MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_017278	TGA	2	6	560609	560614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438965
14003	NC_017278	CAC	2	6	560622	560627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438965
14004	NC_017278	CCCT	2	8	560634	560641	0 %	25 %	0 %	75 %	384438965
14005	NC_017278	GGA	2	6	560648	560653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438965
14006	NC_017278	CCT	2	6	560773	560778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438966
14007	NC_017278	CTT	2	6	560795	560800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438966
14008	NC_017278	AGG	3	9	560847	560855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438966
14009	NC_017278	TGG	2	6	560856	560861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438966
14010	NC_017278	GC	3	6	560884	560889	0 %	0 %	50 %	50 %	384438966
14011	NC_017278	TCC	2	6	560913	560918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438966
14012	NC_017278	CCT	2	6	560923	560928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438966
14013	NC_017278	GCC	2	6	560973	560978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438966
14014	NC_017278	GAG	2	6	560987	560992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438966
14015	NC_017278	TCC	2	6	561012	561017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438966
14016	NC_017278	CCT	2	6	561022	561027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438966
14017	NC_017278	CCA	2	6	561028	561033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438966
14018	NC_017278	GAG	2	6	561050	561055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438966
14019	NC_017278	C	6	6	561070	561075	0 %	0 %	0 %	100 %	384438966
14020	NC_017278	CCT	2	6	561114	561119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14021	NC_017278	CTG	2	6	561244	561249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438967
14022	NC_017278	CAC	2	6	561316	561321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438967
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14024	NC_017278	GGC	2	6	561427	561432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438967
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14027	NC_017278	CAC	2	6	561615	561620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438968
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14029	NC_017278	GCCC	2	8	561664	561671	0 %	0 %	25 %	75 %	384438968
14030	NC_017278	AGG	2	6	561682	561687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438968
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14032	NC_017278	CGC	4	12	561724	561735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438968
14033	NC_017278	CCA	2	6	561743	561748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438968
14034	NC_017278	GCG	3	9	561772	561780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438968
14035	NC_017278	TTC	2	6	561819	561824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438968
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14037	NC_017278	C	6	6	561895	561900	0 %	0 %	0 %	100 %	384438969
14038	NC_017278	C	6	6	561935	561940	0 %	0 %	0 %	100 %	384438969
14039	NC_017278	CTC	2	6	561951	561956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438969
14040	NC_017278	CAC	2	6	562008	562013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438969
14041	NC_017278	C	8	8	562094	562101	0 %	0 %	0 %	100 %	384438969
14042	NC_017278	CGCTC	2	10	562130	562139	0 %	20 %	20 %	60 %	384438969
14043	NC_017278	CCA	2	6	562166	562171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438969
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14047	NC_017278	CGC	2	6	562446	562451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14048	NC_017278	CTT	2	6	562492	562497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438970
14049	NC_017278	CCA	2	6	562515	562520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438970
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14051	NC_017278	GTC	2	6	562546	562551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438970
14052	NC_017278	CCTCCA	2	12	562614	562625	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384438970
14053	NC_017278	CAC	2	6	562645	562650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438970
14054	NC_017278	CCG	2	6	562680	562685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438970
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14056	NC_017278	CCT	2	6	562707	562712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438970
14057	NC_017278	CTCC	2	8	562736	562743	0 %	25 %	0 %	75 %	384438970
14058	NC_017278	AAG	2	6	562776	562781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438970
14059	NC_017278	C	6	6	562790	562795	0 %	0 %	0 %	100 %	384438970
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14062	NC_017278	C	6	6	562829	562834	0 %	0 %	0 %	100 %	384438970
14063	NC_017278	TCC	2	6	562844	562849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438970
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14065	NC_017278	G	7	7	562867	562873	0 %	0 %	100 %	0 %	384438970
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14070	NC_017278	GGT	2	6	563043	563048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438970
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14081	NC_017278	CGGG	2	8	563437	563444	0 %	0 %	75 %	25 %	384438970
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14086	NC_017278	GGCG	2	8	563642	563649	0 %	0 %	75 %	25 %	384438970
14087	NC_017278	CTA	2	6	563703	563708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438970
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14089	NC_017278	AAGG	2	8	563734	563741	50 %	0 %	50 %	0 %	384438970
14090	NC_017278	GGC	2	6	563756	563761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438971
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14092	NC_017278	TCA	2	6	563909	563914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438971
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14094	NC_017278	CCGC	2	8	563937	563944	0 %	0 %	25 %	75 %	384438971
14095	NC_017278	G	6	6	563954	563959	0 %	0 %	100 %	0 %	384438971
14096	NC_017278	GCGG	2	8	563979	563986	0 %	0 %	75 %	25 %	384438971
14097	NC_017278	ACCC	2	8	564011	564018	25 %	0 %	0 %	75 %	384438971
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14101	NC_017278	GCC	2	6	564181	564186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438971
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14105	NC_017278	GGC	2	6	564317	564322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438971
14106	NC_017278	CCTT	2	8	564337	564344	0 %	50 %	0 %	50 %	384438971
14107	NC_017278	GAA	2	6	564354	564359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438971
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14109	NC_017278	GGCC	2	8	564456	564463	0 %	0 %	50 %	50 %	384438971
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14119	NC_017278	GACCA	2	10	564712	564721	40 %	0 %	20 %	40 %	384438971
14120	NC_017278	G	6	6	564764	564769	0 %	0 %	100 %	0 %	384438971
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14231	NC_017278	TGGCGG	2	12	568870	568881	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384438974
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14235	NC_017278	TGG	3	9	569008	569016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438974
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14239	NC_017278	G	7	7	569142	569148	0 %	0 %	100 %	0 %	384438974
14240	NC_017278	ACG	2	6	569179	569184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438974
14241	NC_017278	GGC	2	6	569189	569194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438974
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14243	NC_017278	CCT	2	6	569233	569238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438974
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14352	NC_017278	G	6	6	572363	572368	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14353	NC_017278	C	7	7	572439	572445	0 %	0 %	0 %	100 %	384438979
14354	NC_017278	G	6	6	572483	572488	0 %	0 %	100 %	0 %	384438979
14355	NC_017278	GCAG	2	8	572498	572505	25 %	0 %	50 %	25 %	384438979
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14360	NC_017278	CTA	2	6	572610	572615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438979
14361	NC_017278	GGCGG	2	10	572631	572640	0 %	0 %	80 %	20 %	384438979
14362	NC_017278	TGC	2	6	572651	572656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438979
14363	NC_017278	GGGC	2	8	572660	572667	0 %	0 %	75 %	25 %	384438979
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