MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_017278	CGGGG	2	10	1831997	1832006	0 %	0 %	80 %	20 %	384440213
48002	NC_017278	GAG	2	6	1832045	1832050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440213
48003	NC_017278	GGA	2	6	1832131	1832136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440213
48004	NC_017278	CTT	2	6	1832149	1832154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440213
48005	NC_017278	GGT	2	6	1832185	1832190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440213
48006	NC_017278	CTC	2	6	1832195	1832200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440213
48007	NC_017278	CCCT	2	8	1832201	1832208	0 %	25 %	0 %	75 %	384440213
48008	NC_017278	CCCCA	2	10	1832210	1832219	20 %	0 %	0 %	80 %	384440213
48009	NC_017278	GGAGCT	2	12	1832284	1832295	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384440213
48010	NC_017278	AGG	2	6	1832361	1832366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440213
48011	NC_017278	GAG	2	6	1832441	1832446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440213
48012	NC_017278	GTG	2	6	1832495	1832500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440213
48013	NC_017278	CGC	2	6	1832512	1832517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440213
48014	NC_017278	CCA	2	6	1832526	1832531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440213
48015	NC_017278	GCG	2	6	1832547	1832552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440213
48016	NC_017278	CTT	2	6	1832567	1832572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440213
48017	NC_017278	G	6	6	1832579	1832584	0 %	0 %	100 %	0 %	384440213
48018	NC_017278	GGT	2	6	1832601	1832606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440213
48019	NC_017278	AGG	2	6	1832608	1832613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440213
48020	NC_017278	GGA	2	6	1832652	1832657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440214
48021	NC_017278	CGCCC	2	10	1832715	1832724	0 %	0 %	20 %	80 %	384440214
48022	NC_017278	GGA	2	6	1832736	1832741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440214
48023	NC_017278	CCT	2	6	1832757	1832762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440214
48024	NC_017278	AGGTGG	2	12	1832792	1832803	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384440214
48025	NC_017278	GGA	2	6	1832808	1832813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440214
48026	NC_017278	AAG	2	6	1832855	1832860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440214
48027	NC_017278	ACC	2	6	1832870	1832875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440214
48028	NC_017278	AAG	2	6	1833010	1833015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440214
48029	NC_017278	GAG	2	6	1833035	1833040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440214
48030	NC_017278	GCG	2	6	1833050	1833055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440215
48031	NC_017278	CGC	2	6	1833203	1833208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440215
48032	NC_017278	CTT	2	6	1833209	1833214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440215
48033	NC_017278	GGC	2	6	1833296	1833301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440215
48034	NC_017278	ACCTTC	2	12	1833345	1833356	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384440215
48035	NC_017278	TGG	2	6	1833373	1833378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440215
48036	NC_017278	CGA	2	6	1833401	1833406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440215
48037	NC_017278	GAG	2	6	1833417	1833422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440215
48038	NC_017278	ACC	2	6	1833460	1833465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440215
48039	NC_017278	TCTTCC	2	12	1833502	1833513	0 %	50 %	0 %	50 %	384440215
48040	NC_017278	CAC	2	6	1833525	1833530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440215
48041	NC_017278	G	6	6	1833545	1833550	0 %	0 %	100 %	0 %	384440215
48042	NC_017278	TCA	2	6	1833571	1833576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440215
48043	NC_017278	GGT	2	6	1833647	1833652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440215
48044	NC_017278	GGT	3	9	1833746	1833754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440216
48045	NC_017278	GCG	2	6	1833766	1833771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440216
48046	NC_017278	CCCG	2	8	1833794	1833801	0 %	0 %	25 %	75 %	384440216
48047	NC_017278	AAG	2	6	1833874	1833879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440216
48048	NC_017278	TGG	2	6	1833904	1833909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440216
48049	NC_017278	TGG	2	6	1833943	1833948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440216
48050	NC_017278	GGA	2	6	1833959	1833964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440216
48051	NC_017278	GGT	2	6	1833995	1834000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440216
48052	NC_017278	CGC	2	6	1834031	1834036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440216
48053	NC_017278	TGA	2	6	1834048	1834053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440216
48054	NC_017278	TGGG	2	8	1834101	1834108	0 %	25 %	75 %	0 %	384440216
48055	NC_017278	GGA	2	6	1834130	1834135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440216
48056	NC_017278	AGG	2	6	1834161	1834166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48057	NC_017278	GGA	2	6	1834168	1834173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440217
48058	NC_017278	GAA	2	6	1834224	1834229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440217
48059	NC_017278	CCT	2	6	1834304	1834309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440217
48060	NC_017278	GGA	2	6	1834394	1834399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440217
48061	NC_017278	CCT	2	6	1834454	1834459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440217
48062	NC_017278	AAG	2	6	1834473	1834478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440217
48063	NC_017278	GAG	2	6	1834533	1834538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440217
48064	NC_017278	CCG	2	6	1834543	1834548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440217
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48066	NC_017278	CTT	2	6	1834609	1834614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48067	NC_017278	ATCA	2	8	1834617	1834624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48068	NC_017278	CAT	2	6	1834631	1834636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48069	NC_017278	GC	3	6	1834638	1834643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48070	NC_017278	CTA	2	6	1834647	1834652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48071	NC_017278	TGA	2	6	1834680	1834685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440218
48072	NC_017278	GGC	2	6	1834717	1834722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440218
48073	NC_017278	TCC	2	6	1834767	1834772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440218
48074	NC_017278	TGG	2	6	1834794	1834799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440218
48075	NC_017278	CGG	2	6	1834800	1834805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440218
48076	NC_017278	CAT	2	6	1834834	1834839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440218
48077	NC_017278	ACC	2	6	1834907	1834912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440218
48078	NC_017278	GCC	2	6	1834951	1834956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440218
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48080	NC_017278	GGA	2	6	1834975	1834980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440218
48081	NC_017278	CTC	2	6	1834991	1834996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440218
48082	NC_017278	TGG	3	9	1835016	1835024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440218
48083	NC_017278	C	6	6	1835076	1835081	0 %	0 %	0 %	100 %	384440218
48084	NC_017278	GCGG	2	8	1835089	1835096	0 %	0 %	75 %	25 %	384440218
48085	NC_017278	CCT	3	9	1835110	1835118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440218
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48088	NC_017278	G	6	6	1835153	1835158	0 %	0 %	100 %	0 %	384440219
48089	NC_017278	TGG	4	12	1835180	1835191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440219
48090	NC_017278	CTG	2	6	1835194	1835199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440219
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48099	NC_017278	GAG	2	6	1835703	1835708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440220
48100	NC_017278	CTGG	2	8	1835730	1835737	0 %	25 %	50 %	25 %	384440220
48101	NC_017278	GGATCC	2	12	1835803	1835814	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384440220
48102	NC_017278	CGG	2	6	1835838	1835843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440220
48103	NC_017278	TGCCCC	2	12	1835854	1835865	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384440220
48104	NC_017278	CCT	2	6	1835876	1835881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440220
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48106	NC_017278	C	6	6	1835918	1835923	0 %	0 %	0 %	100 %	384440220
48107	NC_017278	CCT	2	6	1835933	1835938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440220
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48112	NC_017278	CCT	3	9	1836118	1836126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440221
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48114	NC_017278	CCCT	2	8	1836164	1836171	0 %	25 %	0 %	75 %	384440221
48115	NC_017278	CTC	3	9	1836182	1836190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440221
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48336	NC_017278	GCCC	2	8	1844256	1844263	0 %	0 %	25 %	75 %	384440229
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