MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_017278	CCT	2	6	1620623	1620628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440011
42502	NC_017278	AAG	2	6	1620660	1620665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440011
42503	NC_017278	CTGGAA	2	12	1620675	1620686	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384440011
42504	NC_017278	TGA	2	6	1620721	1620726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440011
42505	NC_017278	G	6	6	1620785	1620790	0 %	0 %	100 %	0 %	384440011
42506	NC_017278	GCC	2	6	1620807	1620812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440011
42507	NC_017278	G	6	6	1620815	1620820	0 %	0 %	100 %	0 %	384440011
42508	NC_017278	AGG	2	6	1620835	1620840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440011
42509	NC_017278	GGCC	2	8	1620871	1620878	0 %	0 %	50 %	50 %	384440011
42510	NC_017278	CTC	2	6	1620942	1620947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440011
42511	NC_017278	GGACG	2	10	1620964	1620973	20 %	0 %	60 %	20 %	384440011
42512	NC_017278	CCT	2	6	1621010	1621015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440011
42513	NC_017278	GCC	2	6	1621066	1621071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440011
42514	NC_017278	GGC	2	6	1621078	1621083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440011
42515	NC_017278	TGG	2	6	1621117	1621122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440011
42516	NC_017278	GGCCT	2	10	1621143	1621152	0 %	20 %	40 %	40 %	384440011
42517	NC_017278	CGGCC	2	10	1621180	1621189	0 %	0 %	40 %	60 %	384440011
42518	NC_017278	G	6	6	1621207	1621212	0 %	0 %	100 %	0 %	384440011
42519	NC_017278	TCC	2	6	1621225	1621230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440011
42520	NC_017278	ACA	2	6	1621231	1621236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440011
42521	NC_017278	CCG	2	6	1621283	1621288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440011
42522	NC_017278	CCT	2	6	1621328	1621333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440011
42523	NC_017278	GGA	2	6	1621451	1621456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440011
42524	NC_017278	CCT	2	6	1621502	1621507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440011
42525	NC_017278	GGA	2	6	1621538	1621543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440011
42526	NC_017278	CCA	2	6	1621696	1621701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440012
42527	NC_017278	TCC	2	6	1621710	1621715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440012
42528	NC_017278	GAG	2	6	1621721	1621726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440012
42529	NC_017278	GTG	2	6	1621748	1621753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440012
42530	NC_017278	GGA	2	6	1621771	1621776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440012
42531	NC_017278	CGGG	2	8	1621802	1621809	0 %	0 %	75 %	25 %	384440012
42532	NC_017278	GGC	2	6	1621867	1621872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440012
42533	NC_017278	CTC	2	6	1621946	1621951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440012
42534	NC_017278	TGG	2	6	1621971	1621976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440012
42535	NC_017278	CTC	2	6	1622027	1622032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440012
42536	NC_017278	G	7	7	1622047	1622053	0 %	0 %	100 %	0 %	384440012
42537	NC_017278	GGT	2	6	1622128	1622133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440012
42538	NC_017278	CCCCT	2	10	1622156	1622165	0 %	20 %	0 %	80 %	384440012
42539	NC_017278	CCT	2	6	1622188	1622193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440012
42540	NC_017278	TCC	2	6	1622292	1622297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440012
42541	NC_017278	G	6	6	1622312	1622317	0 %	0 %	100 %	0 %	384440012
42542	NC_017278	TGG	2	6	1622319	1622324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440012
42543	NC_017278	TGG	2	6	1622337	1622342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440012
42544	NC_017278	GAA	2	6	1622428	1622433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440012
42545	NC_017278	C	6	6	1622445	1622450	0 %	0 %	0 %	100 %	384440012
42546	NC_017278	CGG	2	6	1622460	1622465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440012
42547	NC_017278	GCC	2	6	1622489	1622494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440012
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42549	NC_017278	GCC	2	6	1622536	1622541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440012
42550	NC_017278	GTA	2	6	1622549	1622554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440012
42551	NC_017278	CCT	2	6	1622568	1622573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440013
42552	NC_017278	CGG	2	6	1622586	1622591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440013
42553	NC_017278	CGG	2	6	1622598	1622603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440013
42554	NC_017278	TGG	2	6	1622606	1622611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440013
42555	NC_017278	TGA	2	6	1622630	1622635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440013
42556	NC_017278	TGG	2	6	1622645	1622650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440013
42557	NC_017278	TGG	2	6	1622693	1622698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440013
42558	NC_017278	TCT	2	6	1622702	1622707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440013
42559	NC_017278	TGG	2	6	1622717	1622722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440013
