MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_017278	AGG	2	6	1756202	1756207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440140
46003	NC_017278	GCCC	2	8	1756255	1756262	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46004	NC_017278	CCTA	2	8	1756294	1756301	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46005	NC_017278	GTA	2	6	1756379	1756384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440141
46006	NC_017278	CTC	2	6	1756517	1756522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440141
46007	NC_017278	TCC	2	6	1756536	1756541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440141
46008	NC_017278	TCC	2	6	1756568	1756573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440141
46009	NC_017278	GAC	2	6	1756606	1756611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46010	NC_017278	GCG	2	6	1756735	1756740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46011	NC_017278	CTT	2	6	1756880	1756885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46012	NC_017278	CCT	2	6	1757016	1757021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46013	NC_017278	TGG	2	6	1757032	1757037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46014	NC_017278	CGA	2	6	1757101	1757106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46015	NC_017278	CTT	2	6	1757118	1757123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46016	NC_017278	GCG	3	9	1757143	1757151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46017	NC_017278	G	6	6	1757180	1757185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46018	NC_017278	GTT	2	6	1757256	1757261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46019	NC_017278	AGACGA	2	12	1757291	1757302	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46020	NC_017278	CCCT	2	8	1757317	1757324	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46021	NC_017278	ACA	2	6	1757396	1757401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46022	NC_017278	GCCCCT	2	12	1757468	1757479	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46023	NC_017278	GAA	2	6	1757523	1757528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46024	NC_017278	GAAT	2	8	1757578	1757585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46025	NC_017278	TCC	2	6	1757654	1757659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46026	NC_017278	CTT	2	6	1757664	1757669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46027	NC_017278	GGC	2	6	1757694	1757699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46028	NC_017278	GCT	2	6	1757811	1757816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46029	NC_017278	G	6	6	1757886	1757891	0 %	0 %	100 %	0 %	384440142
46030	NC_017278	GAG	2	6	1757905	1757910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440142
46031	NC_017278	CTT	2	6	1758013	1758018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440142
46032	NC_017278	CTA	2	6	1758046	1758051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440142
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46040	NC_017278	GGC	2	6	1758295	1758300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440142
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46042	NC_017278	TGGGA	2	10	1758486	1758495	20 %	20 %	60 %	0 %	384440142
46043	NC_017278	GCG	2	6	1758529	1758534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440142
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46052	NC_017278	GCG	2	6	1758895	1758900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440142
46053	NC_017278	CTT	2	6	1758953	1758958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440142
46054	NC_017278	AG	3	6	1758994	1758999	50 %	0 %	50 %	0 %	384440142
46055	NC_017278	GCC	2	6	1759024	1759029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440142
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46058	NC_017278	GAA	2	6	1759237	1759242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46059	NC_017278	GCCATC	2	12	1759243	1759254	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46060	NC_017278	GAA	2	6	1759258	1759263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46061	NC_017278	GAC	2	6	1759282	1759287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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46063	NC_017278	CTTCC	2	10	1759314	1759323	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
46064	NC_017278	ATCC	2	8	1759371	1759378	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46065	NC_017278	CAA	2	6	1759380	1759385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46072	NC_017278	GCCG	2	8	1759766	1759773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46073	NC_017278	TAGCA	2	10	1759845	1759854	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46074	NC_017278	ATG	2	6	1759903	1759908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46105	NC_017278	CCTC	2	8	1760814	1760821	0 %	25 %	0 %	75 %	384440144
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46476	NC_017278	ATC	2	6	1775244	1775249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440160
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46478	NC_017278	TGG	2	6	1775277	1775282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440160
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46480	NC_017278	CCA	2	6	1775320	1775325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440160
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46488	NC_017278	ATG	2	6	1775592	1775597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440160
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46491	NC_017278	GAA	2	6	1775711	1775716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440160
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46500	NC_017278	GCCG	2	8	1776117	1776124	0 %	0 %	50 %	50 %	384440161

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