MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 51155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017587	GAC	2	6	36	41	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359471
2	NC_017587	CCG	2	6	95	100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359471
3	NC_017587	CCT	2	6	190	195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359471
4	NC_017587	CTGGA	2	10	201	210	20 %	20 %	40 %	20 %	386359471
5	NC_017587	AGG	2	6	238	243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359471
6	NC_017587	GTG	2	6	288	293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359471
7	NC_017587	AGG	2	6	310	315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359471
8	NC_017587	GCC	2	6	327	332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359471
9	NC_017587	CCG	2	6	334	339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359471
10	NC_017587	C	6	6	343	348	0 %	0 %	0 %	100 %	386359471
11	NC_017587	GTG	2	6	387	392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359471
12	NC_017587	CAA	2	6	398	403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386359471
13	NC_017587	CGC	3	9	416	424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359471
14	NC_017587	CGTGGC	2	12	425	436	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386359471
15	NC_017587	CCGG	2	8	445	452	0 %	0 %	50 %	50 %	386359471
16	NC_017587	TCA	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359471
17	NC_017587	CCT	2	6	653	658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359471
18	NC_017587	TGG	2	6	661	666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359471
19	NC_017587	ACG	2	6	667	672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359471
20	NC_017587	AGG	2	6	703	708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359471
21	NC_017587	ATC	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359471
22	NC_017587	CTC	2	6	761	766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359471
23	NC_017587	GCC	2	6	773	778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359471
24	NC_017587	GC	3	6	801	806	0 %	0 %	50 %	50 %	386359471
25	NC_017587	C	6	6	849	854	0 %	0 %	0 %	100 %	386359471
26	NC_017587	AGC	2	6	895	900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359471
27	NC_017587	TCGCCT	2	12	994	1005	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386359471
28	NC_017587	GCC	2	6	1038	1043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359471
29	NC_017587	ATC	2	6	1098	1103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359471
30	NC_017587	GGA	2	6	1136	1141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359471
31	NC_017587	AAG	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359471
32	NC_017587	GGT	2	6	1169	1174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359471
33	NC_017587	CGG	2	6	1250	1255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359471
34	NC_017587	ACCAC	2	10	1261	1270	40 %	0 %	0 %	60 %	386359471
35	NC_017587	CCT	2	6	1331	1336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359471
36	NC_017587	G	6	6	1450	1455	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017587	GGCCGG	2	12	1501	1512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017587	CTA	3	9	1591	1599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017587	TTTAAA	2	12	1622	1633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017587	AG	3	6	1635	1640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017587	AGG	2	6	1657	1662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017587	CTC	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359472
43	NC_017587	CCT	2	6	1716	1721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359472
44	NC_017587	ACCT	2	8	1762	1769	25 %	25 %	0 %	50 %	386359472
45	NC_017587	CCG	2	6	1844	1849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359472
46	NC_017587	CTT	2	6	1890	1895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359472
47	NC_017587	GCCTC	2	10	1937	1946	0 %	20 %	20 %	60 %	386359472
48	NC_017587	G	7	7	1959	1965	0 %	0 %	100 %	0 %	386359472
49	NC_017587	CTC	2	6	1977	1982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359472
50	NC_017587	CGC	2	6	2130	2135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359472
51	NC_017587	GAG	2	6	2143	2148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359472
52	NC_017587	C	6	6	2186	2191	0 %	0 %	0 %	100 %	386359472
53	NC_017587	CCTGCC	2	12	2241	2252	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386359472
54	NC_017587	CCCG	2	8	2281	2288	0 %	0 %	25 %	75 %	386359472
55	NC_017587	GGCCGA	2	12	2331	2342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386359472
56	NC_017587	TGGCCC	2	12	2366	2377	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386359472
57	NC_017587	ACC	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359472
58	NC_017587	CCT	2	6	2553	2558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359472
59	NC_017587	GGA	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359472
