MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017587	GAG	2	6	21424	21429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359485
502	NC_017587	CCA	2	6	21438	21443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359485
503	NC_017587	C	6	6	21461	21466	0 %	0 %	0 %	100 %	386359485
504	NC_017587	CTC	2	6	21499	21504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359485
505	NC_017587	GAG	2	6	21511	21516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359485
506	NC_017587	GCC	2	6	21533	21538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359485
507	NC_017587	CCT	2	6	21594	21599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359486
508	NC_017587	CTCCCG	2	12	21642	21653	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386359486
509	NC_017587	AGGG	2	8	21656	21663	25 %	0 %	75 %	0 %	386359486
510	NC_017587	CCA	2	6	21683	21688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359486
511	NC_017587	CCG	2	6	21728	21733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359486
512	NC_017587	CGGG	2	8	21742	21749	0 %	0 %	75 %	25 %	386359486
513	NC_017587	AGG	2	6	21823	21828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359486
514	NC_017587	GAG	2	6	21867	21872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359486
515	NC_017587	TCC	3	9	21931	21939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359486
516	NC_017587	GAG	2	6	21948	21953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359486
517	NC_017587	GTCCAG	2	12	21960	21971	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386359486
518	NC_017587	GGA	2	6	22019	22024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359486
519	NC_017587	GGGAG	2	10	22025	22034	20 %	0 %	80 %	0 %	386359486
520	NC_017587	CGC	2	6	22083	22088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017587	G	7	7	22095	22101	0 %	0 %	100 %	0 %	386359487
522	NC_017587	TCC	2	6	22131	22136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359487
523	NC_017587	CGG	2	6	22145	22150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359487
524	NC_017587	CTC	2	6	22204	22209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359487
525	NC_017587	CGCC	2	8	22219	22226	0 %	0 %	25 %	75 %	386359487
526	NC_017587	GGA	3	9	22233	22241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359487
527	NC_017587	GCG	2	6	22277	22282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359487
528	NC_017587	CCA	2	6	22326	22331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359487
529	NC_017587	C	7	7	22356	22362	0 %	0 %	0 %	100 %	386359487
530	NC_017587	C	7	7	22447	22453	0 %	0 %	0 %	100 %	386359487
531	NC_017587	ACC	2	6	22454	22459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359487
532	NC_017587	AGG	3	9	22508	22516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359487
533	NC_017587	CCACCC	2	12	22530	22541	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	386359487
534	NC_017587	GGA	3	9	22542	22550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359487
535	NC_017587	GAG	2	6	22567	22572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359487
536	NC_017587	CCGTG	2	10	22617	22626	0 %	20 %	40 %	40 %	386359487
537	NC_017587	GTC	2	6	22705	22710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359487
538	NC_017587	GGC	2	6	22717	22722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359487
539	NC_017587	GTG	2	6	22772	22777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359487
540	NC_017587	G	6	6	22797	22802	0 %	0 %	100 %	0 %	386359487
541	NC_017587	AGG	2	6	22808	22813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359487
542	NC_017587	CGC	2	6	22909	22914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359488
543	NC_017587	GTCC	2	8	22926	22933	0 %	25 %	25 %	50 %	386359488
544	NC_017587	CCT	4	12	22934	22945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359488
545	NC_017587	AGT	2	6	22970	22975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359488
546	NC_017587	CCA	2	6	23003	23008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359488
547	NC_017587	GGTG	2	8	23024	23031	0 %	25 %	75 %	0 %	386359488
548	NC_017587	AGG	2	6	23047	23052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359488
549	NC_017587	GAG	2	6	23085	23090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359488
550	NC_017587	GCGG	2	8	23145	23152	0 %	0 %	75 %	25 %	386359488
551	NC_017587	CCT	2	6	23153	23158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359488
552	NC_017587	AGG	2	6	23216	23221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359488
553	NC_017587	ACC	2	6	23299	23304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359488
554	NC_017587	GGCC	2	8	23311	23318	0 %	0 %	50 %	50 %	386359488
555	NC_017587	CGG	2	6	23348	23353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359488
556	NC_017587	CGTCC	2	10	23355	23364	0 %	20 %	20 %	60 %	386359488
557	NC_017587	GCG	2	6	23424	23429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359488
558	NC_017587	CCA	2	6	23474	23479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359488
559	NC_017587	CGT	3	9	23543	23551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359488
560	NC_017587	C	6	6	23593	23598	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
561	NC_017587	G	6	6	23603	23608	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017587	GCCTG	2	10	23644	23653	0 %	20 %	40 %	40 %	386359489
563	NC_017587	TCC	2	6	23769	23774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359489
564	NC_017587	TTA	2	6	23886	23891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017587	GA	3	6	23972	23977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017587	C	6	6	24055	24060	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
