MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017278	GCC	2	6	141525	141530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438525
3502	NC_017278	CGC	2	6	141543	141548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438525
3503	NC_017278	GCAG	2	8	141639	141646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_017278	GGCG	2	8	141783	141790	0 %	0 %	75 %	25 %	384438526
3505	NC_017278	C	7	7	141859	141865	0 %	0 %	0 %	100 %	384438526
3506	NC_017278	GTG	3	9	141977	141985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438526
3507	NC_017278	ATC	2	6	141989	141994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438526
3508	NC_017278	GGC	2	6	142028	142033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_017278	CCT	2	6	142061	142066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438527
3510	NC_017278	TCGGCC	2	12	142141	142152	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438527
3511	NC_017278	CCT	2	6	142232	142237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438527
3512	NC_017278	G	6	6	142250	142255	0 %	0 %	100 %	0 %	384438527
3513	NC_017278	GGC	2	6	142327	142332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438527
3514	NC_017278	CCA	2	6	142342	142347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438527
3515	NC_017278	CCT	2	6	142379	142384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438527
3516	NC_017278	AGG	2	6	142417	142422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438527
3517	NC_017278	CTC	2	6	142512	142517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438527
3518	NC_017278	C	6	6	142520	142525	0 %	0 %	0 %	100 %	384438527
3519	NC_017278	CCT	2	6	142547	142552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438527
3520	NC_017278	GGA	2	6	142613	142618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438527
3521	NC_017278	GAA	2	6	142641	142646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438527
3522	NC_017278	TTGGCC	2	12	142714	142725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438527
3523	NC_017278	CGC	2	6	142745	142750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438527
3524	NC_017278	AGG	2	6	142816	142821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438527
3525	NC_017278	CCT	2	6	142832	142837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438527
3526	NC_017278	CCT	2	6	142865	142870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438527
3527	NC_017278	TCC	2	6	142927	142932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438527
3528	NC_017278	TCC	2	6	142969	142974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438527
3529	NC_017278	GAGG	2	8	142986	142993	25 %	0 %	75 %	0 %	384438527
3530	NC_017278	CCG	2	6	142997	143002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438527
3531	NC_017278	AAG	2	6	143005	143010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438527
3532	NC_017278	AGG	2	6	143011	143016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438527
3533	NC_017278	GGC	2	6	143042	143047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438527
3534	NC_017278	C	6	6	143089	143094	0 %	0 %	0 %	100 %	384438527
3535	NC_017278	G	6	6	143112	143117	0 %	0 %	100 %	0 %	384438527
3536	NC_017278	AGG	2	6	143119	143124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438527
3537	NC_017278	GCAGG	2	10	143132	143141	20 %	0 %	60 %	20 %	384438527
3538	NC_017278	GCG	2	6	143185	143190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438527
3539	NC_017278	GGC	2	6	143222	143227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438527
3540	NC_017278	CCT	2	6	143246	143251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438527
3541	NC_017278	AGGTG	2	10	143342	143351	20 %	20 %	60 %	0 %	384438527
3542	NC_017278	CCA	2	6	143378	143383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438527
3543	NC_017278	ACC	2	6	143407	143412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438527
3544	NC_017278	GCACCC	2	12	143420	143431	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384438527
3545	NC_017278	GCC	2	6	143447	143452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438527
3546	NC_017278	GCC	3	9	143461	143469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438527
3547	NC_017278	CTG	2	6	143517	143522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438527
3548	NC_017278	CCG	2	6	143653	143658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438527
3549	NC_017278	GCC	2	6	143673	143678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438527
3550	NC_017278	GAGG	2	8	143691	143698	25 %	0 %	75 %	0 %	384438527
3551	NC_017278	CGG	2	6	143729	143734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438527
3552	NC_017278	C	6	6	143750	143755	0 %	0 %	0 %	100 %	384438527
3553	NC_017278	GATG	2	8	143816	143823	25 %	25 %	50 %	0 %	384438527
3554	NC_017278	GGC	2	6	143840	143845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438527
3555	NC_017278	G	6	6	143872	143877	0 %	0 %	100 %	0 %	384438527
3556	NC_017278	ACC	2	6	143920	143925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438527
3557	NC_017278	CTC	2	6	143946	143951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438527
3558	NC_017278	GGA	2	6	143960	143965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438527
3559	NC_017278	GCC	2	6	143969	143974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438527
3560	NC_017278	C	6	6	144079	144084	0 %	0 %	0 %	100 %	384438527
3561	NC_017278	CCA	2	6	144113	144118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438527
3562	NC_017278	GCG	2	6	144126	144131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438527
3563	NC_017278	CTC	2	6	144133	144138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438527
3564	NC_017278	GCC	2	6	144142	144147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438527
3565	NC_017278	GGGC	2	8	144254	144261	0 %	0 %	75 %	25 %	384438527
