GCG	2	6	492559	492564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360004
13018	NC_017587	AGA	2	6	492600	492605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360004
13019	NC_017587	AGG	2	6	492624	492629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360004
13020	NC_017587	CCCG	2	8	492680	492687	0 %	0 %	25 %	75 %	386360004
13021	NC_017587	GAG	3	9	492699	492707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360004
13022	NC_017587	TGC	2	6	492726	492731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360005
13023	NC_017587	GGC	2	6	492778	492783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360005
13024	NC_017587	CTC	2	6	492815	492820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360005
13025	NC_017587	GAG	2	6	492832	492837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360005
13026	NC_017587	GGC	2	6	492876	492881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360005
13027	NC_017587	G	6	6	492882	492887	0 %	0 %	100 %	0 %	386360005
13028	NC_017587	C	6	6	492896	492901	0 %	0 %	0 %	100 %	386360005
13029	NC_017587	GGA	3	9	492913	492921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360005
13030	NC_017587	CTC	2	6	492935	492940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360005
13031	NC_017587	CCT	2	6	492943	492948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360005
13032	NC_017587	GAG	2	6	492953	492958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360005
13033	NC_017587	CTA	2	6	492973	492978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360005
13034	NC_017587	AAG	2	6	493035	493040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360005
13035	NC_017587	AGG	2	6	493053	493058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360005
13036	NC_017587	GGT	2	6	493088	493093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360005
13037	NC_017587	CGT	2	6	493117	493122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360006
13038	NC_017587	CCG	2	6	493316	493321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360006
13039	NC_017587	TCT	2	6	493322	493327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360006
13040	NC_017587	TCC	4	12	493352	493363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360006
13041	NC_017587	GGCGG	2	10	493416	493425	0 %	0 %	80 %	20 %	386360006
13042	NC_017587	TGG	2	6	493430	493435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360006
13043	NC_017587	TCC	3	9	493466	493474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360006
13044	NC_017587	GAG	2	6	493570	493575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360006
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13048	NC_017587	CGGGG	2	10	493669	493678	0 %	0 %	80 %	20 %	386360006
13049	NC_017587	GAG	2	6	493717	493722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360006
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13052	NC_017587	TCCC	2	8	493872	493879	0 %	25 %	0 %	75 %	386360006
13053	NC_017587	GAG	2	6	493954	493959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360006
13054	NC_017587	GGA	2	6	493980	493985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360006
13055	NC_017587	GCC	2	6	493999	494004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360006
13056	NC_017587	AGG	2	6	494033	494038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360006
13057	NC_017587	AGG	2	6	494078	494083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360006
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13059	NC_017587	CGA	2	6	494112	494117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360006
13060	NC_017587	GAA	2	6	494151	494156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360006
13061	NC_017587	CGC	2	6	494163	494168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360006
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13063	NC_017587	GCG	2	6	494219	494224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360006
13064	NC_017587	CTT	2	6	494239	494244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360006
13065	NC_017587	GGT	2	6	494273	494278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360006
13066	NC_017587	AGG	2	6	494281	494286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_017587	GAG	2	6	494325	494330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360007
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13069	NC_017587	CCG	2	6	494394	494399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360007
13070	NC_017587	GAG	2	6	494418	494423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360007
13071	NC_017587	CCT	2	6	494432	494437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360007
13072	NC_017587	AGGTGG	2	12	494467	494478	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386360007
13073	NC_017587	AAG	2	6	494526	494531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360007
13074	NC_017587	ACC	2	6	494545	494550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360007
13075	NC_017587	CCT	2	6	494651	494656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360007
13076	NC_017587	CAGGTG	2	12	494694	494705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386360007
13077	NC_017587	GCG	2	6	494726	494731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360008
13078	NC_017587	CGC	2	6	494879	494884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360008
13079	NC_017587	CTT	2	6	494885	494890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360008