42560	NC_017278	GCC	2	6	1622764	1622769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440013
42561	NC_017278	TTC	2	6	1622770	1622775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440013
42562	NC_017278	CCG	2	6	1622786	1622791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440013
42563	NC_017278	CCGC	2	8	1622798	1622805	0 %	0 %	25 %	75 %	384440013
42564	NC_017278	CTCC	2	8	1622826	1622833	0 %	25 %	0 %	75 %	384440013
42565	NC_017278	TGG	2	6	1622870	1622875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440013
42566	NC_017278	CCT	5	15	1622883	1622897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440013
42567	NC_017278	C	6	6	1622912	1622917	0 %	0 %	0 %	100 %	384440013
42568	NC_017278	CTC	2	6	1622956	1622961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440013
42569	NC_017278	CTGG	2	8	1622962	1622969	0 %	25 %	50 %	25 %	384440013
42570	NC_017278	ATG	2	6	1622995	1623000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440013
42571	NC_017278	GTGG	2	8	1623004	1623011	0 %	25 %	75 %	0 %	384440013
42572	NC_017278	TGG	2	6	1623182	1623187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440013
42573	NC_017278	CTT	2	6	1623192	1623197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440013
42574	NC_017278	GGGAG	2	10	1623198	1623207	20 %	0 %	80 %	0 %	384440013
42575	NC_017278	TCC	2	6	1623218	1623223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440013
42576	NC_017278	GGT	2	6	1623240	1623245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440013
42577	NC_017278	CGC	2	6	1623249	1623254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440013
42578	NC_017278	TCC	2	6	1623257	1623262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440013
42579	NC_017278	AGG	2	6	1623359	1623364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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42582	NC_017278	TCC	2	6	1623558	1623563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440014
42583	NC_017278	TGG	2	6	1623651	1623656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440014
42584	NC_017278	CTTT	2	8	1623882	1623889	0 %	75 %	0 %	25 %	384440015
42585	NC_017278	GAG	2	6	1623932	1623937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440016
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42587	NC_017278	CAA	2	6	1623982	1623987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440016
42588	NC_017278	TGG	2	6	1624008	1624013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440016
42589	NC_017278	GAC	2	6	1624121	1624126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440016
42590	NC_017278	TGG	2	6	1624203	1624208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440016
42591	NC_017278	GCC	2	6	1624241	1624246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440016
42592	NC_017278	GCC	2	6	1624269	1624274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440016
42593	NC_017278	GGT	2	6	1624375	1624380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440016
42594	NC_017278	AGG	2	6	1624395	1624400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440016
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42597	NC_017278	AGG	2	6	1624481	1624486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440017
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42599	NC_017278	GAA	2	6	1624542	1624547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440017
42600	NC_017278	GCCC	2	8	1624551	1624558	0 %	0 %	25 %	75 %	384440017
42601	NC_017278	TCT	2	6	1624583	1624588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440017
42602	NC_017278	CACCCG	2	12	1624599	1624610	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384440017
42603	NC_017278	GGC	2	6	1624626	1624631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440017
42604	NC_017278	CGG	2	6	1624633	1624638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440017
42605	NC_017278	CAG	2	6	1624674	1624679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440017
42606	NC_017278	CTG	2	6	1624711	1624716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440017
42607	NC_017278	CGC	2	6	1624761	1624766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440017
42608	NC_017278	CCA	2	6	1624776	1624781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440017
42609	NC_017278	GTG	3	9	1624804	1624812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440017
42610	NC_017278	G	7	7	1624816	1624822	0 %	0 %	100 %	0 %	384440017
42611	NC_017278	CCCAC	2	10	1624835	1624844	20 %	0 %	0 %	80 %	384440017
42612	NC_017278	CCT	2	6	1624851	1624856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440017
42613	NC_017278	TCC	2	6	1624925	1624930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440017
42614	NC_017278	CTC	2	6	1624960	1624965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440017
42615	NC_017278	CCT	2	6	1624968	1624973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440017
42616	NC_017278	C	7	7	1624998	1625004	0 %	0 %	0 %	100 %	384440017
42617	NC_017278	CCT	2	6	1625007	1625012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440017
42618	NC_017278	C	6	6	1625195	1625200	0 %	0 %	0 %	100 %	384440017
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42621	NC_017278	TGG	2	6	1625330	1625335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440017
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42623	NC_017278	TGG	2	6	1625374	1625379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440018
42624	NC_017278	G	7	7	1625445	1625451	0 %	0 %	100 %	0 %	384440018