60	NC_017587	TCC	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359472
61	NC_017587	CCG	2	6	2585	2590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359472
62	NC_017587	AGG	3	9	2612	2620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359472
63	NC_017587	GCCC	2	8	2622	2629	0 %	0 %	25 %	75 %	386359472
64	NC_017587	CCT	2	6	2673	2678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359472
65	NC_017587	CGAGCC	2	12	2732	2743	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386359472
66	NC_017587	G	6	6	2750	2755	0 %	0 %	100 %	0 %	386359472
67	NC_017587	GGT	3	9	2775	2783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359472
68	NC_017587	GTA	2	6	2802	2807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017587	ACC	2	6	2854	2859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359473
70	NC_017587	TCG	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359473
71	NC_017587	GC	3	6	2875	2880	0 %	0 %	50 %	50 %	386359473
72	NC_017587	CGG	2	6	3009	3014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359473
73	NC_017587	AGG	2	6	3107	3112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359473
74	NC_017587	GCTGGA	2	12	3129	3140	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386359473
75	NC_017587	CAA	2	6	3150	3155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386359473
76	NC_017587	GCG	2	6	3208	3213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359473
77	NC_017587	TCA	2	6	3293	3298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386359473
78	NC_017587	G	6	6	3301	3306	0 %	0 %	100 %	0 %	386359473
79	NC_017587	CCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359473
80	NC_017587	G	6	6	3462	3467	0 %	0 %	100 %	0 %	386359473
81	NC_017587	GAG	2	6	3493	3498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359473
82	NC_017587	CTC	2	6	3514	3519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359473
83	NC_017587	GCGG	2	8	3528	3535	0 %	0 %	75 %	25 %	386359473
84	NC_017587	AAG	2	6	3551	3556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386359473
85	NC_017587	CGAG	2	8	3581	3588	25 %	0 %	50 %	25 %	386359473
86	NC_017587	CGGGA	2	10	3595	3604	20 %	0 %	60 %	20 %	386359473
87	NC_017587	ACC	2	6	3608	3613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359473
88	NC_017587	GGAGGG	2	12	3615	3626	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	386359473
89	NC_017587	TCCTC	2	10	3632	3641	0 %	40 %	0 %	60 %	386359473
90	NC_017587	GAG	2	6	3643	3648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359473
91	NC_017587	TGG	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359473
92	NC_017587	GAC	2	6	3718	3723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359473
93	NC_017587	GGC	2	6	3734	3739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359473
94	NC_017587	G	6	6	3756	3761	0 %	0 %	100 %	0 %	386359473
95	NC_017587	GAC	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359473
96	NC_017587	CGGG	2	8	3814	3821	0 %	0 %	75 %	25 %	386359473
97	NC_017587	GGA	2	6	3957	3962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359473
98	NC_017587	GAG	3	9	4069	4077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359473
99	NC_017587	GGGCC	2	10	4080	4089	0 %	0 %	60 %	40 %	386359473
100	NC_017587	GCC	2	6	4108	4113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359473
101	NC_017587	GAC	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359474
102	NC_017587	AGG	2	6	4164	4169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359474
103	NC_017587	GGA	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359474
104	NC_017587	TCC	2	6	4302	4307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359474
105	NC_017587	TCC	3	9	4359	4367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359474
106	NC_017587	CCG	2	6	4392	4397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359474
107	NC_017587	CCT	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359474
108	NC_017587	GAC	2	6	4484	4489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359474
109	NC_017587	GGAGGT	2	12	4540	4551	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386359474
110	NC_017587	CAA	3	9	4567	4575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386359474
111	NC_017587	GAC	2	6	4700	4705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359474
112	NC_017587	CTC	3	9	4706	4714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359474
113	NC_017587	GAG	2	6	4796	4801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359474
114	NC_017587	GGA	2	6	4807	4812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359474
115	NC_017587	TGG	2	6	4827	4832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359474
116	NC_017587	G	6	6	4836	4841	0 %	0 %	100 %	0 %	386359474
117	NC_017587	GGA	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359474
118	NC_017587	TCC	2	6	4896	4901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359474
