MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017587	CTT	2	6	171595	171600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359649
4502	NC_017587	TCC	2	6	171605	171610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359649
4503	NC_017587	CTT	2	6	171619	171624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359649
4504	NC_017587	GTC	2	6	171658	171663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359649
4505	NC_017587	GCG	2	6	171715	171720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_017587	CCA	2	6	171733	171738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359650
4507	NC_017587	CTT	3	9	171758	171766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359650
4508	NC_017587	CCT	2	6	171778	171783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359650
4509	NC_017587	CCT	2	6	171796	171801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359650
4510	NC_017587	GCC	2	6	171809	171814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359650
4511	NC_017587	CCT	2	6	171835	171840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359650
4512	NC_017587	TGA	2	6	171874	171879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359650
4513	NC_017587	CTT	2	6	171887	171892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359650
4514	NC_017587	CCT	2	6	171901	171906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359650
4515	NC_017587	TCT	2	6	171928	171933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359650
4516	NC_017587	CGG	2	6	171937	171942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359650
4517	NC_017587	GCG	2	6	171945	171950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359650
4518	NC_017587	GCC	2	6	171951	171956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359650
4519	NC_017587	CGGCCA	2	12	171973	171984	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386359650
4520	NC_017587	CGG	2	6	171994	171999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359650
4521	NC_017587	CCT	2	6	172012	172017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359650
4522	NC_017587	GCT	2	6	172033	172038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359650
4523	NC_017587	CCT	2	6	172106	172111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4524	NC_017587	GCC	2	6	172117	172122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359651
4525	NC_017587	TTC	2	6	172123	172128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359651
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4527	NC_017587	TGG	2	6	172244	172249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359651
4528	NC_017587	GGA	2	6	172298	172303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359651
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4530	NC_017587	CGA	2	6	172475	172480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359651
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4532	NC_017587	TCC	2	6	172639	172644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_017587	CGG	2	6	172715	172720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_017587	C	6	6	172740	172745	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4535	NC_017587	GC	3	6	172768	172773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_017587	GTC	2	6	172812	172817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_017587	GA	3	6	172876	172881	50 %	0 %	50 %	0 %	386359652
4538	NC_017587	C	6	6	172959	172964	0 %	0 %	0 %	100 %	386359652
4539	NC_017587	C	6	6	172983	172988	0 %	0 %	0 %	100 %	386359652
4540	NC_017587	CCA	2	6	173000	173005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359652
4541	NC_017587	CCT	2	6	173060	173065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359652
4542	NC_017587	CGCCCC	2	12	173075	173086	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	386359652
4543	NC_017587	C	6	6	173126	173131	0 %	0 %	0 %	100 %	386359652
4544	NC_017587	CCT	2	6	173135	173140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359652
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4546	NC_017587	C	7	7	173204	173210	0 %	0 %	0 %	100 %	386359652
4547	NC_017587	CAC	2	6	173241	173246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359652
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4550	NC_017587	CGC	2	6	173323	173328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359652
4551	NC_017587	CCT	2	6	173330	173335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359652
4552	NC_017587	CGA	2	6	173341	173346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359652
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4554	NC_017587	G	7	7	173405	173411	0 %	0 %	100 %	0 %	386359652
4555	NC_017587	GCC	2	6	173417	173422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359652
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4557	NC_017587	TGG	2	6	173570	173575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359652
4558	NC_017587	GAAGG	2	10	173576	173585	40 %	0 %	60 %	0 %	386359652
4559	NC_017587	AGGTG	2	10	173628	173637	20 %	20 %	60 %	0 %	386359652
4560	NC_017587	GAA	2	6	173638	173643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359652
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4562	NC_017587	GGC	2	6	173694	173699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359652
4563	NC_017587	GCAG	2	8	173745	173752	25 %	0 %	50 %	25 %	386359652
4564	NC_017587	CCT	2	6	173763	173768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359652
4565	NC_017587	GAAG	2	8	173787	173794	50 %	0 %	50 %	0 %	386359652
4566	NC_017587	GA	4	8	173812	173819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_017587	TCC	2	6	173830	173835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_017587	GCAAG	2	10	173844	173853	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4569	NC_017587	AGA	2	6	173941	173946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359653
4570	NC_017587	ATGACG	2	12	173991	174002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386359653
4571	NC_017587	GCG	2	6	174056	174061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359653
4572	NC_017587	GGC	2	6	174062	174067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359653
4573	NC_017587	CAC	2	6	174074	174079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359653
4574	NC_017587	ACC	2	6	174096	174101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359653
4575	NC_017587	CCGCC	2	10	174206	174215	0 %	0 %	20 %	80 %	386359653
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4582	NC_017587	CCA	2	6	174517	174522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359653
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4589	NC_017587	CAC	2	6	174746	174751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359653
4590	NC_017587	GGC	2	6	174775	174780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359653
4591	NC_017587	GCC	2	6	174848	174853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359653
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4593	NC_017587	TGG	2	6	174919	174924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359653
4594	NC_017587	CCCA	2	8	174935	174942	25 %	0 %	0 %	75 %	386359653
4595	NC_017587	CCA	2	6	174958	174963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359653
4596	NC_017587	GCC	2	6	174996	175001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359653
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4603	NC_017587	C	6	6	175223	175228	0 %	0 %	0 %	100 %	386359654
4604	NC_017587	CTT	2	6	175237	175242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359654
4605	NC_017587	C	6	6	175279	175284	0 %	0 %	0 %	100 %	386359654
4606	NC_017587	GGC	2	6	175285	175290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359654
4607	NC_017587	GCC	2	6	175295	175300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359654
4608	NC_017587	ACC	2	6	175361	175366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359654
4609	NC_017587	CAC	4	12	175375	175386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359654
4610	NC_017587	G	6	6	175416	175421	0 %	0 %	100 %	0 %	386359654
4611	NC_017587	GGA	2	6	175425	175430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359654
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4613	NC_017587	TGG	2	6	175538	175543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359655
4614	NC_017587	CCTT	2	8	175561	175568	0 %	50 %	0 %	50 %	386359655
4615	NC_017587	GAT	2	6	175587	175592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359655
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4619	NC_017587	CCG	2	6	175784	175789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359655
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4621	NC_017587	CCA	2	6	175826	175831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359655
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4994	NC_017587	TGA	2	6	188580	188585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359666
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4996	NC_017587	CCA	2	6	188766	188771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359666
4997	NC_017587	GCC	2	6	188857	188862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359666
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