MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_017278	ACC	2	6	651167	651172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439064
16503	NC_017278	GCC	2	6	651174	651179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439064
16504	NC_017278	CTC	2	6	651180	651185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439064
16505	NC_017278	CCCT	2	8	651290	651297	0 %	25 %	0 %	75 %	384439064
16506	NC_017278	CGT	2	6	651330	651335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384439064
16507	NC_017278	GGT	2	6	651343	651348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439064
16508	NC_017278	CCA	2	6	651375	651380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439064
16509	NC_017278	C	6	6	651393	651398	0 %	0 %	0 %	100 %	384439064
16510	NC_017278	GCA	2	6	651441	651446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384439064
16511	NC_017278	GGC	2	6	651643	651648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439064
16512	NC_017278	AGG	2	6	651650	651655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439064
16513	NC_017278	AGG	3	9	651659	651667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439064
16514	NC_017278	CGG	2	6	651710	651715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16515	NC_017278	CCTT	2	8	651730	651737	0 %	50 %	0 %	50 %	384439065
16516	NC_017278	G	6	6	651838	651843	0 %	0 %	100 %	0 %	384439065
16517	NC_017278	CCCAGG	2	12	651909	651920	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384439065
16518	NC_017278	GATGGC	2	12	651944	651955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384439065
16519	NC_017278	AGG	2	6	652002	652007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439065
16520	NC_017278	AGG	2	6	652014	652019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439065
16521	NC_017278	GGC	2	6	652049	652054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439065
16522	NC_017278	C	9	9	652087	652095	0 %	0 %	0 %	100 %	384439065
16523	NC_017278	GGCG	2	8	652102	652109	0 %	0 %	75 %	25 %	384439065
16524	NC_017278	GGC	2	6	652121	652126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439065
16525	NC_017278	CCA	2	6	652174	652179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439065
16526	NC_017278	CCA	2	6	652222	652227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439065
16527	NC_017278	AGG	2	6	652239	652244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439065
16528	NC_017278	CCA	2	6	652315	652320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439065
16529	NC_017278	TCG	2	6	652383	652388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384439065
16530	NC_017278	AGG	2	6	652395	652400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439065
16531	NC_017278	CGGAC	2	10	652407	652416	20 %	0 %	40 %	40 %	384439065
16532	NC_017278	GCCACT	2	12	652456	652467	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384439065
16533	NC_017278	G	8	8	652603	652610	0 %	0 %	100 %	0 %	384439065
16534	NC_017278	AGG	2	6	652680	652685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439065
16535	NC_017278	AGG	5	15	652689	652703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439065
16536	NC_017278	GCG	2	6	652727	652732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439065
16537	NC_017278	GCG	2	6	652736	652741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439065
16538	NC_017278	AGG	2	6	652786	652791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439066
16539	NC_017278	GAG	2	6	652797	652802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439066
16540	NC_017278	CCA	2	6	652826	652831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439066
16541	NC_017278	CAC	2	6	652848	652853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439066
16542	NC_017278	CCA	2	6	652880	652885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439066
16543	NC_017278	AGG	2	6	652942	652947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439066
16544	NC_017278	CAC	2	6	653016	653021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439066
16545	NC_017278	AGG	2	6	653080	653085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439066
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16547	NC_017278	GGA	2	6	653144	653149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439066
16548	NC_017278	AACC	2	8	653185	653192	50 %	0 %	0 %	50 %	384439066
16549	NC_017278	AGA	2	6	653234	653239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439066
16550	NC_017278	GGC	2	6	653307	653312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439066
16551	NC_017278	GAG	2	6	653337	653342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439066
16552	NC_017278	CCA	2	6	653345	653350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439066
16553	NC_017278	GGC	2	6	653355	653360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439066
16554	NC_017278	CTC	2	6	653400	653405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439066
16555	NC_017278	AGG	2	6	653470	653475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439066
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16557	NC_017278	CAC	2	6	653610	653615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439066
16558	NC_017278	GGGC	2	8	653692	653699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16559	NC_017278	CCT	2	6	653790	653795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439067
16560	NC_017278	CGG	2	6	653802	653807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439067
16561	NC_017278	GCT	2	6	653880	653885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384439067
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16563	NC_017278	CTGG	2	8	653980	653987	0 %	25 %	50 %	25 %	384439067
16564	NC_017278	CCCAG	2	10	654036	654045	20 %	0 %	20 %	60 %	384439067
16565	NC_017278	C	6	6	654102	654107	0 %	0 %	0 %	100 %	384439067
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16571	NC_017278	GTAGAT	2	12	654448	654459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384439067
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16573	NC_017278	GGCG	2	8	654510	654517	0 %	0 %	75 %	25 %	384439067
16574	NC_017278	CCA	2	6	654564	654569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439067
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16588	NC_017278	AGG	2	6	655296	655301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16592	NC_017278	CCA	2	6	655521	655526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439068
16593	NC_017278	GAG	2	6	655561	655566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439068
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16605	NC_017278	CCT	2	6	656099	656104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439069
16606	NC_017278	CTC	2	6	656247	656252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439069
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16857	NC_017278	G	6	6	666269	666274	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16858	NC_017278	C	7	7	666341	666347	0 %	0 %	0 %	100 %	384439078
16859	NC_017278	GCA	2	6	666352	666357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384439078
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