567	NC_017587	C	6	6	24079	24084	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
568	NC_017587	CCA	2	6	24096	24101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_017587	CCT	2	6	24156	24161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_017587	CGCCCC	2	12	24171	24182	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
571	NC_017587	CCT	2	6	24229	24234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_017587	AGG	2	6	24275	24280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017587	CAC	2	6	24333	24338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_017587	GCC	2	6	24359	24364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_017587	CG	3	6	24397	24402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
576	NC_017587	CGC	2	6	24415	24420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_017587	CCT	2	6	24422	24427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_017587	CGA	2	6	24433	24438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017587	GTG	2	6	24478	24483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017587	G	7	7	24497	24503	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017587	GCC	2	6	24509	24514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_017587	AGG	2	6	24605	24610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017587	TGG	2	6	24662	24667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017587	GAAGG	2	10	24668	24677	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017587	AGGTG	2	10	24720	24729	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017587	GAA	2	6	24730	24735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017587	AGG	2	6	24749	24754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017587	GGC	2	6	24786	24791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017587	GCAG	2	8	24837	24844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
590	NC_017587	CCT	2	6	24855	24860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_017587	GAAG	2	8	24879	24886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017587	GA	4	8	24904	24911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017587	TCC	2	6	24922	24927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_017587	GCAAG	2	10	24936	24945	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
595	NC_017587	AGG	2	6	25010	25015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017587	GAA	2	6	25042	25047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359490
597	NC_017587	GGCGTG	2	12	25052	25063	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386359490
598	NC_017587	CCG	2	6	25140	25145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359490
599	NC_017587	GGC	2	6	25154	25159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359490
600	NC_017587	TGG	2	6	25176	25181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359490
601	NC_017587	GAA	2	6	25192	25197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359490
602	NC_017587	CCG	2	6	25230	25235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359490
603	NC_017587	CAG	2	6	25262	25267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359490
604	NC_017587	GCC	2	6	25274	25279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359490
605	NC_017587	TTC	2	6	25388	25393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359490
606	NC_017587	AAC	2	6	25409	25414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386359490
607	NC_017587	CTT	2	6	25444	25449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359490
608	NC_017587	TAC	2	6	25469	25474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359490
609	NC_017587	CCT	2	6	25483	25488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359490
610	NC_017587	GCCC	2	8	25509	25516	0 %	0 %	25 %	75 %	386359490
611	NC_017587	GGCG	2	8	25569	25576	0 %	0 %	75 %	25 %	386359490
612	NC_017587	GGGC	2	8	25666	25673	0 %	0 %	75 %	25 %	386359490
613	NC_017587	CAA	2	6	25705	25710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386359490
614	NC_017587	GGC	2	6	25717	25722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359490
615	NC_017587	TGGG	2	8	25748	25755	0 %	25 %	75 %	0 %	386359490
616	NC_017587	C	6	6	25764	25769	0 %	0 %	0 %	100 %	386359490
617	NC_017587	GAG	3	9	25790	25798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359490
618	NC_017587	GCA	2	6	25813	25818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359490
619	NC_017587	CTACGC	2	12	25849	25860	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386359490
620	NC_017587	CGG	2	6	25926	25931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359490
621	NC_017587	CGC	2	6	25942	25947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359490
622	NC_017587	GGC	2	6	25955	25960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359490
623	NC_017587	AGG	2	6	25998	26003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359490
624	NC_017587	CCT	2	6	26028	26033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359490
625	NC_017587	GCCC	2	8	26083	26090	0 %	0 %	25 %	75 %	386359490
626	NC_017587	ACCG	2	8	26096	26103	25 %	0 %	25 %	50 %	386359490
627	NC_017587	GAA	2	6	26116	26121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359490
628	NC_017587	CCT	2	6	26137	26142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359490
629	NC_017587	GAA	2	6	26251	26256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359490
630	NC_017587	CCG	2	6	26293	26298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359490
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632	NC_017587	TGG	2	6	26430	26435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359491
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