MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017278	G	6	6	596421	596426	0 %	0 %	100 %	0 %	384439006
15003	NC_017278	G	6	6	596510	596515	0 %	0 %	100 %	0 %	384439006
15004	NC_017278	AGG	2	6	596524	596529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439006
15005	NC_017278	ACGG	2	8	596577	596584	25 %	0 %	50 %	25 %	384439006
15006	NC_017278	GTG	2	6	596601	596606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439006
15007	NC_017278	C	7	7	596617	596623	0 %	0 %	0 %	100 %	384439006
15008	NC_017278	AGG	2	6	596635	596640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439006
15009	NC_017278	GTG	3	9	596649	596657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439006
15010	NC_017278	GCA	2	6	596689	596694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384439006
15011	NC_017278	CCT	2	6	596696	596701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439006
15012	NC_017278	GAG	2	6	596772	596777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439006
15013	NC_017278	CCTGGC	2	12	596818	596829	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384439007
15014	NC_017278	CCT	2	6	596836	596841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15015	NC_017278	CTG	2	6	596858	596863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384439007
15016	NC_017278	TCC	2	6	596889	596894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15017	NC_017278	GGC	2	6	596929	596934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439007
15018	NC_017278	CGC	2	6	596938	596943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439007
15019	NC_017278	CTT	2	6	596944	596949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384439007
15020	NC_017278	GGC	2	6	597052	597057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439007
15021	NC_017278	TCC	2	6	597072	597077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15022	NC_017278	CCT	2	6	597144	597149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15023	NC_017278	TCT	2	6	597183	597188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384439007
15024	NC_017278	CCA	2	6	597201	597206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439007
15025	NC_017278	CCCG	2	8	597235	597242	0 %	0 %	25 %	75 %	384439007
15026	NC_017278	CCT	2	6	597265	597270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15027	NC_017278	GAT	2	6	597283	597288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384439007
15028	NC_017278	GGC	2	6	597355	597360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439007
15029	NC_017278	GGA	2	6	597391	597396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439007
15030	NC_017278	GGT	2	6	597402	597407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439007
15031	NC_017278	TGG	2	6	597458	597463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439007
15032	NC_017278	CTGGG	2	10	597476	597485	0 %	20 %	60 %	20 %	384439007
15033	NC_017278	TCC	2	6	597552	597557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15034	NC_017278	CAG	2	6	597572	597577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384439007
15035	NC_017278	G	6	6	597582	597587	0 %	0 %	100 %	0 %	384439007
15036	NC_017278	GCC	2	6	597629	597634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439007
15037	NC_017278	CTT	2	6	597724	597729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384439007
15038	NC_017278	CCT	2	6	597730	597735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15039	NC_017278	CTTGG	2	10	597746	597755	0 %	40 %	40 %	20 %	384439007
15040	NC_017278	CCT	2	6	597757	597762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15041	NC_017278	CCG	2	6	597792	597797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439007
15042	NC_017278	TCT	2	6	597843	597848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384439007
15043	NC_017278	TGG	2	6	597864	597869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439007
15044	NC_017278	TCC	2	6	597870	597875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15045	NC_017278	CCT	2	6	597892	597897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
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15048	NC_017278	CGGGG	2	10	597967	597976	0 %	0 %	80 %	20 %	384439007
15049	NC_017278	TCC	3	9	597978	597986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15050	NC_017278	CCT	2	6	598003	598008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15051	NC_017278	GCC	2	6	598017	598022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439007
15052	NC_017278	GCC	2	6	598061	598066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439007
15053	NC_017278	CCT	2	6	598081	598086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15054	NC_017278	CCT	2	6	598090	598095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15055	NC_017278	CCT	2	6	598147	598152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15056	NC_017278	TCC	2	6	598161	598166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15057	NC_017278	GTG	2	6	598181	598186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439007
15058	NC_017278	GCGG	2	8	598195	598202	0 %	0 %	75 %	25 %	384439007
15059	NC_017278	CCG	3	9	598231	598239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439007
15060	NC_017278	TGG	2	6	598251	598256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439007
15061	NC_017278	A	6	6	598323	598328	100 %	0 %	0 %	0 %	384439007
15062	NC_017278	G	8	8	598357	598364	0 %	0 %	100 %	0 %	384439007