3566	NC_017278	GA	3	6	144461	144466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017278	T	6	6	144471	144476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017278	CAACC	2	10	144701	144710	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3569	NC_017278	GTC	2	6	144732	144737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_017278	GCGA	2	8	144765	144772	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_017278	TGC	2	6	144800	144805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_017278	G	6	6	144877	144882	0 %	0 %	100 %	0 %	384438528
3573	NC_017278	GAG	2	6	144896	144901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438528
3574	NC_017278	CTT	2	6	145004	145009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438528
3575	NC_017278	CTA	2	6	145037	145042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438528
3576	NC_017278	ACC	2	6	145059	145064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438528
3577	NC_017278	CCG	2	6	145139	145144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438528
3578	NC_017278	TGG	2	6	145147	145152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438528
3579	NC_017278	CGC	2	6	145181	145186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438528
3580	NC_017278	GTCA	2	8	145191	145198	25 %	25 %	25 %	25 %	384438528
3581	NC_017278	GGC	2	6	145205	145210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438528
3582	NC_017278	GACG	2	8	145268	145275	25 %	0 %	50 %	25 %	384438528
3583	NC_017278	GGC	2	6	145286	145291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438528
3584	NC_017278	GAG	2	6	145320	145325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438528
3585	NC_017278	TGGGA	2	10	145477	145486	20 %	20 %	60 %	0 %	384438528
3586	NC_017278	GCG	2	6	145520	145525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438528
3587	NC_017278	TCA	2	6	145537	145542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438528
3588	NC_017278	GTG	2	6	145611	145616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438528
3589	NC_017278	CTG	2	6	145665	145670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438528
3590	NC_017278	GGA	2	6	145673	145678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438528
3591	NC_017278	GAA	2	6	145710	145715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438528
3592	NC_017278	GGA	2	6	145730	145735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438528
3593	NC_017278	GCC	2	6	145743	145748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438528
3594	NC_017278	GTG	2	6	145770	145775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438528
3595	NC_017278	GCG	2	6	145886	145891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438528
3596	NC_017278	CTT	2	6	145944	145949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438528
3597	NC_017278	AGG	2	6	146017	146022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438528
3598	NC_017278	C	6	6	146053	146058	0 %	0 %	0 %	100 %	384438528
3599	NC_017278	CAA	2	6	146212	146217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_017278	GCT	2	6	146219	146224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_017278	CGG	2	6	146242	146247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_017278	GTG	2	6	146248	146253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017278	GCC	2	6	146309	146314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_017278	GGC	2	6	146318	146323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_017278	GCC	2	6	146373	146378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_017278	GGT	2	6	146388	146393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017278	CCG	2	6	146422	146427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438529
3608	NC_017278	CTC	2	6	146434	146439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438529
3609	NC_017278	C	7	7	146460	146466	0 %	0 %	0 %	100 %	384438529
3610	NC_017278	AGG	2	6	146503	146508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438529
3611	NC_017278	GGGGC	2	10	146520	146529	0 %	0 %	80 %	20 %	384438529
3612	NC_017278	CCA	2	6	146552	146557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438529
3613	NC_017278	CGG	2	6	146566	146571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438529
3614	NC_017278	GGCC	2	8	146591	146598	0 %	0 %	50 %	50 %	384438529
3615	NC_017278	CCT	2	6	146609	146614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438529
3616	NC_017278	GGT	2	6	146657	146662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438529
3617	NC_017278	CCA	2	6	146714	146719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438529
3618	NC_017278	C	6	6	146728	146733	0 %	0 %	0 %	100 %	384438529
3619	NC_017278	GCC	2	6	146744	146749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438529
3620	NC_017278	C	6	6	146778	146783	0 %	0 %	0 %	100 %	384438529
3621	NC_017278	GCG	2	6	146796	146801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438529
3622	NC_017278	GAA	2	6	146802	146807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438529
3623	NC_017278	CGG	2	6	146864	146869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438529
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3625	NC_017278	CCT	3	9	146999	147007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438529
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3743	NC_017278	GGA	2	6	152510	152515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3744	NC_017278	CCT	2	6	152585	152590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438537
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3996	NC_017278	ACC	3	9	162091	162099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438544
3997	NC_017278	CGG	2	6	162164	162169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438544
3998	NC_017278	C	7	7	162203	162209	0 %	0 %	0 %	100 %	384438544
3999	NC_017278	CCA	2	6	162212	162217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438544
4000	NC_017278	GGC	2	6	162255	162260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438544

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