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42632	NC_017278	CTC	2	6	1625775	1625780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440018
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42648	NC_017278	ACC	2	6	1626127	1626132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440018
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42682	NC_017278	CCT	2	6	1627387	1627392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440020
42683	NC_017278	GTG	2	6	1627428	1627433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440020
42684	NC_017278	CCA	2	6	1627441	1627446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440020
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42687	NC_017278	GGGCCG	2	12	1627492	1627503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440020
42688	NC_017278	GAG	3	9	1627523	1627531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440020
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42690	NC_017278	TCC	2	6	1627683	1627688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440020
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42693	NC_017278	GTT	2	6	1627802	1627807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440020
42694	NC_017278	TGA	2	6	1627822	1627827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440020
42695	NC_017278	TCC	2	6	1627836	1627841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440020
42696	NC_017278	AGG	2	6	1627842	1627847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440020
42697	NC_017278	C	6	6	1627872	1627877	0 %	0 %	0 %	100 %	384440020
42698	NC_017278	GGC	2	6	1627934	1627939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440020
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42700	NC_017278	TCC	2	6	1628028	1628033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440020
42701	NC_017278	GCCGG	2	10	1628044	1628053	0 %	0 %	60 %	40 %	384440020
42702	NC_017278	AGG	2	6	1628061	1628066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440020
42703	NC_017278	ACC	2	6	1628080	1628085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440020
42704	NC_017278	CTC	2	6	1628227	1628232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440021
42705	NC_017278	GCC	2	6	1628233	1628238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440021
42706	NC_017278	GGT	2	6	1628310	1628315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440021
42707	NC_017278	G	7	7	1628350	1628356	0 %	0 %	100 %	0 %	384440021
42708	NC_017278	GGA	2	6	1628448	1628453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440021
42709	NC_017278	GCC	2	6	1628551	1628556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440021
42710	NC_017278	C	6	6	1628567	1628572	0 %	0 %	0 %	100 %	384440021
42711	NC_017278	AGC	2	6	1628588	1628593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440021
42712	NC_017278	CTT	2	6	1628714	1628719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42713	NC_017278	G	7	7	1628737	1628743	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42714	NC_017278	TTC	2	6	1628803	1628808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440022
42715	NC_017278	TCC	2	6	1628827	1628832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440022
42716	NC_017278	CAC	3	9	1628837	1628845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440022
42717	NC_017278	GCC	2	6	1628860	1628865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440022
42718	NC_017278	GCGG	2	8	1628876	1628883	0 %	0 %	75 %	25 %	384440022
42719	NC_017278	GGA	2	6	1628885	1628890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440022
42720	NC_017278	TGG	2	6	1628920	1628925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440022
42721	NC_017278	TGG	2	6	1629037	1629042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440022
42722	NC_017278	GGC	2	6	1629077	1629082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440022
42723	NC_017278	TGC	2	6	1629109	1629114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440022
42724	NC_017278	TGG	2	6	1629154	1629159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440022
42725	NC_017278	AGG	2	6	1629169	1629174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440022
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42727	NC_017278	TGG	2	6	1629274	1629279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440022
42728	NC_017278	GAG	2	6	1629303	1629308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440022
42729	NC_017278	CCT	2	6	1629317	1629322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440022
42730	NC_017278	GGA	2	6	1629338	1629343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440022
42731	NC_017278	AAG	2	6	1629351	1629356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440022
42732	NC_017278	CTC	2	6	1629366	1629371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440022
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42970	NC_017278	CGG	2	6	1638493	1638498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440030
42971	NC_017278	TCA	2	6	1638543	1638548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440030
42972	NC_017278	TCC	2	6	1638582	1638587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440030
42973	NC_017278	CGA	2	6	1638595	1638600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440030
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42999	NC_017278	CCTC	2	8	1639859	1639866	0 %	25 %	0 %	75 %	384440031
43000	NC_017278	AGGCCC	2	12	1639867	1639878	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384440031

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