15063	NC_017278	GCG	2	6	598405	598410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439007
15064	NC_017278	CTC	2	6	598427	598432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439007
15065	NC_017278	ACT	3	9	598533	598541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384439007
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15069	NC_017278	G	7	7	598630	598636	0 %	0 %	100 %	0 %	384439007
15070	NC_017278	TCC	4	12	598730	598741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439008
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15072	NC_017278	C	6	6	598852	598857	0 %	0 %	0 %	100 %	384439008
15073	NC_017278	G	6	6	598871	598876	0 %	0 %	100 %	0 %	384439008
15074	NC_017278	CGT	2	6	598914	598919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384439008
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15077	NC_017278	CCAGGA	2	12	599031	599042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384439008
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15079	NC_017278	TGGC	2	8	599250	599257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15080	NC_017278	GCCC	2	8	599296	599303	0 %	0 %	25 %	75 %	384439009
15081	NC_017278	C	6	6	599301	599306	0 %	0 %	0 %	100 %	384439009
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15085	NC_017278	C	6	6	599505	599510	0 %	0 %	0 %	100 %	384439009
15086	NC_017278	TGGGTC	2	12	599529	599540	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384439009
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15092	NC_017278	CCT	2	6	599701	599706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439010
15093	NC_017278	GAG	2	6	599765	599770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439010
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15101	NC_017278	TCC	3	9	599940	599948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439010
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15111	NC_017278	GGC	2	6	600325	600330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439010
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15119	NC_017278	G	7	7	600681	600687	0 %	0 %	100 %	0 %	384439011
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15121	NC_017278	GTGGCC	2	12	600778	600789	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384439011
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15221	NC_017278	AAG	3	9	604512	604520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15222	NC_017278	GGCC	2	8	604546	604553	0 %	0 %	50 %	50 %	384439016
15223	NC_017278	CCTT	2	8	604563	604570	0 %	50 %	0 %	50 %	384439016
15224	NC_017278	G	6	6	604615	604620	0 %	0 %	100 %	0 %	384439016
15225	NC_017278	CTC	2	6	604742	604747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439016
15226	NC_017278	GCG	2	6	604802	604807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439016
15227	NC_017278	GAG	2	6	604862	604867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439016
15228	NC_017278	TCC	2	6	604907	604912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439016
15229	NC_017278	CCA	2	6	604972	604977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439016
15230	NC_017278	TCG	2	6	604998	605003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384439016
15231	NC_017278	AGG	2	6	605025	605030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439016
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15233	NC_017278	CCTT	2	8	605091	605098	0 %	50 %	0 %	50 %	384439016
15234	NC_017278	GCC	2	6	605151	605156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439016
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15237	NC_017278	TCCC	2	8	605299	605306	0 %	25 %	0 %	75 %	384439017
15238	NC_017278	C	6	6	605334	605339	0 %	0 %	0 %	100 %	384439017
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15370	NC_017278	TCGGCC	2	12	610305	610316	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384439022
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15372	NC_017278	CTC	2	6	610346	610351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439022
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15402	NC_017278	GGCT	2	8	611346	611353	0 %	25 %	50 %	25 %	384439023
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15410	NC_017278	GCC	2	6	611622	611627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439023
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15415	NC_017278	TCC	2	6	611851	611856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439024
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15421	NC_017278	GCCTAC	2	12	612081	612092	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384439024
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15471	NC_017278	GAG	2	6	613940	613945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439027
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15488	NC_017278	TGAAGG	2	12	614464	614475	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384439027
15489	NC_017278	G	7	7	614474	614480	0 %	0 %	100 %	0 %	384439027
15490	NC_017278	TTC	2	6	614544	614549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384439027
15491	NC_017278	C	6	6	614577	614582	0 %	0 %	0 %	100 %	384439027
15492	NC_017278	GTG	3	9	614607	614615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439027
15493	NC_017278	AGGT	2	8	614643	614650	25 %	25 %	50 %	0 %	384439027
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15500	NC_017278	AGGA	2	8	614736	614743	50 %	0 %	50 %	0 %	384439027

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