MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017278	TGA	2	6	634083	634088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384439047
16002	NC_017278	CCT	3	9	634153	634161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439048
16003	NC_017278	GGC	2	6	634201	634206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439048
16004	NC_017278	TC	3	6	634219	634224	0 %	50 %	0 %	50 %	384439048
16005	NC_017278	GGCC	2	8	634267	634274	0 %	0 %	50 %	50 %	384439048
16006	NC_017278	CAG	2	6	634358	634363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384439048
16007	NC_017278	CCTCCC	2	12	634369	634380	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384439048
16008	NC_017278	CCT	2	6	634402	634407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439048
16009	NC_017278	CGC	2	6	634412	634417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439048
16010	NC_017278	GCA	2	6	634444	634449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384439048
16011	NC_017278	AGG	2	6	634455	634460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439048
16012	NC_017278	GGC	2	6	634520	634525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439048
16013	NC_017278	C	6	6	634582	634587	0 %	0 %	0 %	100 %	384439048
16014	NC_017278	GGGCCA	2	12	634588	634599	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384439048
16015	NC_017278	CCA	2	6	634609	634614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439048
16016	NC_017278	GGC	2	6	634615	634620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439048
16017	NC_017278	GAG	2	6	634700	634705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439048
16018	NC_017278	G	6	6	634714	634719	0 %	0 %	100 %	0 %	384439048
16019	NC_017278	TGGC	2	8	634731	634738	0 %	25 %	50 %	25 %	384439048
16020	NC_017278	CCT	2	6	634771	634776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439048
16021	NC_017278	CCA	2	6	634807	634812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439048
16022	NC_017278	C	6	6	634814	634819	0 %	0 %	0 %	100 %	384439048
16023	NC_017278	GCGG	2	8	634871	634878	0 %	0 %	75 %	25 %	384439048
16024	NC_017278	GCC	2	6	634890	634895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439048
16025	NC_017278	GGCG	2	8	634918	634925	0 %	0 %	75 %	25 %	384439048
16026	NC_017278	AAG	2	6	634965	634970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439048
16027	NC_017278	GAG	2	6	634976	634981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439048
16028	NC_017278	CGC	2	6	634986	634991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439048
16029	NC_017278	AGG	2	6	634998	635003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439048
16030	NC_017278	AAG	2	6	635039	635044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439048
16031	NC_017278	GGC	3	9	635066	635074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439048
16032	NC_017278	ACC	2	6	635091	635096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439048
16033	NC_017278	CCT	2	6	635125	635130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439048
16034	NC_017278	C	7	7	635200	635206	0 %	0 %	0 %	100 %	384439048
16035	NC_017278	AGG	2	6	635214	635219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439048
16036	NC_017278	CCG	2	6	635248	635253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439048
16037	NC_017278	GCG	2	6	635259	635264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439048
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16039	NC_017278	C	6	6	635311	635316	0 %	0 %	0 %	100 %	384439048
16040	NC_017278	CCA	2	6	635338	635343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439048
16041	NC_017278	AAG	2	6	635348	635353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439048
16042	NC_017278	AGG	2	6	635358	635363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439048
16043	NC_017278	GGAA	2	8	635389	635396	50 %	0 %	50 %	0 %	384439048
16044	NC_017278	G	7	7	635398	635404	0 %	0 %	100 %	0 %	384439048
16045	NC_017278	GGCCC	2	10	635409	635418	0 %	0 %	40 %	60 %	384439049
16046	NC_017278	TCC	2	6	635425	635430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439049
16047	NC_017278	CCCGG	2	10	635435	635444	0 %	0 %	40 %	60 %	384439049
16048	NC_017278	GGC	2	6	635564	635569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439049
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16050	NC_017278	CCCGG	2	10	635606	635615	0 %	0 %	40 %	60 %	384439049
16051	NC_017278	GAG	2	6	635625	635630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439049
16052	NC_017278	GGA	2	6	635633	635638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439049
16053	NC_017278	CCT	3	9	635666	635674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439049
16054	NC_017278	GAA	2	6	635679	635684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439049
16055	NC_017278	C	6	6	635740	635745	0 %	0 %	0 %	100 %	384439049
16056	NC_017278	CGG	2	6	635783	635788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439049
16057	NC_017278	TCG	2	6	635812	635817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384439049
16058	NC_017278	AAG	2	6	635829	635834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439049
16059	NC_017278	GTC	2	6	635886	635891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384439049