13080	NC_017587	GGC	2	6	494972	494977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360008
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13083	NC_017587	CGA	2	6	495077	495082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386360008
13084	NC_017587	GAG	4	12	495093	495104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360008
13085	NC_017587	ACC	2	6	495136	495141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360008
13086	NC_017587	TCTTCC	2	12	495178	495189	0 %	50 %	0 %	50 %	386360008
13087	NC_017587	GTG	3	9	495324	495332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360008
13088	NC_017587	CCT	2	6	495362	495367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360008
13089	NC_017587	GCCCC	2	10	495416	495425	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13090	NC_017587	GGGGC	2	10	495436	495445	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13091	NC_017587	TAA	2	6	495464	495469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_017587	CAT	2	6	495562	495567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360009
13093	NC_017587	CGC	2	6	495583	495588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360009
13094	NC_017587	TTC	2	6	495626	495631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360009
13095	NC_017587	CGC	2	6	495685	495690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360009
13096	NC_017587	CAC	2	6	495706	495711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360009
13097	NC_017587	GCCC	2	8	495715	495722	0 %	0 %	25 %	75 %	386360009
13098	NC_017587	GCC	2	6	495734	495739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360009
13099	NC_017587	ATC	2	6	495863	495868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386360009
13100	NC_017587	GAA	2	6	495890	495895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360009
13101	NC_017587	AGG	2	6	495931	495936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360009
13102	NC_017587	CGT	2	6	495964	495969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386360010
13103	NC_017587	GAAG	2	8	496008	496015	50 %	0 %	50 %	0 %	386360010
13104	NC_017587	CTC	2	6	496024	496029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360010
13105	NC_017587	AAG	2	6	496114	496119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360010
13106	NC_017587	C	6	6	496136	496141	0 %	0 %	0 %	100 %	386360010
13107	NC_017587	GGCC	2	8	496234	496241	0 %	0 %	50 %	50 %	386360010
13108	NC_017587	TCT	2	6	496253	496258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386360010
13109	NC_017587	CTGGA	2	10	496264	496273	20 %	20 %	40 %	20 %	386360010
13110	NC_017587	CAGC	2	8	496284	496291	25 %	0 %	25 %	50 %	386360010
13111	NC_017587	TCC	2	6	496343	496348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360010
13112	NC_017587	GCCTTC	2	12	496384	496395	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386360010
13113	NC_017587	CTC	2	6	496417	496422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360010
13114	NC_017587	GAG	2	6	496474	496479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360010
13115	NC_017587	AGCG	2	8	496489	496496	25 %	0 %	50 %	25 %	386360010
13116	NC_017587	GTG	2	6	496507	496512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360010
13117	NC_017587	CCA	2	6	496557	496562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360010
13118	NC_017587	C	7	7	496566	496572	0 %	0 %	0 %	100 %	386360010
13119	NC_017587	AAG	2	6	496605	496610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386360010
13120	NC_017587	CCT	2	6	496646	496651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360011
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13357	NC_017587	GAG	2	6	504836	504841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360022
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13361	NC_017587	CCCCT	2	10	504992	505001	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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13481	NC_017587	GCGG	2	8	510284	510291	0 %	0 %	75 %	25 %	386360025
13482	NC_017587	TGG	2	6	510315	510320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360025
13483	NC_017587	CTC	2	6	510410	510415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360025
13484	NC_017587	GGA	2	6	510437	510442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360025
13485	NC_017587	GGC	2	6	510526	510531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386360025
13486	NC_017587	G	7	7	510635	510641	0 %	0 %	100 %	0 %	386360025
13487	NC_017587	TGG	2	6	510850	510855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386360025
13488	NC_017587	GTA	2	6	510914	510919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386360025
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13490	NC_017587	C	6	6	510940	510945	0 %	0 %	0 %	100 %	386360025
13491	NC_017587	GGA	2	6	511066	511071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386360025
13492	NC_017587	GCC	2	6	511087	511092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360025
13493	NC_017587	CAC	2	6	511115	511120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386360025
13494	NC_017587	CGC	2	6	511170	511175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386360025
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13500	NC_017587	TCC	2	6	511396	511401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386360025

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