119	NC_017587	CGC	2	6	4909	4914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359474
120	NC_017587	CGG	2	6	5049	5054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359474
121	NC_017587	ATG	2	6	5084	5089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386359474
122	NC_017587	TCC	2	6	5114	5119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359474
123	NC_017587	TCC	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359474
124	NC_017587	GCCCC	2	10	5151	5160	0 %	0 %	20 %	80 %	386359474
125	NC_017587	CAC	2	6	5167	5172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386359474
126	NC_017587	GGC	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359474
127	NC_017587	GAC	2	6	5198	5203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359474
128	NC_017587	GTG	2	6	5204	5209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359474
129	NC_017587	GGC	2	6	5252	5257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359474
130	NC_017587	GGA	2	6	5265	5270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359474
131	NC_017587	G	6	6	5349	5354	0 %	0 %	100 %	0 %	386359474
132	NC_017587	CGA	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359474
133	NC_017587	GGT	2	6	5455	5460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386359474
134	NC_017587	CGC	2	6	5464	5469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359474
135	NC_017587	GAC	2	6	5494	5499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386359474
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137	NC_017587	GAG	2	6	5666	5671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359475
138	NC_017587	GGGGTA	2	12	5681	5692	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386359475
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140	NC_017587	GAG	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359475
141	NC_017587	GC	3	6	5771	5776	0 %	0 %	50 %	50 %	386359475
142	NC_017587	GAG	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359475
143	NC_017587	TCC	2	6	5859	5864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359475
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215	NC_017587	CCT	2	6	9120	9125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359478
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221	NC_017587	GGGCG	2	10	9274	9283	0 %	0 %	80 %	20 %	386359478
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229	NC_017587	CTCCA	2	10	9479	9488	20 %	20 %	0 %	60 %	386359478
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242	NC_017587	TCG	2	6	9924	9929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359479
243	NC_017587	CTT	2	6	10031	10036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359479
244	NC_017587	TCC	2	6	10098	10103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359479
245	NC_017587	TCT	2	6	10234	10239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359479
246	NC_017587	CCT	2	6	10321	10326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
247	NC_017587	G	6	6	10357	10362	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
248	NC_017587	CTTGC	2	10	10370	10379	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
249	NC_017587	AGG	2	6	10387	10392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
250	NC_017587	TC	4	8	10404	10411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
251	NC_017587	CTTC	2	8	10429	10436	0 %	50 %	0 %	50 %	386359480
252	NC_017587	AGG	2	6	10455	10460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359480
253	NC_017587	CTGC	2	8	10471	10478	0 %	25 %	25 %	50 %	386359480
254	NC_017587	GCC	2	6	10524	10529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386359480
255	NC_017587	CCT	2	6	10561	10566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359480
256	NC_017587	CTT	2	6	10579	10584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386359480
257	NC_017587	CACCT	2	10	10586	10595	20 %	20 %	0 %	60 %	386359480
258	NC_017587	CTTCC	2	10	10639	10648	0 %	40 %	0 %	60 %	386359480
259	NC_017587	CCT	2	6	10706	10711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386359480
260	NC_017587	GGC	2	6	10802	10807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359480
261	NC_017587	C	7	7	10813	10819	0 %	0 %	0 %	100 %	386359480
262	NC_017587	TCG	2	6	10878	10883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386359480
263	NC_017587	AGG	2	6	10889	10894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386359480
264	NC_017587	GCG	2	6	10896	10901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359480
265	NC_017587	CG	3	6	10914	10919	0 %	0 %	50 %	50 %	386359480
266	NC_017587	GGC	2	6	10952	10957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386359480
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268	NC_017587	G	7	7	11014	11020	0 %	0 %	100 %	0 %	386359480
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433	NC_017587	TCGC	2	8	18830	18837	0 %	25 %	25 %	50 %	386359484
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