16060	NC_017278	ACC	2	6	635953	635958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439049
16061	NC_017278	CCT	2	6	636032	636037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439049
16062	NC_017278	AGCTCC	2	12	636040	636051	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384439049
16063	NC_017278	GTC	2	6	636072	636077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384439049
16064	NC_017278	CCT	2	6	636136	636141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439050
16065	NC_017278	GGA	2	6	636151	636156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439050
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16067	NC_017278	C	6	6	636193	636198	0 %	0 %	0 %	100 %	384439050
16068	NC_017278	GGGGC	2	10	636218	636227	0 %	0 %	80 %	20 %	384439050
16069	NC_017278	GGA	2	6	636238	636243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439050
16070	NC_017278	CCT	2	6	636259	636264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439050
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16072	NC_017278	GGA	2	6	636287	636292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439050
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16078	NC_017278	AGG	3	9	636435	636443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439050
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16089	NC_017278	G	8	8	636678	636685	0 %	0 %	100 %	0 %	384439051
16090	NC_017278	CCT	2	6	636774	636779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439051
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16104	NC_017278	GCG	2	6	637456	637461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439052
16105	NC_017278	CCT	2	6	637500	637505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439052
16106	NC_017278	CGGGG	2	10	637515	637524	0 %	0 %	80 %	20 %	384439052
16107	NC_017278	CCA	2	6	637545	637550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439052
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16109	NC_017278	CTC	2	6	637654	637659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439052
16110	NC_017278	CCT	2	6	637791	637796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16111	NC_017278	GCCAG	2	10	637896	637905	20 %	0 %	40 %	40 %	384439053
16112	NC_017278	GGT	3	9	638005	638013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439053
16113	NC_017278	CCA	2	6	638019	638024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439053
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16116	NC_017278	GCC	2	6	638102	638107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439053
16117	NC_017278	CTC	2	6	638113	638118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439053
16118	NC_017278	TGA	2	6	638166	638171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384439053
16119	NC_017278	ACC	2	6	638174	638179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439053
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16121	NC_017278	CGG	2	6	638259	638264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439054
16122	NC_017278	AGG	2	6	638333	638338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439054
16123	NC_017278	TCC	2	6	638339	638344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439054
16124	NC_017278	GAG	2	6	638359	638364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439054
16125	NC_017278	GGC	2	6	638365	638370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439054
16126	NC_017278	GGC	2	6	638373	638378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439054
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16188	NC_017278	AAG	2	6	640685	640690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16230	NC_017278	GA	3	6	642160	642165	50 %	0 %	50 %	0 %	384439057
16231	NC_017278	GTG	2	6	642174	642179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439057
16232	NC_017278	GAA	2	6	642189	642194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439057
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16234	NC_017278	CCCGC	2	10	642225	642234	0 %	0 %	20 %	80 %	384439057
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16486	NC_017278	CGG	2	6	650551	650556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439063
16487	NC_017278	TGG	2	6	650608	650613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439063
16488	NC_017278	TCC	2	6	650664	650669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439063
16489	NC_017278	C	6	6	650668	650673	0 %	0 %	0 %	100 %	384439063
16490	NC_017278	ACC	2	6	650687	650692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439064
16491	NC_017278	GCTCCA	2	12	650703	650714	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384439064
16492	NC_017278	G	6	6	650763	650768	0 %	0 %	100 %	0 %	384439064
16493	NC_017278	ACC	2	6	650783	650788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439064
16494	NC_017278	C	7	7	650836	650842	0 %	0 %	0 %	100 %	384439064
16495	NC_017278	AGA	2	6	650859	650864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439064
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16498	NC_017278	GGC	2	6	651004	651009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439064
16499	NC_017278	G	6	6	651039	651044	0 %	0 %	100 %	0 %	384439064
16500	NC_017278	CCAGGG	2	12	651123	651134	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384439064

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